โปรโตพาร์โวไวรัส
| โปรโตพาร์โวไวรัส | |
|---|---|
| ภาพถ่ายอิเล็กตรอนไมโครสโคปของไวรัสพาร์โวในสุนัข | |
| การจำแนกประเภทไวรัส | |
| (ไม่จัดอันดับ): | ไวรัส |
| อาณาจักร: | ฟลอโรวิเรีย |
| อาณาจักร: | โชโตคุวิเร |
| ไฟลัม: | คอสซาวีริโคตา |
| ระดับ: | ควินโตไวริเซเตส |
| คำสั่ง: | พิคโคไวรัลส์ |
| ตระกูล: | พาร์โวไวรัส |
| อนุวงศ์: | พาร์โววิรินาอี |
| ประเภท: | โปรโตพาร์โวไวรัส |
| ชนิด[ 1 ] | |
Protoparvovirusเป็นสกุลของไวรัสใน วงศ์ย่อย Parvovirinaeของวงศ์ไวรัส Parvoviridae [ 2 ] [ 3 ]สัตว์มีกระดูกสันหลังเป็นโฮสต์ตามธรรมชาติ มี 23 สปีชีส์ในสกุลนี้ [ 4 ]รวมถึง Protoparvovirus rodent1 ซึ่งไวรัสตัวอย่างคือไวรัสขนาดเล็กของหนู (MVM) สกุลนี้ยังรวมถึงไวรัสพาร์โวของสุนัข (CPV) ซึ่งทำให้เกิดความเสียหายต่อระบบทางเดินอาหารในลูกสุนัขซึ่งมีอัตราการตายประมาณ 80% [ 5 ]และไวรัสพาร์โวของสุกร (PPV) ซึ่งเป็นสาเหตุสำคัญของการตายของทารกในครรภ์และภาวะมีบุตรยากในสุกร [ 1 ]สกุลนี้แบ่งตามวิวัฒนาการออกเป็นสองสาขา สาขาหนึ่งประกอบด้วยสมาชิกผู้ก่อตั้งวงศ์จำนวนมาก เช่น MVM, CPV และ PPV ซึ่งได้รับการศึกษาอย่างละเอียด และสาขาที่สองประกอบด้วยไวรัสที่คาดการณ์ไว้เท่านั้น ซึ่งลำดับรหัสพันธุกรรมได้รับการระบุเมื่อเร็ว ๆ นี้ในธรรมชาติโดยใช้วิธีการค้นพบไวรัส แต่ชีววิทยาของไวรัสเหล่านี้ยังไม่ได้รับการสำรวจมากนัก ปัจจุบันสาขาที่สองนี้ประกอบด้วยสองสปีชีส์ที่สมาชิกติดเชื้อในมนุษย์ เรียกว่า Protoparvovirus primate1และ Protoparvovirus primate3จนถึงปี 2014 สกุลนี้เรียกว่า Parvovirus แต่ได้เปลี่ยนชื่อเพื่อขจัดความสับสนระหว่างสมาชิกของสกุลนี้กับ สมาชิกของวงศ์ Parvoviridae ทั้งหมด [ 6 ] [ 7 ]
อนุกรมวิธาน
มีการระบุชนิดพันธุ์ 23 ชนิด โดยหลายชนิดมีไวรัส สายพันธุ์ไวรัส จีโนไทป์ หรือซีโรไทป์ที่มีชื่อเรียกหลายชนิด เมื่อนำมาใช้กับไวรัสนิยามของชนิดพันธุ์จะค่อนข้างแปลก[ 8 ]มันเป็นเพียงแนวคิดทางอนุกรมวิธานเชิงนามธรรมที่จัดกลุ่มตัวแปรทางพันธุกรรมที่เลือกไว้ ช่วยในการแยกแยะสาขาในสายวิวัฒนาการ แต่ไม่ใช่สิ่งที่เป็นรูปธรรมเหมือนไวรัสที่สามารถติดเชื้อในสัตว์หรือแยกได้[ 9 ]หากระดับความหลากหลายที่ใช้ในการกำหนดชนิดพันธุ์ถูกตั้งไว้ต่ำมาก หลายชนิดจะมีไวรัสเพียงชนิดเดียว และไวรัสและชนิดพันธุ์อาจได้รับชื่อเดียวกัน ส่งผลให้เกิดความสับสนระหว่างสองแนวคิดในวรรณกรรม และลดบทบาททางวิวัฒนาการของกลุ่มอนุกรมวิธานชนิดพันธุ์ เพื่อแก้ไขปัญหานี้ ระดับความหลากหลายที่ยอมรับในปัจจุบันสำหรับชนิดพันธุ์ในParvoviridaeจึงค่อนข้างกว้าง: ชนิดพันธุ์ถูกกำหนดให้เป็นกลุ่มของไวรัสที่คล้ายคลึงกันซึ่งเข้ารหัสโปรตีนการจำลองแบบเฉพาะ ซึ่งโดยทั่วไปเรียกว่า NS1 ซึ่งมีความเหมือนกันอย่างน้อย 85% กับโปรตีนที่เข้ารหัสโดยสมาชิกอื่น ๆ ของชนิดพันธุ์[ 6 ] [ 7 ]
สกุลนี้ประกอบด้วยสปีชีส์ต่อไปนี้ โดยระบุชื่อวิทยาศาสตร์และตามด้วยไวรัสตัวอย่างของสปีชีส์: [ 4 ] [ 10 ]
- Protoparvovirus carnivoran1หรือพาร์โวไวรัสในสุนัข ; สายพันธุ์นี้ยังประกอบด้วยพาร์โวไวรัสในแมว ด้วย
- โปรโตพาร์โวไวรัส คาร์บอนิคัล 2 ( ไวรัสพาร์โวของนากทะเล)
- โปรโตพาร์โวไวรัส คาร์ปิทัล 3 , ไวรัสบูฟาในสุนัข
- โปรโตพาร์โวไวรัส คาร์โบนา 4 , พาร์โวไวรัสสุนัขจิ้งจอก
- โปรโตพาร์โวไวรัส คาร์ปิรัล 5 นิวลาไวรัส
- Protoparvovirus carnivoran6 , ParvoviridaeDogfe372C6
- Protoparvovirus carnivoran7 , ParvoviridaeDogfe373C1
- Protoparvovirus carnivoran8 , ParvoviridaeDogfe342C1
- Protoparvovirus chiropteran1 , Megabat bufavirus 1
- Protoparvovirus chiropteran2 , Bat parvovirus BtPk-PV/Switzerland/2019
- โปรโตพาร์โวไวรัส eulipotyphla1 , Mpulungu bufavirus
- โปรโตพาร์โวไวรัส อินเซอร์ตัม 1 , ทูซาไวรัส
- Protoparvovirus pinniped1 , California sea lion parvovirus Hanchett
- โปรโตพาร์โวไวรัส ไพรเมต 1 , บูฟาไวรัส 1a
- โปรโตพาร์โวไวรัส ไพรเมต 2 , ไวรัสพาร์โวไวรัส 1 ของอู่ฮั่น
- โปรโตพาร์โวไวรัส ไพรเมต 3 , คูตาไวรัส
- โปรโตพาร์โวไวรัสในหนู 1 , ไวรัสขนาดเล็กในหนู
- โปรโตพาร์โวไวรัสในสัตว์ฟันแทะ 2 , พาร์โวไวรัสในหนู 1
- Protoparvovirus rodent3, Rat bufavirus SY-2015
- Protoparvovirus ungulate1, Porcine parvovirus
- Protoparvovirus ungulate2, Porcine bufavirus
- Protoparvovirus ungulate3, Equine protoparvovirus
- Protoparvovirus ungulate4, Porcine parvovirus 8
Protoparvoviruses that infect humans were first discovered in 2012 in the feces of children from Burkina Faso, and named using the siglum bufavirus.[11] Three genotypes of bufaviruses have so far been detected, circulating in Tunisia, Finland[12] and Bhutan[13]
A second virus in this genus that infects humans —cutavirus— was initially isolated from the feces of children with diarrhea.[14]
A third potential human protoparvovirus —tusavirus 1— has been reported in the feces of a single human, but whether or not it is able to infect humans or was simply ingested remains to be clarified.[15]
Structure
Viruses in genus Protoparvovirus have non-enveloped protein capsids around 18–26 nm in diameter, which show T=1 icosahedral symmetry. Genomes are single-stranded linear DNA between 4–6kb in length, with small (100–500b) imperfect palindromic sequences at each terminus that fold to form distinctive duplex hairpin telomeres.[5]
| Genus | Structure | Symmetry | Capsid | Genomic arrangement | Genomic segmentation |
|---|---|---|---|---|---|
| Protoparvovirus | Icosahedral | T=1 | Non-enveloped | Linear ssDNA | No |
The capsid is thought to be made up of 60 VP proteins (PDB: 2CAS), both VP1 and VP2.
Genomic organization
The Protoparvovirus genome has two ORFs. The non-structural ORF (NS) is the "first" on the 5' side, with the structural (VP) on the 3' end. The genome is expressed by extensive alternative splicing. This not only allows for VP to be expressed, but also produces multiple alternatively spliced versions of each ORF, typically called NS1, NS2(P,Y,L), VP1, and VP2.[5] Some examples of annotated proteins from UniProt are:
- NS1 of the Minute virus of mice (MVM), P03134
- NS2 of MVM, P0DJZ2
- VP1 of canine parvovirus (CPV), P17455
- VP2 of CPV, P61826
Life cycle
การจำลองแบบของไวรัสเกิดขึ้นในนิวเคลียส การเข้าสู่เซลล์โฮสต์ทำได้โดยการเกาะติดกับตัวรับของโฮสต์ ซึ่งเป็นตัวกลางในการดูดซึมเข้าสู่เซลล์โดยใช้คลัทริน การจำลองแบบเป็นไปตามแบบจำลองลูกกลิ้งผมเปีย ในบางคู่ของไวรัส/เซลล์โฮสต์ ไวรัสรุ่นลูกสามารถเคลื่อนที่ผ่านไซโตพลาซึมในถุงเวสิเคิลและถูกปล่อยออกจากเซลล์โฮสต์ดั้งเดิมก่อนที่เซลล์จะตาย ในขณะที่ไวรัสที่เหลือจะถูกปล่อยออกมาหลังจากเซลล์แตกสลาย ปัจจุบันเป็นที่ทราบกันว่าสัตว์มีกระดูกสันหลังจาก 6 อันดับทำหน้าที่เป็นโฮสต์ตามธรรมชาติ เส้นทางการแพร่กระจายโดยทั่วไปคือทางอุจจาระ-ปากและ/หรือทางระบบทางเดินหายใจ[ 5 ]
| ประเภท | รายละเอียดโฮสต์ | การมุ่งเป้าไปยังเนื้อเยื่อ | รายละเอียดการลงทะเบียน | รายละเอียดการเผยแพร่ | ไซต์จำลอง | สถานที่ประกอบการ | การแพร่เชื้อ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| โปรโตพาร์โวไวรัส | สัตว์มีกระดูกสันหลัง | ตัวแปร | เอนโดไซโทซิส | การส่งออกเวสิเคิลระยะแรก/การแตกตัวของเซลล์ | นิวเคลียส | นิวเคลียส | อุจจาระ-ปาก หรือทางเดินหายใจ |
ประวัติศาสตร์
ไวรัสหนู Kilham ซึ่งแยกได้ในปี พ.ศ. 2492 [ 16 ]เป็นสมาชิกตัวแรกของตระกูลไวรัส DNA สายเดี่ยวขนาดเล็กเชิงเส้นนี้ที่ได้รับการระบุ
ในช่วงหลายปีต่อมา ไวรัสที่มีลักษณะทางกายภาพคล้ายกันหลายชนิด รวมถึง H1, LuIII, ไวรัสขนาดเล็กของหนู และไวรัสเนื้องอก X ถูกแยกออกมาจากเซลล์หรือเนื้อเยื่อที่ใช้เป็นประจำในห้องปฏิบัติการวิจัย[ 17 ]และไวรัสพาร์โวของสุกร (PPV) ซึ่งเป็นสาเหตุสำคัญประการหนึ่งของความล้มเหลวในการสืบพันธุ์ในสุกร ถูกแยกได้จากสุกรที่ติดเชื้อ[ 18 ]ในปี พ.ศ. 2514 ไวรัสเหล่านี้ทั้งหมดได้รับการยอมรับว่าเป็นส่วนหนึ่งของสกุลทางอนุกรมวิธานที่เรียกว่าParvovirusในรายงานฉบับแรกของคณะกรรมการระหว่างประเทศว่าด้วยการจำแนกประเภทของไวรัส (ICTV) ที่เพิ่งก่อตั้งขึ้นใหม่[ 19 ]
รายงาน ICTV ฉบับที่สองที่ตีพิมพ์ในปี 1976 ได้กำหนดวงศ์Parvoviridaeซึ่งในขณะนั้นประกอบด้วยสามสกุล โดยสกุลหนึ่งยังคงใช้ชื่อParvovirusและมีไวรัสทั้งหมดที่กล่าวมาข้างต้นรวมถึงไวรัสโรคไข้หวัดแมว (ปัจจุบันเรียกว่าไวรัสพาร์โวแมวหรือ FPV) ซึ่งแสดงให้เห็นว่าก่อให้เกิดการระบาดของโรคลำไส้อักเสบ โรคไข้หวัด และโรคสมองน้อยผิดปกติแต่กำเนิดในแมวบ้าน ในปี 1978 ไวรัสจากสายพันธุ์เดียวกันกับ FPV ได้ปรากฏขึ้นซึ่งสามารถติดเชื้อในสุนัขได้ (เรียกว่าไวรัสพาร์โวสุนัขหรือ CPV) ซึ่งแพร่กระจายไปทั่วโลกอย่างรวดเร็ว ทำให้เกิดการระบาดใหญ่ของโรคลำไส้และหลอดเลือดหัวใจที่รุนแรง[ 20 ]
สกุลParvovirusยังคงมีไวรัสใหม่ๆ เกิดขึ้นเรื่อยๆ จนถึงปี 2014 เมื่อมีการเปลี่ยนชื่อเป็นProtoparvovirus [ 6 ] [ 7 ]
ลิงก์ภายนอก
- ไวรัลโซน : โปรโตพาร์โวไวรัส
- ไอซีทีวี