Capitanich เข้ารับตำแหน่งทางการเมืองครั้งแรกในปี พ.ศ. 2530 โดยทำหน้าที่เป็นเลขานุการส่วนตัวของผู้ว่าราชการจังหวัดชาโกDanilo Baroni ^{[ 5 ]}

หลังจากนั้น Capitanich ก็ได้รับการเลื่อนตำแหน่งอย่างรวดเร็วในหน่วยงานราชการ ในปี 1994 เขาได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้ประสานงานโครงการสร้างงานในภาคเอกชนในกระทรวงช่วยเหลือการปฏิรูปเศรษฐกิจของจังหวัด ปีต่อมาเขากลายเป็นผู้ช่วยเลขานุการฝ่ายประสานงานด้านเทคนิคและการบริหารในกระทรวงการพัฒนาสังคม ในปี 1998 เขาได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้ช่วยเลขานุการฝ่ายโครงการสังคมในกระทรวงการพัฒนาสังคม และในปี 2001 เขาได้รับการแต่งตั้งเป็นรัฐมนตรีว่าการกระทรวงโครงสร้างพื้นฐาน^{[ 1 ] [ 6 ]}

Capitanich ได้รับเลือกเป็นวุฒิสมาชิกจาก Chaco ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2544 และได้รับการแต่งตั้งเป็นรัฐมนตรีว่าการกระทรวงเศรษฐกิจชั่วคราวของอาร์เจนตินาในช่วงวิกฤตการณ์สถาบันเมื่อวันที่ 21 ธันวาคมของปีนั้น โดยดำรงตำแหน่งเป็นเวลาสองวัน ประธานาธิบดีEduardo Duhaldeได้แต่งตั้ง Capitanich เป็นหัวหน้าคณะรัฐมนตรีเมื่อวันที่ 2 มกราคม พ.ศ. 2545 ^{[ 4 ]}ขณะดำรงตำแหน่งดังกล่าวภายใต้ Duhalde Capitanich มีส่วนเกี่ยวข้องกับบริษัทที่ปรึกษา M-Unit ซึ่งเขาถูกกล่าวหาว่าจัดหาเงินทุนของรัฐบาลอย่างลับๆ^{[ 1 ]}เขาทำงานที่ M-Unit ร่วมกับรัฐมนตรีว่าการกระทรวงเศรษฐกิจ Axel Kicillof ซึ่งเขาร่วมมือกันเขียนหนังสือ^{[ 7 ]} Capitanich ดำรงตำแหน่งหัวหน้าคณะรัฐมนตรีจนถึงเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2545

เขายังคงดำรงตำแหน่งสมาชิกวุฒิสภา และสนับสนุนแนวร่วมเพื่อชัยชนะของ ประธานาธิบดี เนสเตอร์ เคิร์ชเนอร์ในปี 2003 เขาลงสมัครรับเลือกตั้งเป็นผู้ว่าการรัฐชาโก แต่พ่ายแพ้ให้กับรอย นิคิชจากพรรคสหภาพพลเมืองหัวรุนแรง

ในการเลือกตั้งระดับจังหวัดปี 2007 คาปิทานิชลงสมัครรับเลือกตั้งเป็นผู้ว่าการในนามกลุ่ม Frente Chaco Deserves More ซึ่งเป็นพันธมิตรของหลายพรรคการเมือง โดยมีพรรค Justicialist เป็นสมาชิกส่วนใหญ่ เมื่อวันที่ 16 พ.ศ. 2550 เขาได้รับเลือกเป็นผู้ว่าการจังหวัดชาโก โดยเอาชนะผู้สมัครจากพรรคผู้ปกครองและอดีตผู้ว่าการ Ángel Rozas สังกัดพรรค Radical Civic Union ซึ่งผลการเลือกตั้งครั้งนี้สวนทางกับการคาดการณ์เบื้องต้นของโพล ในปี 2008 เขาได้รับการยกย่องจากรางวัล Konex สำหรับผลงานในฐานะนักการเมืองในหมวด "สถาบัน - ชุมชน - บริษัท"8

ในการเลือกตั้งเมื่อวันที่ 18 กันยายน 2554 เขาได้รับเลือกตั้งเป็นผู้ว่าการรัฐอีกครั้ง โดยได้รับคะแนนเสียงมากกว่า 66%

ในการกล่าวเปิดการประชุมสภาประจำปี 2013 นายคาปิทานิชได้กล่าวถึงความสำเร็จของคณะบริหารของเขา ซึ่งรวมถึง: อัตราการเติบโตสะสมของจังหวัดในช่วงปี 2003-2011 อยู่ที่ 78.5% และ 38% หากพิจารณาช่วงปี 2009-2013 นอกจากนี้ยังมีการลดลงของหนี้สินของจังหวัดและการเติบโตของการจ้างงานในภาคเอกชนอย่างเป็นทางการ

ในด้านการศึกษา อัตราการไม่รู้หนังสือลดลงจาก 8.8% เหลือ 5.4% ส่วนในด้านโครงสร้างพื้นฐานทางการศึกษา มีการสร้าง ขยาย และปรับปรุงโรงเรียน 12 แห่ง เพื่อรองรับนักเรียนกว่า 6,000 คน ในระดับชั้นต่างๆ

ในส่วนของด้านสุขภาพ ในสมัยรัฐบาลของเขา มีการเปิดโรงพยาบาลใหม่ 25 แห่ง ซึ่งเป็นสถิติสูงสุดในประวัติศาสตร์ของจังหวัด อัตราการเสียชีวิตของทารกลดลงจาก 20.9 ต่อพันคน เหลือ 14.4 ต่อพันคน ในปี 2554

ในช่วงปี 2008–2015 จำนวนเส้นทางที่สร้างขึ้นจะเทียบเท่ากับ 430  กิโลเมตร ในสมัยรัฐบาลของเขา งานก่อสร้างทางด่วนบนทางหลวงหมายเลข 16 เสร็จสมบูรณ์ ซึ่งต้องใช้เงินลงทุนมากกว่า 259 ล้านเปโซ และรวมถึงการก่อสร้างคันดินและไหล่ทาง นอกจากนี้ ยังมีการก่อสร้างทางหลวงส่วนแรกที่เชื่อมระหว่างเมืองเรซิสเตนเซียกับเมืองมาคาลเล ซึ่งต้องใช้เงินลงทุน 160 ล้านเปโซ และงานก่อสร้างบนทางหลวงจังหวัดหมายเลข 13 ด้วยเงินลงทุนเกือบ 539 ล้านเปโซ

นอกจากนี้ ยังมีการดำเนินงานก่อสร้างศูนย์กีฬา "เนสเตอร์ เคิร์ชเนอร์" ศูนย์บูรณาการชุมชน (CIC) โมดูลด้านสุขภาพ สนามกีฬาขนาดเล็กแห่งใหม่ของสโมสรสังคมและกีฬาฟอนทานา และที่อยู่อาศัยสำหรับชาวโทบาสอีกด้วย