กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 4 นาที

KIAA0090

KIAA0090 เป็น ยีน ของมนุษย์ ที่เข้ารหัส โปรตีน ที่มีหน้าที่ไม่ทราบแน่ชัด [ 1 ] KIAA0090 มีชื่อเรียกอีกสองชื่อคือ OTTHUMP00000002581 และ RP1-43E13.

KIAA0090

KIAA0090เป็นยีน ของมนุษย์ ที่เข้ารหัสโปรตีนที่มีหน้าที่ไม่ทราบแน่ชัด[ 1 ] KIAA0090 มีชื่อเรียกอีกสองชื่อคือ OTTHUMP00000002581 และ RP1-43E13.1 ยีนนี้เข้ารหัสตัวแปรการถอดรหัสหลายตัวซึ่งสามารถกำหนดตำแหน่งไปยังส่วนประกอบย่อยของเซลล์ที่แตกต่างกันได้ KIAA0090 มีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนตัวกระตุ้นหลายตัว KIAA0090 มีโดเมนซ้ำแบบ COG1520 WD40 ที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ ซึ่งเชื่อว่าเป็นวิธีการของปฏิสัมพันธ์ดังกล่าว

การศึกษาลักษณะเฉพาะของยีน KIAA0090 และผลิตภัณฑ์ทรานสคริปต์ของยีนนี้

รูปที่ 1 : แผนภาพสรุปของบริเวณใกล้เคียงยีน KIAA0090 บริเวณส่งเสริมการทำงาน เอ็กซอน/อินตรอน และผลิตภัณฑ์ทรานสคริปต์ที่แตกต่างกัน

KIAA0090ตั้งอยู่บนโครโมโซมที่หนึ่งในแขน p ที่ตำแหน่ง 1p36.132 [ 2 ]ครอบคลุมพื้นที่ 36.74 กิโลเบส ตั้งแต่เบสคู่ที่ 19451486 ถึง 19414744 ยีนนี้ประกอบด้วยอินทรอน gt-at/อินทรอนทางเลือก 37 ตัว โดยมีเอ็กซอน 57 ตัวที่แสดงในรูปแบบที่ไม่ถูกตัดต่อ 1 รูปแบบที่มีความยาว 4253 bp และรูปแบบที่ถูกตัดต่อแบบทางเลือก 20 รูปแบบที่มีความยาวแตกต่างกัน[ 3 ]ยีนนี้มีโปรโมเตอร์ที่เป็นไปได้ 8 ตัว[ 4 ]ยีนนี้ถูกขนาบข้างด้วย UBR4 ทางด้านขวาและ MRTO4 ทางด้านซ้าย[ 1 ]ข้อมูลนี้แสดงเป็นภาพกราฟิกในรูปที่ 1

แท็กแสดงลำดับและโคลน cDNAที่แยกได้บ่งชี้ว่า KIAA0090 มีการแสดงออกอย่างแพร่หลายในระดับต่ำถึงปานกลางทั่วร่างกาย[ 5 ]ซึ่งรวมถึงแต่ไม่จำกัดเพียง อัณฑะ ลิ้น ปอด สมองน้อย สมอง ต่อมน้ำนม หลอดลมรก หลอดอาหาร ต่อมน้ำลาย สมอง ฮิปโปแคมปัส อะมิกดาลา ไขกระดูก ทาลามัส ม้าม มดลูก ต่อมไทมัส ไต ตา หัวใจ ถุงน้ำดี ต่อมลูกหมาก ตับ ต่อมพาราไทรอยด์ รังไข่ กระเพาะอาหารกล้ามเนื้อโครงร่าง ลำไส้ใหญ่ ตับอ่อน และผิวหนัง การแสดงออกของ KIAA0090 เปลี่ยนแปลงไปตลอดการพัฒนา ( การเกิดตัวอ่อนทารกในครรภ์ ผู้ใหญ่ ฯลฯ) และในระหว่างการเกิดมะเร็งหลักฐานบ่งชี้ว่ามีความสัมพันธ์ระหว่างสภาวะและระดับการแสดงออก แต่ไม่มีข้อมูลใดที่แสดงว่า KIAA0090 เป็นสาเหตุของโรคหรือระยะใดของการพัฒนา

mRNA ของยีนนี้เข้ารหัสโปรตีนไอโซฟอร์ม 18 ชนิด 6 ส่วนตัวแปรการต่อเชื่อมอีก 3 ชนิดที่เหลือไม่มีหลักฐานสนับสนุนความสามารถในการแปลรหัส

การวิเคราะห์ลักษณะเฉพาะของผลิตภัณฑ์โปรตีน KIAA0090

การวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่าผลิตภัณฑ์โปรตีน KIAA0090 ที่ไม่ได้ตัดต่อมีความยาว 993 กรดอะมิโนมีจุดไอโซอิเล็กทริกที่ 7.418 และน้ำหนักโมเลกุล 111765.73 ดาลตัน[ 6 ] [ 7 ]โครงสร้างหลักของโปรตีนนี้ประกอบด้วยโดเมนที่อนุรักษ์ไว้ 4 โดเมน[ 8 ]ซึ่งรวมถึงเปปไทด์สัญญาณจากตำแหน่งที่ 1 ถึง 22 โดเมนคล้าย COG1520 WD40 โดเมนลิวซีนซิปเปอร์ โดเมน DUF1620 (โดเมนที่มีหน้าที่ไม่ทราบแน่ชัด) และโดเมนทรานส์เมมเบรน สามารถดูได้ในรูปที่ 2มีกรดอะมิโนซิสเทอีนที่อนุรักษ์ไว้หลายตำแหน่งที่ 226, 235, 335, 364, 449, 581, 675, 925 และ 985 [ 9 ]นอกจากนี้ยังมีสัญญาณระบุตำแหน่งภายในหลายตัว[ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]ขึ้นอยู่กับผลลัพธ์ของการตัดต่อและการดัดแปลงหลังการแปล โปรตีนสามารถมีตำแหน่งอยู่ที่เพอร์ออกซิโซม เยื่อหุ้มเซลล์ นอกเซลล์ ไซโตโซล นิวเคลียส หรือไมโตคอนเดรีย

รูปที่ 2:แผนที่โปรตีนที่มีคำอธิบายประกอบของ KIAA0090 พร้อมตำแหน่งโดเมนและหน้าที่การทำงาน

การดัดแปลงหลังการแปลของ KIAA0090 สามารถเกิดขึ้นได้ มีตำแหน่งฟอสโฟรีเลชัน ที่ เป็นไปได้ 54 ตำแหน่ง ได้แก่ ซีรีน 33 ตำแหน่ง ทรีโอนีน 10 ตำแหน่ง และไทโรซีน 11 ตำแหน่ง [ 15 ]มีตำแหน่งไกลโคซิเลชันแบบ N-linked 3 ตำแหน่งที่เรซิเดิว 370, 818 และ 913 [ 16 ]เปปไทด์สัญญาณสามารถถูกตัดออกระหว่างเรซิเดิว 21 และ 22 [ 13 ]

รูปที่ 3:การแปลความหมายเชิงแนวคิดของ KIAA0090 พร้อมด้วยโดเมน ตำแหน่งการฟอสโฟรีเลชัน ตำแหน่งการไกลโคซิเลชันแบบ N-linked และเปปไทด์สัญญาณ

ข้อมูลนี้แสดงเป็นภาพในรูปที่ 3โครงสร้างนอกเหนือจากโครงสร้างหลักยังคงเป็นการคาดการณ์ การวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศให้ข้อมูลที่เป็นเอกฉันท์ซึ่งแสดงในรูปที่ 3 เช่น กัน[ 17 ] [ 18 ]โปรตีนนี้ได้รับการอนุรักษ์ไว้อย่างสูงในสิ่งมีชีวิตยูคาริโอตทั้งในสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์และเซลล์เดียว ซึ่งรวมถึงแต่ไม่จำกัดเพียงสัตว์ พืช เชื้อรา และโปรติสต์

รูปที่ 4:ปฏิสัมพันธ์ระหว่าง KIAA0090 กับโปรตีน

โดเมน WD40 ที่คล้ายกับ COG1520 เป็นโดเมนตัวกระตุ้นการทำงานที่ระบุได้เพียงโดเมนเดียวของ KIAA0090 โปรตีนที่มี WD40 เป็นตัวส่งสัญญาณที่เกี่ยวข้องกับการส่งสัญญาณไปยังปัจจัยการจับ เซนโทรเมียร์ และตัวกระตุ้นอื่นๆ[ 19 ]การทดลอง Coimmunoprecipitation ได้พิสูจน์แล้วว่า KIAA0090 มีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนประเภทนี้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งโปรตีนเซนโทรเมียร์ CENPH, ตัวยับยั้ง BAX TMBI4, ปัจจัยการไรโบซิเลชัน ADP ARF6, ไคเนส TNIK และตัวยับยั้งการถอดรหัส T22D1 [ 20 ]จำนวนตัวแปรการต่อเชื่อมแสดงให้เห็นว่ารายการนี้อาจไม่แน่นอน เมื่อมีการกำหนดลักษณะเพิ่มเติมเสร็จสมบูรณ์ คาดว่าจะมีปฏิสัมพันธ์เพิ่มเติม

ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=KIAA0090&oldid=1310614351 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ KIAA0090

KIAA0090 เป็น ยีน ของมนุษย์ ที่เข้ารหัส โปรตีน ที่มีหน้าที่ไม่ทราบแน่ชัด [ 1 ] KIAA0090 มีชื่อเรียกอีกสองชื่อคือ OTTHUMP00000002581 และ RP1-43E13.

การศึกษาลักษณะเฉพาะของยีน KIAA0090 และผลิตภัณฑ์ทรานสคริปต์ของยีนนี้

KIAA0090 ตั้งอยู่บนโครโมโซมที่หนึ่งในแขน p ที่ตำแหน่ง 1p36.132 [ 2 ] ครอบคลุมพื้นที่ 36.

การวิเคราะห์ลักษณะเฉพาะของผลิตภัณฑ์โปรตีน KIAA0090

การวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่าผลิตภัณฑ์โปรตีน KIAA0090 ที่ไม่ได้ตัดต่อมีความยาว 993 กรดอะมิโน มี จุดไอโซอิเล็กทริก ที่ 7.418 และ น้ำหนักโมเลกุล 111765.