ภาพพิมพ์
ในชีววิทยาโมเลกุล ฐานข้อมูล PRINTSเป็นชุดของสิ่งที่เรียกว่า "ลายนิ้วมือ" [ 1 ] [ 2 ]ซึ่งให้ทั้งแหล่งข้อมูลคำอธิบายโดยละเอียดสำหรับตระกูลโปรตีนและเครื่องมือวินิจฉัยสำหรับลำดับที่กำหนดใหม่ ลายนิ้วมือคือกลุ่มของโมทีฟ ที่อนุรักษ์ไว้ ซึ่งนำมาจากการจัดเรียงลำดับหลายลำดับ - โมทีฟเหล่านี้รวมกันเป็นลายเซ็นลักษณะเฉพาะสำหรับตระกูลโปรตีนที่จัดเรียง โมทีฟเหล่านี้ไม่จำเป็นต้องต่อเนื่องกันในลำดับ แต่สามารถรวมกันในพื้นที่ 3 มิติเพื่อกำหนดตำแหน่งการจับโมเลกุลหรือพื้นผิวปฏิสัมพันธ์ จุดแข็งในการวินิจฉัยที่สำคัญของลายนิ้วมืออยู่ที่ความสามารถในการแยกแยะความแตกต่างของลำดับในระดับแคลน ซูเปอร์แฟมิลี แฟมิลี และซับแฟมิลี สิ่งนี้ช่วยให้สามารถวินิจฉัยการทำงานอย่างละเอียดของลำดับที่ไม่ได้รับการระบุลักษณะ ทำให้สามารถแยกแยะระหว่างสมาชิกในแฟมิลีบนพื้นฐานของลิแกนด์ที่พวกมันจับหรือโปรตีนที่พวกมันมีปฏิสัมพันธ์ด้วย และเน้นตำแหน่งโอลิโกเมอไรเซชันหรืออัลโลสเตอริกที่อาจเกิดขึ้นได้
ก่อนหน้านี้ PRINTS เคยตั้งอยู่ที่ศูนย์การศึกษาและวิจัยด้านชีวสารสนเทศของมหาวิทยาลัยแมนเชสเตอร์ แต่ได้ยุติการให้บริการแล้ว และInterProทำหน้าที่เป็นคลังเก็บข้อมูล[ 3 ]
ลิงก์ภายนอก
- ฐานข้อมูล PRINTS ที่จัดเก็บไว้ใน InterPro