เมทิลไลซีนเป็นอนุพันธ์ของกรดอะมิโนไลซีนโดยที่หมู่แอมโมเนียม ของโซ่ข้าง ได้รับการเมทิลเลชันหนึ่งครั้งหรือมากกว่า^{[ 1 ]}

ไลซีนที่ถูกเมทิลเลชันดังกล่าวมีบทบาทสำคัญในเอพิเจเนติกส์ การเมทิลเลชันของไลซีนเฉพาะของฮิสโตน บางชนิด ในนิวคลีโอโซมจะเปลี่ยนแปลงการจับกันของDNA รอบข้าง กับฮิสโตนเหล่านั้น ซึ่งส่งผลต่อการแสดงออกของยีนบน DNA นั้น^{[ 2 ] [ 3 ]} การจับกันจะได้รับผลกระทบเนื่องจากรัศมีที่มีประสิทธิภาพของประจุบวกเพิ่มขึ้น (หมู่เมทิลมีขนาดใหญ่กว่าอะตอมไฮโดรเจนที่มันแทนที่) ทำให้ แรงดึงดูด ทางไฟฟ้าสถิต ที่มีศักยภาพสูงสุด กับ DNA ที่มีประจุลบ ลดลง

เชื่อกันว่าการเติมหมู่เมทิลลงบนไลซีน (และอาร์จินีน) บนหางของฮิสโตนไม่ได้ส่งผลโดยตรงต่อการจับกับ DNA แต่เครื่องหมายเมทิลดังกล่าวจะดึงดูดโปรตีนอื่นๆ ที่ปรับเปลี่ยนโครงสร้างของโครมาติน^{[ 4 ]}

ในไฟล์Protein Data Bank ไลซีนที่มีการเติมหมู่เมทิลจะถูกระบุด้วย ตัวย่อMLYหรือMLZ

• 
  ไลซีนที่ไม่ถูกเมทิลเลต
• 
  โมโนเมทิลเลต: 6- N-เมทิลไลซีน
• 
  ไดเมทิลเลต: (6- N ,6- N )ไดเมทิลไลซีน
• 
  ไตรเมทิลเลต: (6- N ,6- N ,6- N )ไตรเมทิลไลซีน