ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 30 มิถุนายน พ.ศ. 2489 ในชื่อ^SV Eisen und Stahl 1946 Linz [ ^{1 ]}ซึ่งเป็นทีมโรงงานของ บริษัทเหล็ก VÖEST ของรัฐ (ปัจจุบันคือVoestalpine ) ในปี พ.ศ. 2492 ทีมนี้ได้รับการเปลี่ยนชื่อเป็นSK VÖEST Linz

ในปี 1969 สก. โวเอสต์ (SK VÖEST)คว้าแชมป์ลีกระดับภูมิภาคกลาง (Regional League Central)และเลื่อนชั้นสู่เนชันแนลลีกา (Nationalliga ) ซึ่งเป็นลีก ก่อนหน้าบุนเดสลีกา (Bundesliga ) ในช่วงฤดูร้อนปี 1972 สีประจำสโมสรเปลี่ยนจากขาวดำเป็นน้ำเงินขาวเพื่อแยกตัวจากคู่แข่งร่วมเมืองอย่างลาสก (LASK ) สโมสรประสบความสำเร็จสูงสุดในฤดูกาล 1973–74 เมื่อพวกเขาคว้าแชมป์ออสเตรียการตกชั้นเริ่มต้นในปี 1988 เมื่อสก. โวเอสต์ (SK VOEST ) (ไม่มีเครื่องหมายอุมเลาต์ตั้งแต่ปี 1978) ตกชั้นสู่ลีกสูงสุด (ดิวิชั่น 2)

แม้ว่าสโมสรจะสามารถกลับเข้าสู่บุนเดสลีกาได้ในปี 1991 แต่บริษัทเหล็กได้ถอนเงินทุนออกไป และทีมก็ถูกเปลี่ยนชื่ออีกครั้งเป็นFC Stahl Linzในปี 1991 และFC Linzในปี 1993 ^{[ 2 ]} ในปี 1997 เนื่องจากปัญหาทางการเงิน สโมสรจึงต้องยุบตัวลงในที่สุด โดยการควบรวมกิจการกับ LASKซึ่งเป็นคู่ปรับมายาวนาน^{[ 3 ]}

ในปีเดียวกันนั้นเองสโมสร FC Blau-Weiß Linzก็ถูกก่อตั้งขึ้นโดยอดีตแฟนบอลของ FC Linz ซึ่งสืบทอดประเพณีของสโมสรที่ยุบไป แต่ไม่ใช่สโมสรที่สืบทอดอย่างเป็นทางการของ FC Linz Blau Weiß Linz ได้เลื่อนชั้นสู่Austrian Bundesligaในปี 2023 หลังจากก่อตั้งมา 26 ปี พวกเขาจะลงเล่นในลีกฟุตบอลสูงสุดของออสเตรียเป็นครั้งแรกในฤดูกาล2023–24

นับตั้งแต่ปี 2013 สโมสรฟุตบอล FC Stahl Linz ได้ก่อตั้งขึ้นใหม่จากส่วนฟุตบอลของบริษัท SK VÖEST สโมสรนี้ได้ลงเล่นในฐานะสโมสรอิสระในลีกสมัครเล่นระดับล่างของอัปเปอร์ออสเตรียตั้งแต่ฤดูกาล 2014–15 และตามที่สมาคมฟุตบอลบุนเดสลีกาของออสเตรียระบุ ไว้ สโมสรนี้เป็นสโมสรที่สืบทอดอย่างเป็นทางการจาก FC Linz ซึ่งถูกยุบไปในปี 1997 ปัจจุบัน (ก่อนฤดูกาล 2023–24) FC Stahl Linz เล่นอยู่ใน 2. Klasse Mitte (ดิวิชั่น 8 ของออสเตรียและดิวิชั่น 5 ของอัปเปอร์ออสเตรีย )