อ่าน 6 นาที
โดเมน POU
POU (ออกเสียงว่า 'พาว') เป็นกลุ่มของปัจจัยการถอดรหัสยูคาริโอต ที่มีโดเมนโฮมีโอที่ได้ รับการอนุรักษ์ไว้อย่างดี โดเมนPouเป็นโดเมนการจับกับ DNA แบบสองส่วน ที่พบในโปรตีนเหล่านี้
โดเมน POU
| โดเมน Pou - ปลาย N ของโดเมน homeobox | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||
| เครื่องหมาย | ปู | ||||||
| พีแฟม | PF00157 | ||||||
| อินเตอร์โปร | IPR000327 | ||||||
| โปรไซต์ | PDOC00035 | ||||||
| สโคป2 | 1 ต.ค. / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| |||||||
POU (ออกเสียงว่า 'พาว') เป็นกลุ่มของปัจจัยการถอดรหัสยูคาริโอต ที่มีโดเมนโฮมีโอที่ได้ รับการอนุรักษ์ไว้อย่างดี [ 1 ]โดเมนPouเป็นโดเมนการจับกับ DNA แบบสองส่วน ที่พบในโปรตีนเหล่านี้
นิรุกติศาสตร์
คำย่อ POU มาจากชื่อของปัจจัยการถอดรหัสสามตัว ได้แก่:
- Pit -1เฉพาะต่อมใต้สมอง
- โปรตีนปัจจัยการถอดรหัส Octamer Oct -1และOct-2 ( ลำดับ Octamer คือ ATGCAAAT)
- ปัจจัย การถอดรหัส U nc-86 ในระบบประสาท จาก Caenorhabditis elegans
ความหลากหลาย
ยีนโดเมน POU ได้รับการอธิบายไว้ในสิ่งมีชีวิตที่แตกต่างกันอย่างมาก เช่น Caenorhabditis elegans , Drosophila , Xenopus , ปลา ซีบราและมนุษย์ แต่ยังไม่พบในพืช และเชื้อรา
การเปรียบเทียบยีนโดเมน POU ในสัตว์ต่าง ๆ ชี้ให้เห็นว่าตระกูลนี้สามารถแบ่งออกเป็น 6 กลุ่มหลัก (POU1-POU6) Pit-1เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่ม POU1, Oct-1และOct-2เป็นสมาชิกของ POU2 ในขณะที่ Unc-86 เป็นสมาชิกของPOU4กลุ่มทั้ง 6 กลุ่มแยกตัวออกจากกันในช่วงต้นของการวิวัฒนาการของสัตว์: กลุ่ม POU1, POU3, POU4 และ POU6 วิวัฒนาการมาก่อนบรรพบุรุษร่วมสุดท้ายของฟองน้ำและยูเมตาโซแอนส์ POU2 วิวัฒนาการในBilateraและ POU5 ดูเหมือนจะเป็นเอกลักษณ์เฉพาะของสัตว์มีกระดูกสันหลัง[ 2 ]
มีการอนุรักษ์ลำดับกรดอะมิโนในระดับสูงอย่างน่าประหลาดใจ (37%-42%) ของโฮมีโอโดเมน POU ต่อตัวควบคุมการถอดรหัส comS ซึ่งเป็นโปรตีนความสามารถจากแบคทีเรียแกรมบวกBacillus subtilis [ 3 ] คล้าย กับวิธีที่ตัวควบคุมโฮมีโอโดเมน POU นำไปสู่การแยกเนื้อเยื่อในสัตว์หลายเซลล์ปัจจัยการถอดรหัสนี้มีความสำคัญต่อการแยกกลุ่มย่อยของB. subtilisไปสู่สถานะความสามารถทางพันธุกรรม
การทำงาน
โปรตีน POU เป็นปัจจัยการถอดรหัสของ ยูคาริโอต ที่มีโดเมนการจับกับ DNA แบบสองส่วน ที่เรียกว่าโดเมน POU สมาชิกต่างๆ ของตระกูล POU มีหน้าที่หลากหลาย ซึ่งทั้งหมดเกี่ยวข้องกับการทำงานของระบบประสาทต่อมไร้ท่อ[ 4 ]และการพัฒนาของสิ่งมีชีวิต[ 5 ]ยีนอื่นๆ บางส่วนก็ได้รับการควบคุมเช่นกัน รวมถึงยีนสำหรับ โซ่ เบาและหนักของ อิมมูโนโกลบูลิน (Oct-2) [ 6 ] [ 7 ]และ ยีน ฮอร์โมนบำรุงเช่น ยีนสำหรับโปรแลคตินและฮอร์โมนการเจริญเติบโต (Pit-1)
โครงสร้าง
โดเมน POU เป็นโดเมนแบบไบพาร์ไทต์ที่ประกอบด้วยสองหน่วยย่อยที่คั่นด้วยบริเวณที่ไม่ได้รับการอนุรักษ์ขนาด 15-55 กรด อะมิโน หน่วย ย่อยปลาย Nเรียกว่าโดเมนเฉพาะ POU (POUs) ( InterPro : IPR000327 ) ในขณะที่ หน่วยย่อย ปลาย Cเป็นโดเมนโฮมีโอโบกซ์ ( InterPro : IPR007103 ) โครงสร้างสามมิติของคอมเพล็กซ์ที่รวมโดเมนย่อย POU ทั้งสองที่จับกับ DNA นั้นมีอยู่แล้ว โดเมนย่อยทั้งสองมีโครงสร้างโมทีฟ ' เฮลิกซ์-เทิร์น-เฮลิกซ์ ' ซึ่งเชื่อมโยงโดยตรงกับส่วนประกอบสองส่วนของไซต์การจับ DNA แบบไบพาร์ไทต์ และทั้งสองจำเป็นสำหรับการจับ DNA ที่มีความสัมพันธ์สูงและจำเพาะต่อลำดับ โดเมนนี้อาจเกี่ยวข้องกับปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนกับโปรตีนด้วย[ 8 ]โดเมนย่อยเชื่อมต่อกันด้วยตัวเชื่อมที่ยืดหยุ่น[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]ในโปรตีน โดเมนเฉพาะ POU มักจะมาพร้อมกับโดเมนโฮมีโอเสมอ แม้จะไม่มีลำดับที่เหมือนกัน แต่โครงสร้างสามมิติของ POU ก็คล้ายกับโครงสร้างสามมิติของตัวยับยั้งแบคทีริโอเฟจแลมบ์ดาและสมาชิกอื่นๆ ในกลุ่ม HTH_3 [ 9 ] [ 10 ]
ตัวอย่าง
ยีนของมนุษย์ที่เข้ารหัสโปรตีนที่มีโดเมน POU และยีนเทียม ที่เกี่ยวข้อง ได้แก่:
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ โดเมน POU
POU (ออกเสียงว่า 'พาว') เป็นกลุ่มของปัจจัยการถอดรหัสยูคาริโอต ที่มีโดเมนโฮมีโอที่ได้ รับการอนุรักษ์ไว้อย่างดี โดเมนPouเป็นโดเมนการจับกับ DNA แบบสองส่วน ที่พบในโปรตีนเหล่านี้
นิรุกติศาสตร์
คำย่อ POU มาจากชื่อของปัจจัยการถอดรหัสสามตัว ได้แก่:
ความหลากหลาย
ยีน โดเมน POU ได้รับการอธิบายไว้ในสิ่งมีชีวิตที่แตกต่างกันอย่างมาก เช่น Caenorhabditis elegans , Drosophila , Xenopus , ปลา ซีบรา และมนุษย์ แต่ยังไม่พบใน พืช และ เชื้อรา
การทำงาน
โปรตีน POU เป็น ปัจจัยการถอดรหัสของ ยูคาริโอต ที่มี โดเมนการจับกับ DNA แบบสองส่วน ที่เรียกว่าโดเมน POU สมาชิกต่างๆ ของตระกูล POU มีหน้าที่หลากหลาย ซึ่งทั้งหมดเกี่ยวข้องกับการทำงานของ ระบบประสาทต่อมไร้ท่อ [ 4 ] และการพัฒนาของสิ่งมีชีวิต [ 5 ] ยีนอื่นๆ...