โมอีนเกิดในปี 1951 ในเมืองนาจาฟ อาบัดเมื่ออายุ 18 ปี เขาได้รับการยอมรับเข้าศึกษาใน คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยชีราซและหลังจากเกิดการปฏิวัติอิหร่านเขาได้รับการแต่งตั้งเป็นอธิการบดีมหาวิทยาลัยชีราซ เขาได้รับเลือกเป็นผู้แทนราษฎรของเมืองชีราซในการเลือกตั้งกลางวาระของรัฐสภา ชุดแรก ของอิหร่านในปี 1982

โมอีนดำรงตำแหน่งรัฐมนตรีว่าการกระทรวงวัฒนธรรมและการอุดมศึกษาในสมัยประธานาธิบดีอัคบาร์ ฮาเชมี ราฟซานจานี (1989-1993) และประธานาธิบดีโมฮัมหมัด คาตามี (1997-2000) และต่อมาได้ดำรงตำแหน่งรัฐมนตรีว่าการกระทรวงวิทยาศาสตร์ การวิจัย และเทคโนโลยี (ตำแหน่งเดียวกัน แต่เปลี่ยนชื่อ) ในสมัยประธานาธิบดีคาตามี (2000-2003) ในฐานะรัฐมนตรี โมอีนลาออกหลังจากเหตุการณ์ประท้วงของนักศึกษาในเดือนกรกฎาคม 1999 และอีกครั้งในเดือนกรกฎาคม 2003 หลังจากที่เขาไม่สามารถโน้มน้าวสภาผู้พิทักษ์ให้ปรับทิศทางกระทรวงของเขาไปสู่เป้าหมายที่เขาตั้งไว้คือ "ผลผลิตทางวิทยาศาสตร์" ที่สูงขึ้น

เมื่อวันที่ 12 ตุลาคม 2547 มิร์-ฮอสเซน มูซาวีปฏิเสธที่จะลงสมัครรับเลือกตั้งประธานาธิบดี ทำให้แนวร่วมอิสลามอิหร่าน (IIPF)พิจารณาเสนอชื่อโมอีนแทน สมาชิก IIPF ประกาศการเสนอชื่อของเขาในเวลาต่อมา และเมื่อวันที่ 29 ธันวาคม 2547 โมอีนตกลงที่จะลงสมัครรับเลือกตั้งประธานาธิบดี โดยเป็นผู้สมัครรายใหญ่คนแรกที่ประกาศเข้าร่วมการแข่งขัน

ตรงข้ามกับความคาดหวังทั่วไปและผลสำรวจความคิดเห็น โมอีน ซึ่งคาดว่าจะอยู่ในกลุ่มผู้สมัครยอดนิยม 3 อันดับแรกในรอบแรก กลับทำผลงานได้ไม่ดีนักและได้อันดับที่ 5 ในท้ายที่สุด ส่งผลให้การเลือกตั้งต้องมีการเลือกตั้งรอบสองระหว่างอัคบาร์ ฮาเชมี ราฟซานจานีและมาห์มูด อาห์มาดิเนจาด

แคมเปญหาเสียงปัจจุบันของโมอีนนำโดยอาลี ชาคูรี-ราดและได้รับการสนับสนุนจากพรรคการเมืองและองค์กรต่างๆ ดังต่อไปนี้:

• แนวร่วมอิสลามอิหร่าน
• โมญาฮิดีน แห่งองค์การปฏิวัติอิสลาม ( ซาซมาน-เอ โมจาเฮดิน-เอ เองเฮลาบ-เอ เอสลามี )
• ขบวนการเพื่อการปลดปล่อยอิหร่าน ( nehzat-e āzādi-e irān )
• สภากองกำลังศาสนาแห่งชาติ ( โชเรย์-เอ นิรุฮาย-เอ เมลลี่ มาซาบี )
• สมาคมการแพทย์อิสลามแห่งสมาคมการแพทย์ ( อันโจมัน-เอ เอสลามิ-เอ จาเม-เย เปเซชกี )
• สมาคมครูอิสลาม ( อันโจมาน-เอเอสลามิ-เอโมอัลเลมาน )
• อาจารย์สมาคมอิสลามแห่งมหาวิทยาลัย ( อันโจมาน-เอ เอสลามิ-เอ โมดาร์เรซิน-เอ ดาเนชกาห์-ฮา )

โมสตาฟา โมอิน เป็นหนึ่งในนักวิจัยชั้นนำของอิหร่านในสาขาภูมิคุ้มกันวิทยาและภูมิแพ้ในเด็ก ปัจจุบันดำรงตำแหน่งประธานศูนย์วิจัยในเครือคณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยเตหะราน

• แคมเปญหาเสียงเลือกตั้งประธานาธิบดีอย่างเป็นทางการ
• บล็อกอย่างเป็นทางการ (ภาษาเปอร์เซีย)
• ผลงานวิจัยของ Mostafa Moin ใน PubMed
• การเสนอชื่อโมอีนเป็นประธานาธิบดีโดย IIPFบทความจาก หนังสือพิมพ์ ชาร์ก (ภาษาเปอร์เซีย)
• ประวัติย่อของ ดร. โมสตาฟา โมอิน
• คลังวิดีโอการหาเสียงเลือกตั้งประธานาธิบดีของโมสตาฟา โมอิน