Warming ย้าย  จากNykøbing FC ไป Brøndby IFในเดือนมิถุนายน 2015 ตอนอายุ 15 ปี^{[ 4 ]}

Magnus Warming ประเดิมสนามให้กับ Brøndby IF เมื่ออายุ 16 ปี 348 วัน ถือเป็นผู้เล่นที่อายุน้อยที่สุดในประวัติศาสตร์ของสโมสร โดยเขาถูกส่งลงสนามในช่วง 10 นาทีสุดท้ายในเกมที่แพ้SønderjyskE ไป 3-0 เมื่อวันที่ 21 พฤษภาคม 2017 ^{[ 5 ]}สถิตินี้ถูกทำลายโดยMorten Frendrupซึ่งประเดิมสนามเมื่ออายุ 16 ปี 310 วัน ในปี 2018 ^{[ 6 ]}

เมื่อวันที่ 11 มกราคม 2019 Warming กลับไปที่ Nykøbing FC ด้วยสัญญายืมตัวจนจบปี 2019 ^{[ 7 ]} Warming ลงเล่นในลีก 9 นัดและทำประตูได้ 1 ประตูให้กับ Nykøbing ในฤดูกาล 2018–19เขากลับไปที่ Brøndby และฝึกซ้อมกับสโมสรในช่วงสองสามสัปดาห์แรกของช่วงปรีซีซั่น 2019–20 ก่อนจะกลับไปที่ Nykøbing ในเดือนกรกฎาคมเพื่อทำสัญญายืมตัวให้เสร็จสิ้น^{[ 8 ]}

เมื่อวันที่ 7 มกราคม 2020 Warming ได้เซ็นสัญญากับLyngby Boldklub [ ^{9 ] เขา}สร้างความประทับใจในหลายโอกาส โดยเฉพาะอย่างยิ่งการทำประตูสำคัญในช่วงครึ่งหลังของฤดูกาล 2020–21 ^{[ 10 ] [ 11 ]}เขาตกชั้นไปเล่นในลีกสูงสุดของเดนมาร์กเมื่อวันที่ 9 พฤษภาคม 2021 หลังจากแพ้ให้กับAC Horsensทีม อันดับสุดท้าย ^{[ 12 ]}เมื่อวันที่ 12 พฤษภาคม 2021 มีการประกาศว่า Warming ปฏิเสธข้อเสนอการย้ายทีมจากBodø/Glimtแชมป์ เก่าของนอร์เวย์ ^{[ 13 ] [ 14 ]}

เมื่อวันที่ 9 กรกฎาคม 2021 มีการประกาศว่า Warming ได้เซ็นสัญญาสามปีกับสโมสรโตริโนในเซเรียอา^{[ 15 ] [ 16 ]} เขาลงเล่นนัดแรกเมื่อวันที่ 17 ตุลาคม ในเกมที่แพ้ นาโปลี 1-0 นอกบ้าน โดยลงมาเป็นตัวสำรองในช่วงท้ายเกมแทนเบน ลาสซีน โคเน^{[ 17 ]}

เมื่อวันที่ 21 กรกฎาคม 2023 สโมสรBrann ใน Eliteserienประกาศเซ็นสัญญากับ Warming เป็นเวลาสี่ปีครึ่ง^{[ 21 ]}โดยมีค่าตัวประมาณ 8 ล้านโครนนอร์เวย์ (700,000 ยูโร) ^{[ 22 ]}ทำให้เขาเป็นนักเตะที่ Brann ซื้อมาด้วยราคาแพงที่สุดนับตั้งแต่Daouda Bambaในปี 2018 ^{[ 22 ]} การย้ายทีมครั้งนี้ทำให้ Warming ได้ร่วมทีมกับ Svenn Croneอดีตเพื่อนร่วมทีมจาก Brøndby และ Lyngby รวมถึงJaphet Sery Larsenอดีตเพื่อนร่วมทีมชาติเดนมาร์กชุดอายุไม่เกิน 21 ปี^{[ 21 ]}

เขาได้รับบาดเจ็บที่กล้ามเนื้อในเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2566 ทำให้ต้องพักรักษาตัวเป็นเวลาหลายสัปดาห์^{[ 23 ]}