กลุ่มนี้เริ่มมีบทบาทโดดเด่นขึ้นหลังจากกัปตันBlaise Compaoréยึดอำนาจในการรัฐประหารนองเลือดในปี 1987และมีส่วนเกี่ยวข้องกับการสังหารนอกกระบวนการยุติธรรม หลายครั้ง ตามคำสั่งของประธานาธิบดี Compaoré ในช่วงทศวรรษ 1990 โดยทำหน้าที่เป็น ทั้ง หน่วยสังหารและบอดี้การ์ดในปี 1990 Dabo Boukary นักศึกษาแพทย์และนักกิจกรรมเยาวชนถูกทรมานจนเสียชีวิตโดย RSP ^{[ 5 ]} ในปี 1998 David Ouedraogo ซึ่งเป็นคนขับรถของ François Compaoréน้องชายของประธานาธิบดี ถูกฆาตกรรม ซึ่งกระตุ้นให้ Norbert Zongoนักข่าวซึ่งเป็นนักวิจารณ์รัฐบาลที่โดดเด่นที่สุดในประเทศในขณะนั้น เริ่มทำการสอบสวน ในวันที่ 13 ธันวาคม 1998 พบศพที่ถูกเผาของ Zongo น้องชายของเขา Ernest, Ablassé Nikiema และ Blaise Ilboudo ในSapouyโดยมีร่องรอยกระสุนปืนจำนวนมาก ในตอนแรก รัฐบาลมองว่าการฆาตกรรมดังกล่าวเป็น "อุบัติเหตุที่น่าเศร้า" แต่ในที่สุดก็ถูกกดดันจากสาธารณชนให้แต่งตั้งคณะกรรมการสอบสวน

คณะกรรมการสอบสวนอิสระพบว่า Ouedraogo ถูกทหารของ RSP ทรมานจนตายในค่ายทหารเนื่องจากถูกกล่าวหาว่าขโมยของจากน้องชายของประธานาธิบดี และ Norbert Zongo กับอีกสามคนก็ถูก RSP สังหารเช่นกัน^{[ 6 ]}ต่อมา Compaoré สัญญาว่าจะปรับโครงสร้าง RSP ใหม่ และทหารหลายคนถูกจับกุม รวมถึง Marcel Kafando ซึ่งเป็นผู้บัญชาการหน่วยในขณะที่เกิดเหตุฆาตกรรม อย่างไรก็ตาม ภายในปี 2006 ทุกคนได้รับการตัดสินให้พ้นผิดหรือถูกยกเลิกข้อกล่าวหา^{[ 7 ]}

สมาชิกของ RSP ไม่เพียงแต่ทำหน้าที่เป็นผู้บังคับใช้คำสั่งของ Compaoré เท่านั้น แต่ยังถูกกล่าวหาว่ามีส่วนเกี่ยวข้องในการพยายามยึดอำนาจอย่างน้อยสองครั้ง ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2539 ทหาร RSP จำนวน 25 นายถูกจับกุม และพร้อมกับผู้บัญชาการกรมทหาร – Hyacinthe Kafando (ไม่มีความเกี่ยวข้องกับ Marcel Kafando ผู้สืบทอดตำแหน่งของเขา) ซึ่งขณะนั้นอยู่ต่างประเทศ – พวกเขาถูกนำตัวขึ้นศาลในข้อหาวางแผนก่อรัฐประหารซึ่งอาจเกี่ยวข้อง กับ ไอวอรีโคสต์^{[ 8 ]} Kafando ซึ่งมีส่วนเกี่ยวข้องกับการรัฐประหารทางทหารของ Compaoré ในปี พ.ศ. 2530 (ซึ่งได้รับความช่วยเหลือจากรัฐบาลไอวอรีโคสต์ในขณะนั้นเช่นกัน) ได้รับอนุญาตให้กลับไปยังบูร์กินาฟาโซจากการลี้ภัยในปี พ.ศ. 2544 ^{[ 9 ]}ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2546 รัฐบาลประกาศว่าได้ป้องกัน การรัฐประหาร ที่วางแผนไว้ ได้สำเร็จ ในช่วงต้นเดือนมกราคม พ.ศ. 2547 สมาชิกกองกำลังติดอาวุธ 15 นาย รวมถึงสมาชิกหลายคนของ RSP ถูกจับกุมพร้อมกับพลเรือนอีก 2 คน ในข้อสงสัยว่ามีส่วนเกี่ยวข้องกับการสมคบคิดที่ถูกกล่าวหา^{[ 10 ]}หลังจากประธานาธิบดี Compaoré ลาออกเมื่อวันที่ 31 ตุลาคม พ.ศ. 2557 อันเป็นผลมาจากการประท้วงต่อต้านข้อเสนอของเขาที่จะยกเลิกข้อจำกัดวาระการดำรงตำแหน่งประธานาธิบดี RSP ได้ก่อรัฐประหารเมื่อวันที่ 16 กันยายน พ.ศ. 2558 หลังจากมีการแนะนำให้ยุบพรรค และเข้ายึดครองเมืองOuagadougouอย่างไรก็ตาม หลังจากการต่อต้านจากประชาชนและการดำเนินการของกองทัพประจำการ ประธานาธิบดีรักษาการMichel KafandoและนายกรัฐมนตรีYacouba Zidaได้รับการคืนตำแหน่งเมื่อวันที่ 23 กันยายน พ.ศ. 2558 ^{[ 11 ]}

กองทหารรักษาความมั่นคงของประธานาธิบดีมีบทบาทสำคัญในการปราบปรามการประท้วงในบูร์กินาฟาโซในปี 2011ซึ่งปะทุขึ้นในเดือนกุมภาพันธ์และดำเนินต่อไปจนกระทั่งมีการตกลงกันได้ในเดือนมิถุนายน นอกจากการประท้วงบนท้องถนนและการนัดหยุดงานขนาดใหญ่แล้ว การลุกฮือยังเกี่ยวข้องกับการก่อกบฏในหมู่กองกำลังติดอาวุธหลายกรณี กองทหารรักษาความมั่นคงของประธานาธิบดีมีบทบาทสำคัญในการปราบปรามการก่อกบฏเหล่านี้ ตัวอย่างเช่น การปิดล้อมฐานทัพในโบโบ-ดิอูลาสโซในเดือนมิถุนายนและการต่อสู้กับกองกำลังที่ก่อกบฏที่นั่น^{[ 12 ] [ 13 ]}เหตุการณ์เหล่านี้ทำให้เกิดความขัดแย้งระหว่างกองทัพบกและกองทหารรักษาความมั่นคงของประธานาธิบดี โดยฝ่ายหนึ่งเป็นที่หวาดกลัวของคอมปาโอเรและอีกฝ่ายหนึ่งเป็นที่ไว้วางใจ จากบทบาทของพวกเขาในการประท้วง กองทหารรักษาความมั่นคงของประธานาธิบดีได้รับอาวุธที่ดีกว่ากองทัพส่วนที่เหลือมาก รวมถึงได้รับค่าตอบแทนที่ดีกว่าด้วย^{[ 14 ]}

เมื่อวันที่ 11 เมษายน 2555 ทหารที่หนีทัพชื่อ Romuald Tuina ได้ปล้น ธนาคาร Ouagadougouในเวลากลางวันแสกๆ โดยได้เงินไปมากกว่า 7 ล้านฟรังก์ CFA และหลบหนีไปยังไอวอรี่โคสต์ ในคืนวันที่ 30–31 สิงหาคม 2556 Tuina ซึ่งได้กลับมายังบูร์กินาฟาโซแล้ว ได้พยายามลอบสังหาร Compaoré โดยเปิดฉากยิงใส่สำนักงานของประธานาธิบดีหลังจากบุกเข้าไปในทำเนียบประธานาธิบดีโดยสวมเครื่องแบบทหาร เขาถูกสังหารในการยิงต่อสู้ที่เกิดขึ้น^{[ 15 ] [ 16 ]}

หลังจากครองอำนาจมา 27 ปี ประธานาธิบดีบลาส์ คอมปาโอเร พยายามที่จะยกเลิกข้อจำกัดทางรัฐธรรมนูญเกี่ยวกับวาระการดำรงตำแหน่งประธานาธิบดี ทำให้เขาสามารถลงสมัครรับเลือกตั้งอีกครั้งในปี 2015ซึ่งจุดชนวนให้เกิดการลุกฮือของชาวบูร์กินาฟาโซในช่วงปลายเดือนตุลาคมปี 2014ซึ่งมีผู้ประท้วงหลายหมื่นคนเดินขบวนต่อต้านระบอบการปกครอง กองทหารรักษาความมั่นคงของประธานาธิบดีเข้าร่วมการปะทะในเบื้องต้นโดยอยู่ฝ่ายประธานาธิบดี ยิงกระสุนจริงและแก๊สน้ำตาเมื่อผู้ประท้วงเดินขบวนไปยังทำเนียบประธานาธิบดี^{[ 17 ]}และสังหารผู้ประท้วงอย่างน้อยสามคนที่พยายามบุกเข้าไปในบ้านของฟรานซิส คอมปาโอเร น้องชายของประธานาธิบดี^{[ 18 ]}

เมื่อวันที่ 31 ตุลาคม ประธานาธิบดี Blaise Compaoré ลาออกจากตำแหน่งประธานาธิบดีและหลบหนีออกนอกประเทศ ภายหลังเหตุการณ์นี้ พลเอกHonoré Traoréผู้บัญชาการกองทัพบก อ้างว่าได้จัดตั้งรัฐบาลทหารชั่วคราวโดยมีตนเองเป็นประธานาธิบดี อย่างไรก็ตาม Traoré ถูกผู้ประท้วงจำนวนมากปฏิเสธในฐานะพันธมิตรใกล้ชิดของ Compaoré และในเวลาไม่นาน พันโท Yacouba Isaac Zida ก็อ้างสิทธิ์ในตำแหน่งดังกล่าว Zida ซึ่งเป็นรองผู้บัญชาการกรมรักษาความปลอดภัยประธานาธิบดี เรียกร้องให้มีการเปลี่ยนผ่านอย่างสันติ โดยระบุว่าเขาจะ "รับหน้าที่เป็นหัวหน้าของการเปลี่ยนผ่านนี้และหัวหน้าของรัฐเพื่อรับประกันความต่อเนื่องของรัฐ" ^{[ 19 ]}ต่อมาคำกล่าวอ้างของ Zida ได้รับการยอมรับจากกองทัพ ซึ่งผู้นำของกองทัพประกาศว่า Zida ได้รับ "เลือกอย่างเป็นเอกฉันท์ให้เป็นผู้นำในช่วงเปลี่ยนผ่าน" ^{[ 20 ]}

ในขณะที่กลุ่มฝ่ายค้านบางกลุ่ม เช่นLe Balai Citoyenให้การสนับสนุน Zida ทันที^{[ 21 ]}การประท้วงต่อต้านการยึดอำนาจโดยกองทัพก็เกิดขึ้นในเวลาต่อมา ในอีกหลายวันต่อมา Zida ได้พบกับผู้นำทางการเมืองและบุคคลสำคัญในสังคมหลายคน พยายามเจรจาหาทางออกให้กับวิกฤตและจัดตั้งรัฐบาลเอกภาพแห่งชาติองค์กรระหว่างประเทศต่างๆ เริ่มออกข้อเรียกร้องให้ส่งมอบอำนาจให้กับกองกำลังพลเรือนในไม่ช้า^{[ 22 ] [ 23 ]}

เมื่อวันที่ 16 กันยายน 2558 ซึ่งเป็นเวลาสองวันหลังจากคณะกรรมการปฏิรูปแนะนำให้ยุบ RSP สมาชิกของ RSP ได้ทำการรัฐประหารและจับกุมประธานาธิบดีมิเชล คาฟานโดนายกรัฐมนตรียาคูบา ซิดาและสมาชิกคนอื่นๆ ของรัฐบาลเฉพาะกาล^{[ 24 ] [ 25 ]}

คณะรัฐบาลทหารชุดใหม่ล้มเหลวในการรวมอำนาจทั่วประเทศและเผชิญกับการประท้วงจากผู้นำระดับภูมิภาค และในที่สุดก็จากกองทัพประจำการ เพื่อฟื้นฟูรัฐบาลเฉพาะกาล หลังจากที่กองทัพเข้าสู่เมืองวากาดูกูเพื่อเผชิญหน้ากับ RSP คาฟานโดก็ได้รับการแต่งตั้งกลับมาเป็นประธานาธิบดีอีกครั้งในวันที่ 23 กันยายน และซีดาก็กลับมาดำรงตำแหน่งนายกรัฐมนตรีเช่นกันกิลเบิร์ต ดีเอนเดเรกล่าวว่าการรัฐประหารเป็นความผิดพลาด และ “เรารู้ว่าประชาชนไม่เห็นด้วย นั่นเป็นเหตุผลที่เรายอมแพ้” ^{[ 26 ]}

ในเดือนกันยายน พ.ศ. 2558 RSP ถูกยุบตามคำแนะนำก่อนการรัฐประหารในปี พ.ศ. 2558 ไม่นาน^{[ 27 ]}