ดันนิแกนเริ่มต้นอาชีพในซีเอฟแอลในปี 1983กับทีมเอ็ดมอนตัน เอสกิโมส์ใน ฤดูกาล แรก ของเขา เขาเป็นตัวสำรองของ วอร์เร นมูน

ก่อน ฤดูกาล CFL ปี 1984มูนได้ย้ายไปเล่นให้กับฮิวสตัน ออยเลอร์สในNFLและทีมเอสกิโมส์ก็กลายเป็นทีมของดันนิแกน ในปีนั้น เขาได้รับการเสนอชื่อเป็นผู้เล่นยอดเยี่ยมที่สุดของเอ็ดมอนตัน ดันนิแกนอยู่อันดับที่สี่ใน CFL ในด้านการส่งบอล อันดับที่สี่ในการวิ่ง และสร้างสถิติ CFL สำหรับระยะวิ่งสูงสุดของควอเตอร์แบ็กในหนึ่งฤดูกาล (732) ซึ่งเป็นสถิติที่ถูกทำลายไปแล้วในภายหลัง

ในปี 1985ดันนิแกนได้รับการเสนอชื่อให้เป็นผู้เล่นที่โดดเด่นที่สุดของเอ็ดมอนตันเป็นปีที่สองติดต่อกัน และยังได้รับเลือกเป็นออลสตาร์ฝั่งตะวันตกของ CFL และออลสตาร์ของ CFL อีกด้วย

เขาพาทีมเอสกิโมส์เข้าชิงถ้วยเกรย์คัพ สองปีติดต่อกัน ในปี 1986และ1987 โดยคว้าแชมป์ได้ในปี 1987 แต่เขาต้องนั่งดูเกมส่วนใหญ่จากข้างสนามเนื่องจากอาการบาดเจ็บ ตัวสำรองของเขาในช่วงเวลานั้นคือ เดมอน อัลเลนซึ่งกำลังสร้างตำนานของซีเอฟแอลอีกคนหนึ่ง

หลังจาก คว้าแชมป์ เกรย์คัพครั้งที่ 75ดันนิแกนพยายามที่จะเข้าสู่เมเจอร์ลีกเบสบอลเขาทำงานร่วมกับแมวมองจากทีมแคลิฟอร์เนียแองเจิลส์จากนั้นก็ไปปรากฏตัวที่ฟลอริดาในช่วงฝึกซ้อมฤดูใบไม้ผลิเขาหวังที่จะได้ร่วมทีมมอนทรีออลเอ็กซ์โปส์เขาได้รับการเซ็นสัญญาระดับคลาสเอ แต่ก็ถูกปล่อยตัวในวันสุดท้ายของสัญญา

แม้ว่าเอ็ดมอนตันจะยังคงถือครองสิทธิ์ในตัวเขาอยู่ แต่พวกเขาก็แลกตัวเขากับบริติชโคลัมเบีย ไลออนส์ในเดือนมิถุนายนปี 1988โดยได้จิม แซนดัสกีและข้อตกลงในอนาคตมาแทน ข้อตกลงในอนาคตที่ทำให้การแลกเปลี่ยนเสร็จสมบูรณ์ในเดือนมกราคม ปี 1989 นั้นรวมถึงเจฟฟ์ บราส เวลล์ , เกร็ก สตูมอน , เรจจี เทย์เลอร์ , อังเดร ฟรานซิสและเลอรอย บลูห์ สิทธิ์ในการเลือกตัวรอบแรกของบริติชโคลัมเบียใน การดราฟต์ผู้เล่นจากวิทยาลัย CFL ปี 1989ดันนิแกนนำไลออนส์อยู่อันดับสามในดิวิชั่นตะวันตกด้วยสถิติ 10-8 บริติชโคลัมเบียเอาชนะซัสแคตเชวัน 42-18 ในรอบรองชนะเลิศตะวันตก ในรอบชิงชนะเลิศตะวันตก บริติชโคลัมเบียเอาชนะทีมที่แลกตัวดันนิแกนไปในเดือนมิถุนายนอย่างเอ็ดมอนตัน เอสกิโมส์ 37-19 นี่เป็นครั้งแรกที่เอสกิโมส์แพ้เกมเพลย์ออฟที่สนามคอมมอนเวลธ์สเตเดียม ใน เกม เกรย์คัพ บริติชโคลัมเบียแพ้ให้กับวินนิเป็ก 22-21 บริติชโคลัมเบียมีโอกาสที่จะชนะเกมในช่วงท้ายควอเตอร์ที่สี่ วินนิเป็กนำอยู่ 22–19 และบีซีกำลังตั้งเกมรุกอยู่ที่เส้น 7 หลาของวินนิเป็ก ดันนิแกนพยายามส่งบอลเข้าไปในเอนด์โซน แต่บอลถูกเดลเบิร์ต ฟาว เลอร์ปัด และถูกไมเคิล เกรย์ดัก รับได้

ในปี 1989ดันนิแกนอยู่ในทีมที่แพ้เป็นครั้งแรก และเป็นทีมที่พลาดการเข้าสู่รอบเพลย์ออฟ บีซีมีสถิติ 7–11 ในส่วนของผลงานส่วนตัว เขาทำสถิติสูงสุดในอาชีพในขณะนั้นด้วยการขว้างลูกทำทัชดาวน์ 27 ครั้ง และทำระยะขว้างเกิน 4,000 หลาเป็นครั้งแรก (4,509 หลา) เขาได้รับการเสนอชื่อเป็นผู้เล่นที่โดดเด่นที่สุดของบีซี อย่างไรก็ตามผู้บริหารชุด ใหม่ เข้ามา และดันนิแกนก็ต้องย้ายทีมอีกครั้ง

ในเดือนมีนาคมปี 1990ดันนิแกนถูกแลกตัวไปอยู่กับทีมโทรอนโต อาร์โกนอตส์ โดยแลก กับริค จอห์นสัน , วิลลี เพลส , โทนี วิสโก , เอมา นูเอล โทลเบิร์ต , ท็อดด์ ไวส์แมนและเจิร์ลด์ เบย์ลิส เมื่อเขามาถึงโทรอนโต พวกเขาได้เข้าสู่รอบเพลย์ออฟในปี 1990 แต่แพ้ในรอบชิงชนะเลิศของดิวิชั่น

อย่างไรก็ตามปี 1991พิสูจน์แล้วว่าเป็นปีที่น่าจดจำสำหรับ CFL และทีมอา ร์โกนอตส์ นักแสดงและนักแสดงตลกชาวแคนาดาจอห์น แคนดี้ร่วมกับนักฮอกกี้ผู้ยิ่งใหญ่เวย์น เกร็ต สกี และเจ้าของทีมลอสแอนเจลิส คิงส์บรูซ แม็คนอลซื้อทีมอาร์โกนอตส์ จากนั้น โตรอนโตก็สร้างความฮือฮาด้วยการเซ็นสัญญากับรากิบ "ร็อกเก็ต" อิสมาอิลนักรับจากนอเทรอดาม ร็อกเก็ต ร่วมกับดันนิแกน และไมเคิล "พินบอล" เคลมอนส์นักวิ่งนำโตรอนโตไปสู่สถิติ 13–5 หลังจากได้บายในรอบแรก อาร์โกนอต ส์เอาชนะวินนิเป็กต่อหน้าผู้ชมเต็มสนามสกายโดมและผ่านเข้ารอบเกรย์คัพ อย่างไรก็ตาม ในเกมเพลย์ออฟ นั้น ดันนิแกน กระดูกไหปลาร้าหัก เขาสามารถขว้างลูกได้ไกลเท่าห้องจัดเลี้ยงของโรงแรมหลังจากแพทย์ฉีดยาชาที่ไหล่ของเขา ในสภาพอากาศติดลบ 19 องศา เขาขว้างลูกทำทัชดาวน์ ได้สองครั้ง และคว้าแชมป์เกรย์คัพครั้งที่สองของเขา ดันนิแกนได้รับสถานะฟรีเอเจนต์ในเดือนกุมภาพันธ์ 1992

ในเดือนมิถุนายนปี 1992ดันนิแกนเซ็นสัญญากับทีมวินนิเป็ก บลูบอมเบอร์สซึ่งเขาใช้เวลาอยู่ที่นั่นสามปี ทีมบลูบอมเบอร์สได้เข้าชิงเกรย์คัพในปี 1992แต่ก็พ่ายแพ้ให้กับทีมคาลการี สแตมป์พีเดอร์สในเกมนั้น ดันนิแกนทำสถิติขว้างบอล 6 จาก 19 ครั้ง ได้ระยะ 47 หลา และไม่สามารถทำแต้มได้เลย เขาถูกเปลี่ยนตัวออกในช่วงท้ายเกมโดยแดนนี่ แม็คมานัสซึ่งทำแต้มได้ 10 คะแนน

ฤดูกาล1993เป็นฤดูกาลที่ประสบความสำเร็จอย่างมากสำหรับดันนิแกน เขาได้รับเลือกเป็นออลสตาร์ของซีเอฟแอล อีสต์ ทำทัชดาวน์จากการวิ่งมากที่สุดในซีเอฟแอล (11 ครั้ง) ได้รับการเสนอชื่อเป็นผู้เล่นยอดเยี่ยมที่สุดของวินนิเป็ก ผู้เล่นยอดเยี่ยมที่สุดของดิวิชั่นตะวันออก และสุดท้ายเป็นผู้เข้าชิงรางวัลของลีกรองจากดั๊ก ฟลูตี เขาทำลายสถิติของบลูบอมเบอร์ด้วยการขว้างทัชดาวน์ 36 ครั้ง วินนิเป็กจบฤดูกาลด้วยสถิติ 14–4 น่าเสียดายที่ดันนิแกนเอ็นร้อยหวายฉีกขาดในเกมที่สิบหกของฤดูกาลกับซาคราเมนโต โกลด์ ไมเนอร์ส และต้องพลาดการแข่งขันที่เหลือของฤดูกาล เขาถูกแทนที่โดยแซมมี การ์ซาซึ่งนำวินนิเป็กไปสู่เกรย์คัพ ดันนิแกนดูเกมนั้นโดยใช้ไม้ค้ำยัน วินนิเป็กแพ้เอ็ดมอนตัน 33–23

ในปี 1994ดันนิแกนกลับมาจากการบาดเจ็บเอ็นร้อยหวาย ในวันที่ 14 กรกฎาคม เขาได้สร้างประวัติศาสตร์ในวงการอเมริกันฟุตบอลอาชีพด้วยการขว้างบอลได้ 713 หลา ในเกมที่ชนะทีมเก่าของเขาอย่างเอสกิโมส์ 50-35 เขาได้รับการเสนอชื่อเป็นผู้เล่นออลสตาร์ภาคตะวันออกเป็นฤดูกาลที่สองติดต่อกัน ดันนิแกนได้รับสถานะผู้เล่นอิสระในเดือนกุมภาพันธ์ 1995

ในปี 1995ลีก CFL กำลังเข้าสู่ฤดูกาลที่สามของการขยายตัวในสหรัฐอเมริกาและได้เพิ่มทีมอีกสองทีม ได้แก่เมมฟิส แมด ด็อกส์และเบอร์มิงแฮม บาร์ราคูดาส เมมฟิสพยายามดึงตัวดันนิแกน แต่สุดท้ายก็ได้ตัวเดมอน อัลเลน มาแทน ดันนิแกนย้ายมาอยู่เบอร์มิงแฮมในเดือนเมษายน ฤดูกาลนี้เป็นฤดูกาลที่ดีที่สุดของดันนิแกนในแง่สถิติ โดยเขาทำระยะการขว้างได้ 4,911 หลา และทำทัชดาวน์ได้ 34 ครั้ง เขาได้รับการเสนอชื่อเข้าชิงรางวัลผู้เล่นยอดเยี่ยมที่สุดของทีม

ในการแข่งขันนัดที่แปดของฤดูกาล ทีมเบอร์มิงแฮมเอาชนะคาลการี สแตมป์พีเดอร์ส ที่เมืองคาลการี ด้วยคะแนน 31-28 โดยดันนิแกนขว้างลูกทัชดาวน์ให้เอ็ดดี้ บริตตันในช่วง 9 วินาทีสุดท้ายของเกม เกมนี้ยุติสถิติการชนะในบ้านและไม่แพ้ใครติดต่อกัน 27 นัดในฤดูกาลปกติของคาลการีในลีก CFL ซึ่งเริ่มมาตั้งแต่ปี 1992 นอกจากนี้ ในเกมนี้ ดันนิแกนยังแซงหน้าทอม เคลเมนต์ขึ้นไปอยู่อันดับสองในสถิติการขว้างลูกระยะไกลที่สุดตลอดกาลของ CFL อีกด้วย

ในการแข่งขันนัดสุดท้ายในบ้านกับเอ็ดมอนตัน ดันนิแกนได้รับบาดเจ็บที่มือข้างที่ใช้ขว้างลูก และต้องนั่งดูการแข่งขันที่เหลือของฤดูกาล รวมถึงรอบเพลย์ออฟจากข้างสนาม สุดท้ายแล้วทีมบาร์ราคูดาสก็พ่ายแพ้ในรอบเพลย์ออฟให้กับซานอันโตนิโอ เท็กซานส์ด้วย คะแนน 52–9

ทีมทั้งหมดในสหรัฐอเมริกาต่างยุบทีม ยกเว้นแชมป์เกรย์คัพอย่าง บัลติมอร์ สตาลเลียนส์ที่ย้ายไปอยู่ที่มอนทรีออลเนื่องจากการยุบทีมของบาร์ราคูดาส ทำให้ดันนิแกนได้รับสถานะผู้เล่นอิสระในเดือนกุมภาพันธ์ ปี 1996

ในเดือนพฤษภาคมปี 1996ดันนิแกนเซ็นสัญญาสองปีมูลค่ากว่า 1 ล้านดอลลาร์กับทีมแฮมิลตัน ไทเกอร์-แคทส์ แฮมิลตันเริ่มต้นฤดูกาลด้วยสถิติ 4–1 รวมถึงชัยชนะครั้งที่ 100 ของดันนิแกนในฐานะควอเตอร์แบ็กตัวจริงในเกมที่ห้าของทีมกับบีซี ในเกมที่หกของฤดูกาล แฮมิลตันเป็นเจ้าบ้านรับการมาเยือนของบีซี และดันนิแกนต้องออกจากเกมเนื่องจากอาการบาดเจ็บ ในควอเตอร์แรก เขาถูกเรจจี้ คาร์ธอนและเชลตัน ควาร์ลส์เข้าปะทะ และต้องออกจากเกมเนื่องจากอาการกระทบกระเทือนทางสมอง ดันนิแกนพลาดการแข่งขันที่เหลือของฤดูกาลเนื่องจากอาการบาดเจ็บ

ดันนิแกนประกาศเกษียณอายุอย่างเป็นทางการเมื่อวันที่ 18 กุมภาพันธ์ 1997 สาเหตุการเกษียณของเขาเกิดจากอาการบาดเจ็บที่ศีรษะเรื้อรัง

ก่อนเกษียณ ดันนิแกนเป็นควอเตอร์แบ็กเพียงคนเดียวที่นำทีมถึง 4 ทีมที่แตกต่างกันเข้าสู่รอบชิงชนะเลิศเกรย์คัพ (เอดมันตัน, บีซี, โตรอนโต, วินนิเป็ก) นอกจากนี้ เขายังจบอันดับสองรองจากรอน แลนแคสเตอร์ในสถิติการส่งบอลในฤดูกาลปกติตลอดกาลดังต่อไปนี้:

• ทัชดาวน์ (303)
• หลา (43,857)
• ความพยายาม (5,476)
• จำนวนการเสร็จสิ้น (3,057)

เขาเป็นเพียงควอเตอร์แบ็กคนที่สองต่อจากแลนแคสเตอร์ที่ทำสถิติชนะ 100 เกมในฤดูกาลปกติในฐานะควอเตอร์แบ็กตัวจริง ดันนิแกนอยู่อันดับที่ 5 ในด้านระยะวิ่งของควอเตอร์แบ็ก (5,031 หลา)

ในปี 2549 Dunigan ได้รับการโหวตให้เป็นหนึ่งใน50 ผู้เล่นยอดเยี่ยม (อันดับ 39) ของ CFL ในยุคสมัยใหม่โดยเครือข่ายกีฬาของแคนาดาTSN [ ^{2 ]} Dunigan ยังได้รับเลือกเข้าสู่หอเกียรติยศฟุตบอลแคนาดาในปี 2549 ^{อีก ด้วย}

ในเดือนกุมภาพันธ์ ปี 1997 ดันนิแกนได้รับการแต่งตั้งให้เป็นผู้ประสานงานเกมรุกของ ทีมฟุตบอล มหาวิทยาลัยวัลโดสตาสเตทเขาดำรงตำแหน่งนี้ในฤดูกาลปี 1997 และ 1998

ในปี 2547 Calgary Stampedersได้ว่าจ้าง Dunigan ให้เป็นผู้จัดการทั่วไปและหัวหน้าโค้ช ในเดือนกรกฎาคม เขารับบทบาทเป็นผู้ประสานงานฝ่ายรุกหลังจากที่เขาไล่John Jenkinsออก^{[ 3 ]}หลังจากฤดูกาลที่น่าผิดหวังด้วยผลงาน 4–14 Dunigan ก็ถูกไล่ออก^{[ 3 ]}

ในระหว่างช่วงที่เขายังเล่นอยู่ เมื่อทีมของเขาไม่ได้เข้าชิงถ้วยเกรย์คัพ ดันนิแกนจะทำหน้าที่เป็นนักวิเคราะห์ให้กับCFL ทางช่อง CBCซึ่งรวมถึงปี 1989 และ 1994 นอกจากนี้เขายังทำหน้าที่เป็นผู้บรรยายร่วมในเกมรอบรองชนะเลิศฝั่งตะวันตกปี 1993 ระหว่างซัสแคตเชวันกับเอดมันตัน ตั้งแต่ปี 1999 ถึง 2003 และตั้งแต่ปี 2005 ถึง 2024 ดันนิแกนเป็นนักวิเคราะห์ในสตู ดิโอ และผู้บรรยายร่วมให้กับCFL ทางช่อง TSN

ในปี 2549 ด้วยคำท้าจากครอบครัว Dunigan ได้ไปออดิชั่นเพื่อเป็นพิธีกรรายการโทรทัศน์เกี่ยวกับการทำบาร์บีคิวชื่อRoad Grillซึ่งออกอากาศครั้งแรกในปี 2551 โดยมีเขาเป็นพิธีกร นอกจากนี้เขายังเป็น ผู้เขียน ตำราอาหารโดยใช้สูตรอาหารจากรายการดังกล่าว^{[ 4 ] [ 5 ]}

Dunigan พูดตรงไปตรงมาเกี่ยวกับผลกระทบที่เป็นอันตรายของการกระทบกระเทือนทางสมองเขาประสบปัญหาเกี่ยวกับความจำ ปัญหาในการพูด ปัญหาเรื่องการทรงตัว และการสูญเสียความจำจากการกระทบกระเทือนทางสมองหลายครั้งที่เขาได้รับระหว่างอาชีพการเล่นของเขา^{[ 6 ]}