อากูญาเริ่มฝึกฝนด้านกีฬาที่สโมสรดอนบอสโกในบ้านเกิดของเขา ในเวลานั้นเขาเล่นในตำแหน่งวิงแบ็กซ้าย [ ^{2 ] ผล}งานที่ดีของเขาทำให้เขาได้รับความสนใจจากแมวมองที่เชิญเขาไปทดสอบฝีมือที่สโมสรต่างๆ ในบัวโนสไอเรส ดังนั้นเมื่ออายุ 13 ปี เขาจึงไปทดสอบฝีมือกับ โบคาจูเนียร์สและซานลอเรนโซเดอัลมาโกรแต่ก็ไม่ได้อยู่กับ ทีม สี่ปีต่อมาเขาไปทดสอบฝีมือกับกิลเมสริเวอร์เพลทและติเกรก่อนที่จะถูกเฟอร์โรการ์ริลโอเอสเตดึงตัวไป ในที่สุด หลังจากเล่นใน ทีมสำรองของเฟอร์โรมาหลายฤดูกาลเขาก็ได้รับการเลื่อนชั้นขึ้นสู่ทีมชุดใหญ่ เขาประเดิมสนามในปี 2009 ในการแข่งขันพรีเมรา บี นาซิอองนาลโดยเล่นในตำแหน่งปีกภายใต้โค้ชโฆเซ มาเรีย เบียนโก ในฤดูกาล 2013–14เขาโดดเด่นในเรื่องความสามารถในการช่วยเหลือเพื่อนร่วมทีม โดยทำแอสซิสต์ได้ถึง 12 ครั้ง ซึ่งดึงดูดความสนใจจากสโมสรใหญ่ๆ ที่เฟอร์โร อากูนาลงเล่นทั้งหมด 117 นัด ทำได้ 5 ประตูและ 23 แอสซิสต์^{[ 3 ]}

เมื่อวันที่ 18 กรกฎาคม 2557 อากูนาได้ย้ายไปร่วมทีมราซิง คลับด้วยค่าตัวสุทธิ 4,900,000 เปโซ โดยได้สิทธิ์ในการซื้อหุ้น 50% พร้อมออปชั่นซื้อเพิ่มอีก 25% ในราคา 750,000 ดอลลาร์สหรัฐ เมื่อวันที่ 27 กรกฎาคม 2557 เขาลงเล่นเกมแรกให้กับทีมราซิงในรอบน็อกเอาต์ของศึกโคปา อาร์เจนตินา ฤดูกาล 2013–14พบกับซาน มาร์ติน เด ซาน ฮวนซึ่งเขาทำประตูชัยด้วยลูกโหม่งให้ราซิงเอาชนะไป 1-0 ต่อมาในปีเดียวกันนั้น เขาเป็นส่วนหนึ่งของทีมราซิงที่คว้าแชมป์อาร์เจนตินา พรีเมรา ดิวิซิออน ฤดูกาล 2014เป็นการยุติสถิติไร้แชมป์ 13 ปีของทีมจากอาเวลลาเนดา โดยอากูนาลงเล่น 15 นัดและทำได้ 2 ประตู

เมื่อวันที่ 12 มิถุนายน 2017 ประธานสโมสร Racing อย่าง Víctor Blanco ยืนยันว่า Acuña จะออกจากสโมสรไปเล่นให้กับSporting CP [ ^{4 ] เขา}ประเดิมสนามให้กับทีมโปรตุเกสในเกมเยือนที่ชนะDesportivo Aves 2-0 เมื่อวันที่ 15 พฤษภาคม 2018 Acuña และเพื่อนร่วมทีมหลายคน รวมถึงโค้ช ได้รับบาดเจ็บจากการถูกโจมตีโดยแฟนบอล Sporting ประมาณ 50 คน ที่สนามฝึกซ้อมของสโมสร หลังจากที่ทีมจบอันดับสามในลีกและพลาดการผ่านเข้ารอบ UEFA Champions League ^{[ 5 ] [ 6 ]}แม้จะถูกโจมตี แต่เขากับทีมที่เหลือก็ตกลงที่จะเล่นในรอบชิงชนะเลิศฟุตบอลถ้วยโปรตุเกสที่กำหนดไว้ในสุดสัปดาห์ถัดไป^{[ 7 ]}ในที่สุดก็แพ้ให้กับCD Aves

เมื่อวันที่ 14 กันยายน 2020 อากูนาได้เข้าร่วมสโมสรเซบียา ของสเปน ด้วยสัญญา 4 ปี^{[ 8 ]}เมื่อวันที่ 7 พฤศจิกายน 2021 อากูนาทำประตูแรกในลีกฤดูกาล 2021–22 ในเกมดาร์บี้แมตช์ที่เซบียาชนะเรอัล เบติส 2–0 ^{[ 9 ]} เมื่อวันที่ 13 กุมภาพันธ์ 2021 เขาได้ต่อสัญญากับเซบียาจนถึงปี 2025

ระหว่างการแข่งขันระหว่างเซบีย่ากับเกตาเฟ่เมื่อวันที่ 30 มีนาคม 2024 อากูนาตกเป็นเหยื่อของการตะโกนเหยียดเชื้อชาติจากด้านหลังม้านั่งโค้ช ส่งผลให้เกตาเฟ่ถูกสั่งให้ปิดบางส่วนของสนามเป็นเวลา 3 นัด^{[ 10 ]}

เมื่อวันที่ 18 สิงหาคม เซบีย่าและริเวอร์เพลทเริ่มเจรจาเรื่องการย้ายทีมของอคูญา การซื้อขายเสร็จสิ้นลงด้วยค่าตัวกว่าสามล้านยูโรเพื่อซื้อสิทธิ์ในตัวนักเตะทั้งหมด โดยมีสัญญาถึงเดือนธันวาคม 2027 และเมื่อวันที่ 20 สิงหาคม อคูญาได้รับการเปิดตัวอย่างเป็นทางการในฐานะนักเตะใหม่ของริเวอร์เพลท

ณ วันที่แข่งขัน 24 พฤศจิกายน 2025 ^{[ 21 ]}

ณ วันที่แข่งขัน 27 มีนาคม 2026 ^{[ 22 ]}