โครมาโทแกรมมวลเป็นการแสดงข้อมูลสเปกโทรเมตรีมวล ในรูป แบบโครมาโทแกรมโดยแกน xแสดงถึงเวลาและแกน y แสดงความเข้มของสัญญาณ^{[ 1 ]}ข้อมูลต้นฉบับประกอบด้วยข้อมูลมวล อย่างไรก็ตาม ข้อมูลมวลไม่ได้ถูกแสดงในโครมาโทแกรมมวลในรูปแบบกราฟิก แต่จะแสดงความเข้มของสัญญาณเทียบกับเวลาแทน การใช้งานที่พบบ่อยที่สุดของการแสดงข้อมูลนี้คือเมื่อใช้สเปกโทรเมตรีมวลร่วมกับโครมาโทกราฟีรูป แบบใดรูปแบบหนึ่ง เช่น ในโครมาโทกราฟีของเหลว-สเปกโทรเมตรีมวลหรือโครมาโทกราฟีแก๊ส-สเปกโทรเมตรีมวลในกรณีนี้ แกน x แสดงถึงเวลาการคงอยู่ คล้ายกับโครมาโทแกรมอื่นๆ แกน y แสดงความเข้มของสัญญาณหรือความเข้มของสัญญาณสัมพัทธ์ มีเมตริกหลายประเภทที่ความเข้มนี้อาจแสดง ขึ้นอยู่กับข้อมูลที่สกัดจากสเปกตรัมมวลแต่ละรายการ

โครมาโตแกรมกระแสไอออนรวม (TICC) แสดงถึงความเข้มรวมตลอดช่วงมวลทั้งหมดที่ตรวจพบในทุกจุดของการวิเคราะห์^{[ 2 ] [ 3 ]}โดยทั่วไปช่วงจะมีหน่วยมวลต่อประจุหลายร้อยหน่วยหรือมากกว่านั้น ในตัวอย่างที่ซับซ้อน TICC มักให้ข้อมูลที่จำกัด เนื่องจากสารวิเคราะห์หลายชนิดถูกชะออกมาพร้อมกัน ทำให้ไม่สามารถระบุชนิดแต่ละชนิดได้

โครมาโตแกรมพีคฐานคล้ายกับ TICC แต่จะตรวจสอบเฉพาะพีคที่มีความเข้มสูงสุดในแต่ละสเปกตรัมเท่านั้น^{[ 4 ] [ 3 ]}ซึ่งหมายความว่าโครมาโตแกรมพีคฐานแสดงถึงความเข้มของพีคที่มีความเข้มสูงสุดในทุกจุดของการวิเคราะห์ โครมาโตแกรมพีคฐานมักจะมีลักษณะที่สะอาดกว่าและให้ข้อมูลมากกว่าโครมาโตแกรม TIC เนื่องจากพื้นหลังลดลงโดยการมุ่งเน้นไปที่สารวิเคราะห์ เพียงตัวเดียว ในทุกจุด

ในโครมาโทแกรมไอออนที่สกัด (EIC หรือ XIC) หรือที่เรียกว่าโครมาโทแกรมไอออนที่สร้างใหม่ (RIC) ค่า m/z หนึ่งค่าหรือมากกว่าที่แสดงถึงสารวิเคราะห์ที่สนใจหนึ่งตัวหรือมากกว่าจะถูกกู้คืน ('สกัด') จากชุดข้อมูลทั้งหมดสำหรับการวิเคราะห์โครมาโทกราฟี^{[ 3 ]}ความเข้มรวมหรือความเข้มของพีคฐานภายในช่วงความคลาดเคลื่อนของมวลรอบอัตราส่วนมวลต่อประจุ ของสารวิเคราะห์เฉพาะ จะถูกพล็อตที่ทุกจุดในการวิเคราะห์ ขนาดของช่วงความคลาดเคลื่อนของมวลโดยทั่วไปขึ้นอยู่กับความแม่นยำของมวลและความละเอียดของมวลของเครื่องมือที่รวบรวมข้อมูล สิ่งนี้มีประโยชน์สำหรับการตรวจสอบข้อมูลซ้ำเพื่อตรวจจับสารวิเคราะห์ที่ไม่เคยคาดคิดมาก่อน เพื่อเน้นไอโซเมอร์ที่อาจเกิดขึ้น แก้ไขสารที่สงสัยว่ามีการชะล้างร่วมกัน หรือเพื่อให้ได้โครมาโทแกรมที่ชัดเจนของสารประกอบที่สนใจ โครมาโทแกรมไอออนที่สกัดจะถูกสร้างขึ้นโดยการแยกไอออนที่สนใจออกจากไฟล์ข้อมูลที่มีสเปกตรัมมวลทั้งหมดในช่วงเวลาหลังจากนั้น สิ่งนี้แตกต่างจากโครมาโทแกรมไอออนที่เลือก ซึ่งจะกล่าวถึงต่อไป โดยที่ข้อมูลจะถูกรวบรวมเฉพาะสำหรับค่า m/z ที่เฉพาะเจาะจงเท่านั้น คำที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดคือโครมาโทแกรมสารประกอบที่สกัด (ECC)

โค รมาโตแก รมการตรวจสอบไอออนที่เลือก (SIM) คล้ายกับ EIC/XIC ยกเว้นว่าเครื่องแมสสเปกโทรเมตรีทำงานในโหมด SIM ดังนั้นจึงตรวจจับเฉพาะค่า m/z ที่เลือกไว้ล่วงหน้าในการวิเคราะห์^{[ 5 ]}การทดลอง SIM สามารถทำได้โดยใช้เครื่องแมสสเปกโทรเมตรี (MS) หรือเครื่องแมสสเปกโทรเมตรีแบบคู่ (MS/MS) ซึ่งพบได้บ่อยกว่าในเครื่อง MS สิ่งนี้แตกต่างอย่างมากจากโครมาโตแกรมไอออนที่สกัดที่กล่าวถึงข้างต้นตรงที่ในการทดลอง SIM จะเก็บข้อมูลเฉพาะไอออนที่สนใจเท่านั้น สำหรับโครมาโตแกรมไอออนที่สกัด (EIC หรือ XIC) จะเก็บข้อมูลในช่วงมวลทั้งหมดในระหว่างการทำงานและตรวจสอบหาตัววิเคราะห์ที่สนใจหลังจากเสร็จสิ้นการทำงาน

การ ทดลอง การติดตามปฏิกิริยาที่เลือก (SRM) คล้ายกับการทดลอง SIM มาก ยกเว้นว่าใช้สเปกโทรเมตรีมวลแบบคู่ขนาน และตรวจจับไอออนผลิตภัณฑ์เฉพาะของไอออนหลักเฉพาะ ^{[ 3 ]}มวลของสารวิเคราะห์หลักจะถูกเลือกก่อน ในขณะที่ไอออนอื่นๆ จะถูกกรองออกไป จากนั้นไอออนของสารวิเคราะห์หลักจะถูกแตกตัวในเฟสแก๊ส และไอออนชิ้นส่วนเฉพาะจะถูกติดตาม การทดลองนี้มีความจำเพาะสูงมาก เนื่องจากโครมาโตแกรม SRM แสดงเฉพาะไอออนที่มีมวลเฉพาะที่แตกตัวในลักษณะที่สร้างมวลผลิตภัณฑ์ที่เฉพาะเจาะจงมาก การทดลองประเภทนี้สามารถทำได้โดยใช้สเปกโทรเมตรีมวลแบบคู่ขนานเท่านั้น ความก้าวหน้าทางเทคโนโลยีในด้าน MS/MS นำไปสู่การพัฒนา MRM (Multiple Reaction Monitoring) ซึ่งช่วยให้สามารถตรวจจับสารวิเคราะห์ที่แยกตัวออกมาพร้อมกันหลายตัวที่มีไอออนหลักและ/หรือไอออนผลิตภัณฑ์ที่แตกต่างกันได้

• สเปกตรัมมวล