ชานก์1
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	SHANK1 , SPANK-1, SSTRIP, ซินามอน, SH3 และโดเมนซ้ำแอนคิรินหลายตัว 1
รหัสภายนอก	OMIM : 604999 ; MGI : 3613677 ; HomoloGene : 22949 ; GeneCards : SHANK1 ; OMA : SHANK1 - orthologs
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 19 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 19q13.33 เริ่ม 50,659,255 bp [ 1 ] จบ 50,719,802 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 7 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 7 | 7 B3 เริ่ม 43,959,677 bp [ 2 ] จบ 44,009,996 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน คอร์เทกซ์ซิงกูเลตส่วนหน้า กลีบหน้าผากด้านขวา เปลือกสมองส่วนหน้า อะมิกดาล่า ซีกขวาของสมองน้อย เปลือกสมองส่วนรับภาพหลัก คอร์เทกซ์พรีฟรอนทัลด้านข้างส่วนหลัง พื้นที่บรอดแมน 9 ฮิปโปแคมปัสแท้ ไจรัสขมับกลาง สูงสุดที่แสดงใน เปลือกสมองส่วนหน้า เปลือกสมองส่วนสั่งการหลัก กลีบขมับ ซับบิคูลัม ไจรัสซิงกูเลต อะมิกดาล่า นิวเคลียสเจนิคิวเลตด้านข้าง คอร์เทกซ์รูปทรงลูกแพร์ เปลือกสมองส่วนรับภาพหลัก นิวเคลียสด้านหลังส่วนกลาง ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอ GPS ไม่มีข้อมูล
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับกับตัวรับโซมาโตสแตติน การจับโดเมน SH3 การจับซ้ำของแอนไคริน การจับโปรตีนโครงสร้าง การจับกับปลาย C ของโปรตีน การจับโปรตีน กิจกรรมตัวปรับตัวรับสัญญาณประสาทไซแนปส์ การจับโปรตีนที่เหมือนกัน การจับกับตัวรับกลูตาเมตแบบไอโอโนโทรปิก กิจกรรมอะแดปเตอร์ของคอมเพล็กซ์ตัวรับสัญญาณ การจับเชิงซ้อนที่มีโปรตีน ส่วนประกอบของเซลล์ ไซโตพลาซึม เยื่อหุ้มเซลล์หลังไซแนปส์ เมมเบรน หนามเดนไดรต์ ไซแนปส์ ไซแนปส์กระตุ้น โครงสร้างทางกายวิภาคภายในเซลล์ คอมเพล็กซ์ตัวรับกลูตาเมตแบบเลือก NMDA จุดเชื่อมต่อเซลล์ เดนไดรต์ การฉายภาพของเซลล์ประสาท คอมเพล็กซ์ตัวรับกลูตาเมตแบบไอโอโนโทรปิก ความหนาแน่นหลังไซแนปส์ ไซโตซอล เยื่อหุ้มพลาสมา ไซแนปส์ Schaffer collateral - CA1 ไซแนปส์กลูตาเมอร์จิก หนามประสาท กระบวนการทางชีวภาพ การแยกเซลล์ พฤติกรรมการดมกลิ่น การเรียนรู้แบบเชื่อมโยง กระบวนการทางประสาทและกล้ามเนื้อที่ควบคุมการทรงตัว การควบคุมเชิงลบของการประกอบกลุ่มเส้นใยแอคติน การควบคุมเชิงบวกของการพัฒนาหนามเดนไดรต์ การพัฒนาระบบประสาท การควบคุมกิจกรรมของตัวรับ AMPA การสร้างรูปร่างของหนามเดนไดรต์ พฤติกรรมการเปล่งเสียง พฤติกรรมของผู้ใหญ่ ความทรงจำระยะยาว การเจริญเติบโตของไซแนปส์ การควบคุมเชิงบวกของศักยภาพโพสต์ไซแนปส์กระตุ้น พฤติกรรมทางสังคม การปรับตัว การกำหนดผลกระทบ ปฏิกิริยาการทรงตัว การกำหนดตำแหน่งของโปรตีนไปยังไซแนปส์ การประกอบเชิงซ้อนที่มีโปรตีน การจัดระเบียบโพสต์ไซแนปส์ การประกอบไซแนปส์ การสร้างรูปร่างของสมอง การประกอบไซแนปส์ที่จุดเชื่อมต่อประสาทกล้ามเนื้อ การควบคุมเชิงบวกของการส่งสัญญาณประสาทผ่านไซแนปส์ กลูตาเมต การเสริมศักยภาพระยะยาว การประกอบความหนาแน่นหลังไซแนปส์ แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 50944 243961 วงดนตรี ENSG00000161681 ENSMUSG00000038738 ยูนิโปรท Q9Y566 D3YZU1 RefSeq (mRNA) NM_016148 NM_001034115 RefSeq (โปรตีน) NP_057232 NP_001029287 สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 19: 50.66 – 50.72 Mb Chr 7: 43.96 – 44.01 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

โปรตีน SH3 และโดเมนแอนคิรินซ้ำหลายตัว 1เป็นโปรตีนที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSHANK1 ^{[ 5 ] [ 6 ]}

จากการศึกษาพบว่า SHANK1 มีปฏิสัมพันธ์กับ:

• ARHGEF7 , ^{[ 7 ]}
• BAIAP2 , ^{[ 8 ]}
• DNM2 , ^{[ 9 ]}
• SPTAN1 , ^{[ 10 ]} และ
• ตัวรับโซมาโตสแตติน 2 ^{[ 5 ]}

SHANK1 เป็นโปรตีนโครงสร้างที่มีบทบาทสำคัญในการสร้างและบำรุงรักษาไซแนปส์กระตุ้นในสมอง การกลายพันธุ์ในยีน SHANK1 มีส่วนเกี่ยวข้องกับความผิดปกติทางพัฒนาการของระบบประสาทหลายประการ รวมถึงโรคออทิสติกสเปกตรัม (ASD) โรคจิตเภทและ ความบกพร่อง ทางสติปัญญา^{[ 11 ] [ 12 ]} โดยเฉพาะอย่างยิ่ง การสูญเสียการแสดงออกของ SHANK1 มีความเชื่อมโยงกับ ASD และการกลายพันธุ์ของ SHANK1 ได้ถูกระบุในบุคคลที่เป็น ASD หรือความผิดปกติทางพัฒนาการของระบบประสาทอื่นๆ ASD หรือที่รู้จักกันในชื่อ "โรคออทิสติกสเปกตรัม" ถูกระบุว่าเป็นกลุ่มของภาวะที่ทำให้เกิดลักษณะเฉพาะในสมองของมนุษย์ซึ่งนำไปสู่ความบกพร่อง ความบกพร่องเหล่านี้ ได้แก่ ปัญหาด้านการสื่อสาร ความสนใจ และการเข้าสังคม หรือรูปแบบพฤติกรรมที่แตกต่างกัน

Sato et al 2012 ได้ยืนยันถึงอิทธิพลที่สำคัญของการกลายพันธุ์และการลบของ SHANK1 ในผู้ชายที่เป็น ASD ^{[ 13 ]}การศึกษานี้ประกอบด้วยบุคคลชาวแคนาดา 1,158 คน และบุคคลชาวยุโรป 456 คน ซึ่งทั้งหมดเป็น ASD SHANK 1 ตั้งอยู่บนโครโมโซม 19ในมนุษย์ ในขณะที่SHANK2ตั้งอยู่บนโครโมโซม 11และSHANK3 ตั้งอยู่ บนโครโมโซม 22 โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ตำแหน่งของ SHANK1 นั้นได้รับการศึกษาน้อยกว่าในส่วนที่เกี่ยวข้องกับ ASD เมื่อเทียบกับ SHANK2 และ SHANK3 วัตถุประสงค์ของการศึกษาคือเพื่อให้บริบทเพิ่มเติมและวิเคราะห์โปรตีนเฉพาะ SHANK1 ในฐานะจุดสนใจสำหรับการพัฒนา ASD ในผู้ชายที่เกิดจากการลบ การลบขนาดเล็ก และ/หรือการกลายพันธุ์ นักวิจัยพบว่าการลบยีนแบบ de novo เกิดขึ้นในผู้ชายที่เป็น ASD ที่มีการทำงานสูง ในขณะที่ผู้ชาย 15,000 คนที่ใช้เป็นกลุ่มควบคุมไม่มีการลบยีนดังกล่าว

การศึกษาครั้งนี้มุ่งเน้นไปที่บุคคล 7 คน ซึ่งพบว่ามีการขาดหายไปของยีน SHANK1 บนโครโมโซม 19 ในจำนวนนี้ 4 คนเป็นเพศชายที่มีภาวะออทิสติกแบบทำงานได้ดี (high functioning ASD) ซึ่งตรวจพบการกลายพันธุ์หรือการขาดหายไปของยีน SHANK1 ที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมจากหลายรุ่น ในกลุ่มเดียวกันนี้ มีเพศหญิง 2 คนที่มีการขาดหายไปของยีน SHANK1 แต่ไม่ได้แสดงอาการออทิสติก และคนสุดท้ายเป็นเพศชายที่มีการขาดหายไปของยีน SHANK1 โดยไม่เกี่ยวข้องกับการถ่ายทอดทางพันธุกรรม แต่แสดงอาการออทิสติก บุคคลทุกคนในงานวิจัยนี้ที่แสดงอาการออทิสติกได้รับการประเมินและวินิจฉัยโดยแพทย์ผู้เชี่ยวชาญโดยใช้แบบประเมิน Autism Diagnostic Observation Schedule (ADOS) และ/หรือ Autism Diagnostic Interview-Revised (ADI-R) บุคคลเหล่านี้ได้รับการคัดเลือกจากโรงพยาบาลและศูนย์การแพทย์เฉพาะทางต่างๆ ทั่วประเทศแคนาดาและยุโรป

ได้ทำการทดสอบในห้องปฏิบัติการเพื่อระบุยีนในแต่ละบุคคลโดยใช้เทคนิค SYBR-Green-based real-time quantitative PCR (qPCR) การทดสอบมุ่งเน้นไปที่ครอบครัวที่ 1 ซึ่งเป็นตำแหน่งทางพันธุกรรมที่พบยีนตระกูล SHANK การทดสอบนี้ใช้ไพรเมอร์เพื่อตรวจสอบการกลายพันธุ์ การขาดหาย หรือการขาดหายเล็กน้อยของยีน SHANK1 ผลการทดสอบระบุว่ามีการขาดหายขนาด 63.8 กิโลเบส ซึ่งทำให้เกิดการกำจัดเอ็กซอน 1-20 ของยีน SHANK1 รวมถึงการขาดหายในยีน CLEC11A ด้วย ยีน CLEC11A (MIM 604713) ตั้งอยู่บนโครโมโซม 2q14.1 และเข้ารหัสโปรตีนที่เรียกว่า osteoactivin Osteoactivin พบได้ในเนื้อเยื่อหลายชนิด เช่น กระดูก กระดูกอ่อน และปอด พบว่ายีนนี้เป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการทางชีวภาพหลายอย่าง เช่น การปรับโครงสร้างกระดูก การสร้างหลอดเลือดใหม่ และการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน การกลายพันธุ์ในยีน CLEC11A เกี่ยวข้องกับความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของการเกิดโรคกระดูกพรุนและโรคเกี่ยวกับกระดูกอื่นๆ

นอกจากจะพบว่ายีน SHANK1 มีความเกี่ยวข้องกับการพัฒนาของ ASD ในผู้ชายที่มีการกลายพันธุ์แบบลบยีนแล้ว ยังพบการถ่ายทอดยีนจากโครโมโซมของบุคคลที่ศึกษาซึ่งมาจากมารดาด้วย ปรากฏว่ามารดาในกรณีเหล่านี้มียีน SHANK1 สองสำเนา อย่างไรก็ตาม กรณีนี้ไม่เกิดขึ้นในผู้ชายที่มีการกลายพันธุ์ของยีน แต่เกิดขึ้นเฉพาะในผู้ชายที่มีการลบยีนเท่านั้น

นักวิจัยพบว่า ชายที่เป็นโรคออทิสติกสเปกตรัม (ASD) ที่ไม่เกี่ยวข้องกับครอบครัวที่ 1 ซึ่งมีการกลายพันธุ์แบบ de novo deletion ของยีน SHANK1 สนับสนุนการตีความว่า CNV ของยีน SHANK1 ที่ถ่ายทอดในครอบครัวที่ 1 นั้น เป็นสาเหตุหลักที่ทำให้บุคคลนั้นเป็นโรค ASD เพื่อสนับสนุนข้อกล่าวอ้างนี้เพิ่มเติม นักวิจัยยังระบุว่า จำเป็นต้องมีการทดสอบอย่างต่อเนื่องในรายงานกรณีศึกษาของครอบครัวหลายรุ่น หลักฐานสนับสนุนว่า การกลายพันธุ์ การลบ หรือการลบส่วนเล็กๆ ของยีน SHANK1 มีอิทธิพลมากพอๆ กับยีน SHANK2 และ SHANK3 ในการทำให้ผู้ชายเป็นโรค ASD

ความสำคัญของการค้นพบการกลายพันธุ์ของยีนนั้นไม่ได้จำกัดอยู่แค่ด้านการแพทย์เท่านั้น ยังช่วยให้เข้าใจว่าทำไมจึงมีการวินิจฉัยโรคออทิสติกในเพศชายมากกว่าเพศหญิง นอกจากนี้ยังช่วยให้สามารถตีความทางพันธุกรรมเกี่ยวกับความแตกต่างของโรคออทิสติกที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมและการกลายพันธุ์ทางพันธุกรรมที่ไม่เกี่ยวข้อง ซึ่งอาจส่งผลต่อด้านสังคมของผู้ป่วยโรคออทิสติก การมีหลักฐานที่ผ่านการทดสอบและเชื่อถือได้เกี่ยวกับต้นกำเนิดของโรคออทิสติกนั้นมีความสำคัญอย่างยิ่ง เนื่องจากมีผู้ได้รับการวินิจฉัยมากขึ้นเรื่อยๆ และแหล่งข้อมูลสำหรับผู้ป่วยกลุ่มนี้ก็เพิ่มมากขึ้นอย่างต่อเนื่อง