ชีสเคเฟอร์ทำโดยใช้ยีสต์และแบคทีเรียที่เรียกว่าเคเฟอร์แทนการใช้กรดหรือเรนเน็ตเพิ่มเติม เพื่อแยกนมออกเป็นส่วนที่เป็นก้อนนมและส่วนที่เป็นน้ำเวย์ ส่วนที่เป็นก้อนนมจะถูกแยกออกโดยการกรองเย็นหรือโดยการให้ความร้อนโดยใช้กรดที่เป็นผลพลอยได้จากเชื้อเคเฟอร์เพื่อทำให้ก้อนนมจับตัวกัน จากนั้นจึงกรองอีกครั้งชีส ที่ได้จะ มีรสชาติเปรี้ยวจัด เข้มข้น และมีเนื้อสัมผัสที่เนียนนุ่มคล้ายกับชีสบรีอาจจะมีหรือไม่มีเชื้อจุลินทรีย์ที่มีชีวิตเหลืออยู่ในชีสหลังการผลิต ขึ้นอยู่กับกระบวนการผลิตเฉพาะ

ในปี 2024 นักวิทยาศาสตร์ได้ถอดรหัสดีเอ็นเอของชีสเคเฟอร์อายุ 3,600 ปีที่พบพร้อมกับมัมมี่ในภาคตะวันตกเฉียงเหนือของจีน ถือเป็นหลักฐานทางโบราณคดีที่เก่าแก่ที่สุดของชีสที่ยังคงสภาพสมบูรณ์^{[ 1 ] [ 2 ]}

• เว็บไซต์การทำชีสเคเฟอร์ของดอมถูกเก็บถาวรเมื่อวันที่ 18 กุมภาพันธ์ 2011 ที่Wayback Machine