เมื่อลูกเรือเร่งเครื่องปฏิกรณ์จนถึง 1.4% ของกำลังการผลิตในเวลา 17.00 น. ของวันที่ 1 กันยายน พ.ศ. 2517 ^{[ 7 ]}เกิดความไม่เพียงพอในการป้องกันเล็กน้อยที่ทำให้เกิดการรั่วไหลของนิวตรอนและรังสีแกมมา^{[ 5 ]}จากโครงสร้างป้องกันเครื่องปฏิกรณ์^{[ 7 ]}บริษัท Westinghouse Electric Corporationได้ตรวจสอบการออกแบบและเตือนถึงความเป็นไปได้นี้ แต่ไม่มีการเปลี่ยนแปลงการออกแบบ^{[ 7 ]}ไม่มีการได้รับรังสีอย่างมีนัยสำคัญ แต่กลายเป็นประเด็นทางการเมือง โดยชาวประมงท้องถิ่นขัดขวางการกลับเข้าท่าเรือเป็นเวลานานกว่า 50 วัน^{[ 5 ]}ในที่สุดรัฐบาลก็ตกลงกับรัฐบาลท้องถิ่นและชาวประมง ได้ อนุญาตให้ เรือมุตสึกลับเข้าท่าเรือได้โดยมีเงื่อนไขว่าจะต้องหาท่าเรือใหม่ และเรือก็กลับไปยังโอมีนาโตะในวันที่ 15 ตุลาคม^{[ 7 ]}

ในเมืองซาเซโบะระหว่างปี 1978 ถึง 1982 ได้มีการปรับเปลี่ยนต่างๆ เกิดขึ้นกับเกราะป้องกันเตาปฏิกรณ์ของเรือมุตสึและท่าเรือหลักของเรือถูกย้ายไปยังเซกิเนฮามะในปี 1983 ^{[ 7 ]}หลังจากการปรับปรุงครั้งใหญ่ เรือมุตสึก็เสร็จสมบูรณ์ในเดือนกุมภาพันธ์ 1991 ^{[ 7 ]}จากนั้นเธอก็ได้ดำเนินการตามวัตถุประสงค์การออกแบบเดิมคือการเดินทาง82,000 กิโลเมตร (51,000 ไมล์)ในการทดสอบ และถูกปลดประจำการในปี 1992 ^{[ 7 ]}ตลอดระยะเวลากว่า 25 ปี โครงการนี้มีค่าใช้จ่ายมากกว่า 120 พันล้านเยน (ประมาณ 1.2 พันล้านดอลลาร์สหรัฐ) ^{[ 7 ]}