หลังจากสำเร็จการศึกษาจากมหาวิทยาลัยฮาร์วาร์ด เฟรเซอร์เริ่มต้นอาชีพทนายความกับบริษัทDrinker Biddle & Reathในฟิลาเดลเฟีย^{[ 7 ]}ในปี 1991 เอสเธอร์ เอฟ. ลาร์เดนต์ หัวหน้าโครงการตัวแทนผู้ต้องหาคดีประหารชีวิต ได้ขอให้เฟรเซอร์เป็นทนายความให้แก่เจมส์ วิลลี "โบ" คอชแรน ผู้ต้องขังรอ ประหารชีวิต ^{[ 5 ]}คอชแรนถูกจับกุมและถูกกล่าวหาว่าฆาตกรรมผู้ช่วยผู้จัดการร้านขายของชำในเบอร์มิงแฮมในปี 1976 ^{[ 11 ]}เฟรเซอร์ ซึ่งขณะนั้นเป็นหุ้นส่วนของบริษัท Drinker Biddle และเพื่อนร่วมงานอีกสองคนรับคดีนี้^{[ 9 ]}ในปี 1995 หลังจากอยู่ในแดนประหารมา 19 ปีศาลอุทธรณ์แห่งสหรัฐอเมริกาประจำเขตที่ 11ได้ยกเลิกคำพิพากษาลงโทษคอชแรน ในปี 1997 คอชแรนได้รับการพิจารณาคดีใหม่และพบว่าไม่มีความผิด^{[ 11 ]}เฟรเซอร์ยังคงเป็นตัวแทนของเขาต่อไปหลังจากออกจากบริษัท Drinker Biddle ในระหว่างอาชีพนักกฎหมายของเฟรเซอร์ เขายังลาพักร้อนในช่วงฤดูร้อนสี่ครั้งเพื่อสอนการว่าความในศาลในแอฟริกาใต้^{[ 6 ]}

ในฐานะทนายความที่ Drinker Biddle ลูกค้ารายหนึ่งของ Frazier คือMerck & Co.ซึ่งเป็นบริษัทยาที่ใหญ่เป็นอันดับสองในสหรัฐอเมริกา^{[ 7 ] [ 9 ]}ในปี 1992 เขาเข้าร่วมแผนกกิจการสาธารณะของ Merck ในตำแหน่งที่ปรึกษาทั่วไป^{[ 7 ] [ 12 ]} Frazier ได้รับการแต่งตั้งเป็นที่ปรึกษาทั่วไปอาวุโสในปี 1999 ^{[ 13 ]}ในฐานะที่ปรึกษาทั่วไป เขาได้รับการยกย่องว่าดูแลการป้องกันของบริษัทจากการเรียกร้องที่ว่ายาต้านการอักเสบVioxxทำให้เกิดอาการหัวใจวายและโรคหลอดเลือดสมอง^{[ 9 ] [ 13 ] [ 14 ]}นักวิเคราะห์ในขณะนั้นประเมินความรับผิดของ Merck ไว้ระหว่าง 20 ถึง 50 พันล้านดอลลาร์^{[ 15 ]} Frazier กล่าวว่าคดีนี้เป็น "ความท้าทายที่สำคัญที่สุดที่เขาเคยเผชิญ" ^{[ 9 ]}เขาเลือกที่จะต่อสู้คดีทั้งหมดในศาลแทนที่จะยุติคดีทั้งหมดอย่างรวดเร็ว^{[ 12 ]}คดีที่เหลือได้รับการยุติในปี พ.ศ. 2550 ด้วยเงิน 4.85 พันล้านดอลลาร์^{[ 13 ]}

ในปี 2549 เฟรเซอร์ได้รับการเลื่อนตำแหน่งเป็นรองประธานบริหาร นอกเหนือจากบทบาทในฐานะที่ปรึกษาทั่วไป^{[ 13 ]}เขาเป็นผู้นำกลุ่มที่ใหญ่ที่สุดของบริษัท คือ กลุ่มสุขภาพมนุษย์ ตั้งแต่ปี 2550 จนกระทั่งเขาได้รับการแต่งตั้งเป็นประธานของเมอร์คในเดือนเมษายน 2553 ^{[ 7 ] [ 16 ]}เมื่อวันที่ 1 มกราคม 2554 เขาได้ดำรงตำแหน่งซีอีโอและเป็นสมาชิกคณะกรรมการบริหารของบริษัท แทนที่ริชาร์ด คลาร์ ก อดีตซีอีโอของเมอร์ ค^{[ 7 ] [ 17 ]}เฟรเซอร์เป็นชาวแอฟริกันอเมริกันคนแรกที่เป็นผู้นำบริษัทเภสัชกรรมขนาดใหญ่^{[ 5 ]}

ในฐานะซีอีโอ เฟรเซอร์ได้สั่งการให้บริษัทรับความเสี่ยงทางการเงินในการพัฒนาวิธีการรักษาใหม่ๆ^{[ 15 ]}ในปี 2013 เขาให้ความสำคัญกับการจัดหาเงินทุนวิจัยมากกว่าการบรรลุเป้าหมายรายได้ของปี^{[ 12 ]}เขาให้ความสำคัญเป็นพิเศษกับการปรับปรุงการรักษาโรคอัลไซเมอร์บิดาของเฟรเซอร์เสียชีวิตด้วยโรคอัลไซเมอร์ เฟรเซอร์กล่าวว่าแรงจูงใจของเขาที่เมอร์คคือความปรารถนาที่จะปรับปรุงชีวิตของผู้คนในประเทศกำลังพัฒนา^{[ 15 ]}

เฟรเซอร์ได้รับค่าตอบแทนรวม 21,387,205 ดอลลาร์ในปี 2014; 17,023,820 ดอลลาร์ในปี 2015; และ 21,781,200 ดอลลาร์ในปี 2016 ^{[ 18 ] [ 19 ]}เมื่อวันที่ 26 กุมภาพันธ์ 2017 มีรายงานว่าเฟรเซอร์เป็นเจ้าของหุ้นของ Merck จำนวน 600,304 หุ้น มูลค่าประมาณ 37,000,000 ดอลลาร์^{[ 20 ]} จากธุรกรรมหุ้นของ Merck เพียงอย่างเดียวและระยะเวลาที่เขาทำงานที่บริษัท มูลค่าสุทธิของเขาจึงอยู่ที่หลายร้อยล้านดอลลาร์^{[ 21 ]}ณ วันที่ 31 ธันวาคม 2016 นายเฟรเซอร์มีสิทธิ์ได้รับเงินอุดหนุนการเกษียณอายุก่อนกำหนดภายใต้แผนที่มีคุณสมบัติและ SRP โดยมีเงินบำนาญมูลค่า 26,593,261 ดอลลาร์^{[ 22 ]}ใน "รายงานความร่วมมือประจำปี" จาก Equilar และThe New York Timesเฟรเซอร์^{[ 23 ]}อยู่ในอันดับที่ 66 ในรายชื่อ "ซีอีโอที่ได้รับค่าตอบแทนสูงสุด 200 อันดับแรกของบริษัทมหาชนขนาดใหญ่" ประจำเดือนพฤษภาคม 2015 และอยู่ในอันดับที่ 7 ในรายชื่อผู้บริหารบริษัทยาชีวเภสัชภัณฑ์ที่มีค่าตอบแทนรวมสูงสุด^{[ 24 ]}

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2559 เฟรเซอร์ขายหุ้นของบริษัทจำนวน 60,000 หุ้น โดยขายในราคาเฉลี่ย 64.44 ดอลลาร์^{[ 25 ]} ในปี พ.ศ. 2561 พ.ศ. 2562 พ.ศ. 2562 พ.ศ. 2562 และ พ.ศ. 2563 ตามลำดับ เฟรเซอร์ขายหุ้นของบริษัทจำนวน 787,792, 694,698 และ 280,000 หุ้น โดยมีมูลค่ารวม ณ เวลาที่ขาย 110.23 ล้านดอลลาร์ เมื่อวันที่ 4 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2564 เมอร์คประกาศว่าเฟรเซอร์จะเกษียณจากตำแหน่งประธานและซีอีโอในปลายเดือนมิถุนายน แต่ยังคงดำรงตำแหน่งประธานกรรมการบริหารต่อไป^{[ 26 ]}