ในปี 1984เขาลงสมัครรับเลือกตั้งเป็นสมาชิกสภาผู้แทนราษฎรของสหรัฐอเมริกา แข่งกับ แฟรงค์ แมคคลอสกีสมาชิกพรรคเดโมแครตหน้าใหม่ผลการนับคะแนนเบื้องต้นทำให้แมคคลอสกีนำอยู่ 72 คะแนน^{[ 5 ]}แต่หลังจากพบข้อผิดพลาดในการนับคะแนนในอีกหนึ่งเดือนต่อมา แมคอินไทร์ก็ขึ้นนำ 34 คะแนนและได้รับการรับรองว่าเป็นผู้ชนะ แม้ว่าการนับคะแนนใหม่จะยังไม่เสร็จสิ้น^{[ 6 ]}การนับคะแนนใหม่ยังคงดำเนินอยู่เมื่อสภาผู้แทนราษฎรชุดใหม่เข้ารับตำแหน่ง ดังนั้นสภาผู้แทนราษฎรที่ควบคุมโดยพรรคเดโมแครตจึงลงมติตามแนวพรรคให้ไม่รับผู้สมัครคนใดเข้ารับตำแหน่ง แต่จ่ายเงินให้ทั้งสองคนเสมือนเป็นสมาชิกสภาผู้แทนราษฎร โดยปกติแล้วสภาผู้แทนราษฎรจะรับผู้ชนะที่ได้รับการรับรองเข้ารับตำแหน่งเป็นการชั่วคราว แต่จะไม่ทำเช่นนั้นหากการนับคะแนนใหม่ยังไม่เสร็จสิ้น

การนับคะแนนใหม่เสร็จสิ้นภายในสิ้นเดือนมกราคม พ.ศ. 2528 ผลลัพธ์สุดท้ายคือ McIntyre นำอยู่ 418 คะแนน เขาได้รับการรับรองให้เป็นผู้ชนะอีกครั้ง และหลังจากที่พรรครีพับลิกันบังคับให้มีการลงคะแนนในเรื่องนี้ เขาก็ถูกปฏิเสธที่นั่งอีกครั้ง แม้ว่าคณะกรรมการบริหารสภาผู้แทนราษฎรจะสัญญาว่าจะแก้ไขเรื่องนี้ภายใน 45 วัน^{[ 7 ]}การนับคะแนนใหม่ของรัฐบาลกลาง ซึ่งนำโดยสำนักงานบัญชีของรัฐบาลภายใต้กฎที่ส่วนใหญ่เห็นพ้องกันบนพื้นฐานของสองพรรค พบว่า McCloskey ชนะด้วยคะแนน 4 เสียง แม้ว่าคณะทำงานจะตัดสินใจที่ก่อให้เกิดข้อโต้แย้งหลายประการ ซึ่งทำให้สมาชิกพรรครีพับลิกันเพียงคนเดียวของคณะทำงานเปรียบเทียบว่าเหมือนถูกข่มขืน^{[ 8 ]}จากนั้นพรรครีพับลิกันพยายามที่จะไม่ให้ผู้สมัครคนใดได้ที่นั่งและจัดการเลือกตั้งใหม่ แต่สภาผู้แทนราษฎรได้ลงคะแนนตามแนวพรรค เลือกที่จะให้ McCloskey ได้ที่นั่ง ทำให้สมาชิกพรรครีพับลิกันในสภาผู้แทนราษฎรเดินออกจากห้องประชุมอย่างเป็นสัญลักษณ์ ประท้วงด้วยการทำให้กระบวนการล่าช้า และประกาศว่าการเลือกตั้งถูกขโมย^{[ 9 ]}

แมคอินไทร์สนใจที่จะลงสมัครรับเลือกตั้งเป็นรองผู้ว่าการรัฐในปี 1986 แต่ถูกชักชวนให้ลงสมัครชิงตำแหน่งกับแมคคลอสกีอีกครั้ง ในเวลานั้น ประธานาธิบดีโรนัลด์ เรแกนได้รับความนิยมลดลงกว่าในปี 1984 และแมคอินไทร์ก็ใช้เงินในการหาเสียงน้อยกว่า ส่งผลให้แมคคลอสกีชนะไปด้วยคะแนน 53% ต่อ 47%

แมคอินไทร์หมดความสนใจในเวทีการเมืองระดับชาติ และได้รับการแต่งตั้งเป็น ผู้พิพากษาศาลแขวง ลอว์เรนซ์เคาน์ตี้ในปี 1988 เขาได้รับเลือกตั้งใหม่โดยไม่มีคู่แข่งในปี 1990, 1996 และ 2002 และดำรงตำแหน่งจนกระทั่งเสียชีวิต