โดเมน PAN
| PAN_1 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
โครงสร้างสารละลายของโมดูล PAN จากEimeria tenella | |||||||
| ตัวระบุ | |||||||
| เครื่องหมาย | PAN_1 | ||||||
| พีแฟม | PF00024 | ||||||
| ตระกูลพีแฟม | ซีแอล0168 | ||||||
| อินเตอร์โปร | IPR003014 | ||||||
| โปรไซต์ | PDOC00376 | ||||||
| สโคป2 | 1bht / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| |||||||
โดเมนPANมีความสามารถในการทำงานที่หลากหลายอย่างมีนัยสำคัญ โดยทำหน้าที่ทางชีวภาพ ที่หลากหลายด้วยการเป็นตัวกลางในปฏิสัมพันธ์ระหว่าง โปรตีนกับโปรตีนและ โปรตีน กับคาร์โบไฮเดรต[ 1 ]โดเมนเหล่านี้มี โครงสร้างคล้าย ห่วงผมคล้ายกับที่พบในน็อตตินแต่มีรูปแบบของพันธะไดซัลไฟด์ที่ แตกต่างกัน
มีการแสดงให้เห็นว่าโดเมน N-terminal ของสมาชิกใน กลุ่ม พลาสมิโนเจน / ปัจจัยการเจริญเติบโตของเซลล์ตับโดเมนแอปเปิลของ กลุ่ม พรีแคลลิเครอินในพลาสมา / ปัจจัยการแข็งตัวของเลือด XIและโดเมนของ โปรตีน หนอนตัวกลม ชนิดต่างๆ อยู่ในกลุ่มโมดูลซูเปอร์แฟมิลีเดียวกัน คือ โมดูล PAN [ 1 ]โดเมน PAN ประกอบด้วย แกนกลาง ที่อนุรักษ์ไว้ซึ่งประกอบด้วยสะพานไดซัลไฟด์สามแห่ง ในสมาชิกบางส่วนของกลุ่มนี้จะมีสะพานไดซัลไฟด์ที่สี่เพิ่มเติมซึ่งเชื่อมปลายN-และC-terminusของโดเมน
โดเมนแอปเปิล เช่นเดียวกับตัวอย่างอื่นๆ ของโดเมน PAN ประกอบด้วยβ-strand เจ็ดเส้นที่พับเป็น แผ่นขนานโค้งที่รองรับα-helixพันธะไดซัลไฟด์สองพันธะล็อกเฮลิกซ์ไว้กับ β4 และ β5 ตรงกลาง ในขณะที่พันธะที่สามเชื่อมต่อปลาย N และ C ของโดเมน ในโดเมนแอปเปิล ลูป β4–β5 และลูปไขว้ β5–β6 สร้างช่องเล็กๆ บนด้านตรงข้ามของแผ่นจาก α-helix [ 2 ]
ในพลาสมิโนเจนตามธรรมชาติ โดเมน PAN จะเชื่อมโยงกับโดเมนkringle ห้าโดเมน [ 3 ]ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโดเมน PAN และ kringle มีบทบาทสำคัญในการทำให้คอมเพล็กซ์ควอเทอร์นารีของพลาสมิโนเจนตามธรรมชาติมีความเสถียร