ไวรัสไข้หวัดใหญ่สายพันธุ์ A ชนิด H5N1ซึ่งเป็นสายพันธุ์ที่ก่อโรคสูงของไวรัสไข้หวัดใหญ่ถูกตรวจพบครั้งแรกในประชากรห่านในมณฑลกวางตุ้งประเทศจีน ในปี 1996 ^{[ 3 ]}

ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2547 มีการตรวจพบไวรัส ไข้หวัดนกในนกที่ประเทศเวียดนามทำให้เกิดความกังวลเกี่ยวกับการเกิดขึ้นของสายพันธุ์ใหม่ เกรงกันว่าหากไวรัสไข้หวัดนกผสมกับไวรัสไข้หวัดใหญ่ในมนุษย์ (ไม่ว่าจะเป็นในนกหรือในมนุษย์) สายพันธุ์ใหม่ที่เกิดขึ้นอาจแพร่ระบาดได้ง่ายและมีอันตรายถึงชีวิตสูง

ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2548 พบผู้ป่วยไข้หวัดนก (สายพันธุ์H5N1 ที่ร้ายแรง) ใน ตุรกี มาร์คอส คีปริอานู กรรมาธิการด้านสุขภาพของสหภาพ ยุโรปกล่าวว่า "ขณะนี้เราได้รับการยืนยันแล้วว่าไวรัสที่พบในตุรกีเป็นไวรัสไข้หวัดนก H5N1 มีความสัมพันธ์โดยตรงกับไวรัสที่พบในรัสเซียมองโกเลียและจีน " หลังจากนั้นไม่นานก็พบผู้ป่วยไข้หวัดนกในโรมาเนียและกรีซนอกจากนี้ยังพบผู้ป่วยที่อาจติดเชื้อไวรัสในโครเอเชียบัลแกเรียและสหราชอาณาจักร^{[ 4 ]}อย่างไรก็ตามณ สิ้นเดือนตุลาคม มีผู้เสียชีวิตจาก H5N1 เพียง 67 ราย ซึ่งผิดปกติจากการระบาดใหญ่ของ ไข้หวัดใหญ่ครั้งก่อน ๆ

การระบาดของ H5N1 ในนก โดยเฉพาะสัตว์ปีก ทำให้เกิดการระบาดใหญ่ทั่วโลก ในปี 2555 มีนกประมาณ 400 ล้านตัวที่ตายจากการติดเชื้อไข้หวัดใหญ่สายพันธุ์ H5N1 การศึกษาแสดงให้เห็นว่าH5N1ปรับตัวเข้ากับเป็ดและห่านบ้านได้เป็นอย่างดี ทำให้พวกมันเป็นกุญแจสำคัญในการควบคุมสายพันธุ์ H5N1 และป้องกันการระบาดใหญ่ทั่วโลกในอนาคต^{[ 3 ]}

ปัจจุบัน เชื้อไข้หวัดนกสายพันธุ์เอเชียที่มีความรุนแรงสูงยังคงคร่าชีวิตสัตว์ปีกและนกป่าอย่างต่อเนื่องในระดับระบาดทั่วโลก การคงอยู่ของเชื้อโรคดังกล่าวในสิ่งแวดล้อมจะนำไปสู่การทำลายล้างนกในระดับระบาดทั่วโลกต่อไป เพื่อพยายามควบคุมสิ่งนี้ นักวิทยาศาสตร์ได้ทำการวิจัยโดยใช้ขนที่ร่วงของเป็ดบ้านเพื่อทดสอบการแพร่กระจายของ H5N1 แม้ว่าจะพบการคงอยู่ของไวรัสในน้ำดื่มและอุจจาระ แต่ขนกลับแสดงให้เห็นถึงเชื้อ H5N1 ที่คงอยู่นานที่สุดถึง 160 วัน^{[ 5 ]}การคงอยู่ของเชื้อที่พบในขนบ่งชี้ถึงศักยภาพในการปนเปื้อนสิ่งแวดล้อมไม่เพียงแต่ H5N1 เท่านั้น แต่ยังรวมถึงไวรัสอื่นๆ ที่ยังไม่ได้ทดสอบด้วย

โรคจมูกขาว (WNS) เป็นการติดเชื้อราที่แพร่กระจายอย่างรวดเร็ว ซึ่งเป็นสาเหตุของการตายของค้างคาวหลายล้านตัวในช่วง 9 ปีที่ผ่านมาในสหรัฐอเมริกาและแคนาดา^{[ 6 ]} Geomyces-destructansเป็นเชื้อราที่เป็นสาเหตุของรอยโรคที่ผิวหนังซึ่งพบเห็นได้บนผิวหนังที่สัมผัส โดยเฉพาะอย่างยิ่งบนปีกและจมูก และในรูขุมขนของค้างคาวที่ได้รับผลกระทบ WNS เพิ่งถูกค้นพบเมื่อไม่นานมานี้ในถ้ำ Howe's Cave รัฐนิวยอร์กในช่วงฤดูหนาวปี 2006–2007 ^{[ 7 ]}แต่ส่งผลกระทบต่อค้างคาวจำศีลถึง 25% ^{[ 8 ]}ค้างคาว 6 สายพันธุ์ได้รับผลกระทบถึงแก่ชีวิตจากโรคระบาดนี้ ได้แก่ค้างคาวสีน้ำตาลตัวใหญ่ค้างคาวเท้าเล็กค้างคาวสีน้ำตาลตัวเล็กค้างคาวหูยาวเหนือ ค้างคาวอินเดียนา และค้างคาวสามสี และการสำรวจประชากรค้างคาวในปัจจุบันชี้ให้เห็นว่าประชากรลดลงมากกว่า 75% ในช่วง 2 ปีที่ผ่านมา^{[ 9 ]}ขอบเขตทางภูมิศาสตร์ของ WNS ได้แพร่กระจายไปทั่ว 33 รัฐ และ 4 จังหวัดของแคนาดา^{[ 8 ] [ 9 ]}

กลไกที่การติดเชื้อที่ผิวหนังทำให้ค้างคาวตายยังไม่ชัดเจน^{[ 8 ]}อย่างไรก็ตาม สาเหตุภายนอกของการตายของค้างคาวที่ติดเชื้อขึ้นอยู่กับระยะและความรุนแรงของการติดเชื้อ ค้างคาวที่ติดเชื้อมักจะตายจากการอดอาหารในช่วงฤดูหนาว และอาจได้รับความเสียหายถาวรต่อเยื่อปีกและทำให้การหาอาหารในฤดูร้อนบกพร่องหากรอดชีวิตจากฤดูหนาว^{[ 10 ]} ค้างคาวสีน้ำตาลตัวเล็ก ( Myotis lucifugus ) ซึ่งเป็นหนึ่งในสายพันธุ์ค้างคาวที่พบมากที่สุดในอเมริกาเหนือตะวันออกอาจหายไปจากภูมิภาคนี้ภายใน 16 ปี^{[ 10 ]}

ค้างคาวที่ติดเชื้ออย่างรุนแรงจะออกจากจำศีลก่อนกำหนด และหากพวกมันมีชีวิตรอดได้นานพอและเข้าไปอยู่ในที่จำศีลอื่น โอกาสในการแพร่เชื้อก็อาจสูง เนื่องจากคาดว่าพวกมันจะพกพาสปอร์ของเชื้อราจำนวนมาก^{[ 8 ]}การแพร่เชื้อเกิดขึ้นได้ทั้งทางกายภาพจากการสัมผัสระหว่างค้างคาวด้วยกัน หรือจากที่จำศีลไปยังค้างคาว ผ่านการสัมผัสกับสปอร์ของGeomyces destructansที่มีอยู่บนพื้นผิวที่ค้างคาวเกาะพัก^{[ 8 ]}

โรคนิวคาสเซิลเป็นโรคติดต่อในนกที่ส่งผลกระทบต่อนกหลายชนิดทั้งในประเทศและในป่า^{[ 11 ]}โรคนี้ติดต่อได้โดยการสัมผัสโดยตรงระหว่างนกที่แข็งแรงกับของเหลวที่ขับออกมาจากร่างกายของนกที่ติดเชื้อ ซึ่งรวมถึงการแพร่เชื้อผ่านมูลนก สารคัดหลั่งจากจมูก ปาก และตา โรคนิวคาสเซิลแพร่กระจายอย่างรวดเร็วในหมู่นกที่เลี้ยงไว้ในกรง เช่น ไก่ที่เลี้ยงเพื่อการค้า^{[ 12 ]}อาการต่างๆ ได้แก่ จาม หายใจหอบ น้ำมูกไหล ไอ ท้องเสียเป็นสีเขียวและมีน้ำมาก กระวนกระวาย ซึมเศร้า กล้ามเนื้อสั่น ปีกตก บิดหัวและคอ เดินวนเป็นวงกลม เป็นอัมพาตอย่างสมบูรณ์ การผลิตไข่ลดลงบางส่วนถึงทั้งหมด และไข่เปลือกบาง บวมของเนื้อเยื่อรอบดวงตาและที่คอ และตายอย่างฉับพลัน^{[ 12 ]}

โรคนิวคาสเซิลถูกระบุครั้งแรกในเกาะชวา ประเทศอินโดนีเซีย ในปี 1926 และในปี 1927 ในเมืองนิวคาสเซิลอะพอนไทน์ประเทศอังกฤษ (ซึ่งเป็นที่มาของชื่อโรค) อย่างไรก็ตาม โรคนี้อาจแพร่ระบาดมาตั้งแต่ปี 1898 เมื่อโรคระบาดได้ทำลายสัตว์ปีกในประเทศทั้งหมดทางตะวันตกเฉียงเหนือของสกอตแลนด์^{[ 13 ]}ผลกระทบของโรคนี้เห็นได้ชัดเจนที่สุดในสัตว์ปีกในประเทศ เนื่องจากสัตว์ปีกมีความอ่อนแอต่อโรคสูง และมีศักยภาพที่จะส่งผลกระทบอย่างรุนแรงต่ออุตสาหกรรมสัตว์ปีกหากเกิดการระบาดของโรค โรคนี้เป็นโรคประจำถิ่นในหลายประเทศ การเกิดขึ้นและการแพร่กระจายของจีโนไทป์ใหม่ทั่วโลกเป็นภัยคุกคามที่สำคัญต่อสัตว์ปีก ซึ่งแสดงให้เห็นว่าโรคนี้มีการวิวัฒนาการอย่างต่อเนื่อง นำไปสู่ความหลากหลายที่มากขึ้น (มิลเลอร์และคณะ, 2009) ^{[ 14 ]}

น่าเสียดายที่มีการดำเนินการเพียงเล็กน้อยเพื่อทำความเข้าใจขั้นตอนและความก้าวหน้าของจีโนไทป์ใหม่ (Alexander et al., 2012) ^{[ 14 ]} vNDV รุ่นใหม่ได้รับการจำแนกเป็นไอโซเลตและมีหลักฐานที่บ่งชี้ถึงการเกิดขึ้นของโรคระบาดใหญ่ครั้งที่ห้าซึ่งเริ่มต้นโดยไอโซเลต vNDV ที่มีความสัมพันธ์กันสูงจากอินโดนีเซีย อิสราเอล และปากีสถาน^{[ 15 ]}สายพันธุ์ไวรัสเหล่านี้มีความเกี่ยวข้องกับสายพันธุ์เก่าจากนกป่า ซึ่งบ่งชี้ว่าแหล่งกักเก็บที่ไม่รู้จักอาจมีไอโซเลต vNDV ใหม่ที่สามารถก่อให้เกิดโรคระบาดใหญ่เพิ่มเติมได้

ไม่มีการรักษาใดสำหรับ NDV แต่การใช้วัคซีนป้องกัน^{[ 16 ]}และมาตรการสุขอนามัยจะช่วยลดโอกาสการระบาดได้

โรค ไคทริดิโอไมโคซิสที่เกิดจากเชื้อราไคทริดเป็นโรคเชื้อราที่ร้ายแรงซึ่งคร่าชีวิตสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบกไปแล้ว 30 ชนิดทั่วโลก และทำให้ประชากรสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบกโดยรวมลดลง เชื้อราBatrachochytrium dendrobatidisสามารถพบได้ในทุกทวีปที่มีดินอุดมสมบูรณ์ และมีส่วนทำให้กบและซาลาแมนเดอร์บางชนิดสูญพันธุ์^{[ 17 ]}อันที่จริง มีการประมาณการว่าสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบก 287 ชนิดติดเชื้อโรคนี้ในกว่า 35 ประเทศ^{[ 18 ]}ประเทศเหล่านี้มักจะมีสภาพภูมิอากาศที่หลากหลายหรือเขตร้อน เช่นเดียวกับที่พบในอเมริกากลาง อเมริกาใต้ และแอฟริกา ซึ่งมีสภาพภูมิอากาศที่เหมาะสมตั้งแต่ 17 องศาเซลเซียสถึง 23 องศาเซลเซียสสำหรับเชื้อราที่จะเจริญเติบโต^{[ 17 ]}

รายงานการพบเชื้อราไคทริดครั้งแรกเกิดขึ้นในปี 1998 โดยพบที่ผิวหนังของสัตว์ครึ่งบกครึ่ง น้ำ ^{[ 17 ]}เนื่องจากสัตว์ครึ่งบกครึ่งน้ำดูดซึมสารอาหารที่จำเป็นผ่านทางผิวหนัง เชื้อราจึงเกาะติดกับสัตว์ครึ่งบกครึ่งน้ำ ทำให้สัตว์หายใจไม่ออก และเข้าสู่กระแสเลือดของสิ่งมีชีวิต^{[ 19 ] [ 20 ]}อาการที่พบได้บ่อยในสัตว์ที่ได้รับผลกระทบ ได้แก่ อาการเซื่องซึมและเสียสมดุล และเริ่มตายภายใน 21 วันหลังจากการติดเชื้อ^{[ 17 ]}กบที่ตายและได้รับการตรวจสอบจะพบสปอร์ของเชื้อราจำนวนมากในบริเวณที่มีเคราติน เช่น บริเวณเชิงกราน ปาก และท้อง^{[ 21 ]}

เชื้อราแพร่กระจายผ่านการขนส่งสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบกโดยมนุษย์ สัตว์สะเทินน้ำสะเทินบกที่ติดเชื้อที่หลุดรอดหรือถูกปล่อยสู่ธรรมชาติสามารถนำพาเชื้อราและรุกรานถิ่นที่อยู่โดยรอบของสัตว์ท้องถิ่นที่ไม่มีภูมิคุ้มกันต่อโรคนี้ได้ สัตว์เช่นกบอเมริกันบูลฟร็อกและกบแอฟริกันคลอว์ดฟร็อกสามารถเป็นพาหะของโรคนี้ได้โดยไม่แสดงอาการหรือเสียชีวิต สัตว์ประเภทนี้มักเป็นสาเหตุของการแพร่กระจายของโรคในถิ่นที่อยู่ที่ไม่ได้รับการพัฒนา^{[ 22 ]}

ลักษณะบางประการของสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบกที่มีแนวโน้มที่จะอ่อนแอต่อโรคนี้ได้แก่ การขาดจุลินทรีย์ ที่พัฒนาแล้วหลายชนิด ที่อาศัยและแพร่พันธุ์บนผิวหนังของสัตว์ชนิดนั้นๆ รวมถึงระบบภูมิคุ้มกันที่ยังไม่พัฒนาในสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบกบางชนิด^{[ 17 ]}สัตว์ชนิดที่มักจะแพร่พันธุ์ในน้ำไหลซึ่งชะล้างจุลินทรีย์ออกจากผิวหนังของสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบกมีแนวโน้มที่จะติดเชื้อได้มากกว่า องค์กรต่างๆ ทั่วโลกได้พยายามนำกฎระเบียบมาใช้ในการขนส่งสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบกข้ามพรมแดนเพื่อป้องกันการลดลงอย่างต่อเนื่องของสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบก อย่างไรก็ตามความคืบหน้าเป็นไปอย่างช้าๆ^{[ 17 ]}นอกจากความคืบหน้าที่ช้าแล้ว การรักษาเชื้อราไคทริดที่มีอยู่เพียงอย่างเดียวยังพบได้ในห้องปฏิบัติการสำหรับสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบกที่เลี้ยงไว้ในกรง ด้วยเหตุนี้ จึงไม่มีวิธีใดที่ทราบในการกำจัดโรคนี้ในป่า