อินเตอร์เฟรอนแลมบ์ดา 3
| ไอเอฟเอ็นแอล3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | IFNL3 , IL-28B, IL28B, IL28C, อินเตอร์ลิวคิน 28B, อินเตอร์เฟรอน แลมบ์ดา 3, อินเตอร์เฟรอน แลมบ์ดา 3, IFN-แลมบ์ดา-3, IFN-แลมบ์ดา-4, IL-28C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 607402 ; เอ็มจีไอ : 2450574 ; โฮโมโลยีน : 77540 ; การ์ดยีน : IFNL3 ; OMA : IFNL3 - ออโธล็อก | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
อินเตอร์เฟรอนแลมบ์ดา 3เข้ารหัสโปรตีน IFNL3 IFNL3เดิมชื่อIL28Bแต่คณะกรรมการการตั้งชื่อยีนขององค์การจีโนมมนุษย์ได้เปลี่ยนชื่อยีนนี้ในปี 2013 พร้อมกับการตั้งชื่อให้กับยีนIFNL4 ที่เพิ่งค้นพบใหม่ [ 5 ] ยีนเหล่านี้ ร่วมกับIFNL1 (เดิมชื่อ IL29 ) และIFNL2 (เดิมชื่อIL28A ) อยู่ในกลุ่มเดียวกันบนโครโมโซมบริเวณ 19q13 IFNL3 มีความเหมือนกันของกรดอะมิโนประมาณ 96% กับ IFNL2 ประมาณ 80% กับ IFNL1 และประมาณ 30% กับ IFNL4
ยีนอินเตอร์เฟรอนแลมบ์ดาเข้ารหัสไซโตไคน์ที่จัดอยู่ในกลุ่มอินเตอร์เฟรอนประเภท IIIซึ่งมีความสัมพันธ์ห่างๆ กับอินเตอร์เฟรอนประเภท Iและตระกูล IL-10อินเตอร์เฟรอนประเภท III ถูกกระตุ้นโดยการติดเชื้อไวรัสและมีปฏิสัมพันธ์กับตัวรับไซโตไคน์คลาส II แบบเฮเทอโรไดเมอริก ซึ่งประกอบด้วยตัวรับอินเตอร์ลิวคิน 10 เบต้า (IL10RB) และตัวรับอินเตอร์เฟรอนแลมบ์ดา 1 (IFNLR1) เพื่อส่งสัญญาณผ่านเส้นทางต้านไวรัส JAK-STAT [ข้อมูลจากRefSeq , กรกฎาคม 2008]
โรคไวรัสตับอักเสบซี
ตัวแปรต่างๆ ถูกย้ายไปยังIFNL4
ในปี 2552 (กล่าวคือ ก่อนการค้นพบIFNL4 ) ผลการศึกษาการเชื่อมโยงทั่วทั้งจีโนม (GWAS) ระบุว่าโพลีมอร์ฟิซึมแบบนิวคลีโอไทด์เดี่ยว (SNPs) ที่อยู่ใกล้กับIFNL3 (rs12979860, rs8099917 และอื่นๆ) มีความสัมพันธ์อย่างมากกับการตอบสนองต่อการรักษาด้วยเพกิเลตเต็ดอินเตอร์เฟรอน-α และริบาไวรินสำหรับโรคตับอักเสบซีเรื้อรัง[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]รวมถึง การหายจากการติดเชื้อไวรัส ตับอักเสบซี (HCV) โดยธรรมชาติ [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]ยีนที่รู้จักกันในชื่อIL28B (ปัจจุบันคือIFNL3)เป็นยีนที่ใกล้เคียงที่สุดที่รู้จักในขณะนั้น ดังนั้นตัวแปรทางพันธุกรรมเหล่านี้จึงเรียกว่า " ตัวแปร IL28B " สันนิษฐานว่าความสัมพันธ์ที่สังเกตได้สะท้อนถึงความแตกต่างในโครงสร้างหรือการควบคุมของยีนนั้น อย่างไรก็ตาม การค้นพบIFNL4พบว่า SNP rs12979860 ตั้งอยู่ในอินทรอน 1 ของIFNL4ในขณะที่ rs8099917 อยู่ในบริเวณระหว่างยีนแต่ใกล้กับIFNL4 มากที่สุด [ 5 ] SNP rs12979860 และ rs8099917 มีภาวะสมดุลการเชื่อมโยง สูง กับตัวแปรของIFNL4 ( IFNL4- ΔG/TT; rs368234815) ที่ควบคุมการสร้างโปรตีน IFNL4 [ 5 ] IFNL4- ΔG/TT ดูเหมือนจะเป็นโพลีมอร์ฟิซึมเชิงฟังก์ชันที่อธิบายความสัมพันธ์ GWAS ของ SNP ใกล้เคียงกับการกำจัด HCV และIFNL4- ΔG/TT แสดงให้เห็นว่ามีความสัมพันธ์ทางสถิติที่แข็งแกร่งกว่ากับการกำจัด HCV มากกว่า rs12979860 โดยเฉพาะในประชากรเชื้อสายแอฟริกันซึ่งมีภาวะสมดุลการเชื่อมโยงระหว่างตัวแปรเหล่านี้ อ่อนแอกว่าในประชากรกลุ่มอื่น[ 5 ] [ 14 ]
รูปแบบIFNL3ที่แท้จริง
หนึ่งในตัวแปรการทำงานที่เป็นไปได้ในIFNL3คือ SNP rs4803217 ซึ่งอยู่ในบริเวณควบคุมที่ไม่ถูกแปลรหัส 3' การแทนที่กัวนีนด้วยไทมีนดั้งเดิมที่ไซต์นี้จะเพิ่ม การแสดงออกของ mRNA ของ IFNL3โดยการลดการสลายตัวของ mRNA และการจับไมโครอาร์เอ็นเอที่เกิดจาก HCV [ 15 ]และเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของ RNA [ 16 ] [ 11 ] มีภาวะสมดุลการเชื่อมโยงสูงระหว่าง rs4803217 และ ตัวแปร IFNL4- ΔG/TT [ 5 ] rs4803217 ได้รับการแสดงให้เห็นว่าเกี่ยวข้องกับการกำจัด HCV [ 16 ]อย่างไรก็ตาม ความสัมพันธ์นั้นดูเหมือนจะเกิดจากภาวะสมดุลการเชื่อมโยงกับIFNL4- ΔG/TT มากกว่าผลกระทบการทำงานโดยตรงของ SNP rs4803217 เอง
อ่านเพิ่มเติม
- Sheppard P, Kindsvogel W, Xu W, Henderson K, Schlutsmeyer S, Whitmore TE และ คณะ (มกราคม 2546). "IL-28, IL-29 และตัวรับไซโตไคน์คลาส II IL-28R" Nature Immunology . 4 (1): 63– 8. doi : 10.1038/ni873 . PMID 12469119 . S2CID 35764259 .
- Kotenko SV, Gallagher G, Baurin VV, Lewis-Antes A, Shen M, Shah NK และ คณะ (มกราคม 2546) "IFN-lambda เป็นตัวกลางในการป้องกันไวรัสผ่านคอมเพล็กซ์ตัวรับไซโตไคน์คลาส II ที่แตกต่างกัน" Nature Immunology . 4 (1): 69– 77. doi : 10.1038/ni875 . PMID 12483210 . S2CID 2734534 .
- Li M, He S (เมษายน 2549). "การทำให้บริสุทธิ์และลักษณะเฉพาะของอินเตอร์ลิวคิน-29 ของมนุษย์แบบรีคอมบิแนนท์ที่แสดงออกใน Escherichia coli". Journal of Biotechnology . 122 (3): 334– 40. doi : 10.1016/j.jbiotec.2005.11.019 . PMID 16413080 .
- Mennechet FJ, Uzé G (มิถุนายน 2549). "เซลล์เดนไดรติกที่ได้รับการรักษาด้วยอินเตอร์เฟรอน-แลมบ์ดาจะกระตุ้นการเพิ่มจำนวนของเซลล์ทีกดภูมิคุ้มกันที่แสดงออก FOXP3 โดยเฉพาะ" . Blood . 107 (11): 4417– 23. doi : 10.1182/blood-2005-10-4129 . PMID 16478884 .
- Li MC, Wang HY, Wang HY, Li T, He SH (เมษายน 2549). "การแสดงออกของ IL-28 และ IL-29 ในเซลล์ A549 โดยใช้ไลโปโซมเป็นตัวกลาง และผลต้านไวรัสของ IL-28 และ IL-29 ต่อเซลล์ WISH" Acta Pharmacologica Sinica . 27 (4): 453– 9. doi : 10.1111/j.1745-7254.2006.00292.x . PMID 16539846 .
- Lasfar A, Lewis-Antes A, Smirnov SV, Anantha S, Abushahba W, Tian B และ คณะ (เมษายน 2549) "ลักษณะเฉพาะของระบบตัวรับ-ลิแกนด์ IFN-lambda ของหนู: IFN-lambda แสดงฤทธิ์ต้านมะเร็งต่อมะเร็งผิวหนัง B16" Cancer Research . 66 (8): 4468– 77. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-3653 . PMID 16618774 .
- Dellgren C, Gad HH, Hamming OJ, Melchjorsen J, Hartmann R (มีนาคม 2009). "อินเตอร์เฟรอน-แลมบ์ดา3 ของมนุษย์เป็นสมาชิกที่มีศักยภาพของตระกูลอินเตอร์เฟรอนประเภท III" Genes and Immunity . 10 (2): 125– 31. doi : 10.1038/gene.2008.87 . PMID 18987645 .
- Li M, Liu X, Zhou Y, Su SB (กรกฎาคม 2552). "อินเตอร์เฟรอน-แลมบ์ดา: ตัวปรับการตอบสนองของไวรัส ต่อต้านเนื้องอก และภูมิคุ้มกัน"วารสารชีววิทยาของเม็ดเลือดขาว 86 ( 1): 23– 32. doi : 10.1189/jlb.1208761 . PMID 19304895 . S2CID 37741272 .
- Gad HH, Dellgren C, Hamming OJ, Vends S, Paludan SR, Hartmann R (กรกฎาคม 2552). "อินเตอร์เฟรอน-แลมบ์ดาเป็นอินเตอร์เฟรอนในเชิงหน้าที่ แต่มีความสัมพันธ์เชิงโครงสร้างกับตระกูลอินเตอร์ลิวคิ น-10"วารสารเคมีชีวภาพ 284 (31): 20869– 75. doi : 10.1074/jbc.M109.002923 . PMC 2742852 . PMID 19457860 .
- Ge D, Fellay J, Thompson AJ, Simon JS, Shianna KV, Urban TJ และ คณะ (กันยายน 2552). "ความแปรผันทางพันธุกรรมใน IL28B ทำนายการกำจัดไวรัสที่เกิดจากการรักษาโรคไวรัสตับอักเสบซี" Nature . 461 ( 7262): 399– 401. Bibcode : 2009Natur.461..399G . doi : 10.1038/nature08309 . PMID 19684573 . S2CID 1707096 .