งานโค้ชแรกของฮอร์ตันคือการเป็นผู้ช่วยบัณฑิตศึกษาให้กับมหาวิทยาลัยมินนิโซตาในปี 1984 ภายใต้ การนำของ ลู โฮลท์ซปีต่อมา เขาได้เข้าร่วมทีมมหาวิทยาลัย ที่เขา จบการศึกษาในฐานะผู้ช่วยโค้ชที่เมืองรีโน ในปี 1990 และ 1991 เขาเป็น โค้ช ผู้ฝึกสอนตำแหน่งปีกรับลูกและในปี 1992 เขาได้ลาออกไปเป็น โค้ช ผู้ฝึกสอนตำแหน่งปีกรับลูกที่มหาวิทยาลัยนอร์ทแอลวี (UNLV )

หลังจากฤดูกาลฟุตบอลปี 1992 สิ้นสุด ลง คริส อัลท์หัวหน้าโค้ชทีมวูล์ฟแพ็คได้ลาออกจากตำแหน่งเพื่อไปมุ่งเน้นหน้าที่ในฐานะผู้อำนวยการฝ่ายกีฬา ของมหาวิทยาลัย ฮอร์ตันเป็นผู้สืบทอดตำแหน่งที่อัลท์เลือกไว้ และเขากลับมาจากลาสเวกัสเพื่อรับตำแหน่งหัวหน้าโค้ชของทีมวูล์ฟแพ็ค ฮอร์ตันนำทีมเนวาดาไปสู่สถิติ 7–4 และจบอันดับสองในบิ๊กเวสต์คอนเฟอเรนซ์เมื่อวันที่ 22 พฤศจิกายน 1993 ฮอร์ตันตอบรับตำแหน่งหัวหน้าโค้ชที่ UNLV

หลังจบฤดูกาล 1993 ฮอร์ตันรับตำแหน่งหัวหน้าโค้ชที่ UNLV ซึ่งเป็นคู่แข่งร่วมรัฐ การย้ายทีมครั้งนี้มักถูกเรียกว่า "การแปรพักตร์สีแดง" โดยแฟนๆ วูล์ฟแพ็ค^{[ 1 ]}ในฤดูกาลแรกของเขาในปี 1994 รีเบลส์คว้าแชมป์ร่วมของบิ๊กเวสต์ (อย่างเป็นทางการคือแชมป์คอนเฟอเรนซ์ครั้งแรกและครั้งเดียวในประวัติศาสตร์ของทีม) และลาสเวกัสโบว์ลปี 1994ทำให้ฮอร์ตันได้รับรางวัลโค้ชแห่งปีของคอนเฟอเรนซ์นั้น

อย่างไรก็ตาม ความสำเร็จนี้ไม่ได้คงอยู่ตลอดไป และฮอร์ตันก็ชนะได้อีกเพียง 6 เกมในช่วงสามปีถัดมา เขาถูกไล่ออกหลังจากที่ทีมรีเบลส์จบฤดูกาล 1998 ด้วยสถิติแพ้รวด 11 เกมรวด ซึ่งเป็นฤดูกาลเดียวในประวัติศาสตร์ของโรงเรียนที่ไม่มีชัยชนะเลย จนกระทั่งทีม UNLV ในปี 2020จบฤดูกาลด้วยสถิติแพ้รวด 6 เกมรวด ภายใต้การคุมทีมของโค้ชมาร์คัส อาร์โรโย

หลังจากถูกไล่ออก เขาได้รับการว่าจ้างให้เป็นโค้ชผู้ฝึกสอนตำแหน่งควอเตอร์แบ็กของทีมวิสคอนซิน แบดเจอร์สควอเตอร์แบ็กในช่วงที่เขาคุมทีม ( จิม ซอร์จี , บรูคส์ บอลลิงเจอร์และจอห์น สต็อกโก ) ครองอันดับหนึ่ง สอง และสี่ในประวัติศาสตร์ของทีมแบดเจอร์สในด้านระยะการขว้างบอล

ฮอร์ตันได้รับการว่าจ้างให้เป็นผู้ช่วยพิเศษด้านเกมรุกของทีมเซนต์หลุยส์ แรมส์ในตำแหน่งนั้น เขาช่วยหัวหน้าโค้ชสก็อตต์ ไลน์ฮานในด้านงานธุรการ การวางแผนเกมรุก และการเตรียมการต่างๆ

ฮอร์ตันเคยร่วมงานกับดี ทรอยต์ ไลออนส์หนึ่งฤดูกาล (2009) ในตำแหน่งโค้ชผู้ฝึกสอนควอเตอร์แบ็ก

ฮอร์ตันได้รับการว่าจ้างโดยทิม บรูว์สเตอร์ โค้ชของมินนิโซตา ในเดือนมกราคม 2010 หลังจากเจดด์ ฟิชลาออกไปเป็นโค้ชควอเตอร์แบ็กให้กับซีแอตเติล ซีฮอว์กส์ ใน NFL เมื่อวันที่ 17 ตุลาคม 2010 บรูว์สเตอร์ถูกปลดจากตำแหน่งหัวหน้าโค้ช ฮอร์ตันได้รับเลือกให้มาทำหน้าที่แทนบรูว์สเตอร์เป็นการชั่วคราว เขาทำผลงาน 2-3 ในฐานะโค้ช โดยเอาชนะไอโอวา ฮอว์คอายส์เมื่อวันที่ 27 พฤศจิกายน เพื่อคว้า ถ้วยรางวัล ฟลอยด์ ออฟ โรสเดลซึ่งเป็นการชนะเกมชิงถ้วยรางวัลครั้งแรกของโกเฟอร์สตั้งแต่ปี 2006 เจอร์รี คิลล์ได้รับการว่าจ้างเป็นโค้ชคนต่อไปของมินนิโซตา และฮอร์ตันไม่ได้ถูกต่อสัญญาในทีม

ฮอร์ตันใช้เวลา 12 ปีที่มหาวิทยาลัยซานดิเอโกสเตทก่อนจะเกษียณ บทบาทของเขารวมถึงโค้ชผู้เล่นตำแหน่งวิ่ง, ผู้ประสานงานเกมรุก และผู้ช่วยหัวหน้าโค้ช ในปี 2016 มหาวิทยาลัยซานดิเอโกสเตทสร้างประวัติศาสตร์ NCAA โดยเป็นทีมแรกที่สามารถสร้างผู้เล่นวิ่งระยะ 2,000 หลาและ 1,000 หลาในฤดูกาลเดียวกัน ครั้งหนึ่งเคยได้รับฉายาว่า "ผู้เชี่ยวชาญด้านผู้เล่นวิ่ง" ในสื่อ ทีมแอซเท็กส์มีสิทธิ์เข้าร่วมการแข่งขันโบว์ลในทุกฤดูกาลทั้ง 12 ฤดูกาลภายใต้การคุมทีมของฮอร์ตันที่มหาวิทยาลัยซานดิเอโกสเตท และคว้าแชมป์ Mountain West ได้ 3 สมัย^{[ 2 ] [ 3 ]}