ในการถ่ายภาพรังสีเอกซ์ ไมโครโทโมกราฟีเอก ซ์เรย์ ใช้เอกซ์เรย์ในการสร้างภาพตัดขวางของวัตถุทางกายภาพ ซึ่งสามารถนำมาใช้สร้างแบบจำลองเสมือน ( แบบจำลอง 3 มิติ ) โดยไม่ทำลายวัตถุต้นฉบับ คล้ายกับโทโมกราฟีและเอกซ์เรย์คอมพิวเตอร์โทโมกราฟีคำนำหน้า ไมโคร- (สัญลักษณ์: μ) ใช้เพื่อระบุว่า ขนาด พิกเซลของภาพตัดขวางอยู่ในช่วงไมโครเมตร^{[ 2 ]}ขนาดพิกเซลเหล่านี้ยังส่งผลให้เกิดคำพ้องความหมาย เช่น โทโมกราฟีเอกซ์เร ย์ความละเอียดสูงไมโครคอมพิวเตอร์โทโมกรา ฟี ( ไมโคร-CTหรือμCT ) และคำอื่นๆ ที่คล้ายกัน บางครั้งคำว่าคอมพิวเตอร์โทโมกราฟีความละเอียดสูง (HRCT) และไมโคร-CT จะถูกแยกความแตกต่างกัน^{[ 3 ]} แต่ในบางกรณี จะใช้คำว่าไมโคร-CT ความละเอียดสูง^{[ 4 ]}โทโมกราฟีเกือบทั้งหมดในปัจจุบันเป็นคอมพิวเตอร์โทโมกราฟี

ไมโครซีที (Micro-CT) มีการใช้งานทั้งในด้านการถ่ายภาพทางการแพทย์และการถ่ายภาพรังสีคอมพิวเตอร์เชิงอุตสาหกรรมโดยทั่วไปแล้ว การจัดวางเครื่องสแกนมีสองประเภท ประเภทแรก แหล่งกำเนิดรังสีเอกซ์และตัวตรวจจับมักจะอยู่กับที่ในระหว่างการสแกน ในขณะที่ตัวอย่าง/สัตว์จะหมุน ประเภทที่สอง ซึ่งคล้ายกับเครื่องสแกนซีทีทางคลินิกมากกว่า คือแบบที่ใช้โครงสร้างแบบคาน (gantry-based) โดยที่สัตว์/ตัวอย่างจะอยู่กับที่ ในขณะที่หลอดรังสีเอกซ์และตัวตรวจจับจะหมุนรอบ เครื่องสแกนเหล่านี้มักใช้กับสัตว์ขนาดเล็ก ( เครื่องสแกน ในร่างกาย ) ตัวอย่างทางชีวการแพทย์ อาหาร ซากดึกดำบรรพ์ขนาดเล็ก และการศึกษาอื่นๆ ที่ต้องการรายละเอียดที่แม่นยำมาก

ระบบไมโครโทโมกราฟีเอ็กซ์เรย์ระบบแรกได้รับการคิดค้นและสร้างขึ้นโดยศาสตราจารย์ James C. Elliott ที่วิทยาลัยการแพทย์โรงพยาบาลลอนดอนในช่วงต้นทศวรรษ 1980 ภาพไมโครโทโมกราฟีเอ็กซ์เรย์ที่ตีพิมพ์ครั้งแรกเป็นภาพตัดขวางที่สร้างขึ้นใหม่ของหอยทากเขตร้อนขนาดเล็ก ( Biomphalaria glabrata )โดยมีขนาดพิกเซลประมาณ 50 ไมโครเมตร^{[ 5 ]}

ระบบลำแสงพัด (Fan-beam system) ใช้หลักการตรวจจับรังสีเอกซ์แบบหนึ่งมิติ (1D) และแหล่งกำเนิดรังสีเอกซ์แบบอิเล็กทรอนิกส์ เพื่อสร้างภาพตัดขวาง สองมิติ (2D) ของวัตถุ โดยทั่วไปจะใช้ในระบบ เอกซเรย์คอมพิวเตอร์ ของมนุษย์

ระบบลำแสงทรงกรวยนั้นใช้หลักการตรวจจับรังสีเอกซ์แบบ 2 มิติ ( กล้อง ) และแหล่งกำเนิดรังสีเอกซ์แบบอิเล็กทรอนิกส์ โดยสร้างภาพฉายที่จะนำไปใช้ในการสร้างภาพตัดขวางในภายหลัง

ในระบบเปิด รังสีเอ็กซ์อาจเล็ดลอดหรือรั่วไหลออกมาได้ ดังนั้นผู้ปฏิบัติงานต้องอยู่หลังฉากกั้น สวมชุดป้องกันพิเศษ หรือใช้งานเครื่องสแกนจากระยะไกลหรือในห้องอื่น ตัวอย่างทั่วไปของเครื่องสแกนเหล่านี้ ได้แก่ เครื่องสแกนสำหรับมนุษย์ หรือเครื่องสแกนที่ออกแบบมาสำหรับวัตถุขนาดใหญ่

ในระบบปิด จะมีการติดตั้งแผ่นป้องกันรังสีเอ็กซ์ไว้รอบเครื่องสแกน เพื่อให้ผู้ใช้งานสามารถวางเครื่องสแกนไว้บนโต๊ะหรือโต๊ะพิเศษได้ แม้ว่าเครื่องสแกนจะมีแผ่นป้องกันรังสี แต่ก็ต้องระมัดระวัง และโดยปกติผู้ใช้งานจะพกเครื่องวัดปริมาณรังสีติดตัวไปด้วย เนื่องจากรังสีเอ็กซ์มีแนวโน้มที่จะถูกดูดซับโดยโลหะแล้วปล่อยออกมาใหม่เหมือนเสาอากาศ แม้ว่าเครื่องสแกนทั่วไปจะสร้างรังสีเอ็กซ์ในปริมาณที่ไม่เป็นอันตรายมากนัก แต่การสแกนซ้ำๆ ในช่วงเวลาสั้นๆ อาจก่อให้เกิดอันตรายได้ โดยปกติจะใช้ตัวตรวจจับดิจิทัลที่มีระยะห่างระหว่างพิกเซลเล็กและหลอดรังสีเอ็กซ์แบบไมโครโฟกัสเพื่อให้ได้ภาพที่มีความละเอียดสูง^{[ 6 ]}

ระบบปิดมักจะมีน้ำหนักมากเนื่องจากใช้ตะกั่วในการป้องกันรังสีเอ็กซ์ ดังนั้นเครื่องสแกนขนาดเล็กจึงมีพื้นที่สำหรับวางตัวอย่างจำกัด

เนื่องจากเครื่องสแกนไมโครโทโมกราฟีให้ความละเอียดแบบไอโซโทรปิกหรือใกล้เคียงไอโซโทรปิก การแสดงภาพจึงไม่จำเป็นต้องจำกัดอยู่เฉพาะภาพแกนตามแบบแผนเดิมเท่านั้น แต่โปรแกรมซอฟต์แวร์สามารถสร้างปริมาตรโดยการ "ซ้อน" สไลด์แต่ละแผ่นซ้อนกันได้ จากนั้นโปรแกรมอาจแสดงปริมาตรในรูปแบบอื่น^{[ 7 ]}

สำหรับไมโครโทโมกราฟีด้วยรังสีเอกซ์ มีซอฟต์แวร์โอเพนซอร์สที่มีประสิทธิภาพ เช่น ASTRA toolbox ^{[ 8 ] [ 9 ]} ASTRA Toolbox เป็น toolbox MATLAB และ Python ที่มี GPU primitive ประสิทธิภาพสูงสำหรับโทโมกราฟี 2 มิติและ 3 มิติ ซึ่งพัฒนาโดยiMinds-Vision Labมหาวิทยาลัย Antwerp ตั้งแต่ปี 2009 ถึง 2014 และตั้งแต่ปี 2014 ได้รับการพัฒนาร่วมกันโดย iMinds-VisionLab, UAntwerpen และ CWI, Amsterdam toolbox นี้รองรับลำแสงแบบขนาน แบบพัด และแบบกรวย พร้อมการวางตำแหน่งแหล่งกำเนิด/ตัวตรวจจับที่ยืดหยุ่นสูง มีอัลกอริธึมการสร้างภาพใหม่จำนวนมากให้เลือกใช้ รวมถึง FBP, ART, SIRT, SART, CGLS ^{[ 10 ]}

สำหรับการแสดงภาพสามมิติTomvizเป็นเครื่องมือโอเพนซอร์สยอดนิยมสำหรับการสร้างภาพตัดขวาง

การเรนเดอร์แบบปริมาตร (Volume rendering ) เป็นเทคนิคที่ใช้ในการแสดงภาพฉาย 2 มิติของชุดข้อมูล 3 มิติที่สุ่มตัวอย่างแบบไม่ต่อเนื่อง ซึ่งได้จากเครื่องสแกนไมโครโทโมกราฟี โดยปกติแล้วข้อมูลเหล่านี้จะถูกเก็บรวบรวมในรูปแบบที่สม่ำเสมอ เช่น หนึ่งชิ้นทุกๆ มิลลิเมตร และโดยทั่วไปจะมีจำนวนพิกเซลภาพที่สม่ำเสมอในรูปแบบที่สม่ำเสมอ นี่คือตัวอย่างของตารางปริมาตรแบบสม่ำเสมอ โดยแต่ละองค์ประกอบของปริมาตร หรือว็อกเซล จะถูกแทนด้วยค่าเดียวที่ได้จากการสุ่มตัวอย่างบริเวณโดยรอบว็อกเซล

ในกรณีที่โครงสร้างต่าง ๆ มีความหนาแน่นของเกณฑ์ที่คล้ายกัน การแยกโครงสร้างเหล่านั้นโดยการปรับพารามิเตอร์การแสดงผลปริมาตรเพียงอย่างเดียวอาจเป็นไปไม่ได้ วิธีแก้ปัญหานี้เรียกว่าการแบ่งส่วน ซึ่งเป็นกระบวนการด้วยตนเองหรืออัตโนมัติที่สามารถกำจัดโครงสร้างที่ไม่ต้องการออกจากภาพได้^{[ 11 ] [ 12 ]}

• การบูรณะโบราณวัตถุที่เสียหายจากไฟไหม้ เช่นม้วนหนังสือเอ็นเกดีและกระดาษปาปิรัสเฮอร์คูเลเนียม
• สิ่งของมรดกทางวัฒนธรรม^{[ 13 ]}รวมถึงการแกะแผ่นจารึกอักษรลิ่มที่ห่อด้วยซองดินเหนียว^{[ 14 ]}และเหรียญดินเหนียว

การประยุกต์ใช้ไมโครซีทีที่โดดเด่นในการกำหนดลักษณะอ่างเก็บน้ำคือการสร้างแบบจำลองหินดิจิทัลเพื่อประเมินคุณสมบัติการไหลแบบแอนไอโซโทรปิก^{[ 15 ]}

• การถ่ายภาพสัตว์ขนาดเล็กทั้งในหลอดทดลองและในร่างกาย
• เซลล์ประสาท^{[ 16 ]}
• ตัวอย่างผิวหนังมนุษย์
• ตัวอย่างกระดูก รวมถึงฟัน^{[ 17 ]}มีขนาดตั้งแต่หนูไปจนถึงตัวอย่างเนื้อเยื่อของมนุษย์
• การถ่ายภาพปอดโดยใช้การควบคุมการหายใจ
• การถ่ายภาพระบบหัวใจและหลอดเลือดโดยใช้การควบคุมจังหวะการเต้นของหัวใจ
• การถ่ายภาพดวงตาของมนุษย์ โครงสร้างจุลภาคของดวงตา และเนื้องอก^{[ 18 ]}
• การถ่ายภาพเนื้องอก (อาจต้องใช้สารทึบแสง)
• การถ่ายภาพเนื้อเยื่ออ่อน^{[ 19 ]}
• แมลง^{[ 20 ]} – การพัฒนาของแมลง^{[ 21 ] [ 22 ]}
• ปรสิตวิทยา – การอพยพของปรสิต^{[ 23 ]}สัณฐานวิทยาของปรสิต^{[ 24 ] [ 25 ]}
• การตรวจสอบความสม่ำเสมอของแท็บเล็ต^{[ 26 ]}

ชีววิทยาการพัฒนา

• ติดตามการพัฒนาของเสือทัสมาเนียที่สูญพันธุ์ไปแล้วในระหว่างการเจริญเติบโตในถุงหน้าท้อง^{[ 27 ]}
• สิ่งมีชีวิตที่เป็นแบบจำลองและไม่ใช่แบบจำลอง (ช้าง^{[ 28 ]}ปลาซีบราฟิช^{[ 29 ]}และวาฬ^{[ 30 ]} )

• ชิ้นส่วนอิเล็กทรอนิกส์ขนาดเล็ก เช่น ไอซีDRAM ในเคสพลาสติก

• หัวฉีดสเปรย์

• เซรามิกและวัสดุคอมโพสิตเซรามิก-โลหะ^{[ 1 ]}การวิเคราะห์โครงสร้างจุลภาคและการตรวจสอบความล้มเหลว
• วัสดุผสมที่มีเส้นใยแก้วขนาดเส้นผ่านศูนย์กลาง10 ถึง 12 ไมโครเมตร

• โฟมพลาสติก

• การตรวจหาตำหนิในเพชรและการหาวิธีที่ดีที่สุดในการเจียระไน

• การสร้างภาพสามมิติของอาหาร^{[ 31 ]}
• การวิเคราะห์ความเครียดจากความร้อนและภัยแล้งต่อพืชอาหาร^{[ 32 ]}
• การตรวจจับฟองอากาศในชีสที่มีเสียงดัง^{[ 33 ]}

• ชิ้นไม้สำหรับแสดงภาพวัฏจักรของปีและโครงสร้างของเซลล์

• วัสดุก่อสร้างมรดก^{[ 34 ]}
• คอนกรีตหลังจากรับน้ำหนักแล้ว

ในทางธรณีวิทยา ใช้เพื่อวิเคราะห์รูพรุนขนาดเล็กในหินกักเก็บ^{[ 35 ] [ 36 ]}สามารถใช้ใน การวิเคราะห์ ไมโครเฟซสำหรับลำดับชั้นทางธรณีวิทยา ใน การสำรวจ ปิโตรเลียมใช้เพื่อจำลองการไหลของปิโตรเลียมภายใต้รูพรุนขนาดเล็กและอนุภาคนาโน

สามารถให้ความละเอียดสูงถึง 1 นาโนเมตร

• หินทราย
• การศึกษา ความพรุนและการไหล^{[ 37 ] [ 38 ]}

• สัตว์มีกระดูกสันหลัง
• สัตว์ไม่มีกระดูกสันหลัง^{[ 39 ]}

• ฟอรามินิ เฟอราเบนทิก

• จดหมายโต้ตอบแบบดิจิทัลที่คลี่ออกโดยใช้ ระบบ ล็อกจดหมาย^{[ 41 ] [ 42 ]}

• การค้นหาอนุภาคคล้ายฝุ่นดาว ใน แอโรเจลโดยใช้เทคนิคเอ็กซ์เรย์^{[ 43 ]}
• ตัวอย่างที่นำกลับมาจากดาวเคราะห์น้อย25143 ItokawaโดยภารกิจHayabusa ^{[ 44 ]}

• การแสดงภาพด้วยสีฟ้าและสีเขียว หรือฟิลเตอร์สีฟ้าเพื่อดูความลึก

• บุหรี่
• รังแมลงสังคม^{[ 45 ]}

• ซินโครตรอน
• โปรดอัปโหลด

วิกิมีเดียคอมมอนส์มีสื่อที่เกี่ยวข้องกับการถ่ายภาพรังสีเอกซ์แบบไมโครโทโมกราฟี

• การถ่ายภาพรังสีเอกซ์คอมพิวเตอร์ขนาดเล็ก: ระเบียบวิธีและการประยุกต์ใช้เก็บถาวรเมื่อ 16 กรกฎาคม 2011 ที่Wayback Machine
• ภาพสามมิติของการเจริญเติบโตของกระดูกในวัสดุชีวภาพแคลเซียมฟอสเฟตจากการถ่าย ภาพรังสีเอกซ์แบบไมโครโทโมกราฟีด้วยซินโครตรอนและไม่ใช้ซินโครตรอน เก็บถาวร เมื่อวันที่ 23 พฤษภาคม 2548 ที่Wayback Machine
• การถ่ายภาพเอกซเรย์คอมพิวเตอร์แบบไมโครโฟกัสในงานวิจัยวัสดุ เก็บ ถาวร เมื่อ 10 กันยายน 2005 ที่Wayback Machine
• การระบุตำแหน่งอนุภาคคล้ายฝุ่นดาวในแอโรเจลโดยใช้เทคนิคเอ็กซ์เรย์
• การใช้ไมโครซีทีในการศึกษาเกี่ยวกับนิ่วในไต
• การใช้ไมโครซีทีในจักษุวิทยา
• การประยุกต์ใช้กล้องจุลทรรศน์อัลตราเอ็กซ์เรย์ Gatan (XuM) ในการตรวจสอบตัวอย่างวัสดุและชีวภาพ
• การถ่ายภาพไมโครโทโมกราฟีด้วยรังสีเอกซ์ซินโครตรอนแบบ 3 มิติของตัวอย่างสี