พีดีลิม5
โปรตีนโดเมน PDZ และ LIM 5เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนPDLIM5 [ 5 ] [ 6 ]
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นโปรตีนโดเมน LIM โดเมน LIM เป็นนิ้วสังกะสีคู่ที่อุดมด้วยซิสเทอีนซึ่งประกอบด้วยกรดอะมิโน 50 ถึง 60 ตัวที่เกี่ยวข้องกับปฏิกิริยาระหว่างโปรตีน โปรตีนที่มีโดเมน LIM เป็นโครงสร้างสำหรับการสร้างคอมเพล็กซ์โปรตีนหลายชนิด โปรตีนเหล่านี้เกี่ยวข้องกับการจัดระเบียบโครงร่างเซลล์ การกำหนดสายพันธุ์เซลล์ การพัฒนาอวัยวะ และการเกิดมะเร็ง โปรตีนที่เข้ารหัสนี้ยังเป็นสมาชิกของโปรตีนในกลุ่ม Enigma ซึ่งเป็นตระกูลโปรตีนที่มีโดเมน PDZ 100 กรดอะมิโนที่ปลาย Nและโดเมน LIM 1 ถึง 3 โดเมนที่ปลาย C มีการค้นพบตัวแปรการถอดรหัสหลายตัวที่เข้ารหัสไอโซฟอร์มที่แตกต่างกันสำหรับยีนนี้ แม้ว่าจะยังไม่ได้มีการระบุลักษณะทั้งหมดอย่างสมบูรณ์ก็ตาม[ 6 ]
ปฏิสัมพันธ์
PDLIM5 ได้รับการแสดงให้เห็นว่ามีปฏิสัมพันธ์กับPRKCB1 [ 7 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Sudo K, Chinen K, Nakamura Y (1995). "แท็กแสดงลำดับ (EST) จำนวน 2058 รายการจากคลัง cDNA ปอดทารกในครรภ์มนุษย์" Genomics . 24 (2): 276– 9. doi : 10.1006/geno.1994.1616 . PMID 7698749 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "การทำให้เป็นมาตรฐานและการลบ: สองแนวทางเพื่ออำนวยความสะดวกในการค้นพบยีน" . Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Kuroda S, Tokunaga C, Kiyohara Y และ คณะ (1997). "ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีนของโดเมน LIM ของนิ้วสังกะสีกับโปรตีนไคเนส C" . J. Biol. Chem . 271 (49): 31029– 32. doi : 10.1074/jbc.271.49.31029 . PMID 8940095 .
- Ueki N, Seki N, Yano K และ คณะ (1999). "การแยก การแสดงออกในเนื้อเยื่อ และการกำหนดโครโมโซมของยีนโปรตีน LIM ของมนุษย์ ซึ่งแสดงความเหมือนกับยีน enigma homologue (ENH) ของหนู" . J. Hum. Genet . 44 (4): 256– 60. doi : 10.1007/s100380050155 . PMID 10429367 .
- Nakagawa N, Hoshijima M, Oyasu M และคณะ (2000). "ENH ซึ่งประกอบด้วยโดเมน PDZ และ LIM โปรตีนเฉพาะของกล้ามเนื้อหัวใจ/กล้ามเนื้อโครงร่าง เชื่อมโยงกับโปรตีนโครงร่างเซลล์ผ่านโดเมน PDZ" Biochem. Biophys. Res. Commun . 272 (2): 505– 12. doi : 10.1006/bbrc.2000.2787 . PMID 10833443 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "การโคลนนิ่ง DNA โดยใช้การรวมตัวใหม่เฉพาะตำแหน่งในหลอดทดลอง" . Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R และ คณะ (2001). "มุ่งสู่แคตตาล็อกยีนและโปรตีนของมนุษย์: การจัดลำดับและการวิเคราะห์ cDNA ของมนุษย์ที่เข้ารหัสโปรตีนสมบูรณ์ใหม่ 500 รายการ" . Genome Res . 11 (3): 422– 35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A และ คณะ (2001). "การระบุตำแหน่งย่อยของเซลล์อย่างเป็นระบบของโปรตีนใหม่ที่ระบุโดยการ จัดลำดับ cDNA ขนาดใหญ่" EMBO Rep . 1 (3): 287– 92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH และ คณะ (2003). "การสร้างและการวิเคราะห์เบื้องต้นของลำดับ cDNA ของมนุษย์และหนูที่มีความยาวเต็มมากกว่า 15,000 ลำดับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Maeno-Hikichi Y, Chang S, Matsumura K และ คณะ (2003). "คอมเพล็กซ์ช่อง PKC epsilon-ENH ปรับการทำงานของช่อง Ca2+ ชนิด N โดยเฉพาะ" Nat. Neurosci . 6 (5): 468– 75. doi : 10.1038/nn1041 . PMID 12665800 . S2CID 19964052 .
- Iwamoto K, Kakiuchi C, Bundo M และ คณะ (2004). "การจำแนกลักษณะทางโมเลกุลของโรคอารมณ์สองขั้วโดยการเปรียบเทียบโปรไฟล์การแสดงออกของยีนในสมองหลังการเสียชีวิตของผู้ป่วยโรคทางจิตเวชที่สำคัญ" . Mol. Psychiatry . 9 (4): 406– 16. doi : 10.1038/sj.mp.4001437 . PMID 14743183 .
- Petroziello J, Yamane A, Westendorf L และ คณะ (2004). "การผสมแบบลบออกและการโปรไฟล์การแสดงออกที่ยับยั้งระบุชุดยีนเฉพาะที่แสดงออกมากเกินไปในมะเร็งปอดชนิดไม่ใช่เซลล์ขนาดเล็ก" Oncogene . 23 ( 46): 7734– 45. doi : 10.1038/sj.onc.1207921 . PMID 15334068 .
- อิวาโมโตะ เค, บันโด เอ็ม, วาชิซึกะ เอส และ คณะ (2547) "การแสดงออกของ HSPF1 และ LIM ในเซลล์เม็ดเลือดขาวที่ได้มาจากผู้ป่วยโรคไบโพลาร์และโรคจิตเภท " เจ. ฮัม. เจเนท . 49 (5): 227– 31. ดอย : 10.1007/s10038-004-0136-5 . PMID15362566 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). "From ORFeome to Biology: A Functional Genomics Pipeline". Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Niederländer N, Fayein NA, Auffray C, Pomiès P (2005). "Characterization of a new human isoform of the enigma homolog family specifically expressed in skeletal muscle". Biochem. Biophys. Res. Commun. 325 (4): 1304–11. doi:10.1016/j.bbrc.2004.10.178. PMID 15555569.
- Kato T, Iwayama Y, Kakiuchi C, et al. (2005). "Gene expression and association analyses of LIM (PDLIM5) in bipolar disorder and schizophrenia". Mol. Psychiatry. 10 (11): 1045–55. doi:10.1038/sj.mp.4001719. PMID 16044170.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Horiuchi Y, Arai M, Niizato K, et al. (2006). "A polymorphism in the PDLIM5 gene associated with gene expression and schizophrenia". Biol. Psychiatry. 59 (5): 434–9. doi:10.1016/j.biopsych.2005.07.041. PMID 16213469. S2CID 22930796.