| RFX4 |
|---|
|
| ตัวระบุ |
|---|
| ชื่อเรียกอื่น | RFX4 , NYD-SP10, ปัจจัยควบคุม X4 |
|---|
| รหัสภายนอก | โอมิม : 603958 ; เอ็มจีไอ : 1918387 ; โฮโมโลยีน : 31119 ; การ์ดยีน : RFX4 ; OMA : RFX4 - ออโธล็อก |
|---|
|
|
| รูปแบบการแสดงออกของ RNA |
|---|
| บีจี | | มนุษย์ | เมาส์ (ออร์โธล็อก) |
|---|
| สูงสุดที่แสดงใน | - อัณฑะซ้าย
- อัณฑะข้างขวา
- กลอบัส พัลลิดัสภายนอก
- โซนโพรงสมอง
- กลอบัส พัลลิดัสภายใน
- อสุจิ
- นิวเคลียสคอเดต
- อะมิกดาล่า
- นิวเคลียสแอคคัมเบนส์
- นิวเคลียสเวสติบูลาร์ส่วนบน
|
| | สูงสุดที่แสดงใน | - ส่วนย่อยเอวของไขสันหลัง
- เซลล์สเปิร์ม
- สเปิร์มมาติด
- นิวเคลียสซูพราไคแอสมาติก
- กระแสการอพยพของส่วนหน้า
- โกลบัส พัลลิดัส
- โซนโพรงสมอง
- นิวเคลียสสมองน้อยส่วนลึก
- ท่อสร้างอสุจิ
- นิวเคลียสเทกเมนทัลด้านหลัง
|
| | ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม |
|
|---|
| ไบโอจีพีเอส | |
|---|
|
| ออนโทโลยีของยีน |
|---|
| หน้าที่ระดับโมเลกุล | - การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับของบริเวณควบคุมซิสของ RNA polymerase II
- การจับกับ DNA
- กิจกรรมกระตุ้นการถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II
- การจับโครมาติน
- การจับโปรตีน
- กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II
- กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA
| | ส่วนประกอบของเซลล์ | | | กระบวนการทางชีวภาพ | - การควบคุมการถอดรหัสโดย RNA polymerase II
- การพัฒนาสมองส่วนหน้า
- การพัฒนาของเทเลนเซฟาลอน
- การพัฒนาไขสันหลังส่วนหลัง
- การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ
- การควบคุมเชิงลบของเส้นทางการส่งสัญญาณ Smoothened ที่เกี่ยวข้องกับการสร้างรูปแบบของไขสันหลังส่วนท้อง
- การสร้างรูปร่างของเปลือกสมองน้อย
- การพัฒนาสมองส่วนกลาง
- การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II
- การควบคุมกระบวนการแปรรูปโปรตีน
- การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ
- การถอดรหัสโดย RNA polymerase II
- การประกอบซีเลียม
| | แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO |
|
|
| วิกิดาต้า |
|
ปัจจัยการถอดรหัส RFX4เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนRFX4 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
ยีนนี้เป็นสมาชิกของตระกูลยีนปัจจัยควบคุม X ซึ่งเข้ารหัสปัจจัยการถอดรหัส ที่มี โดเมนการจับกับ DNA แบบปีกเกลียวที่มีการอนุรักษ์สูงโปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้มีความสัมพันธ์เชิงโครงสร้างกับปัจจัยควบคุม X1, X2, X3 และ X5 มีการแสดงให้เห็นว่ามันมีปฏิสัมพันธ์กับตัวเองเช่นเดียวกับปัจจัยควบคุม X2 และ X3 แต่ไม่มีปฏิสัมพันธ์กับปัจจัยควบคุม X1 โปรตีนนี้อาจเป็นตัวยับยั้ง การถอดรหัส มากกว่าตัวกระตุ้นการถอดรหัสมีการอธิบาย ตัวแปรการถอดรหัสสามแบบที่เข้ารหัส ไอโซฟอร์ม ที่แตกต่างกันสำหรับยีนนี้ [ 7 ]
RFX4 มีส่วนเกี่ยวข้องกับการกำหนดสายพันธุ์ประสาทและการควบคุมสถานะเซลล์ของกลิโอบลาสโตมา: การแสดงออกเกินของปัจจัยการถอดรหัสแบบรวมกลุ่มด้วย RNA-seq ของเซลล์เดี่ยวระบุว่า RFX4 เพียงพอที่จะกระตุ้นโปรแกรมคล้ายเซลล์ต้นกำเนิดประสาทจากเซลล์ต้นกำเนิดที่มีศักยภาพหลายอย่างของมนุษย์ซึ่งแตกต่างไปสู่สายพันธุ์เซลล์ประสาทและเซลล์เกลียของระบบประสาทส่วนกลาง[ 8 ]และในกลิโอบลาสโตมา มีรายงานว่า RFX4 เป็นผู้ประสานงานของการเจริญเติบโตและการแยกความแตกต่างในเซลล์เนื้องอกที่บุกรุกแบบกระจาย ซึ่งการรบกวนจะกระจายเส้นทางการบุกรุกและยืดอายุการอยู่รอดในซีโนกราฟต์[ 9 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Dotzlaw H, Alkhalaf M, Murphy LC (1992). "การจำแนกลักษณะของ mRNA ตัวแปรตัวรับเอสโตรเจนจากมะเร็งเต้านมของมนุษย์" . Mol. Endocrinol . 6 (5): 773– 85. doi : 10.1210/mend.6.5.1603086 . PMID 1603086 . S2CID 25208340 .
- Reith W, Ucla C, Barras E, Gaud A, Durand B, Herrero-Sanchez C และคณะ (1994). "RFX1 ซึ่งเป็นทรานส์แอคติเวเตอร์ของเอนแฮนเซอร์ I ของไวรัสตับอักเสบ B จัดอยู่ในกลุ่มโปรตีนจับกับ DNA แบบโฮโมไดเมอริกและเฮเทอโรไดเมอริกตระกูลใหม่" . Mol. Cell. Biol . 14 (2): 1230– 44. doi : 10.1128/mcb.14.2.1230 . PMC 358479 . PMID 8289803 .
- Gajiwala KS, Chen H, Cornille F, Roques BP, Reith W, Mach B และคณะ (2000). "โครงสร้างของโปรตีนปีกเกลียว hRFX1 เผยให้เห็นรูปแบบใหม่ของการจับกับ DNA" Nature . 403 (6772): 916– 21. Bibcode : 2000Natur.403..916G . doi : 10.1038/35002634 . PMID 10706293 . S2CID 4425783 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS และคณะ (2003). "การสร้างและการวิเคราะห์เบื้องต้นของลำดับ cDNA ของมนุษย์และหนูที่มีความยาวเต็มมากกว่า 15,000 ลำดับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Blackshear PJ, Graves JP, Stumpo DJ, Cobos I, Rubenstein JL, Zeldin DC (2003). "การตอบสนองทางฟีโนไทป์แบบไล่ระดับต่อการขาดบางส่วนและสมบูรณ์ของตัวแปรการถอดรหัสเฉพาะสมองของปัจจัยการถอดรหัสแบบปีกเกลียว RFX4" . Development . 130 (19): 4539– 52. doi : 10.1242/dev.00661 . PMID 12925582 .
- Araki R, Takahashi H, Fukumura R, Sun F, Umeda N, Sujino M และคณะ (2004). "การแสดงออกที่จำกัดและการเหนี่ยวนำด้วยแสงของทรานสคริปต์ปัจจัยควบคุม X4 ของหนูตัวใหม่ในนิวเคลียสซูพราไคแอสมาติก" J. Biol. Chem . 279 (11): 10237– 42. doi : 10.1074/jbc.M312761200 . PMID 14701801 .
- Glaser B, Kirov G, Bray NJ, Green E, O'Donovan MC, Craddock N และคณะ (2005). "การระบุแฮพลอไทป์ที่มีความเสี่ยงต่อโรคไบโพลาร์ในยีนที่เข้ารหัสปัจจัยการถอดรหัสแบบปีกเกลียว RFX4" . Mol. Psychiatry . 10 (10): 920– 7. doi : 10.1038/sj.mp.4001689 . PMID 15940297 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N และคณะ (2005). "มุ่งสู่แผนที่ระดับโปรตีโอมของเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนของมนุษย์" Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- Matsushita H, Uenaka A, Ono T, Hasegawa K, Sato S, Koizumi F และคณะ (2006). "การระบุไอโซฟอร์ม RFX4-E และ -F ที่จำเพาะต่อเนื้องอกสมองและการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันแบบฮิวโมรัลในผู้ป่วย" (PDF) . Cancer Sci . 96 (11): 801– 9. doi : 10.1111/j.1349-7006.2005.00112.x . PMC 11159248 . PMID 16271074 . S2CID 25967004 .
ลิงก์ภายนอก
- RFX4+โปรตีน,+มนุษย์ ที่ หัวข้อทางการ แพทย์ (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
บทความนี้ได้นำข้อความจากหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกาด้านการแพทย์ มา ใช้ ซึ่งเป็นข้อมูลสาธารณะ
