กลับไปหน้าบทความ

อ่าน 1 นาที

รายงาน PDB

ฐาน ข้อมูล PDBREPORT เป็นฐานข้อมูลของความผิดปกติและข้อผิดพลาดที่พบในโครงสร้างของโมเลกุลชีวภาพใน Protein Data Bank [ 1 ]

รายงาน PDB

ฐาน ข้อมูล PDBREPORTเป็นฐานข้อมูลของความผิดปกติและข้อผิดพลาดที่พบในโครงสร้างของโมเลกุลชีวภาพในProtein Data Bank [ 1 ]

ฐานข้อมูล PDBREPORTS เป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์สำหรับการประเมินคุณภาพของโครงสร้างโปรตีนใน โครงการ ชีวสารสนเทศโครงสร้างโปรตีนแบบจำลองทางคอมพิวเตอร์ และถูกใช้บ่อยครั้งโดยผู้เข้าร่วมการแข่งขันการสร้างแบบจำลองความคล้ายคลึงกันของCASP PDBREPORTS สร้างขึ้นโดยใช้ซอฟต์แวร์ WHAT_CHECK WHAT_CHECK เป็นตัวเลือกหนึ่งของซอฟต์แวร์ WHAT IF ที่ใช้ตรวจสอบความถูกต้องของโมเลกุลขนาดใหญ่ (โดยเฉพาะโปรตีน )

ตัวเลือก WHAT_CHECK หลายตัวกำหนดค่าความปกติ กล่าวคือ จำนวนค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานที่ค่าสังเกตใดๆ เบี่ยงเบนจากค่าเฉลี่ย และในกรณีส่วนใหญ่ เหตุการณ์ดังกล่าวจะถูกแสดงรายการหากค่าเบี่ยงเบนมากกว่า 4 ซิกมา ซึ่งหมายความว่าหนึ่งในหมื่นของความผิดปกติที่แสดงนั้นเป็นของจริงและไม่ใช่ข้อผิดพลาด ส่วน 'การตรวจสอบความถูกต้อง' ในหน้า WHAT_CHECK จะอธิบายเรื่องนี้โดยละเอียดเพิ่มเติม

ปัญหา

ข้อมูลใน PDBREPORT อาจถือได้ว่าเป็นรายงานข้อผิดพลาดสำหรับโครงสร้าง โมเลกุลขนาดใหญ่ ที่ถูกบันทึกไว้ในPDB ควรใช้ คำว่า " รายงานข้อผิดพลาด"ด้วยความระมัดระวัง เนื่องจากซอฟต์แวร์ WHAT_CHECK ที่สร้าง PDBREPORT จะระบุความผิดปกติทุกอย่างที่มีค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานสี่เท่าขึ้นไปว่าเป็นข้อผิดพลาด ความผิดปกติที่รายงานบางส่วนอาจเป็นการเบี่ยงเบนจากค่าเฉลี่ย ที่แท้จริง มากกว่าจะเป็นข้อผิดพลาด

ดึงข้อมูลมาจาก " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PDBREPORT&oldid=1240687076 "

สรุปเนื้อหา

ข้อมูลสำคัญจากบทความ

ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ รายงาน PDB

ฐาน ข้อมูล PDBREPORT เป็นฐานข้อมูลของความผิดปกติและข้อผิดพลาดที่พบในโครงสร้างของโมเลกุลชีวภาพใน Protein Data Bank [ 1 ]

ปัญหา

ข้อมูลใน PDBREPORT อาจถือได้ว่าเป็นรายงานข้อผิดพลาดสำหรับ โครงสร้าง โมเลกุลขนาดใหญ่ ที่ถูกบันทึกไว้ใน PDB ควรใช้ คำว่า " รายงานข้อผิดพลาด" ด้วยความระมัดระวัง เนื่องจากซอฟต์แวร์ WHAT_CHECK ที่สร้าง PDBREPORT...