ทีม X-Treme X-Men ประกอบด้วยสตอร์ม , โร้ก , แกมบิต , บิชอป , เซจ (เทสซ่า), ธันเดอร์เบิร์ด (นีล ชาอารา), ไซล็อคและบีสต์ในฐานะสมาชิกดั้งเดิม ไซล็อคถูกฆ่าตายและบีสต์ออกจากเรื่องไปในช่วงแรก และสมาชิกใหม่ไลฟ์การ์ด (เฮเธอร์ คาเมรอน) และสลิปสตรีม (เดวิส คาเมรอน) ก็ถูกเพิ่มเข้ามาในภายหลัง ต่อมาในซีรีส์ ตัวละคร X-Men ที่คุ้นเคยอย่างแคนนอนบอล , ไลลา เชนีย์ , แชโดว์ แคท , แม็กม่าและซันสปอตก็ปรากฏตัวเป็นประจำ โดยมีเพียงแคนนอนบอลเท่านั้นที่เข้าร่วมทีมอย่างเป็นทางการอีแวนเจลีน วีดอน (มนุษย์กลายพันธุ์ที่มีความสามารถในการแปลงร่างเป็นมังกร) ก็ปรากฏตัวหลายครั้งเช่นกัน

นอกจากนี้ เนื้อเรื่องยังแนะนำตัวละครเรดโลตัส ซึ่งมีบทบาทสำคัญในเนื้อเรื่องช่วงออสเตรเลีย และถูกกล่าวถึงในตอนต่างๆ ของเนื้อเรื่องช่วงการรุกรานด้วย

เนื้อเรื่องช่วงแรก (ฉบับที่ 1–4) เกี่ยวกับการผจญภัยของสตอร์มและเหล่าเอ็กซ์เมนที่เธอเลือกมาเพื่อค้นหา ไดอารี่ทั้งสิบสามเล่มของ เดสตินีซึ่งทำนายอนาคต เนื้อเรื่องช่วงนี้ยังแนะนำวาร์กัส (ศัตรูคนใหม่ที่รู้สึกไม่สบายใจกับคำทำนายความตายของเขาในไดอารี่) ซึ่งฆ่าไซล็อคเพื่อทดสอบคำทำนายในไดอารี่ นอกจากนี้เขายังทำร้ายบีสต์ อย่างหนัก ซึ่งนำไปสู่การที่บีสต์เข้าร่วมกับเอ็กซ์เมนกลุ่มใหม่

ในภาคที่สอง (Savage Land 1–4) ทีมเดินทางไปยังดินแดนป่าเถื่อน (Savage Land ) ที่ซึ่งพวกเขาคุ้มกันพวกซอริเด (Saurids) ไปยังดินแดนที่พวกเขาจะไม่ถูกกดขี่ข่มเหง ทีมได้ต่อสู้และเอาชนะเบรนไชลด์ (Brainchild)ซึ่งทำให้สตอร์ม (Storm) สูญเสียการควบคุมพลังของเธอไปชั่วขณะ

เนื้อเรื่องช่วงที่สาม (ฉบับที่ 5–9) เกี่ยวกับแกมบิตในออสเตรเลียและแก๊งมาเฟียที่กำลังทำสงครามกัน หัวหน้าแก๊งมาเฟีย ไวซ์รอย เสียชีวิตอย่างปริศนา และทีมต้องปกป้องลูกๆ มิวแทนต์ของเขาเฮเธอร์และเดวิสซึ่งไม่รู้มาก่อนว่าไวซ์รอยเป็นพ่อของพวกเขา แก๊งมาเฟียและตำรวจกล่าวหาแกมบิตว่าฆาตกรรมหัวหน้าแก๊ง และบิชอปกับโร้กจึงรับหน้าที่เพื่อล้างมลทินให้เขา ขณะที่ทีมได้รู้ว่าเลดี้ มาสเตอร์มายด์และเซบาสเตียน ชอว์อยู่เบื้องหลังทุกอย่าง วายร้ายทั้งสองจับตัวเซจ อดีตผู้ช่วยของชอว์ไปทีมติดอยู่ระหว่างวายร้ายทั้งสองและสงครามแก๊งมาเฟีย แต่ก็สามารถช่วยเหลือเซจและล้างมลทินให้แกมบิตได้ เฮเธอร์และเดวิสเข้าร่วมทีมเอ็กซ์เมนในฐานะไลฟ์การ์ดและสลิปสตรีม ตามลำดับ

ในเนื้อเรื่องช่วงต่อไป (ฉบับที่ 10–18) ทีมได้กลับมารวมตัวกับแกมบิตอีกครั้งที่มาดริปอร์และรับมือกับการรุกรานของกองทัพของข่าน ผู้พิชิตจากต่างมิติ แกมบิตต้องการทับทิมของแม่ของสตอร์ม ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของชุดอัญมณีที่เมื่อได้รับพลังแล้วจะสามารถเปิดประตูมิติได้ เนื่องจากอัญมณีบางส่วนหายไปแล้ว แกมบิตจึงต้องการให้แน่ใจว่าทับทิมของสตอร์มยังคงปลอดภัย อย่างไรก็ตาม แกมบิตถูกโจมตีโดยนักรบจากต่างมิติชื่อไชตัน จับตัวแกมบิตไปและขโมยทับทิมไป จากนั้นไชตันก็ใช้อัญมณีและพลังกลายพันธุ์ของแกมบิตเพื่อเพิ่มพลังให้กับพวกมัน ทำให้เปิดประตูมิติให้ข่านได้ เอ็กซ์เมนของสตอร์มต่อต้านและเอาชนะผู้รุกรานได้ แต่ก่อนหน้านั้นสตอร์มได้รับบาดเจ็บสาหัส

เซจปลุกพลังทั้งหมดที่โร้กเคยฝังไว้ในตัวพร้อมกัน ทำให้โร้กสามารถพลิกสถานการณ์การต่อสู้ได้ ในระหว่างการต่อสู้ระยะประชิด วาร์กัสกลับมาเพื่อฆ่าโร้ก หลังจากที่บันทึกประจำวันทำนายไว้ว่าเธอจะฆ่าเขา ขณะที่โร้กพยายามช่วยแกมบิต เธอถูกพลังงานเดียวกันกับที่ขับเคลื่อนประตูมิติขังไว้ ระหว่างที่ทั้งสองติดอยู่ วาร์กัสใช้ดาบแทงพวกเขาทั้งสอง โร้กใช้พละกำลังของวูล์ฟเวอรีนและฮัลค์เพื่อเอาชนะบาดแผลของเธอ แม้ว่าแกมบิตจะยังใกล้ตาย โร้กพบวาร์กัสและต่อสู้กับเขาเพื่อแก้แค้นให้กับการตายของไซล็อคและการพยายามฆ่าเธอและแกมบิตตามที่ทำนายไว้ในบันทึกประจำวัน การต่อสู้ถูกถ่ายทำโดยทีมข่าว และในขณะที่กล้องดับลง โร้กก็ปรากฏตัวยืนอยู่เหนือวาร์กัสพร้อมดาบ เตรียมพร้อมที่จะฟาดฟัน ไม่ปรากฏชัดว่าเธอฆ่าเขาหรือไม่

ในระหว่างการต่อสู้บนฐานทัพของข่าน พลังของไลฟ์การ์ดเกิดปฏิกิริยาอย่างไม่คาดคิด ทำให้เธอกลายร่างเป็น ชาว ชีอาร์ สีทอง สลิปสตรีมมีปฏิกิริยาไม่ดีต่อเรื่องนี้และวิ่งหนีไปในที่ที่ไม่รู้จัก ทีมประสบความสำเร็จในการเอาชนะข่าน ขณะที่ฮีโร่คนอื่นๆ เข้าร่วมในภารกิจช่วยเหลือ สตอร์ม โร้ก และแกมบิต ซึ่งใกล้ตาย ได้รับการช่วยเหลือจากการมาถึงของจีน เกรย์ไนท์ครอว์เลอร์และบีสต์ ด้วยความเชี่ยวชาญด้านการผ่าตัดของบีสต์ จีนใช้พลังจิตดึงสตอร์มและโร้กขึ้นมาจากห้วงแห่งความตาย และช่วยโร้กทำเช่นเดียวกันกับแกมบิต ไลฟ์การ์ดและธันเดอร์เบิร์ดออกจากเรื่องไปในเนื้อเรื่องตอนนี้ โดยออกตามล่าสลิปสตรีม

ในฉบับต่อๆ ไป (ฉบับที่ 19 และ X-Posé 1–2) (เนื้อเรื่องตอนที่ 6 และ 7) ในขณะที่ทีมกำลังพักฟื้น พวกเขาก็ได้ไปทานอาหารเย็นกับเพื่อนร่วมทีมเก่า อย่างไรก็ตาม เป็นที่ชัดเจนว่ามุมมองของซาเวียร์เปลี่ยนไป และความขัดแย้งทางปรัชญาก็เริ่มขึ้น ทีมต้องรับมือกับด้านการประชาสัมพันธ์ของสิ่งที่พวกเขาทำ ทีมพยายามที่จะให้สารคดีเกี่ยวกับมนุษย์กลายพันธุ์ออกอากาศต่อไป แม้จะมีความพยายามที่จะยุติการออกอากาศเพราะมันไม่ได้เป็นการดูหมิ่น ทีมทำสำเร็จ แต่เพื่อนร่วมทีมเก่าอีกคนหนึ่งคืออาร์คแองเจลปฏิเสธที่จะให้พวกเขาใช้กลวิธีนั้นในการจัดการสื่อ

ฉบับที่ 20-23 (ภาคที่ 8) กล่าวถึงฆาตกรกลายพันธุ์วัยเยาว์ที่ขอลี้ภัยที่สถาบันของเซเวียร์เอ็มม่า ฟรอสต์ไล่เซจและบิชอปออกไปทันทีที่พวกเขามาเยี่ยม เพราะเธอเชื่อว่ามนุษย์กลายพันธุ์ควรดูแลกันเอง ทีมจึงบุกเข้าไปในคฤหาสน์เพื่อนำตัวเด็กชายไปส่งให้เจ้าหน้าที่ แต่เอ็มม่าที่ถูกผีสิงก็มาขัดขวาง เธอถูกผีเอเลียส โบแกนผีเพื่อนเก่าจากเฮลไฟร์คลับที่เธอและเซจเคยเจอมาก่อนเข้าสิง หลังจากทะเลาะกับศาสตราจารย์เอ็กซ์ที่อื่น สตอร์มก็มาช่วยเพื่อนร่วมทีม แต่ความรู้สึกเก่าๆ ก็ปะทุขึ้นมาเมื่อสตอร์มต่อสู้กับเอ็มม่า ฟรอสต์ เอ็มม่าสลัดผีออกไปนอกคฤหาสน์ระหว่างการต่อสู้ แต่พวกเขายังคงต่อสู้กันต่อไปจนกระทั่งสตอร์มแสดงให้เห็นว่าเธอพร้อมจะฆ่าเอ็มม่าและมีความสามารถที่จะทำเช่นนั้นได้ โบแกนพิสูจน์แล้วว่าเป็นภัยคุกคามเบื้องหลังคดีฆาตกรรม สตอร์มและเอ็มม่ารวมพลังกันได้นานพอที่จะช่วยให้ทีมที่เหลือหนีรอดไปได้ จากนั้นพวกเขาก็หยุดโบแกนได้ แต่ก็ไม่ใช่ตลอดไป ความขัดแย้งทางปรัชญาระหว่างกลุ่มเอ็กซ์เมนทั้งสองกลุ่มถึงจุดสูงสุดเมื่อกลุ่มเอ็กซ์ตรีมเอ็กซ์เมนให้คำมั่นสัญญาว่าจะไม่กลับไปยังคฤหาสน์อีกจนกว่าความฝันของการอยู่ร่วมกันอย่างสันติจะกลับมาเป็นเป้าหมายของเอ็กซ์เมนอีกครั้ง แทนที่จะเป็นสิ่งที่กลุ่มเอ็กซ์ตรีมเอ็กซ์เมนเชื่อว่าเป็นลัทธิโดดเดี่ยวและการครอบงำของเหล่ามนุษย์กลายพันธุ์

การกลับมาของแคนนอนบอลเกิดขึ้นในฉบับที่ 24 และฉบับที่ 25-30 (เนื้อเรื่องช่วงที่ 10 และ 11) มีเนื้อเรื่องเกี่ยวกับวิลเลียม สไตรเกอร์ซึ่งเป็นภาคต่อจากนิยายภาพX-Men: God Loves, Man Kills ของแคลร์มอนต์ในปี 1982

ในฉบับที่ 31-35 (ภาค 12) โร้กและแกมบิตกลับมา สตอร์มเสนอตัวให้บริการทีมของเธอแก่สหประชาชาติในฐานะกองกำลังตำรวจมนุษย์กลายพันธุ์ระดับโลกX-Treme Sanctions Executive (XSE) ซึ่งมนุษย์กลายพันธุ์จะยังคงอยู่ภายใต้กฎหมายของมนุษย์ แต่จะถูกควบคุมโดยมนุษย์กลายพันธุ์ด้วยกันเอง^{[ 2 ]}พวกเขาประสบความสำเร็จเนื่องจากรัฐบาลกำลังมองหาวิธีควบคุมภัยคุกคามจากมนุษย์กลายพันธุ์ นอกจากนี้ ทีมยังต่อสู้กับมนุษย์กลายพันธุ์ที่มีพลังอำนาจซึ่งยึดครองเมืองแห่งหนึ่งในแคลิฟอร์เนียและกำลังขับไล่ชาวเมืองออกไปโดยใช้กำลัง นี่เป็นจุดเริ่มต้นของการโจมตีไปมาระหว่างมนุษย์กลายพันธุ์และมนุษย์ ในขณะที่ทีมพยายามสร้างสันติภาพและนำผู้รุกรานมาลงโทษ แม้ว่าทีมจะไม่รู้ แต่เอเลียส โบแกนกำลังมีอิทธิพลต่อเหตุการณ์อย่างลับๆ

ฉบับที่ 36-39 กล่าวถึงภารกิจหนึ่งของสตอร์มในฐานะส่วนหนึ่งของ XSE (เช่น การเปิดโปงเครือข่ายค้าทาสกลายพันธุ์และสนามประลองนักรบในญี่ปุ่น) ฉบับที่ 40-45 กล่าวถึงภัยคุกคามจากเอเลียส โบแกนที่พยายามแก้แค้นกลุ่มเป็นครั้งสุดท้าย ฉบับสุดท้าย ฉบับที่ 46 แสดงให้เห็นคิตตี้ ไพรด์กลับมาร่วมทีม X-Men อีกครั้ง และทีม X-Treme กำลังตัดสินใจว่าจะทำอย่างไรต่อไป: กลับไปที่สถาบันซาเวียร์หรือหาเส้นทางใหม่

• X-Treme X-Menเล่ม 1 #1-46
• X-Treme X-Men Annual 2001
• X-Treme X-Men : Savage Land #1-4
• X-Treme X-Men X-Pose #1-2
• X-Treme X-Men Mekanix (นำแสดงโดย Shadowcat) #1-6

ภารกิจของทีมคือการสำรวจมัลติเวิร์สและตามล่าศาสตราจารย์เอ็กซ์ เวอร์ชั่นชั่วร้ายทั้งสิบตัว หลังจากที่การเทเลพอร์ตข้ามจักรวาลปลุกพวกมันขึ้นมา จนถึงตอนนี้ ทีมได้กำจัดไปแล้วสามตัว: ตัวหนึ่งในโลกที่มนุษย์กลายพันธุ์เป็นเทพเจ้า อีกตัวในสถานการณ์แบบตะวันตกเถื่อน และอะแคนติที่ถูกควบคุมโดยราชินีบรูดหลังจากภารกิจสองครั้งนั้น เคิร์ต แวกโกเนอร์ได้เดินทางกลับไปยังโลกบ้านเกิดของเขา โดยมีแดซเลอร์และฮาวเล็ตต์ไล่ตาม พวกเขาช่วยเขาไว้ได้ด้วยความช่วยเหลือที่ไม่คาดคิดจากเซจ ซึ่งเป็นทูตของSWORDตั้งแต่ครั้งสุดท้ายที่เธออยู่กับกลุ่มผู้ถูกเนรเทศ

หลังจากนั้น พวกเขาก็ได้กลับมารวมตัวกับเซเวียร์อีกครั้ง ซึ่งเซเวียร์ได้ชักชวนไซคลอปส์ แดซเลอร์ และเฮอร์คิวลีสจากมิติอื่นมาร่วมทีม ทีมต่างๆ ได้รวมร่างกัน และแดซเลอร์จากมิติอื่นเสียชีวิตในการเผชิญหน้ากับวิชคิงเซเวียร์ในมิติถัดไป ทำให้แดซเลอร์จากมิติ 616 สวมชุดของเธอ ในมิติถัดไป นามอร์ต่อสู้กับเซเวียร์ที่เป็นนาซี และแดซเลอร์สามารถฆ่าเซเวียร์ที่เป็นนาซีได้ อย่างไรก็ตาม วิชคิงเซเวียร์แกล้งตายและควบคุมเซเวียร์ของทีมไปพร้อมๆ กับการชุบชีวิตเซเวียร์ที่เป็นนาซี เซเวียร์ทั้งสามคนหนีไปยังมิติอื่น โดยสังเวยชนพื้นเมืองเพื่อเพิ่มพลังอำนาจ ทีม X-Treme X-Men ตามมาและช่วยเซเวียร์ของพวกเขาออกมาได้ โชคร้ายที่แหล่งพลังงานที่เซเวียร์คนอื่นๆ ใช้เติบโตขึ้นและฆ่าพวกเขา ทำให้เกิดรอยแยกในมัลติเวิร์สที่กลืนกินชนพื้นเมือง ทีมหนีรอดมาได้ทันเวลาและตามรอยแยกนั้นไป นำไปสู่เหตุการณ์ครอสโอเวอร์ X-Termination กับAstonishing X-MenและAge of Apocalypse

ระหว่างการครอสโอเวอร์ การเดินทางกลับบ้านของไนท์ครอว์เลอร์จาก AoA ส่งผลให้สิ่งมีชีวิตชั่วร้ายสามตัวถูกปลดปล่อยออกมา ซึ่งจะทำลายล้างทุกคนที่พวกมันสัมผัส ส่งผลให้มีผู้เสียชีวิตหลายราย รวมถึงไนท์ครอว์เลอร์ เซเบอร์ทูธ ฮอร์เรอร์โชว์ และฟีนด์จาก AoA ตลอดจนเคิร์ต แวกโกเนอร์ ซาเวียร์ และเฮอร์คิวลีสจาก X-Treme X-Men การครอสโอเวอร์จบลงด้วยการทำลายล้างจักรวาล AoA อย่างเห็นได้ชัด สมาชิกทีม X-Treme X-Men ที่รอดชีวิต ได้แก่ แดซเลอร์ เซจ ฮาวเล็ตต์ และคอร์ปอรัลซัมเมอร์ส ยังคงอยู่บน Earth-616 ^{[ 4 ]}