ภาษาค้นหาโมเลกุล ( MQL ) ถูกออกแบบมาเพื่อรองรับวิธีการค้นหาที่ซับซ้อนและเฉพาะเจาะจงมากขึ้นในสาขาเคมีสารสนเทศแตกต่างจาก คำสั่งค้นหา SMARTS ที่ใช้กันอย่างแพร่หลาย MQL ช่วยให้สามารถระบุคุณสมบัติเชิงพื้นที่และทางกายภาพเคมีของอะตอมและพันธะได้ นอกจากนี้ยังสามารถขยายเพื่อรองรับกราฟที่ไม่ใช่แบบอะตอม หรือที่เรียกว่ากราฟ "คุณลักษณะลดรูป" ได้อย่างง่ายดายภาษาค้นหา นี้ ใช้รูปแบบ Backus–Naur แบบขยาย (EBNF) โดยใช้ JavaCC

• E. Proschak, JK Wegner, A. Schüller, G. Schneider, U. Fechner, Molecular Query Language (MQL)-ไวยากรณ์ที่ไม่มีบริบทสำหรับการจับคู่โครงสร้างย่อย , J. Chem ข้อมูล รุ่น., 2007 , 47 , 295-301. ดอย : 10.1021/ci600305h

• กึ๋น
• รหัสระบุสารเคมีสากล

• แอปพลิเคชัน Java Webstart สำหรับ MQL