แซมเอชดี1
โครงสร้างที่มีอยู่ พีดีบี การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB รายชื่อรหัส PDB 2E8O , 3U1N , 4BZB , 4BZC , 4CC9 , 4MZ7 , 4Q7H , 4QFX , 4QFY , 4QFZ , 4QG0 , 4QG1 , 4QG2 , 4QG4 , 4RXO , 4RXP , 4RXQ , 4RXR , 4RXS , 4TNP , 4TNQ , 4TNR , 4TNX , 4TNY , 4TNZ , 4TO0 , 4TO1 , 4TO2 , 4TO3 , 4TO4 , 4TO5 , 4TO6 , 4ZWE , 4ZWG , 5AO4 , 5AO1 , 5AO0 , 5AO2 , 5AO3
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	SAMHD1 , CHBL2, DCIP, HDDC1, MOP-5, SBBI88, SAM และ HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1, hSAMHD1
รหัสภายนอก	โอมิม : 606754 ; เอ็มจีไอ : 1927468 ; โฮโมโลยีน : 9160 ; GeneCards : SAMHD1 ; OMA : SAMHD1 - ออโธล็อก
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 20 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 20q11.23 เริ่ม 36,890,229 bp [ 1 ] จบ 36,951,893 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 2 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 2|2 H1 เริ่ม 156,939,453 bp [ 2 ] จบ 156,977,185 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน โมโนไซต์ เยื่อหุ้มหัวใจ เนื้อเยื่อบุผิวของโพรงจมูกส่วนหลัง เซลล์เยื่อบุหลอดลม กลีบปอดล่าง เยื่อบุตา เส้นประสาททิเบียล ปมประสาทไตรเจมินัล เยื่อหุ้มปอดชั้นใน หลอดเลือดแดงขมับชั้นตื้น สูงสุดที่แสดงใน เม็ดเลือดขาวชนิดแกรนูโลไซต์ แกสตรูลา ม้าม ต่อมน้ำเหลืองในช่องท้อง เลือด สโตรมาของไขกระดูก ถุงไข่แดง เดซิดัว หางของตัวอ่อน ลำไส้เล็กส่วนต้น ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอ GPS ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับไอออนสังกะสี การจับไอออนโลหะ การจับโปรตีน กิจกรรมเร่งปฏิกิริยา การจับกับ dGTP การจับกับ RNA การจับกรดนิวคลีอิก กิจกรรม dGTPase กิจกรรมไฮโดรเลส กิจกรรมไรโบเอนไซม์ กิจกรรมของเอนไซม์ไตรฟอสฟอริกโมโนเอสเทอร์ไฮโดรเลส การจับโปรตีนที่เหมือนกัน การจับนิวคลีโอไทด์ การจับกับ DNA สายเดี่ยว การจับกับ GTP ส่วนประกอบของเซลล์ เยื่อหุ้มพลาสมา โครงสร้างทางกายวิภาคภายในเซลล์ นิวคลีโอพลาสม์ นิวเคลียส โครโมโซม ตำแหน่งที่เกิดการแตกหักของสายคู่ ไมโครโดเมนที่อุดมไปด้วยเททราสปานิน กระบวนการทางชีวภาพ การควบคุมการตอบสนองภูมิคุ้มกันโดยกำเนิด กระบวนการของระบบภูมิคุ้มกัน กระบวนการสลายตัวของ dATP กระบวนการสลายตัวของ dGTP การตอบสนองการป้องกันต่อไวรัส วิถีการส่งสัญญาณของอินเตอร์เฟรอนชนิดที่ 1 การตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน การเผาผลาญ การตอบสนองภูมิคุ้มกันโดยกำเนิด การรวมตัวเป็นโฮโมเตตราเมอร์ของโปรตีน การไฮโดรไลซิสพันธะฟอสโฟไดเอสเทอร์ของอาร์เอ็นเอ กระบวนการสลายตัวของดีออกซีไรโบนิวคลีโอไทด์ การซ่อมแซมรอยแตกสองสายผ่านการรวมตัวแบบโฮโมโลจัส การจำลองดีเอ็นเอ การซ่อมแซมดีเอ็นเอ การตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งกระตุ้นที่ทำให้เกิดความเสียหายต่อดีเอ็นเอ การกลายพันธุ์แบบโซมาติกของยีนอิมมูโนโกลบูลิน การควบคุมเชิงลบของเส้นทางการส่งสัญญาณที่เกี่ยวข้องกับอินเตอร์เฟรอนชนิดที่ 1 การตัดแต่งสายดีเอ็นเอที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการแยกตัวของสายดีเอ็นเอในการจำลองแบบ แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 25939 56045 วงดนตรี ENSG00000101347 ENSMUSG00000027639 ยูนิโปรท Q9Y3Z3 Q60710 RefSeq (mRNA) NM_015474 NM_001363729 NM_001363733 NM_001139520 NM_018851 NM_001370610 RefSeq (โปรตีน) NP_056289 NP_001350658 NP_001350662 NP_001132992 NP_061339 NP_001357539 สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 20: 36.89 – 36.95 Mb Chr 2: 156.94 – 156.98 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

โปรตีนที่มีโดเมน SAM และโดเมน HD 1เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSAMHD1 SAMHD1 เป็นเอนไซม์ในเซลล์ ทำหน้าที่ยับยั้งการจำลองแบบของHIVในเซลล์เดนไดรต์ [ ^{5 ]}แมโครฟาจ [ ^{6 ] โมโน}ไซต์^{[ 7 ]}และ ลิมโฟไซต์ CD4 ⁺ T ที่พักตัว ^{[ 8 ]}เป็นเอนไซม์ที่แสดงกิจกรรมฟอสโฟไฮโดรเลส^[ 9 ^{] [ 10 ]โดยเปลี่ยน}ดีออกซีนิวคลีโอไซด์ไตรฟอสเฟต (dNTPs) เป็นฟอสเฟตอนินทรีย์ (iPPP) และ2'-ดีออกซีนิวคลีโอไซด์ (เช่น ดีออกซีนิวคลีโอไซด์ที่ไม่มีหมู่ฟอสเฟต) ในการทำเช่นนั้น SAMHD1 จะลดปริมาณ dNTPs ที่มีอยู่สำหรับรีเวิร์สทรานสคริปเทสสำหรับการสังเคราะห์ c DNA ของไวรัส และป้องกันการจำลองแบบของไวรัส^{[ 11 ]} นอกจากนี้ SAMHD1 ยังแสดงกิจกรรมนิวคลีเอส ด้วย ^{[ 12 ]}แม้ว่า จะมีการอธิบายว่ากิจกรรม ของไรโบเอนไซม์จำเป็นต่อการจำกัดHIV-1 ^{[ 13 ]}แต่ข้อมูลล่าสุดยืนยันว่าการจำกัด HIV-1 ในเซลล์โดย SAMHD1 ไม่เกี่ยวข้องกับกิจกรรมของไรโบเอนไซม์^{[ 14 ]}

นอกจากบทบาทในการเผาผลาญนิวคลีโอไทด์แล้วSAMHD1ยังส่งเสริมการซ่อมแซม DNA สายคู่แตก (DSB) ในลักษณะที่ไม่ขึ้นกับ dNTPase การดึงดูด ปัจจัย การซ่อมแซม DNA (CtIP) ไปยังตำแหน่งที่เกิดความเสียหายของ DNA แสดงให้เห็นในเซลล์ที่มี SAMHD1 เพื่ออำนวยความสะดวกในการซ่อมแซม DNA สายคู่แตก (DSB) ที่เกิดจาก HR โดยไม่ขึ้นกับกิจกรรมไตรฟอสโฟไฮโดรเลส ซึ่งแสดงให้เห็นถึงความสำคัญของโปรตีน SAMHD1 สำหรับการเผาผลาญของเซลล์ตามปกติและความสมบูรณ์ของจีโนม^{[ 15 ]}

โปรตีน SAMHD1 มีชื่อเรียกอีกอย่างว่า:

• AGS5: กลุ่มอาการ Acardi- Goutières ประเภท 5 ^{[ 16 ]}
• DCIP: โปรตีน IFNG-induced ที่ได้จากเซลล์เดนไดรต์ 2 ^{[ 17 ]}
• Mg21: โปรตีนที่เหนี่ยวนำโดยอินเตอร์เฟรอนแกมมา^{[ 17 ]}
• HDDC1: โดเมน HD ที่มี 1
• MOP-5: โปรตีนโมโนไซต์ 5
• SAMH1_HUMAN
• SBBI88
• CHBL2

ยีนที่เข้ารหัส SAMHD1 ของมนุษย์ถูกระบุครั้งแรกในไลบรารี cDNA ของเซลล์เดนไดรต์ของมนุษย์ว่าเป็นออร์โธล็อกของยีน Mg11 ที่ถูกเหนี่ยวนำโดย IFN-γ ในหนู^{[ 17 ]}ยีน SAMHD1 ตั้งอยู่บนโครโมโซม 20 SAMHD1 ครอบคลุมลำดับจีโนม 59,532 bp (โครโมโซม 20:34,954,059–35,013,590) ใน 16 เอ็กซอน และเข้ารหัสโปรตีน 626 กรดอะมิโน (aa) ที่มีน้ำหนักโมเลกุล 72.2 kDa ^{[ 18 ] [ 19 ]} SAMHD1 แสดงออกในทั้งเซลล์ที่กำลังแบ่งตัวและเซลล์ที่ไม่แบ่งตัว แต่ฤทธิ์ต้านไวรัสของ SAMHD1 นั้นจำกัดเฉพาะเซลล์ที่ไม่แบ่งตัวเท่านั้น^{[ 20 ]}

โปรตีน SAMHD1 มีความยาว 626 กรดอะมิโน (aa) และมี 2 โดเมน:

ก. โดเมน Sterile alpha motif (SAM): กรดอะมิโนลำดับที่ 45 – 110 ^{[ 21 ] [ 22 ]}โดยทั่วไป โดเมน SAM เป็นที่ทราบกันว่าทำหน้าที่เป็นปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีนและโปรตีนกับกรดนิวคลีอิกในสิ่งมีชีวิตตั้งแต่ยีสต์ไปจนถึงมนุษย์ เป็นตำแหน่งเชื่อมต่อสำหรับไคเนสการส่งสัญญาณและการควบคุมการถอดรหัส^{[ 23 ] [ 24 ]}

b. โปรตีนที่มีโดเมนฮิสติดีน-แอสปาร์ติก (HD) 1: กรดอะมิโน 164 – 319 ^{[ 21 ] [ 22 ]}โปรตีนที่มีโดเมน HD มีลักษณะเฉพาะคือ มีกรด อะมิโนฮิสติดีนและแอสปาร์ติกเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาคู่กัน และแสดงให้เห็นว่ามีกิจกรรมนิวคลีเอส, dGTP ไตรฟอสเฟต, ฟอสเฟต หรือฟอสโฟไดเอสเตอเรส^{[ 23 ] [ 25 ]}

โครงสร้างผลึกของชิ้นส่วน SAMHD1 ที่ประกอบด้วยแกนเร่งปฏิกิริยาเผยให้เห็นว่าโปรตีนเป็นไดเมอร์^{[ 10 ]}นอกจากนี้ การศึกษายังแสดงให้เห็นว่า SAMHD1 เกิดการรวมตัวเป็นโอลิโกเมอร์และสร้างเตตระเมอร์^{[ 26 ]} SAMHD1 จะถูกฟอสโฟรีเลตที่ตำแหน่ง T592 ในเซลล์ที่กำลังแบ่งตัว แต่การฟอสโฟรีเลตนี้จะหายไปเมื่อเซลล์อยู่ในสภาวะที่ไม่แบ่งตัว^{[ 27 ]}

การกลายพันธุ์ใน SAMHD1 พบในกลุ่มอาการ Aicardi–Goutières (AGS) ซึ่งเป็น "โรคสมองอักเสบจากภูมิคุ้มกันตนเองทางพันธุกรรมที่มีลักษณะเฉพาะคือการผลิตอินเตอร์เฟรอนชนิดที่ 1 (IFN) ที่ผิดปกติและอาการที่เลียนแบบการติดเชื้อไวรัสแต่กำเนิด" ^{[ 22 ]}โมโนไซต์ที่แยกได้จากบุคคลที่เป็น AGS มีความไวต่อ HIV-1 สูง^{[ 7 ]}

SAMHD1 ถูกระบุว่าเป็นโปรตีนโฮสต์ที่ถูกจับและปิดกั้นโดยโปรตีนเลนติไวรัส Vpx Vpx ส่งเสริมการติดเชื้อของแมโครฟาจและ DC โดยการกำหนดเป้าหมายไปที่ SAMHD1 ^{[ 28 ]}

โปรตีน SAMHD1 ของมนุษย์มีกิจกรรม dNTP ไตรฟอสเฟต โดยเฉพาะกิจกรรม dGTP-stimulated dNTP ไตรฟอสโฟไฮโดรเลส และกิจกรรมนิวคลีเอสต่อ DNA และ RNA สายเดี่ยว ซึ่งเกี่ยวข้องกับโดเมน HD ของมัน^{[ 12 ] [ 29 ]}การศึกษาอื่นๆ แสดงให้เห็นว่าการปิดกั้น SAMHD1 ช่วยเพิ่มการติดเชื้อ HIV-1 และ SIV Δvpx ในเซลล์ไมอีลอยด์ และยังช่วยเพิ่มการติดเชื้อ HIV-1 ในเซลล์ CD4 ⁺ T ที่พักตัวอีกด้วย ^{[ 20 ] [ 29 ]}

มีการระบุการกลายพันธุ์ 16 ตำแหน่งในยีน SAMHD1 ในผู้ป่วยที่เป็นโรค Aicardi-Goutieres การกลายพันธุ์ส่งผลให้โปรตีน SAMHD1 ทำงานได้น้อยลง อย่างไรก็ตาม ยังไม่ทราบว่าความผิดปกติของโปรตีนนี้ส่งผลให้เกิดความผิดปกติของระบบภูมิคุ้มกัน ความเสียหายจากการอักเสบในสมองและผิวหนัง และลักษณะอื่นๆ ของโรคนี้ได้อย่างไร^{[ 7 ] [ 22 ]}

SAMHD1 ถูกระบุว่าเป็นโปรตีนในเซลล์ที่รับผิดชอบต่อการปิดกั้นการถอดรหัสย้อนกลับของการติดเชื้อ HIV-1 ที่พบในเซลล์ไมอีลอยด์ เช่นเดียวกับในเซลล์ CD4 ⁺ T ที่อยู่ในสภาวะสงบ SAMHD1 ยับยั้งการติดเชื้อ HIV-1 ในเซลล์ไมอีลอยด์โดยการจำกัดปริมาณ dNTP ภายในเซลล์^{[ 28 ]}กิจกรรมไตรฟอสโฟไฮโดรเลสของ dNTP ของ SAMHD1 ได้รับการเสนอให้ลดระดับ dNTP ภายในเซลล์ จำกัดการจำลองแบบของ HIV-1 และป้องกันการกระตุ้นระบบภูมิคุ้มกัน กิจกรรมนิวคลีเอสต่อ DNA และ RNA สายเดี่ยว (ss) รวมถึงต่อ RNA ในไฮบริด DNA/RNA ^{[ 23 ] [ 28 ]}ความสามารถในการยับยั้งไวรัสเรโทรของ SAMHD1 ถูกควบคุมโดยการฟอสโฟรีเลชัน โดย SAMHD1 จะเชื่อมโยงกับคอมเพล็กซ์ไซคลิน A2/CDK1 ซึ่งทำหน้าที่เป็นตัวกลางในการฟอสโฟรีเลชันที่ทรีโอนีน 592 พบว่า SAMHD1 ที่ถูกฟอสโฟรีเลชันแล้วจะมีกิจกรรมน้อยมากหรือไม่มีเลยในเซลล์ที่กำลังแบ่งตัว ในทางกลับกัน SAMHD1 ที่ไม่ถูกฟอสโฟรีเลชันในเซลล์ที่ไม่แบ่งตัวจะมีกิจกรรมการยับยั้งที่ทรงพลัง^{[ 27 ]}

การแสดงออกของโปรตีน SAMHD1 สามารถได้รับอิทธิพลในสี่ระดับในเซลล์มะเร็ง ประการแรก การกลายพันธุ์ในยีน SAMHD1 สามารถป้องกันการสร้าง mRNA ของ SAMHD1 หรือโปรตีนที่ทำงานได้หลังจากการแปล^{[ 30 ]} ประการที่สอง การเมทิลเลชั่นของโปรโมเตอร์สามารถป้องกันการถอดรหัส mRNA ของ SAMHD1 ^{[ 31 ] [ 32 ]}ประการที่สาม miRNA-155 และ miRNA-181a สามารถป้องกันการแปล จึงป้องกันการผลิตโปรตีน^{[ 33 ] [ 34 ]}สุดท้าย การสลายตัวของ SAMHD1 เกิดขึ้นในช่วงระยะ S ของวงจรเซลล์^{[ 35 ]} เซลล์มะเร็งที่ไม่ยึดเกาะ – เซลล์ B เซลล์ T และเซลล์ไมอีลอยด์ ซึ่งเป็นเซลล์ที่แบ่งตัวอย่างรวดเร็ว มีระดับโปรตีน SAMHD1 ต่ำหรือตรวจไม่พบ เมื่อเทียบกับเซลล์ที่ยึดเกาะ การควบคุมความเข้มข้นของ dNTP โดย SAMHD1 ในเซลล์มะเร็งอาจเป็นกลไกสำคัญที่มีนัยสำคัญในการรักษา^{[ 36 ]}แอนติเมตาโบไลต์เป็นนิวคลีโอไซด์ นิวคลีโอไทด์ และอะนาล็อกของเบสที่มีฤทธิ์ต้านมะเร็ง ซึ่งใช้เป็นสารต้านมะเร็งเพื่อส่งเสริมการตายของเซลล์ด้วยกลไกการออกฤทธิ์ที่แตกต่างกันหลายประการ^{[ 37 ]} สำหรับแอนติเมตาโบไลต์บางชนิด รูปแบบไตรฟอสเฟตภายในเซลล์ของอะนาล็อกเป็นสารประกอบที่ออกฤทธิ์^{[ 37 ]} SAMHD1 ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าสามารถไฮโดรไลซ์อะราบิโนส 5'-ไตรฟอสเฟตได้^{[ 38 ]} SAMHD1 ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าเป็นไบโอมาร์กเกอร์และมีอิทธิพลต่อการตอบสนองต่ออะราบิโนส C (ara-C; ไซทาราบีน) ^{[ 39 ]}โปรตีนไวรัส x (Vpx) ได้รับการเสนอให้เป็นวิธีการรักษาที่มีศักยภาพในการปรับปรุงการรักษาด้วยไซทาราบีนสำหรับมะเร็งเม็ดเลือด^{[ 40 ]}

• รายการ GeneReviews/NCBI/NIH/UW เกี่ยวกับโรค Aicardi-Goutières
• รายการ OMIM ในกลุ่มอาการ Aicardi-Goutieres
• ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : Q9Y3Z3 (Human Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1) ที่PDBe -KB
• ภาพรวมของข้อมูลโครงสร้างทั้งหมดที่มีอยู่ในPDBสำหรับUniProt : Q60710 (Mouse Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1) ที่PDBe- KB