การสแกนหลายตัวพร้อมกันคือการเรียกใช้โปรแกรมป้องกันมัลแวร์หรือ โปรแกรม ป้องกันไวรัส หลายตัว พร้อมกัน ในอดีตจะมีเพียงโปรแกรมเดียวเท่านั้นที่สามารถสแกนระบบได้ในเวลาใดเวลาหนึ่ง การใช้โปรแกรมหลายตัวพร้อมกันอาจทำให้เกิดความขัดแย้งซึ่งนำไปสู่การหยุดทำงานของระบบและความล้มเหลวของแอปพลิเคชัน^{[ 1 ] [ 2 ]}อย่างไรก็ตาม แอปพลิเคชันด้านความปลอดภัยและชุดแอปพลิเคชันจำนวนมากได้ปรับปรุงโปรแกรมหลายตัวให้ทำงานร่วมกันได้

หน่วยงานทดสอบได้เผยแพร่ผลลัพธ์ที่แสดงให้เห็นว่าไม่มีเอ็นจิ้นป้องกันไวรัสใดที่มีประสิทธิภาพ 100% ในการป้องกันภัยคุกคามจากมัลแวร์ทุกประเภท^{[ 3 ] [ 4 ]}เนื่องจากเอ็นจิ้นแต่ละตัวใช้วิธีการสแกนที่แตกต่างกันและอัปเดตไฟล์คำจำกัดความมัลแวร์ด้วยความถี่ที่แตกต่างกัน การใช้เอ็นจิ้นหลายตัวจึงเพิ่มโอกาสในการตรวจจับมัลแวร์ก่อนที่จะส่งผลกระทบต่อระบบหรือเครือข่าย^{[ 5 ]}

• F-Secure – ผสานรวมเอ็นจิ้นภายในองค์กรเข้ากับเอ็นจิ้นของ Avira ^{[ 6 ]}
• G Data AntiVirus – ผสานรวมเอ็นจิ้นภายในและ ของ BitDefender avast ถูกลบออกในเวอร์ชัน 2014 ^{[ 7 ]}
• HitmanPro – ผสานรวมเอ็นจิ้นพฤติกรรมภายในองค์กรเข้ากับคลาวด์ที่มีเอ็นจิ้นจาก Kaspersky Lab, BitDefender และ Sophos ^{[ 8 ]}
• Lavasoft Ad-Aware – ผสานรวมระบบป้องกันสปายแวร์ที่พัฒนาขึ้นเองภายในบริษัทเข้ากับระบบของBitdefender
• Microsoft Forefront – รวมเอาเอ็นจิ้นของAuthentium , Kaspersky , Norman และVirusBusterเข้ากับเอ็นจิ้นภายในของตนเอง^{[ 9 ]}
• OPSWAT MetaDefender Cloud – รวมเอ็นจิ้นป้องกันมัลแวร์กว่า 30 ตัวเพื่อสแกนไฟล์หามัลแวร์ นอกจากนี้ยังมีให้บริการแบบติดตั้งบนเซิร์ฟเวอร์ภายในองค์กรด้วย^{[ 10 ]}
• Qihoo 360 Internet Securityใช้ Bitdefender Engine, QVM 2 Engine และ 360 Cloud Engine แต่ในเวอร์ชันภาษาจีนจะมี Avira Engine เพิ่มเข้ามาด้วย
• TrustPort Antivirus – ผสานรวมกลไกการทำงานของBitDefenderและAVGเข้า ด้วยกัน
• ไวรัสโททอล

• ความปลอดภัยทางอินเทอร์เน็ต