อ่าน 5 นาที
ฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบ
ฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบ ( MODs ) คือ ฐานข้อมูลทางชีววิทยา หรือฐานความรู้ ที่มุ่งเน้นการจัดหาข้อมูลทางชีววิทยาเชิงลึกสำหรับ สิ่งมีชีวิตต้นแบบที่ ได้รับการศึกษาอย่างเข้มข้น MODs...
ฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบ
ฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบ ( MODs ) คือฐานข้อมูลทางชีววิทยาหรือฐานความรู้ ที่มุ่งเน้นการจัดหาข้อมูลทางชีววิทยาเชิงลึกสำหรับสิ่งมีชีวิตต้นแบบที่ ได้รับการศึกษาอย่างเข้มข้น MODs ช่วยให้นักวิจัยสามารถค้นหาข้อมูลพื้นฐานเกี่ยวกับชุดยีนขนาดใหญ่ วางแผนการทดลองได้อย่างมีประสิทธิภาพ บูรณาการข้อมูลของตนกับความรู้ที่มีอยู่ และกำหนดสมมติฐานใหม่ได้[ 1 ] [ 2 ] MODs ช่วยให้ผู้ใช้สามารถวิเคราะห์ผลลัพธ์และตีความชุดข้อมูลได้ และข้อมูลที่สร้างขึ้นนั้นถูกนำมาใช้มากขึ้นเรื่อยๆ เพื่ออธิบายสายพันธุ์ที่ยังไม่ได้รับการศึกษาอย่างละเอียด[ 1 ]เท่าที่เป็นไปได้ MODs จะใช้แนวทางร่วมกันในการรวบรวมและนำเสนอข้อมูลทางชีววิทยา ตัวอย่างเช่น MODs ทั้งหมดใช้Gene Ontology (GO) [ 3 ] [ 4 ]เพื่ออธิบายหน้าที่ กระบวนการ และตำแหน่งในเซลล์ของผลิตภัณฑ์ยีนเฉพาะ นอกจากนี้ยังมีโครงการที่ช่วยให้สามารถแบ่งปันซอฟต์แวร์สำหรับการดูแลจัดการ การแสดงภาพ และการสอบถามระหว่าง MODs ต่างๆ ได้[ 5 ]อย่างไรก็ตาม ความหลากหลายของสิ่งมีชีวิตและความต้องการของผู้ใช้ที่แตกต่างกัน หมายความว่า MODs มักจะต้องปรับแต่งการรวบรวม การแสดงผล และการจัดหาข้อมูล[ 1 ]
ประเภทของข้อมูลและบริการ
ฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบสร้าง จัดหา และรวบรวมข้อมูลเฉพาะสายพันธุ์อย่างครบวงจร โดยผสมผสานความรู้จากผู้เชี่ยวชาญ การคัดกรองเอกสาร และชีวสารสนเทศ
บริการที่จัดให้แก่ชุมชนวิจัยทางชีววิทยา ได้แก่:
- คำอธิบายลำดับจีโนม
- ตำแหน่งของยีนและบริเวณควบคุมในจีโนม
- การคัดกรองเชิงหน้าที่ของผลิตภัณฑ์ยีน
- ระบุหน้าที่ที่ผลิตภัณฑ์ของยีนทำโดยพิจารณาจากข้อมูลหลากหลายประเภท รวมถึง คำอธิบายประกอบ Gene Ontology (GO), ลักษณะทางฟีโนไทป์, การแสดงออกของยีน และข้อมูลวิถีทางชีวภาพ
- คำอธิบายลำดับโปรตีน/อาร์เอ็นเอ
- ข้อมูลทางกายวิภาค
- ศูนย์จำหน่ายสินค้า
- ออร์โธโลยี
รายชื่อฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบ
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบ
ฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบ ( MODs ) คือ ฐานข้อมูลทางชีววิทยา หรือฐานความรู้ ที่มุ่งเน้นการจัดหาข้อมูลทางชีววิทยาเชิงลึกสำหรับ สิ่งมีชีวิตต้นแบบที่ ได้รับการศึกษาอย่างเข้มข้น MODs...
ประเภทของข้อมูลและบริการ
ฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบสร้าง จัดหา และรวบรวมข้อมูลเฉพาะสายพันธุ์อย่างครบวงจร โดยผสมผสานความรู้จากผู้เชี่ยวชาญ การคัดกรองเอกสาร และชีวสารสนเทศ
รายชื่อฐานข้อมูลสิ่งมีชีวิตต้นแบบ
ชื่อสามัญ ชื่อวิทยาศาสตร์ หน้าวิกิพีเดีย การเชื่อมโยงฐานข้อมูลออก ยีสต์ทำขนมปัง แซคคาโรไมซีส เซเรวิเซีย ฐานข้อมูลจีโนมของยีสต์ Saccharomyces SGD [ 6 ] ยีสต์ฟิชชัน Schizosaccharomyces pombe ปอมเบส PomBase [ 7 ] กบมีเล็บ กบเซโนปัส เซนเบส Xenbase [ 8 ] [ 9 ]...