PDBWikiเป็นวิกิ ที่ทำหน้าที่เป็น ฐานข้อมูลที่ผู้ใช้ร่วมกัน สร้างคำอธิบาย โครงสร้างโปรตีนโดยแสดงรายการโครงสร้างโปรตีนทั้งหมดที่มีอยู่ในProtein Data Bank (PDB) เว็บไซต์นี้ทำงานบนแอปพลิเคชันวิกิMediaWiki ตั้งแต่ปี 2007 ถึง 2013 ^{[ 1 ] [ 2 ]}เว็บไซต์ปิดตัวลงในปี 2014 และไม่มีวิธีใดที่จะเข้าถึงข้อมูลที่ผู้ใช้ร่วมกันสร้างได้อีกต่อไป PDBWiki มีรายละเอียดของโครงสร้างโปรตีนมากกว่า 50,000 โครงสร้าง และคำอธิบายที่ผู้ใช้ร่วมกันสร้างมากกว่า 50 รายการ ทำให้เป็นแหล่งข้อมูลที่สำคัญสำหรับชุมชนชีววิทยาโครงสร้าง

ฐานข้อมูลโปรตีน (Protein Data Bankหรือ PDB) เป็นแหล่งเก็บข้อมูลโครงสร้างชีวโมเลกุลที่ได้รับการแก้ไขจากการทดลอง อย่างไรก็ตาม PDB อนุญาตให้ดึงข้อมูลได้เท่านั้น และไม่มีฟังก์ชันสำหรับการทำงานร่วมกันหรือการให้ข้อเสนอแนะจากผู้ใช้ ในทางตรงกันข้าม PDBWiki อนุญาตให้แบ่งปันความรู้ของผู้เชี่ยวชาญเกี่ยวกับโครงสร้างที่ฝากไว้ใน PDB โดยมีเครื่องมือสำหรับการอภิปรายและใส่คำอธิบายประกอบโปรตีนในลักษณะการทำงานร่วมกัน เป้าหมายคือการสร้างแหล่งเก็บข้อมูลส่วนกลางที่เข้าถึงได้ฟรีซึ่งรวบรวมข้อมูลจากผู้ใช้และจะเป็นประโยชน์สำหรับทุกคนที่ทำงานกับโครงสร้าง PDB ดังนั้น PDBWiki จึงถือเป็นส่วนหนึ่งของความพยายามที่กว้างขึ้นในการดูแลจัดการฐานข้อมูลทางชีววิทยาโดยชุมชน^{[ 3 ] [ 4 ]}

PDBWiki ได้รับการพัฒนาขึ้นเป็นส่วนหนึ่งของ โครงการ BioWikiและได้ส่งเข้าประกวดในการแข่งขันเนื้อหาข้อมูลชีวภาพแบบเปิดเสรีระดับนานาชาติครั้งที่ 3 ซึ่งจัดโดย BiO.CC เว็บไซต์ข้อมูลชีวภาพที่ดำเนินการโดย KOBIC

เว็บไซต์ดังกล่าวปิดตัวลงในเดือนมกราคม 2014 และถูกแทนที่ด้วยข้อความแจ้งให้เปลี่ยนเส้นทางไปยังProteopediaซึ่งเป็นโครงการฐานข้อมูลชีววิทยาโครงสร้างบนระบบวิกิที่คล้ายคลึงกัน

• โครงการวิกิเกี่ยวกับชีววิทยาระดับโมเลกุลและเซลล์

• หน้าแรกของPDBWiki
• เกี่ยวกับ PDBWiki
• ธนาคารข้อมูลโปรตีนทั่วโลก