มานูเอล มูฮี จบการศึกษาจากมหาวิทยาลัยโพลีเทคนิคแห่งฟิลิปปินส์ในปี 1988 และได้รับใบอนุญาตเป็นวิศวกรโยธาในปีถัดมา เขาได้รับปริญญาโทสาขาวิศวกรรมขนส่งและถนนจากสถาบันระหว่างประเทศเพื่อโครงสร้างพื้นฐาน โดยเน้นด้านวิศวกรรมขนส่ง ไฮดรอลิก และวิศวกรรมสิ่งแวดล้อม ที่มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีแห่งเดลฟท์ (ปี 2000) ประเทศเนเธอร์แลนด์ ต่อมาเขาได้เข้าร่วมโครงการแลกเปลี่ยนนักวิทยาศาสตร์วิจัยของสถาบันเทคโนโลยีโตเกียว ตั้งแต่เดือนมิถุนายนถึงกันยายน ปี 2001 หลังจากนั้นเขาได้รับปริญญาเอกด้านเทคโนโลยีจากมหาวิทยาลัยเทคโนโลยีแห่งฟิลิปปินส์ในปี 2008

มูฮีได้รับปริญญาเอกบริหารด้านความเป็นผู้นำทางการศึกษาจากสถาบันพัฒนาแห่งฟิลิปปินส์ความเชี่ยวชาญของเขาได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวางในฟิลิปปินส์และต่างประเทศ และยังเป็นวิศวกรอาเซียน ที่ขึ้นทะเบียนอีกด้วย ^{[ 3 ]}เขายังเป็นสมาชิกกิตติมศักดิ์ของสถาบันวิศวกรแห่งราชอาณาจักรสิงคโปร์ และเป็นสมาชิกสภาที่ปรึกษาของตำรวจแห่งชาติฟิลิปปินส์เขาได้ตีพิมพ์บทความวิจัย บทความ และการพัฒนาทางเทคนิคหลายฉบับผ่านเอกสารและงานประชุมต่างๆ หนึ่งในนั้นคือ "การเข้าถึงระบบขนส่งทางรางของเมโทรมานิลา" สำหรับการประชุมวิชาการนานาชาติด้านวิศวกรรมสิ่งแวดล้อมของสมาคมส่งเสริมวิทยาศาสตร์แห่งญี่ปุ่น - DOST และการประชุมวิชาการระดับภูมิภาคครั้งที่ 5 ด้านการพัฒนาโครงสร้างพื้นฐานในวิศวกรรมโยธา อีกเรื่องหนึ่งคือ "ผลกระทบของการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิในสะพานคานกล่องเหล็ก" สำหรับสมาคมส่งเสริมวิทยาศาสตร์แห่งญี่ปุ่น วารสารวิศวกรรมสิ่งแวดล้อม และเรื่องที่สามคือ "การประเมินการกระจายตัวของคาร์บอนมอนอกไซด์บนถนนในเมือง" ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของเอกสารทางเทคนิคของการประชุมนานาชาติครั้งที่ 5 ด้านวิศวกรรมโยธา^{[ 4 ] [ 5 ]}

ตั้งแต่ปี 1996 ถึง 2004 มูฮีดำรงตำแหน่งประธานภาควิชาวิศวกรรมโยธาของ PUP ตั้งแต่ปี 2006 ถึง 2012 เขาดำรงตำแหน่งคณบดีวิทยาลัยวิศวกรรมศาสตร์ ตั้งแต่ปี 2012 ถึง 2015 เขาเป็นรองอธิการบดีฝ่ายวิจัย การขยายผล การวางแผน และการพัฒนาของ PUP เขาเป็นรองอธิการบดีฝ่ายวิชาการของ PUP ตั้งแต่เดือนธันวาคม 2015 และตั้งแต่ปี 2018 ถึง 2019 เขายังดำรงตำแหน่งรองอธิการบดีบริหารอีกด้วย^{[ 6 ]}