เอสเอ็มจี6
โครงสร้างที่มีอยู่ พีดีบี การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB รายชื่อรหัส PDB 2DOK , 2HWW , 2HWX , 4UM2
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	SMG6 , C17orf31, EST1A, SMG-6, hSMG5/7a, ปัจจัยการสลายตัวของ mRNA ที่เกิดจากรหัสหยุด, ปัจจัยการสลายตัวของ mRNA ที่เกิดจากรหัสหยุด SMG6, hEST1A
รหัสภายนอก	โอมิม : 610963 ; เอ็มจีไอ : 2144117 ; โฮโมโลยีน : 23024 ; GeneCards : SMG6 ; OMA : SMG6 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ ) คริส. โครโมโซม 17 (มนุษย์) [ 1 ] วงดนตรี 17 หน้า 13.3 เริ่ม 2,059,839 bp [ 1 ] จบ 2,303,785 bp [ 1 ]
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ ) คริส. โครโมโซม 11 (เมาส์) [ 2 ] วงดนตรี 11|11 B5 เริ่ม 74,816,649 bp [ 2 ] จบ 75,055,274 bp [ 2 ]
รูปแบบการแสดงออกของ RNA บีจี มนุษย์ เมาส์ (ออร์โธล็อก) สูงสุดที่แสดงใน เซลล์สโตรมัลของเยื่อบุโพรงมดลูก รังไข่ซ้าย อัณฑะข้างขวา รังไข่ข้างขวา อัณฑะซ้าย ตัวมดลูก โซนโพรงสมอง ต่อมใต้สมองส่วนหน้า ส่วนนูนของปมประสาท ซีกขวาของสมองน้อย สูงสุดที่แสดงใน สเปิร์มมาติด หลอดเลือดแดงใหญ่ส่วนขึ้น ลิ้นหัวใจเอออร์ติก เซลล์สเปิร์ม ปุ่มอวัยวะเพศ หางของตัวอ่อน นิวเคลียสซูพราออปติก โอโอไซต์รอง โซนโพรงสมอง กระแสการอพยพของส่วนหน้า ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม ไบโอ GPS ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน หน้าที่ระดับโมเลกุล การจับกับ DNA การจับตัวของดีเอ็นเอเทโลเมียร์ การจับไอออนโลหะ การจับตัวของดีเอ็นเอพอลิเมอเรส การจับโปรตีน กิจกรรมนิวคลีเอส กิจกรรมเอนโดนิวคลีเอส กิจกรรมไฮโดรเลส การจับ RNA ของเทโลเมอเรส กิจกรรมเอนโดไรโบนิวคลีเอส การจับกับ RNA การจับกันของสารเชิงซ้อนไรโบโปรตีน กิจกรรมไรโบเอนไซม์ ส่วนประกอบของเซลล์ ไซโตพลาซึม ไซโตซอล คอมเพล็กซ์จุดเชื่อมต่อเอ็กซอน-เอ็กซอน โครโมโซม เทโลเมียร์ คอมเพล็กซ์แกนกลางเร่งปฏิกิริยาของเทโลเมอเรส นิวคลีโอลัส คอมเพล็กซ์เอนไซม์เทโลเมอเรสโฮโลเอนไซม์ นิวเคลียส กระบวนการทางชีวภาพ การไฮโดรไลซิสพันธะฟอสโฟไดเอสเทอร์ของกรดนิวคลีอิก การส่งออก mRNA จากนิวเคลียส การควบคุมเชิงลบของการปิดปลายเทโลเมียร์ การควบคุมการกำจัดฟอสเฟต กระบวนการสลายตัวของ mRNA ที่ถอดรหัสจากนิวเคลียส การสลายตัวที่เกิดจากรหัสไร้ความหมาย การไฮโดรไลซิสพันธะฟอสโฟไดเอสเทอร์ของอาร์เอ็นเอ, เอนโดนิวคลีโอไลติก การควบคุมความเสถียรของ RNA การควบคุมการบำรุงรักษาเทโลเมียร์ การควบคุมการบำรุงรักษาเทโลเมียร์ผ่านทางเทโลเมอเรส การควบคุมกิจกรรมของเทโลเมอเรส การบำรุงรักษาเทโลเมียร์โดยเทโลเมอเรส การไฮโดรไลซิสพันธะฟอสโฟไดเอสเทอร์ของอาร์เอ็นเอ แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก สายพันธุ์ มนุษย์ หนู เอนเทรซ 23293 103677 วงดนตรี ENSG00000070366 ENSMUSG00000038290 ยูนิโปรท Q86US8 พี61406 RefSeq (mRNA) NM_001170957 NM_001256827 NM_001256828 NM_001282326 NM_017575 NM_001002764 RefSeq (โปรตีน) NP_001243756 NP_001243757 NP_001269255 NP_060045 NP_001002764 สถานที่ตั้ง (UCSC) Chr 17: 2.06 – 2.3 Mb Chr 11: 74.82 – 75.06 Mb การค้นหาใน PubMed [ 3 ] [ 4 ]
วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์ ดู/แก้ไขเมาส์

โปรตีนที่จับกับเทโลเมอเรส EST1Aเป็นเอนไซม์ที่ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSMG6 บนโครโมโซม 17 [ ^{5 ] [ 6 ] [ 7 ] มัน}ถูกแสดงออกอย่างแพร่หลายในเนื้อเยื่อและเซลล์หลายชนิด^{[ 8 ]}ปลาย C ของโปรตีน EST1A มีโดเมน PilT N-terminus (PIN)โครงสร้างของโดเมนนี้ได้รับการกำหนดโดยการวิเคราะห์ผลึกด้วยรังสีเอกซ์ [ ^{9 ] SMG6}ทำหน้าที่จับกับDNA สายเดี่ยวใน การบำรุงรักษา เทโลเมียร์และRNA สายเดี่ยวในการสลายตัวของ mRNA ที่เกิดจากรหัสหยุด (NMD) ^{[ 10 ] [ 11 ]}ยีนSMG6 ยังมี SNPหนึ่งใน 27 ตัว ที่เกี่ยวข้องกับความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของโรคหลอดเลือดหัวใจ^{[ 12 ]}

ยีนSMG6อยู่บนโครโมโซม 17 ที่แถบ 17p13.3 และประกอบด้วยเอ็กซอน 30 เอ็กซอน [ ^{13 ] ยีน}นี้สร้างไอโซฟอร์ม ได้ 3 แบบ ผ่าน การสไปลซิ งแบบทางเลือก^{[ 14 ]}

SMG6 เป็นหนึ่งในสามโฮโมล็อก ของมนุษย์ สำหรับ Est1p ที่พบในSaccharomyces cerevisiaeประกอบด้วยโดเมน PIN ซึ่งเป็นลักษณะเฉพาะของโปรตีนที่มีกิจกรรมไรโบเอนไซม์^{[ 15 ]}โดเมน PIN สร้างโครงสร้างอัลฟา/เบตาพับที่คล้ายกับที่พบในนิวคลีเอส 5' ^{[ 16 ]}ภายในโดเมน PIN มีไตรแอดมาตรฐานของสารตกค้างที่เป็นกรดซึ่งทำหน้าที่ในการตัด RNA สายเดี่ยว^{[ 17 ]} SMG6 ยังมี โดเมนจับ ฟอสโฟเซอรีนที่คล้ายกับในโปรตีน 14–3–3 ร่วม กับโฮโมล็อกอีกสองตัวคือSMG5และSMG7โดเมนที่คล้ายกับ 14–3–3 นี้และโดเมนแฮร์พินเกลียวปลาย C ที่มีเกลียวอัลฟาเจ็ดเกลียวเรียงซ้อนกันตั้งฉากกับโดเมนที่คล้ายกับ 14–3–3 รวมกันเป็นบริเวณเตตระไตรโคเปปไทด์แบบโมโนเมอร์ (TPR) ความแตกต่างในทิศทางและสารตกค้างเฉพาะใน TPR ระหว่าง SMG6 และโฮ ^โมล็อกของมัน อาจเป็นสาเหตุที่ทำให้ SMG6 ไม่สร้างคอมเพล็กซ์กับ SMG5 และ SMG7 เมื่อถูกดึงดูดโดยUPF1 ^[ 18 ^]

SMG6 มีการแสดงออกอย่างกว้างขวางในเนื้อเยื่อของมนุษย์ทั้งหมด มีหน้าที่สองอย่างใน การบำรุงรักษา เทโลเมียร์และ เส้นทางการเฝ้าระวัง RNA SMG6 จับกับ DNA เทโลเมียร์แบบสายเดี่ยวและทำงานร่วมกับเทโลเมอเรสรีเวิร์สทรานสคริปเทสเพื่อยืดเทโลเมียร์^{[ 6 ]}การแสดงออกมากเกินไปของ SMG6 ทำให้เกิดสะพานแอนาเฟสเนื่องจากการหลอมรวมปลายโครโมโซม และส่งผลต่อการปิดปลายเทโลเมียร์ ซึ่งอาจกระตุ้นให้เกิดการตอบสนองแบบอะพอพโทซิสโดยตรง^{[ 19 ] [ 5 ]} SMG6 ยังทำหน้าที่เป็นเอนโดนิวคลีเอสใน เส้นทาง NMDกิจกรรมเร่งปฏิกิริยาของ SMG6 อยู่ในโดเมน PINซึ่งจำเป็นสำหรับการย่อยสลาย mRNA ที่มี รหัสหยุดการแปลก่อนกำหนด (PTC) ในเซลล์มนุษย์^{[ 20 ]} SMG6 ตัด mRNA ใกล้กับรหัสหยุดการย้ายตำแหน่งก่อนกำหนดและต้องการUPF1และSMG1เพื่อลดระดับ mRNA ของรีพอร์เตอร์^{[ 21 ]}

ในมนุษย์ มีการระบุบริเวณจีโนมที่เลือกโดยอิงจาก SNP จำนวน 150 ตัวในการศึกษาการเชื่อมโยงทั่วทั้งจีโนม (GWAS) เกี่ยวกับโรคหลอดเลือดหัวใจ ดังนั้น การเชื่อมโยงระหว่างการสูบบุหรี่เมื่อเร็วๆ นี้กับตำแหน่ง CpG ภายในและใกล้กับยีนที่เกี่ยวข้องกับโรคหลอดเลือดหัวใจเหล่านี้จึงได้รับการตรวจสอบใน กลุ่มตัวอย่าง ชาวคอเคเชียน 724 คน จากการศึกษา Rotterdam พบตำแหน่ง เมทิลเลชั่น ที่ระบุได้ ใน SMG6 ร่วมกับยีนอื่นๆ และหลายตำแหน่งเหล่านี้แสดงเมทิลเลชั่นที่ต่ำกว่าในผู้ที่สูบบุหรี่ในปัจจุบันเมื่อเทียบกับผู้ที่ไม่เคยสูบบุหรี่^{[ 22 ]}

การศึกษาคะแนนความเสี่ยงทางพันธุกรรมแบบหลายตำแหน่งโดยอิงจากการรวมกันของ 27 ตำแหน่ง รวมถึงยีน SMG6 ระบุบุคคลที่มีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นสำหรับทั้งการเกิดและการเกิดซ้ำของโรคหลอดเลือดหัวใจ ตลอดจนผลประโยชน์ทางคลินิกที่เพิ่มขึ้นจากการบำบัดด้วยสแตติน การศึกษานี้อิงจากการศึกษากลุ่มประชากรในชุมชน (การศึกษา Malmo Diet and Cancer) และการทดลองแบบสุ่มควบคุมเพิ่มเติมอีกสี่ครั้งของกลุ่มประชากรป้องกันขั้นต้น (JUPITER และ ASCOT) และกลุ่มประชากรป้องกันขั้นทุติยภูมิ (CARE และ PROVE IT-TIMI 22) ^{[ 12 ]}