ในปี ค.ศ. 1789 เม็กส์ออกจากนิวเฮเวน รัฐคอนเนตทิคัตไปยังเซนต์จอร์จ เบอร์มูดาที่นั่นเขาประกอบอาชีพทนายความและมีส่วนร่วมในการปกป้องเจ้าของเรือของสหรัฐฯ ที่ถูกโจรสลัดอังกฤษยึด [ ^{2 ] ใน}ปี ค.ศ. 1794 เขากลับมายังสหรัฐอเมริกาและเข้ารับตำแหน่งศาสตราจารย์ด้านคณิตศาสตร์และปรัชญาธรรมชาติที่มหาวิทยาลัยเยล ในฐานะพรรครีพับลิกันเขาขัดแย้งกับพรรคเฟเดอราลิสต์ที่บริหารมหาวิทยาลัยเยล^{[ 3 ]}เขาทำการสอนที่นั่นจนถึงปี ค.ศ. 1801 เมื่อเขาได้รับเลือกให้เป็นอธิการบดีรักษาการคนแรกของมหาวิทยาลัยจอร์เจียในเอเธนส์เงินเดือนของเขาที่จอร์เจียถูกกำหนดไว้ที่ 1,500 ดอลลาร์ต่อปี และเขาได้รับเงิน 400 ดอลลาร์สำหรับค่าใช้จ่ายในการย้ายที่อยู่ของครอบครัว

ที่มหาวิทยาลัยจอร์เจีย เม็กส์ได้ริเริ่ม หลักสูตร ฟิสิกส์ เป็นครั้งแรก ในปี ค.ศ. 1801 เขาลาออกจากตำแหน่งอธิการบดีเมื่อวันที่ 9 สิงหาคม ค.ศ. 1810 หลังจากขัดแย้งกับคณะกรรมการบริหารมหาวิทยาลัย อย่างไรก็ตาม เขายังคงดำรงตำแหน่งศาสตราจารย์ด้านคณิตศาสตร์ ปรัชญาธรรมชาติ และเคมีต่อไปอีกหนึ่งปี

หลังจากจบการศึกษาจากมหาวิทยาลัยจอร์เจีย เม็กส์ได้รับการแต่งตั้งเป็นหัวหน้าสำรวจโดยประธานาธิบดีเจมส์ แมดิสันในปี 1812 และย้ายไปอยู่ที่ซินซินเนติ [ ^{4 ] อย่างไรก็ตาม}เม็กส์เป็นนักดาราศาสตร์มากกว่านักสำรวจ และได้รับคำแนะนำจากผู้สืบทอดตำแหน่งก่อนหน้าของเขาคือ จาเร็ด แมนส์ฟิลด์ ผ่านทางจดหมายและจากเสมียนของเขาในสำนักงานวอชิงตัน ดี.ซี. ^{[ 5 ]}จากนั้นเขายอมรับการแต่งตั้งเป็นกรรมาธิการสำนักงานที่ดินทั่วไปแห่งสหรัฐอเมริกาในวอชิงตัน ดี.ซี.ในปี 1814 ในระหว่างดำรงตำแหน่งที่สำนักงานที่ดินทั่วไปแห่งสหรัฐอเมริกาภายใต้การนำของเจมส์ มอนโร เขาได้ริเริ่มระบบการสังเกตการณ์ ทางอุตุนิยมวิทยาประจำวันครั้งแรกของประเทศที่สำนักงานที่ดินทั่วประเทศ ซึ่งต่อมาได้พัฒนาเป็นกรมอุตุนิยมวิทยาแห่งชาติ

ในปี ค.ศ. 1818 Meigs ได้รับเลือกเป็นสมาชิกของAmerican Philosophical Societyในฟิลาเดลเฟีย [ ^{6 ] ใน}ช่วงทศวรรษ ค.ศ. 1820 Meigs เป็นสมาชิก และในบางช่วงเวลาดำรงตำแหน่งประธานของColumbian Institute for the Promotion of Arts and Sciences [ ^{7 ]}เขายังเป็นหนึ่งในผู้ก่อตั้งและคณะกรรมการของColumbian College (ปัจจุบันคือGeorge Washington University ) และ ^เป็นศาสตราจารย์ด้านปรัชญาเชิงทดลองที่นั่นด้วย

ในปี ค.ศ. 1782 เม็กส์แต่งงานกับคลารา เบนจามิน บุตรชายของพวกเขาเฮนรี เม็กส์รับราชการในสภาคองเกรสของสหรัฐอเมริกาบุตรชายอีกคนหนึ่งชาร์ลส์ เดลูเซนา เม็กส์กลายเป็นสูตินรีแพทย์ ที่มีชื่อเสียง บุตรสาวของพวกเขา คลารา แต่งงานกับจอห์น ฟอร์ไซธ์รัฐมนตรีต่างประเทศของสหรัฐอเมริกาในสมัย ประธานาธิบดี แอนดรูว์ แจ็กสันและมาร์ติน แวน บิวเรนหนึ่งในหลานของเขาคือพลตรีมอนต์โกเมอรี ซี. เม็กส์ผู้ บัญชาการ ในสงครามกลางเมืองอเมริกา

เม็กส์เสียชีวิตเมื่อวันที่ 4 กันยายน ค.ศ. 1822 และถูกฝังไว้ที่สุสานโฮลมีดในกรุงวอชิงตัน ดี.ซี. ในปี ค.ศ. 1878 เมื่อสุสานถูกยุบและหลุมฝังศพถูกย้ายออกไป เขาจึงถูกนำไปฝังใหม่ที่สุสานแห่งชาติอาร์ลิงตันในพื้นที่ของพลตรีเม็กส์

เขาได้รับการจดจำที่มหาวิทยาลัยจอร์เจียในชื่อของเกียรติยศด้านการสอนสูงสุดของมหาวิทยาลัย มหาวิทยาลัยจะมอบรางวัลศาสตราจารย์ดีเด่นด้านการสอน Josiah Meigs ให้แก่คณาจารย์มากถึงห้าท่านในแต่ละปี เมืองMeigs รัฐจอร์เจียได้รับการตั้งชื่อเพื่อเป็นเกียรติแก่เขา เช่นเดียวกับถนน Meigs ในเมือง Athens รัฐจอร์เจีย^{[ 8 ]}