อ่าน 8 นาที
เอ็นเอฟยา
หน่วยย่อยอัลฟาของปัจจัยการถอดรหัสในนิวเคลียส Y เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน NFYA [ 5 ] [ 6 ]
เอ็นเอฟยา
| เอ็นเอฟยา | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | NFYA , CBF-A, CBF-B, HAP2, NF-YA, ปัจจัยการถอดรหัสนิวเคลียร์ Y หน่วยย่อยอัลฟา | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 189903 ; เอ็มจีไอ : 97316 ; โฮโมโลยีน : 32114 ; GeneCards : NFYA ; OMA : NFYA - orthologs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
หน่วยย่อยอัลฟาของปัจจัยการถอดรหัสในนิวเคลียส Yเป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนNFYA [ 5 ] [ 6 ]
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นซับยูนิตหนึ่งของคอมเพล็กซ์ไตรเมอร์ NF-Y ซึ่งก่อตัวเป็นปัจจัยการถอดรหัสที่มีการอนุรักษ์สูงซึ่งจับกับโมทีฟ CCAAT ในบริเวณโปรโมเตอร์ในยีนต่างๆ[ 7 ]ซับยูนิต NFYA เชื่อมโยงกับไดเมอร์ที่แน่นหนาซึ่งประกอบด้วยซับยูนิต NFYB และ NFYC ส่งผลให้เกิดไตรเมอร์ที่จับกับ DNA ด้วยความจำเพาะและความสัมพันธ์สูง ปฏิสัมพันธ์ที่จำเพาะต่อลำดับของคอมเพล็กซ์เกิดขึ้นโดยซับยูนิต NFYA ซึ่งบ่งชี้ถึงบทบาทในฐานะซับยูนิตควบคุม นอกจากนี้ยังมีหลักฐานของการควบคุมหลังการถอดรหัสในผลิตภัณฑ์ยีนนี้ ไม่ว่าจะโดยการย่อยสลายโปรตีนหรือการควบคุมการแปล การควบคุมเพิ่มเติมแสดงให้เห็นโดยการสลับการต่อเชื่อมในโดเมนการกระตุ้นที่อุดมด้วยกลูตามีน โดยมีความชอบเฉพาะเนื้อเยื่อที่ชัดเจนสำหรับไอโซฟอร์มทั้งสอง[ 8 ]
คอมเพล็กซ์ NF-Y ทำหน้าที่เป็นปัจจัยนำร่องโดยส่งเสริม การเข้าถึง โครมาตินเพื่ออำนวยความสะดวกให้ปัจจัยการถอดรหัสเฉพาะเซลล์ชนิดอื่น ๆ ที่อยู่ร่วมกัน[ 9 ]
NF-Y ยังมีส่วนเกี่ยวข้องกับ การเลือกตำแหน่งเริ่มต้น การถอดรหัส (TSS) ในสัตว์อีก ด้วย [ 10 ]โดยจะปกป้องความสมบูรณ์ของบริเวณที่ขาดนิวคลีโอโซมและการแปลตำแหน่ง PIC ที่โปรโมเตอร์ ยีนที่เข้ารหัส โปรตีน
ปฏิสัมพันธ์
NFYA ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับปัจจัยการตอบสนองต่อซีรั่ม[ 11 ]และZHX1 [ 11 ] [ 12 ] NFYA, NFYB และ NFYC ก่อตัวเป็นคอมเพล็กซ์ NFY และได้รับการแสดงให้เห็นว่าคอมเพล็กซ์ NFY ทำหน้าที่เป็นปัจจัยนำร่องโดยการส่งเสริมการเข้าถึงโครมาตินเพื่ออำนวยความสะดวกให้กับปัจจัยการถอดรหัสเฉพาะเซลล์ชนิดอื่น ๆ ที่อยู่ร่วมกัน[ 7 ]
โครงสร้าง
โครงสร้างอะตอมของเฮเทอโรไตรเมอร์ NFY ที่ซับซ้อนกับ dsDNA ได้รับการแก้ไขผ่านการวิเคราะห์ผลึกด้วยรังสีเอกซ์ ( รหัส PDB 4awl ) [ 13 ] โดยใช้ อัลฟาเฮลิกซ์ NFYA หนึ่งตัวเป็นแม่แบบเปปไทด์แบบสเตเปิลที่ ได้รับแรงบันดาลใจจากโครงสร้าง ถูกออกแบบมาเพื่อขัดขวางการก่อตัวของเฮเทอโรไตรเมอร์ NFY โดยการป้องกันไม่ให้ NFYA จับกับเฮเทอโรไดเมอร์ NFYB / C [ 14 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Mantovani R (ตุลาคม 1999). "ชีววิทยาโมเลกุลของปัจจัยการจับ CCAAT NF-Y" Gene . 239 (1): 15– 27. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00368-6 . PMID 10571030 .
- Li XY, Mantovani R, Hooft van Huijsduijnen R และคณะ (มีนาคม 1992) "ความแปรผันเชิงวิวัฒนาการของปัจจัยการถอดรหัสที่จับกับ CCAAT NF-Y" . Nucleic Acids Research . 20 (5): 1087– 1091. doi : 10.1093/nar/20.5.1087 . PMC 312095 . PMID 1549471 .
- Li XY, Hooft van Huijsduijnen R, Mantovani R และคณะ (พฤษภาคม 1992) "การจัดระเบียบอินตรอน-เอ็กซอนของยีน NF-Y การตัดต่อเฉพาะเนื้อเยื่อปรับเปลี่ยนโดเมนการกระตุ้น"วารสารเคมีชีวภาพ267 (13): 8984– 8990. doi : 10.1016 /S0021-9258(19)50377-5 . PMID 1577736 .
- Becker DM, Fikes JD, Guarente L (มีนาคม 1991). "ซีดีเอ็นเอที่เข้ารหัสโปรตีนที่จับกับ CCAAT ของมนุษย์ซึ่งถูกโคลนโดยการเสริมการทำงานในยีสต์" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 88 (5): 1968– 1972. Bibcode : 1991PNAS...88.1968B . doi : 10.1073/pnas.88.5.1968 . PMC 51147 . PMID 2000400 .
- Vuorio T, Maity SN, de Crombrugghe B (ธันวาคม 1990). "การทำให้บริสุทธิ์และการโคลนโมเลกุลของสายโซ่ "A" ของโปรตีน CCAAT-binding heteromeric ของหนู ความเหมือนของลำดับกับปัจจัยการถอดรหัส HAP3 ของยีสต์"วารสารชีวเคมี265 (36): 22480– 22486. doi : 10.1016 /S0021-9258(18)45730-4 . PMID 2266139 .
- Mantovani R, Li XY, Pessara U และคณะ (สิงหาคม 1994). "สารอะนาล็อกเชิงลบเด่นของ NF-YA"วารสารเคมีชีวภาพ 269 ( 32): 20340– 20346. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31997-X . PMID 8051128 .
- Currie RA (ธันวาคม 1997). "ปฏิสัมพันธ์เชิงหน้าที่ระหว่างโดเมนการสร้างไตรเมอร์ของหน่วยย่อยที่จับกับ DNA ของ NF-Y และโปรตีนกลุ่มเคลื่อนที่สูง HMG-I(Y)"วารสารเคมีชีวภาพ272 (49): 30880– 30888. doi : 10.1074 /jbc.272.49.30880 . PMID 9388234 .
- Currie RA (กรกฎาคม 1998). "ลักษณะทางชีวเคมีของคอมเพล็กซ์ปัจจัยการถอดรหัส NF-Y ในระหว่างการพัฒนาของลิมโฟไซต์ B" วารสารชีวเคมี 273 ( 29 ) : 18220– 18229. doi : 10.1074/jbc.273.29.18220 . PMID 9660784 .
- Roder K, Wolf SS, Larkin KJ และคณะ (มิถุนายน 1999). "ปฏิสัมพันธ์ระหว่างปัจจัยการถอดรหัสที่แสดงออกอย่างแพร่หลาย NF-Y และ Sp1" Gene . 234 (1): 61– 69. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00180-8 . PMID 10393239 .
- Yamada K, Printz RL, Osawa H และคณะ (สิงหาคม 1999). "Human ZHX1: การโคลน ตำแหน่งโครโมโซม และปฏิสัมพันธ์กับปัจจัยการถอดรหัส NF-Y" Biochemical and Biophysical Research Communications . 261 (3): 614– 621. Bibcode : 1999BBRC..261..614Y . doi : 10.1006/bbrc.1999.1087 . PMID 10441475 .
- Yamada K, Osawa H, Granner DK (ตุลาคม 1999). "การระบุโปรตีนที่โต้ตอบกับ NF-YA" FEBS Letters . 460 (1): 41– 45. Bibcode : 1999FEBSL.460...41Y . doi : 10.1016/S0014-5793(99)01311-3 . PMID 10571058 . S2CID 28576187 .
- Fan W, Jin S , Tong T และคณะ (มีนาคม 2545) "BRCA1 ควบคุม GADD45 ผ่านการโต้ตอบกับโมทีฟ OCT-1 และ CAAT"วารสารชีวเคมี 277 (10): 8061– 8067. doi : 10.1074 /jbc.M110225200 . PMID 11777930
- Faniello MC, Chirico G, Quaresima B และคณะ (เมษายน 2545). "แบบจำลองทางเลือกของการกระตุ้นการทำงานของโปรโมเตอร์ H ferritin โดย c-Jun"วารสารชีวเคมี 363 (ตอนที่ 1): 53–58 . doi : 10.1042/ 0264-6021 :3630053 . PMC 1222450. PMID 11903046 .
- Bevilacqua MA, Faniello MC, Iovine B และคณะ (พฤศจิกายน 2545) "ปัจจัยการถอดรหัส NF-Y ควบคุมการแยกความแตกต่างของเซลล์ CaCo-2" Archives of Biochemistry and Biophysics 407 ( 1): 39– 44. doi : 10.1016/S0003-9861(02)00436-8 . PMID 12392713 .
- Ge Y, Jensen TL, Matherly LH และคณะ (ธันวาคม 2545). การควบคุมการทำงานร่วมกันของโปรโมเตอร์ cystathionine-beta-synthase-1b ของมนุษย์โดยปัจจัยการถอดรหัส NF-YA isoforms และ Sp1" Biochimica และ Biophysica Acta (BBA) - โครงสร้างและการแสดงออกของยีน . 1579 ( 2– 3): 73– 80. ดอย : 10.1016/s0167-4781(02)00509-2 . PMID12427542 .
- Salsi V, Caretti G, Wasner M และคณะ (กุมภาพันธ์ 2546) "ปฏิสัมพันธ์ระหว่าง p300 และไตรเมอร์ NF-Y หลายตัวควบคุมการทำงานของโปรโมเตอร์ไซคลิน B2"วารสารชีวเคมี 278 ( 9): 6642– 6650. doi : 10.1074/jbc.M210065200 . hdl : 11380/1202119 . PMID 12482752 .
- Peng Y, Jahroudi N (มีนาคม 2546). "ปัจจัยการถอดรหัส NFY ยับยั้งการกระตุ้นโปรโมเตอร์ของปัจจัย von Willebrand ในเซลล์ที่ไม่ใช่เซลล์บุผนังหลอดเลือดผ่านการดึงดูดฮิสโตนดีอะเซทิเลส" วารสารเคมีชีวภาพ 278 ( 10 ) : 8385– 8394. doi : 10.1074/jbc.M213156200 . PMID 12511565 .
ลิงก์ภายนอก
- NFYA+โปรตีน+มนุษย์ ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
- แฟคเตอร์บุ๊คเอ็นเอฟ-ยูเอ
บทความนี้ได้นำข้อความจากหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกาด้านการแพทย์ มา ใช้ ซึ่งเป็นข้อมูลสาธารณะ
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ เอ็นเอฟยา
หน่วยย่อยอัลฟาของปัจจัยการถอดรหัสในนิวเคลียส Y เป็น โปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน NFYA [ 5 ] [ 6 ]
การทำงาน
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นซับยูนิตหนึ่งของคอมเพล็กซ์ไตรเมอร์ NF-Y ซึ่งก่อตัวเป็นปัจจัยการถอดรหัสที่มีการอนุรักษ์สูงซึ่งจับกับโมทีฟ CCAAT ในบริเวณโปรโมเตอร์ในยีนต่างๆ [ 7 ] ซับยูนิต NFYA เชื่อมโยงกับไดเมอร์ที่แน่นหนาซึ่งประกอบด้วยซับยูนิต NFYB และ NFYC...
ปฏิสัมพันธ์
NFYA ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามี ปฏิสัมพันธ์ กับ ปัจจัยการตอบสนองต่อซีรั่ม [ 11 ] และ ZHX1 [ 11 ] [ 12 ] NFYA, NFYB และ NFYC ก่อตัวเป็นคอมเพล็กซ์ NFY และได้รับการแสดงให้เห็นว่าคอมเพล็กซ์ NFY...
โครงสร้าง
โครงสร้างอะตอมของเฮเทอโรไตรเมอร์ NFY ที่ซับซ้อนกับ dsDNA ได้รับการแก้ไขผ่าน การวิเคราะห์ผลึกด้วยรังสีเอกซ์ ( รหัส PDB 4awl ) [ 13 ] โดยใช้ อัลฟาเฮลิกซ์ NFYA หนึ่งตัวเป็นแม่แบบ เปปไทด์แบบสเตเปิลที่ ได้รับแรงบันดาลใจจากโครงสร้าง...