ผลกระทบจากตำแหน่งคือผลกระทบต่อการแสดงออกของยีนเมื่อตำแหน่งของยีนบนโครโมโซมเปลี่ยนแปลง ซึ่งมักเกิดจากการย้ายตำแหน่ง ผลกระทบนี้ได้รับการอธิบายอย่างดีในแมลงหวี่โดยเกี่ยวข้องกับสีตาและเรียกว่าการแปรผันจากผลกระทบตำแหน่ง (PEV) ^{[ 1 ]}

ลักษณะฟีโนไทป์นั้นมีลักษณะเด่นคือการแสดงออกของยีนที่ไม่เสถียรซึ่งส่งผลให้ดวงตามีสีแดง ในแมลงวันกลายพันธุ์ ดวงตาจะมีลักษณะเป็นจุด ด่างสีขาวและแดงสลับ กัน ฟีโนไทป์เหล่านี้มักเกิดจากการย้ายตำแหน่งของโครโมโซม ทำให้ยีนควบคุมสีอยู่ใกล้กับบริเวณเฮเทอโรโครมาตินบริเวณเฮเทอโรโครมาตินสามารถแพร่กระจายและส่งผลต่อการถอดรหัส ซึ่งอาจส่งผลให้การแสดงออกของยีนหยุดชะงักและทำให้เกิดส่วนของดวงตาสีขาวในที่สุด

คำว่า "ผลกระทบจากตำแหน่ง"ยังใช้เพื่ออธิบายความแปรผันของการแสดงออกที่เกิดขึ้นจากยีนดัดแปลงพันธุกรรม ที่เหมือนกัน ซึ่งแทรกเข้าไปในบริเวณต่างๆ ของจีโนมในกรณีนี้ ความแตกต่างในการแสดงออกมักเกิดจาก ตัวเร่งการแสดงออก (enhancer ) ที่ควบคุมยีนข้างเคียง ตัวเร่งการแสดงออกเฉพาะที่เหล่านี้ยังสามารถส่งผลต่อรูปแบบการแสดงออกของยีนดัดแปลงพันธุกรรมได้อีกด้วย เนื่องจากสิ่งมีชีวิตดัดแปลงพันธุกรรม แต่ละชนิด มีตำแหน่งของยีนดัดแปลงพันธุกรรมที่แตกต่างกัน ดังนั้นสิ่งมีชีวิตดัดแปลงพันธุกรรมแต่ละชนิดจึงมีศักยภาพที่จะมีรูปแบบการแสดงออกที่ไม่ซ้ำกัน

• Alberts, Bruce (2002). "รูปที่ 4-45. ผลกระทบของตำแหน่งต่อการแสดงออกของยีนในสิ่งมีชีวิตยูคาริโอตสองชนิดที่แตกต่างกัน"ชีววิทยาโมเลกุลของเซลล์ (ฉบับที่ 4). นิวยอร์ก: Garland Science. ISBN 0-8153-4072-9.