ซีซี13 โครงสร้างที่มีอยู่ พีดีบี การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB รายชื่อรหัส PDB 3BG0 , 3BG1 , 5A9Q
ตัวระบุ ชื่อเรียกอื่น SEC13 , D3S1231E, SEC13L1, SEC13R, npp-20, SEC13 homolog, รูพรุนนิวเคลียร์ และส่วนประกอบที่ซับซ้อนของการเคลือบ COPIIรหัสภายนอก โอมิม : 600152 ; เอ็มจีไอ : 99832 ; โฮโมโลยีน : 6479 ; GeneCards : SEC13 ; OMA : SEC13 - ออโธโลจีการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก)สูงสุดที่แสดงใน เซลล์สโตรมัลของเยื่อบุโพรงมดลูก โอโอไซต์ ต่อมใต้สมอง เซลล์เบต้า ต่อมใต้สมองส่วนหน้า ลำไส้เล็กส่วนต้น เยื่อบุลำไส้เล็กส่วนเจจูนัม ต่อมน้ำลายพาโรติด เนื้อเยื่อกระดูกอ่อน กระดูกหน้าแข้ง
สูงสุดที่แสดงใน ฟันกราม เนื้อเยื่อบุผิวของลำไส้เล็ก ถุงน้ำอสุจิ แผ่นเนื้อเยื่อหู เยื่อบุลำไส้เล็กส่วนปลาย ความนูนของขากรรไกรล่าง ความนูนของขากรรไกรบน เบาะรองหัวใจ ท่อประสาท ลำไส้เล็กส่วนต้น
ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
ไบโอจีพีเอส ข้อมูลการแสดงออกอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับโปรตีน การจับโปรตีนที่เหมือนกัน กิจกรรมของโมเลกุลโครงสร้าง ส่วนประกอบของเซลล์ เยื่อหุ้มเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม ออร์แกเนลล์ที่มีเยื่อหุ้มภายในเซลล์ เมมเบรน เยื่อหุ้มนิวเคลียส รูพรุนนิวเคลียร์ นิวคลีโอพลาสม์ คอมเพล็กซ์ GATOR2 วงแหวนรอบนอกของรูพรุนนิวเคลียร์ เอนโดพลาสมิกเรติคูลัม เยื่อหุ้มถุงลำเลียงจาก ER ไปยัง Golgi เอ็กโซโซมนอกเซลล์ ถุงไซโตพลาสมิก นิวเคลียส ไคเนโตคอร์ เยื่อกอลจิ ไลโซโซม เยื่อหุ้มไลโซโซม เปลือกเวสิเคิล COPII ไซโตซอล เซลล์เจ้าบ้าน กระบวนการทางชีวภาพ การขนส่ง mRNA กระบวนการประมวลผลและการนำเสนอแอนติเจนเปปไทด์จากภายนอกผ่านทาง MHC คลาส II กระบวนการประมวลผลแอนติเจนและการนำเสนอแอนติเจนเปปไทด์ผ่านทาง MHC คลาส I การเคลือบเวสิเคิล COPII การขนส่งโปรตีน การขนส่งโปรตีนภายในเซลล์ การขนส่งผ่านเวสิเคิล การควบคุมเชิงบวกของการส่งสัญญาณ TOR การยึดเกาะของโครมาทิดคู่ การบรรจุสารลงในเวสิเคิลเคลือบ COPII ขนส่ง การออกจากโปรตีนจากเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม การแตกหน่อของเวสิเคิลที่เคลือบด้วย COPII การควบคุมเชิงบวกของการส่งสัญญาณ TORC1 การควบคุมกระบวนการไกลโคไลซิส การส่งออก mRNA จากนิวเคลียส การส่งออก tRNA จากนิวเคลียส กระบวนการไวรัส การถอดรหัสไวรัส การควบคุมการปิดการทำงานของยีนโดย miRNA การขนส่งไวรัสภายในเซลล์ การควบคุมการตอบสนองของเซลล์ต่อความร้อน แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ วงดนตรี ยูนิโปรท RefSeq (mRNA) NM_001136026 NM_001136232 NM_001278946 NM_030673 NM_183352
RefSeq (โปรตีน) NP_001129498 NP_001129704 NP_001265875 NP_109598 NP_899195
สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 3: 10.29 – 10.32 Mb Chr 6: 113.71 – 113.72 Mb ใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
โปรตีนโฮโมล็อก SEC13 เป็นโปรตีน ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีน SEC13 [ 5 ] [ 6 ]
โปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนนี้เป็นของตระกูล SEC13 ของ โปรตีน WD-repeat มีความคล้ายคลึงกับโปรตีน SEC13 และSEC31 ของยีสต์ ซึ่งจำเป็นสำหรับ การสร้าง เวสิเคิล จากเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม ระหว่างการขนส่งโปรตีน[ 6 ]
อ่านเพิ่มเติม Shaywitz DA, Orci L, Ravazzola M และคณะ (1995). "SEC13Rp ของมนุษย์ทำหน้าที่ในยีสต์และตั้งอยู่บนถุงขนส่งที่แตกหน่อจากเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม" . J. Cell Biol . 128 (5): 769– 77. doi : 10.1083/jcb.128.5.769 . PMC 2120388 . PMID 7876304 . Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: วิธีง่ายๆ ในการแทนที่โครงสร้าง cap ของ mRNA ยูคาริโอตด้วยโอลิโกไรโบนิวคลีโอไทด์" Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 . Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY และคณะ (1996). "วิธีการ 'อะแดปเตอร์คู่' สำหรับการสร้างไลบรารีช็อตกันที่ดีขึ้น" Anal. Biochem . 236 (1): 107–13 . doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 . Yu W, Andersson B, Worley KC และคณะ (1997). "การจัดลำดับ cDNA แบบต่อกันขนาดใหญ่" . Genome Res . 7 (4): 353– 8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 . Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K และคณะ (1997). "การสร้างและลักษณะเฉพาะของไลบรารี cDNA ที่อุดมด้วยความยาวเต็มและอุดมด้วยปลาย 5'" Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 . Mammoto A, Sasaki T, Kim Y, Takai Y (2000). "ปฏิสัมพันธ์ทางกายภาพและหน้าที่ของ rabphilin-11 กับโปรตีน Sec13 ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม ความหมายในการลำเลียงเวสิเคิล" J. Biol. Chem . 275 (18): 13167– 70. doi : 10.1074/jbc.C000096200 . PMID 10747849 . Tang BL, Zhang T, Low DY และคณะ (2000). "โฮโมล็อกของยีสต์ sec31p ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม รูปแบบที่แสดงออกอย่างแพร่หลายจะถูกกำหนดตำแหน่งที่บริเวณทางออกของเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม (ER) และจำเป็นต่อการขนส่ง ER-Golgi" . J. Biol. Chem . 275 (18): 13597– 604. doi : 10.1074/jbc.275.18.13597 . PMID 10788476 . Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH และคณะ (2003). "การสร้างและการวิเคราะห์เบื้องต้นของลำดับ cDNA ของมนุษย์และหนูที่มีความยาวเต็มมากกว่า 15,000 ลำดับ" Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 . Gevaert K, Goethals M, Martens L และคณะ (2004). "การสำรวจโปรตีโอมและการวิเคราะห์กระบวนการโปรตีนโดยการระบุเปปไทด์ปลาย N ที่คัดแยกด้วยสเปกโทรเมตรีมวล" Nat . Biotechnol . 21 (5): 566–9 . doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801. S2CID 23783563 . Enninga J, Levay A, Fontoura BM (2003). "Sec13 เคลื่อนที่ไปมาระหว่างนิวเคลียสและไซโตพลาสม์ และมีปฏิสัมพันธ์กับ Nup96 อย่างเสถียรที่คอมเพล็กซ์รูพรุนนิวเคลียส" . Mol. Cell. Biol . 23 (20): 7271– 84. doi : 10.1128/MCB.23.20.7271-7284.2003 . PMC 230331 . PMID 14517296 . Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T และคณะ (2004). "การจัดลำดับและลักษณะเฉพาะของ cDNA มนุษย์ความยาวเต็ม 21,243 รายการ" Nat . Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 . Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H และคณะ (2004). "แผนที่ทางกายภาพและหน้าที่ของเส้นทางการส่งสัญญาณ TNF-alpha/NF-kappa B ของมนุษย์" Nat . Cell Biol . 6 (2): 97– 105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216. S2CID 11683986 . Loïodice I, Alves A, Rabut G และคณะ (2005). "คอมเพล็กซ์ Nup107-160 ทั้งหมด รวมถึงสมาชิกใหม่ 3 ตัว ถูกส่งไปยังไคเนโตคอร์เป็นหน่วยเดียวในการแบ่งเซลล์" . Mol. Biol. Cell . 15 (7): 3333– 44. doi : 10.1091/mbc.E03-12-0878 . PMC 452587 . PMID 15146057 . Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA และคณะ (2004). "สถานะ คุณภาพ และการขยายตัวของโครงการ cDNA ความยาวเต็มของ NIH: ชุดสะสมยีนสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 . Rual JF, Venkatesan K, Hao T และคณะ (2005). "มุ่งสู่แผนที่ระดับโปรตีโอมของเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนของมนุษย์" Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 . Stagg SM, Gürkan C, Fowler DM และคณะ (2006). "โครงสร้างของกรงเคลือบ Sec13/31 COPII" Nature . 439 (7073): 234– 8. Bibcode : 2006Natur.439..234S . doi : 10.1038/nature04339 . PMID 16407955 . S2CID 2426465 .
