แท็กลำดับเปปไทด์คือข้อมูลเกี่ยวกับเปปไทด์ที่ได้จากการวิเคราะห์มวลสารแบบคู่ขนานซึ่งสามารถใช้ระบุเปปไทด์นี้ในฐานข้อมูลโปรตีนได้^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]}

โดยทั่วไปแล้ว สามารถระบุเปปไทด์ได้โดยการแตกตัวเป็นชิ้นเล็กๆ ในเครื่องแมสสเปกโทรเมตรีตัวอย่างเช่น ในระหว่างการแตกตัวที่เกิดจากการชนเปปไทด์จะชนกับแก๊สภายในเครื่องแมสสเปกโทรเมตรีและแตกออกเป็นชิ้นๆ ที่พันธะเปปไทด์ ไอออนชิ้นส่วนที่ได้(เรียกว่าb-ionและy-ion ) จะมีมวลที่แตกต่างกันซึ่งสอดคล้องกับ มวล ตกค้างของกรดอะมิโน ที่เกี่ยวข้อง ดังนั้นสเปกตรัมมวลแบบอนุกรมจึงมีข้อมูลบางส่วนเกี่ยวกับลำดับกรดอะมิโนของเปปไทด์ วิธีการติดแท็กลำดับเปปไทด์ที่พัฒนาโดย Matthias Wilm และMatthias Mannที่EMBL [ ^{4 ] ใช้ข้อมูลนี้เพื่อระบุเปปไทด์ในฐานข้อมูล กล่าวโดยสรุปคือ จะมีการดึงมวลสองสามค่าจากสเปกตรัมเพื่อให้ได้แท็ ก}ลำดับเปปไทด์ แท็กลำดับเปปไทด์นี้เป็นตัวระบุเฉพาะของเปปไทด์ที่เฉพาะเจาะจงและสามารถใช้เพื่อค้นหาในฐานข้อมูลที่มีลำดับเปปไทด์ที่เป็นไปได้ทั้งหมด

มีการพัฒนาสัญลักษณ์สำหรับระบุชิ้นส่วนเปปไทด์ที่เกิดขึ้นจากสเปกตรัมมวลแบบคู่^{[ 5 ]}ไอออนชิ้นส่วนเปปไทด์จะถูกระบุด้วย a, b หรือ c หากประจุยังคงอยู่ที่ปลาย Nและด้วย x, y หรือ z หากประจุยังคงอยู่ที่ปลาย Cตัวห้อยแสดงจำนวนกรดอะมิโนในชิ้นส่วน สัญลักษณ์ ไพรม์แสดงจำนวนโปรตอนหรือไฮโดรเจนที่เพิ่มเข้าไปในชิ้นส่วนเพื่อสร้างไอออนที่สังเกตได้ ตัวอย่างเช่น y ''หมายถึงไอออนที่มีประจุเดี่ยวคล้ายกับเปปไทด์ที่มีโปรตอน (y ''' ) ²⁺คือไอออนที่มีประจุคู่คล้ายกับเปปไทด์ที่มีโปรตอนคู่^{[ 6 ]}

• ลำดับโปรตีน
• การวิเคราะห์มวลโปรตีนด้วยสเปกโทรเมตรี

• โปรแกรม PeptideSearch
• SPIDER: เครื่องมือค้นหาตามแท็กลำดับ
• บทช่วยสอนเกี่ยวกับแท็กลำดับเปปไทด์