เรืออัลบาทรอส IIIมีลักษณะคล้ายเรือประมงบอสตันโดยดาดฟ้าเรือจัดวางตามแบบฉบับเรือประมงบอสตันทั่วไป แม้ว่าจะมีขนาดยาวกว่าเรือประเภทเดียวกันส่วนใหญ่มากก็ตาม เรือลำนี้มีเครื่องกว้านลากอวน ไฟฟ้า ที่มีลวดขนาด 7/8 นิ้ว (2.22 ซม.) ยาว600 ฟาธอม (3,600 ฟุต; 1,100 เมตร) บนดรัมทั้งสอง ทำให้สามารถลากอวนในน้ำลึกได้ถึง 200 ฟาธอม (1,200 ฟุต; 370 เมตร)เรือมีห้องเก็บ ปลา ที่มีความจุ 50,000 ปอนด์ (22,680 กก. ) สำหรับปลาแช่แข็ง และตู้แช่แข็ง สองตู้ ตู้ หนึ่งสามารถแช่แข็งปลาได้อย่างรวดเร็วและรักษาอุณหภูมิไว้ที่ลบ 20 องศาฟาเรนไฮต์ (ลบ 28.9 องศาเซลเซียส ) ในขณะที่อีกตู้หนึ่งรักษาอุณหภูมิไว้ที่ประมาณ 32 องศาฟาเรนไฮต์ (0 องศาเซลเซียส)

เรืออัลบาทรอส IIIมีห้องปฏิบัติการสองห้องบนดาดฟ้าหลักถัดจากเครื่องกว้านอวน ห้องหนึ่งเป็นห้องปฏิบัติการเปียกเปิดออกสู่ดาดฟ้าทั้งด้านซ้ายและด้านขวาผ่านประตูแบบดัตช์ มีอ่าง ล้างสแตนเล ส อยู่ตรงกลางเหมาะสำหรับใช้ในการจัดการและตรวจสอบปลา และมีอ่างล้างขนาดเล็กสองอ่างในตู้บนผนังกั้นด้านนอก สำหรับงานทางเคมีและอุทกศาสตร์ห้องปฏิบัติการ อีกห้องหนึ่ง เป็นห้องปฏิบัติการแห้ง อยู่ด้านท้ายของห้องปฏิบัติการเปียก และใช้เป็นห้องสมุดด้วยมีโต๊ะทำงานขนาดใหญ่ เก้าอี้ ม้านั่ง และชั้นวางหนังสือ และในช่วงแรกๆ ใช้เป็นสำนักงานสำหรับนักวิทยาศาสตร์ที่ทำการศึกษาเบื้องต้นของข้อมูลที่รวบรวมได้ในทะเล แม้ว่าต่อมาจะเต็มไปด้วยอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์ที่เกี่ยวข้องกับการวิจัยโทรทัศน์ ใต้น้ำก็ตาม ^{[ 2 ]}

เรือมีบูมไฮโดรกราฟิกและเครื่องกว้านบนดาดฟ้าสะพานเดินเรือทั้งด้านซ้ายและด้านขวา บูมมีตัวเลื่อนเชิงกลซึ่ง ติด บล็อก ลดระดับ ไว้เพื่อควบคุมระยะห่างของลวดลดระดับจากราว^{[ 2 ]}

เรืออัลบาทรอส IIIมีที่พักสำหรับบุคลากร 35 คน ลูกเรือประจำเรือมี 21 คน (ต่อมาลดเหลือ 18 คน) และนักวิทยาศาสตร์ 6 คน นอกจากนี้ยังมีที่พักสำหรับบุคลากรเพิ่มเติมอีก 8 คน ซึ่งอาจเป็นลูกเรือเพิ่มเติมหรือนักวิทยาศาสตร์เพิ่มเติม ขึ้นอยู่กับความจำเป็นในการเดินทางแต่ละครั้ง^{[ 2 ]}

ภารกิจหลัก ของเรืออัลบาทรอสที่ 3คือการสำรวจด้านการประมงและสมุทรศาสตร์ในมหาสมุทรแอตแลนติกตะวันตก เฉียงเหนือ การเดินทางสำรวจทางวิทยาศาสตร์ครั้งแรกเริ่มต้นขึ้นในวันที่ 17 พฤษภาคม 1948 และเรือได้ปฏิบัติงานอย่างต่อเนื่องจนถึงเดือนกันยายน 1949 โดยทำการสำรวจในบริเวณNew England Banksทำการทดลองเกี่ยวกับการเลือกขนาดของตาข่ายในอวนลากแบบออตเตอร์เพื่อหาขนาดที่เหมาะสมที่สุดในการปล่อยให้ปลาขนาดเล็กหลุดรอดไปได้ และทำการสำรวจทางอุทกศาสตร์ เกี่ยวกับ แพลงก์ตอนกรมประมงและสัตว์ป่าหวังที่จะใช้ประโยชน์จากระวางบรรทุกปลาของเรือ โดยอนุญาตให้เรือจับปลาและนำมาขายเหมือนเรือประมงพาณิชย์ โดยรายได้จะนำไปชดเชยค่าใช้จ่ายในการดำเนินงานบางส่วน อย่างไรก็ตาม แนวคิดนี้พิสูจน์แล้วว่าไม่สามารถทำได้จริง จึงถูกยกเลิกหลังจากออกเดินทางไม่กี่ครั้งแรก และปัญหาการขาดแคลนเงินทุนเริ่มส่งผลกระทบต่อตารางการดำเนินงาน ในปี 1950 เรือต้องระงับการดำเนินงานในเดือนกันยายน ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2494 กรมประมงและสัตว์ป่าได้ให้ยืมเรือลำนี้แก่สถาบันสมุทรศาสตร์วูดส์โฮลที่วูดส์โฮลรัฐแมสซาชูเซตส์ เพื่อทำงานภายใต้ สัญญา ของสำนักงานวิจัยกองทัพเรือและนี่เป็นเงินทุนที่ช่วยให้เรือสามารถกลับมาดำเนินการได้อีกครั้ง ในปี พ.ศ. 2495 กรมประมงและสัตว์ป่าได้ดำเนินการเรือลำนี้เองภายใต้สัญญาที่คล้ายกัน ในที่สุดเรือก็กลับมาทำการวิจัยด้านการประมงอีกครั้งในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2496 เรือหยุดดำเนินการอีกครั้งเนื่องจากขาดแคลนเงินทุนในเดือนกันยายน พ.ศ. 2496 และถูกจอดทิ้งไว้ที่วูดส์โฮล^{[ 2 ]}

ในเดือนมกราคม ปี 1954 กรมประมงและสัตว์ป่าได้รับเงินทุนใหม่สำหรับการดำเนินงานของเรือ และเรืออัลบาทรอสที่ 3จึงกลับมาทำการวิจัยด้านการประมงอีกครั้ง และปฏิบัติงานอย่างต่อเนื่องจนถึงเดือนมีนาคม ปี 1959 โดยอยู่ภายใต้การควบคุมของสำนักประมงพาณิชย์แห่งใหม่ของกรมประมงและสัตว์ป่า อันเป็นผลมาจากการปรับโครงสร้างกิจกรรมของกรมประมงและสัตว์ป่าในปี 1956 ในช่วงชีวิตการทำงาน เรือได้ทำการสำรวจวิจัยด้านการประมงและสมุทรศาสตร์ 128 ครั้ง นอกชายฝั่งนิวอิงแลนด์และพื้นที่ใกล้เคียง งานส่วนใหญ่ของเรือเกี่ยวข้องกับโครงการของคณะกรรมการระหว่างประเทศเพื่อการประมงแอตแลนติกตะวันตกเฉียงเหนือซึ่งเกี่ยวข้องกับการควบคุมการประมงในพื้นที่ และมีส่วนสำคัญในการศึกษาการใช้ ทรัพยากร ปลาหน้าดินของมหาสมุทรแอตแลนติกตะวันตกเฉียงเหนือ งานของเรือได้วางรากฐานสำหรับโครงการวิจัยด้านการประมงในพื้นที่ที่กว้างขวางและเข้มข้นยิ่งขึ้น พัฒนาความรู้ที่จำเป็นสำหรับการจัดการการประมงอย่างชาญฉลาด และปรับปรุงความเข้าใจเกี่ยวกับความสัมพันธ์ของสภาพแวดล้อมกับผลผลิตของทรัพยากรการประมงในพื้นที่

เนื่องจากต้องเผชิญกับค่าใช้จ่ายในการบำรุงรักษาและการดำเนินงานที่เพิ่มขึ้นสำหรับเรือที่เก่าแก่ สำนักงานประมงพาณิชย์จึงปลดประจำการเรืออัลบาทรอส IIIในเดือนมีนาคม พ.ศ. 2492 ในเดือนพฤศจิกายนของปีนั้น เรือลำนี้ถูกขายให้กับIsland Steamship Lineแห่งไฮแอนนิส รัฐแมสซา ชูเซตส์ ซึ่งนำโดยโจเซฟ ที เจลินาส^{[ 2 ]}