เซทซ์
| เซทซ์ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ตัวระบุ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ชื่อเรียกอื่น | SETX , ALS4, AOA2, SCAR1, bA479K20.2, เซนาแท็กซิน, Sen1, SCAN2, STEX | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| รหัสภายนอก | โอมิม : 608465 ; เอ็มจีไอ : 2443480 ; โฮโมโลยีน : 41003 ; GeneCards : SETX ; OMA : SETX - ออโธโลจี | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| วิกิดาต้า | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
เอนไซม์เฮลิเคสเซนาแท็กซินน่าจะเป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSETX [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
ยีนนี้เข้ารหัสโปรตีนชื่อเซนาแท็กซิน ซึ่งเป็นโปรตีนขนาด 302 กิโลดาลตัน[ 8 ]
ลำดับและโครงสร้าง
มีความคล้ายคลึงกันสูงระหว่าง SETX ของมนุษย์และ Sen1 ของยีสต์ Sen1 ในยีสต์เป็นเฮลิเคส RNA/DNA และลำดับที่อนุรักษ์ไว้สูงระหว่างยีนเหล่านี้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในโดเมนเฮลิเคส บ่งชี้ว่า SETX ในมนุษย์อาจมีบทบาทที่คล้ายคลึงกันในการแสดงออกของยีนและการรักษา เสถียรภาพของ จีโนมใน Sen1 ปลาย Nแสดงปฏิสัมพันธ์กับ โดเมน ปลาย CของRNA polymerase II , ribonuclease IIIและปัจจัย NER Rad2/XPGในขณะเดียวกัน ปลาย C เข้ารหัสกิจกรรมเฮลิเคส DNA/RNA [ 9 ] ในทำนองเดียวกัน SETX เข้ารหัสโปรตีนเซนาแท็กซินที่มีปลาย N ที่น่าจะเกี่ยวข้องกับการโต้ตอบกับโปรตีนอื่นๆ เซนาแท็กซินโต้ตอบกับ RNA polymerase II และโปรตีนที่จับกับโพลี(A) ที่ปลาย C เซนาแท็กซินมีโดเมนเฮลิเคสDEAD box [ 10 ]
การทำงาน
แม้ว่าเซนาแท็กซินจะถูกแสดงออกอย่างกว้างขวางในเนื้อเยื่อต่างๆ ในร่างกาย แต่บทบาทของเซลล์ของเซนาแท็กซินยังไม่เป็นที่เข้าใจอย่างสมบูรณ์ อย่างไรก็ตาม จากการวิจัยในปัจจุบันและการตรวจสอบโฮโมล็อกของ SETX เชื่อว่าเซนาแท็กซินมีบทบาทสำคัญในการแก้ไขR-loopการยุติการถอดรหัสและการรักษาเสถียรภาพของจีโนมโดยเป็นองค์ประกอบที่จำเป็นของการตอบสนองต่อความเสียหายของ DNA (DDR) [ 11 ]
SETX ถูกสงสัยว่ามีส่วนเกี่ยวข้องกับการซ่อมแซมความเสียหายของ DNA และการรักษาเสถียรภาพของจีโนมโดยการทำงานร่วมกับโปรตีนอื่นๆ ในการตอบสนองต่อความเสียหายของ DNA R loop อาจเกิดขึ้นจากความเครียดในการจำลองแบบ เช่น เมื่อการถอดรหัสและการจำลองแบบเกิดขึ้นพร้อมกันที่ตำแหน่งใดตำแหน่งหนึ่ง สิ่งนี้มักเกิดขึ้นเมื่อถอดรหัสยีนที่มีความยาวมาก เนื่องจากกระบวนการถอดรหัสของยีนนั้นอาจใช้เวลานานกว่าการจำลองแบบหนึ่งรอบ เมื่อรีพลิโซมและเครื่องจักรการถอดรหัสชนกัน R loop ก็สามารถก่อตัวขึ้นและอาจเกิดการแตกหักของสายคู่ได้[ 12 ]ที่บริเวณที่เกิดการชนกันเหล่านี้ พบว่า SETX อยู่ร่วมกับ 53BP1 ซึ่งเป็นตัวบ่งชี้ความเสียหายของ DNA [ 13 ]นอกจากนี้ ยังพบว่า SETX ส่งเสริมการซ่อมแซมการรวมตัวแบบโฮโมโลจัสและป้องกันการย้ายตำแหน่ง[ 14 ]เพื่อสนับสนุนบทบาทของ SETX ในการซ่อมแซมความเสียหายของ DNA เพิ่มเติม SETX อยู่ร่วมกับปัจจัย DDR อื่นๆ อีกมากมาย ตัวอย่างเช่น BRCA1 ยังแสดงให้เห็นว่าสามารถดึงดูด SETX เพื่อกำจัด R-loop ซึ่งป้องกันการกลายพันธุ์ของ DNA ที่เกิดขึ้นอันเป็นผลมาจาก DNA สายเดี่ยวที่เปราะบางซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของโครงสร้าง R-loop [ 15 ] SETX อาจมีส่วนเกี่ยวข้องในการซ่อมแซมการแตกของสายคู่ผ่านการมีส่วนร่วมในการโหลด RAD51 ซึ่งเป็นโปรตีนที่สำคัญในการซ่อมแซมการแตกของสายคู่ผ่านการรวมตัวแบบโฮโมโลจัส[ 16 ]
นอกจากนี้ Senataxin อาจมีส่วนเกี่ยวข้องกับการยุติการถอดรหัส พบ R-loop จำนวนมากที่ปลาย 3' ของยีนสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมบางชนิด หลังจากตำแหน่งโพลีอะดีนิเลชัน เชื่อกันว่า R-loop มีส่วนเกี่ยวข้องกับการยุติการถอดรหัสโดยการขัดขวาง RNA polymerase II โปรตีน senataxin ซึ่งมีกิจกรรม RNA-DNA helicase และ DHX9 helicase ของมนุษย์สามารถแก้ไข R-loop ได้ ซึ่งทำให้ XRN2 ซึ่งเป็นเอ็กโซนิวคลีเอส สามารถเข้าถึงตำแหน่งโพลีอะดีนิเลชันที่ปลาย 3' และย่อยสลายทรานสคริปต์ที่ปลาย 3' ซึ่งในที่สุดจะนำไปสู่การยุติการถอดรหัส[ 17 ]
ความสำคัญทางคลินิก
พบว่า SETX เกิดการกลายพันธุ์ในโรคอะแท็กเซียในเด็กที่มีอาการอะแพรกเซียของกล้ามเนื้อตาชนิดที่ 2 (AOA2) และโรคกล้ามเนื้ออ่อนแรงชนิดอะไมโอโทรฟิก ในเด็ก (ALS4) [ 18 ]ในเซลล์ ALS4 พบว่า SETX เกิดการกลายพันธุ์ทำให้มีฟังก์ชันเฮลิเคสมากขึ้น ส่งผลให้ระดับ R-loop ต่ำกว่าปกติ ซึ่งทำให้เกิดการส่งสัญญาณ TGF-β ที่ผิดปกติและทำให้เซลล์ประสาทตาย[ 19 ]เซลล์ AOA2 แสดงให้เห็นถึงการสูญเสียการทำงานของเซนาแท็กซินและระดับ R-loop ที่สูงผิดปกติ[ 20 ]โรคทางระบบประสาท เช่น AOA2 และ ALS4 มักพบว่ามีการสะสมของโปรตีนที่ผิดปกติ และงานวิจัยแสดงให้เห็นว่า SETX อาจมีบทบาทสำคัญในออโตฟาจีโดยการควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับการกำจัดโปรตีนที่สะสมอยู่[ 21 ]
อ่านเพิ่มเติม
- Maruyama K, Sugano S (มกราคม 1994). "Oligo-capping: วิธีง่ายๆ ในการแทนที่โครงสร้าง cap ของ mRNA ยูคาริโอตด้วยโอลิโกไรโบนิวคลีโอไทด์" Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (กันยายน 1996). "การทำให้เป็นมาตรฐานและการลบ: สองแนวทางเพื่ออำนวยความสะดวกในการค้นพบยีน" . Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (ตุลาคม 1997). "การสร้างและลักษณะเฉพาะของไลบรารี cDNA ที่อุดมด้วยความยาวเต็มและอุดมด้วยปลาย 5'" Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H และ คณะ (มิถุนายน 1998). "การทำนายลำดับรหัสของยีนมนุษย์ที่ไม่ระบุ X. ลำดับสมบูรณ์ของโคลน cDNA ใหม่ 100 โคลนจากสมองซึ่งสามารถเข้ารหัสโปรตีนขนาดใหญ่ในหลอดทดลองได้" DNA Research . 5 (3): 169– 76. doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811 .
- Moreira MC, Klur S, Watanabe M, Németh AH, Le Ber I, Moniz JC และ คณะ (มีนาคม 2547) "Senataxin ซึ่งเป็นออร์โธล็อกของ RNA helicase ในยีสต์ มีการกลายพันธุ์ในโรค ataxia-ocular apraxia 2" Nature Genetics 36 ( 3): 225– 7. doi : 10.1038/ng1303 . hdl : 10400.16/502 . PMID 14770181 .
- Chen YZ, Bennett CL, Huynh HM, Blair IP, Puls I, Irobi J และ คณะ (มิถุนายน 2547) "การกลายพันธุ์ของยีน DNA/RNA helicase ในรูปแบบหนึ่งของโรคกล้ามเนื้ออ่อนแรงชนิดอะไมโอโทรฟิกในเด็ก (ALS4)" American Journal of Human Genetics 74 (6): 1128– 35. doi : 10.1086/421054 . PMC 1182077 . PMID 15106121 .
- Duquette A, Roddier K, McNabb-Baltar J, Gosselin I, St-Denis A, Dicaire MJ และ คณะ (มีนาคม 2548) "การกลายพันธุ์ในเซนาแท็กซินที่รับผิดชอบต่อกลุ่มโรคอะแท็กเซี ยร่วมกับโรคเส้นประสาทในควิเบก"วารสารประสาทวิทยา 57 ( 3): 408–14 . doi : 10.1002/ana.20408 . PMID 15732101. S2CID 9501982 .
- Asaka T, Yokoji H, Ito J, Yamaguchi K, Matsushima A (พฤษภาคม 2549). "โรคอะแท็กเซียแบบถ่ายทอดทางพันธุกรรมแบบด้อย ร่วมกับโรคเส้นประสาทส่วนปลายและระดับ AFP สูง: การกลายพันธุ์ใหม่ใน SETX" Neurology . 66 (10): 1580– 1. doi : 10.1212/01.wnl.0000216135.59699.9b . PMID 16717225 . S2CID 34988349 .
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (ตุลาคม 2549). "วิธีการตามหลักความน่าจะเป็นสำหรับการวิเคราะห์ฟอสโฟรีเลชันของโปรตีนแบบความเร็วสูงและการระบุตำแหน่งไซต์" Nature Biotechnology . 24 (10): 1285– 92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (พฤศจิกายน 2549). "พลวัตการฟอสโฟรีเลชันทั่วโลก ในร่างกาย และเฉพาะตำแหน่งในเครือข่ายการส่งสัญญาณ" . Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
- Suraweera A, Becherel OJ, Chen P, Rundle N, Woods R, Nakamura J และ คณะ (มิถุนายน 2550). "Senataxin ซึ่งบกพร่องในโรค ataxia oculomotor apraxia ชนิด ที่2 มีส่วนเกี่ยวข้องในการป้องกันความเสียหายของ DNA จากออกซิเดชัน" วารสารชีววิทยาของเซลล์ 177 ( 6 ) : 969–79 . doi : 10.1083/jcb.200701042 . PMC 2064358. PMID 17562789 .
ลิงก์ภายนอก
- ข้อมูลจาก GeneReviews/NCBI/NIH/UW เกี่ยวกับภาวะ Ataxia with Oculomotor Apraxia Type 2
- ข้อมูลจากฐานข้อมูล OMIM เกี่ยวกับภาวะเสียการทรงตัวร่วมกับภาวะอะแพรกเซียของกล้ามเนื้อตาชนิดที่ 2
- พันธุศาสตร์ โฮม รีเฟอร์