ms2 (ซอฟต์แวร์)

ม.ส. 2
ผู้เขียนต้นฉบับ	คอลิน ดับเบิลยู. กลาส, สเตฟเฟน ไรเซอร์, กาบอร์ รัทไค, สเตฟาน เดเบิลลิน, อันเดรียส โคสเตอร์, กาเบรียลา เกวารา-คาร์ริออน, อาแมร์ วาไฟ, มาร์ติน ฮอร์ช, มาร์ติน เบิร์นรอยเธอร์, ธอร์สเทน วินด์มานน์, ไค ลังเกนบัค, เดวิด เซลนี่, เซอร์เกย์ โปรโคเพฟ, อิซาเบล นิทซ์เค, ธอร์สเทน แมร์เกอร์, สเตฟาน เดอเบลอลิน, แบร์นฮาร์ด เอคเคิล, เจอร์เก้น สโตลล์, เซอร์เกย์ วี. ลิชชุค, เดนิส ซาริช, โจชัว มาร์กซ์, ทัตยาน่า แจนเซน, ไมเคิล แชปพัลส์, โรบิน ฟิงเกอร์ฮัต, แม็กซิมิเลียน โคห์นส์, ไซมอน สเตฟาน, ฮานส์ ฮาสเซ, จาดราน วราเบค
นักพัฒนา	TU ไกเซอร์สเลาเทิร์น, TU เบอร์ลิน, HLRS สตุ๊ตการ์ท
ปล่อย	2011 ( 2011 )
เวอร์ชันเสถียร	1 พฤษภาคม 2021 / 29 พฤษภาคม 2021 ( 29 พฤษภาคม 2021 )
เขียนเป็น	ฟอร์ทราน
ระบบปฏิบัติการ	ลินุกซ์ , มอสซาเรลล่า , วินโดวส์
แพลตฟอร์ม	x86 , x86-64
ขนาด	250 MB
มีจำหน่ายใน	ภาษาอังกฤษ
พิมพ์	พลศาสตร์โมเลกุล , มอนเตคาร์โล
ใบอนุญาต	ลิขสิทธิ์แบบครีเอทีฟคอมมอนส์ CC by NC 3.0
เว็บไซต์	www.ms-2.de/home.html​​​​
ที่เก็บข้อมูล	www.ms-2.de/home.html​​​​

ms 2เป็นโปรแกรมจำลองโมเลกุลที่ไม่ใช่เชิงพาณิชย์ ^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]}ประกอบด้วยอัลกอริธึมการจำลองพลศาสตร์โมเลกุลและมอนเตคาร์โล ms 2 ได้รับการออกแบบมาเพื่อคำนวณคุณสมบัติทางเทอร์โมไดนามิกของของเหลว คุณสมบัติทางเทอร์โมไดนามิกจำนวนมากสามารถคำนวณได้อย่างง่ายดายโดยใช้ ms 2 เช่น สมดุลเฟส การขนส่ง และคุณสมบัติทางความร้อน ms 2 มีข้อจำกัดในการจำลองสถานะเอกพันธุ์

ms 2 ประกอบด้วยเทคนิคการจำลองโมเลกุลสองแบบ ได้แก่ พลศาสตร์โมเลกุล (MD) และมอนเตคาร์โลms 2 รองรับการคำนวณสมดุลไอ-ของเหลวของส่วนประกอบบริสุทธิ์และสารผสมหลายองค์ประกอบ วิธีการคำนวณสมดุลเฟสที่แตกต่างกันถูกนำมาใช้ในms 2 นอกจากนี้ms 2 ยังสามารถสุ่มตัวอย่างกลุ่มคลาสสิกต่างๆ เช่น NpT, NVE, NVT, NpH ได้อีกด้วย ในการประเมินศักยภาพทางเคมี มีการนำวิธีการโมเลกุลทดสอบของ Widom และการบูรณาการทางเทอร์โมไดนามิกมาใช้ นอกจากนี้ อัลกอริทึมสำหรับการสุ่มตัวอย่างคุณสมบัติการขนส่งก็ถูกนำมาใช้ในms 2 ด้วย คุณสมบัติการขนส่งถูกกำหนดโดยการจำลอง MD สมดุลตามหลักการของ Green-Kubo และหลักการของ Einstein

ms 2 ถูกใช้บ่อยครั้งในการทำนายคุณสมบัติทางเทอร์โมฟิสิกส์ของของเหลวสำหรับการใช้งานทางวิศวกรรมเคมี^{[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]}รวมถึงการคำนวณทางวิทยาศาสตร์และฟิสิกส์ของสสารอ่อน^{[ 10 ] [ 11 ]}มันถูกใช้เพื่อจำลองทั้งของเหลวจำลองและสารจริง ศักยภาพปฏิสัมพันธ์จำนวนมากถูกนำมาใช้ในms 2 เช่นศักยภาพ Lennard-Jones ศักยภาพ Mieปฏิสัมพันธ์ทางไฟฟ้าสถิต (ประจุจุด ไดโพลจุด และควอดรูโพลจุด) และแรงภายนอก ฟิลด์แรงจากฐานข้อมูลเช่นฐานข้อมูล MolMod ^{[ 12 ]}สามารถนำมาใช้ในms 2 ได้อย่างง่ายดาย

• การเปรียบเทียบซอฟต์แวร์สำหรับการสร้างแบบจำลองกลศาสตร์โมเลกุล
• รายชื่อซอฟต์แวร์การจำลองมอนเตคาร์โล
• รายชื่อซอฟต์แวร์โอเพนซอร์สและใช้งานได้ฟรี

• เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ