สพีไอ1

Q: ปฏิสัมพันธ์

จากการศึกษาพบว่า SPI1 มี ปฏิกิริยา กับสารต่างๆ ดังนี้:

สพีไอ1
โครงสร้างที่มีอยู่
พีดีบี	การค้นหาออร์โธล็อก: PDBe RCSB
รายชื่อรหัส PDB
	1PUE
ตัวระบุ
ชื่อเรียกอื่น	SPI1 , OF, PU.1, SFPI1, SPI-1, SPI-A, โปรโตออนโคยีน Spi-1, AGM10
รหัสภายนอก	โอมิม : 165170 ; เอ็มจีไอ : 98282 ; โฮโมโลยีน : 2346 ; การ์ดยีน : SPI1 ; OMA : SPI1 - ออโธโลจี
ตำแหน่งของยีน ( มนุษย์ )
คริส.	โครโมโซม 11 (มนุษย์)
จบ	47,378,547 bp
ตำแหน่งของยีน ( เมาส์ )
คริส.	โครโมโซม 2 (เมาส์)
จบ	90,946,101 bp
รูปแบบการแสดงออกของ RNA
	สูงสุดที่แสดงใน
	เม็ดเลือดขาวชนิดแกรนูโลไซต์; โมโนไซต์; ปอดข้างขวา; กลีบปอดบนด้านซ้าย; ม้าม; เลือด; เซลล์ไขกระดูก; ภาคผนวก; หลอดเลือดแดงโคโรนารีด้านขวา; ต่อมน้ำเหลือง;
	สูงสุดที่แสดงใน
	เม็ดเลือดขาวชนิดแกรนูโลไซต์; ข้อต่อกระดูกหน้าแข้งและกระดูกต้นขา; ต่อมน้ำเหลืองในช่องท้อง; สโตรมาของไขกระดูก; ม้าม; เลือด; ไขกระดูกของต่อมไทมัส; ตัวอ่อน; ริมฝีปาก; ข้อเท้า;
	ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
	ข้อมูลอ้างอิงเพิ่มเติม
ออนโทโลยีของยีน
หน้าที่ระดับโมเลกุล	การจับกับ DNA; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับ; กิจกรรมกระตุ้นการถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II; การจับกับ DNA แบบจำเพาะลำดับของบริเวณควบคุมซิสของ RNA polymerase II; กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัส, การจับจำเพาะของลำดับบริเวณใกล้เคียงโปรโมเตอร์หลักของ RNA polymerase II; กิจกรรมยับยั้งการถอดรหัสโดยการจับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II; การจับโปรตีน; การจับกับ RNA; กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัส, การจับจำเพาะของลำดับตัวเร่งปฏิกิริยาระยะไกลของ RNA polymerase II; กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA; การจับโปรตีน NFAT; กิจกรรมของปัจจัยถอดรหัสที่จับกับ DNA จำเพาะต่อ RNA polymerase II; การจับตัวของปัจจัยถอดรหัส;
ส่วนประกอบของเซลล์	นิวเคลียส; นิวคลีโอพลาสม์; คอมเพล็กซ์ควบคุมการถอดรหัส;
กระบวนการทางชีวภาพ	การแยกแยะเม็ดเลือดขาวชนิดไมอีลอยด์; การควบคุมการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การตอบสนองของเซลล์ต่อเอทานอล; การบำรุงรักษาประชากรเซลล์ต้นกำเนิดร่างกาย; การแยกแยะลิมโฟไซต์; การควบคุมการแบ่งเซลล์เม็ดเลือดแดง; การแยกแยะเซลล์เดนดริติกไมอีลอยด์; การควบคุมเชิงลบของการถอดรหัสโดย RNA polymerase II; การควบคุมเชิงลบของกระบวนการสังเคราะห์ MHC คลาส II; การแยกแยะเซลล์ต้นกำเนิดลิมโฟไซต์; การถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การแยกตัวของแมโครฟาจ; การถดถอยของโครงสร้างทางกายวิภาค; การควบคุมเชิงลบของการอะเซทิเลชันของฮิสโตน H4; การควบคุมการแสดงออกของยีนในเชิงลบ (เอพิเจเนติกส์); การพัฒนาหลอดเลือด; การแยกแยะเซลล์เม็ดเลือดขาวชนิดแกรนูโลไซต์; กระบวนการอะพอพโทซิสที่เกี่ยวข้องกับการสร้างรูปร่างของหลอดเลือด; การอะเซทิเลชันของฮิสโตน H3; การจำแนกเซลล์เม็ดเลือดแดง; การเกิดเมทิลเลชั่นมากเกินไปของ CpG island; การควบคุมเชิงบวกของการถอดรหัส pri-miRNA โดย RNA polymerase II; การควบคุมการถอดรหัสในเชิงบวกโดย RNA polymerase II; การควบคุมเชิงลบของการถอดรหัสโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การควบคุมการถอดรหัสเชิงบวกโดยใช้ดีเอ็นเอเป็นแม่แบบ; การควบคุมการถอดรหัสโดย RNA polymerase II; การถอดรหัส pri-miRNA โดย RNA polymerase II; การแยกเซลล์; เส้นทางการส่งสัญญาณที่ควบคุมโดยอินเตอร์ลิวคิน-6;
	แหล่งที่มา: Amigo / QuickGO
ออร์โธล็อก
	6688
	20375
	ENSG00000066336
	ENSMUSG00000002111
	พี17947
	พี17433
	NM_001080547 NM_003120
	NM_011355 NM_001378898 NM_001378899
	NP_001074016 NP_003111
	NP_035485 NP_001365827 NP_001365828
	วิกิดาต้า
ดู/แก้ไขข้อมูลมนุษย์	ดู/แก้ไขเมาส์

ปัจจัยการถอดรหัส PU.1เป็นโปรตีน ที่ ^ในมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดยยีนSPI1 [ ⁵^]

การทำงาน

ยีนนี้เข้ารหัสปัจจัยการถอดรหัสโดเมน ETS ที่กระตุ้นการแสดงออกของยีนในระหว่างการพัฒนาเซลล์ไมอีลอยด์และบีลิมโฟอยด์^{[ 6 ]}โปรตีนนิวเคลียร์จะจับกับลำดับที่มีพิวรีนสูงที่เรียกว่า PU-box ซึ่งพบในตัวเร่งของยีนเป้าหมาย และควบคุมการแสดงออกของยีนเหล่านั้นโดยประสานงานกับปัจจัยการถอดรหัสและโคแฟคเตอร์อื่นๆ โปรตีนนี้ยังสามารถควบคุมการตัดต่อทางเลือกของยีนเป้าหมายได้อีกด้วย มีการค้นพบตัวแปรการถอดรหัสหลายตัวที่เข้ารหัสไอโซฟอร์มที่แตกต่างกันสำหรับยีนนี้^{[ 7 ]}

ปัจจัยการถอดรหัส PU.1 มีความสำคัญต่อการสร้างเม็ดเลือดและ การตัดสินใจชะตา ^กรรมของเซลล์ PU.1 สามารถโต้ตอบทางกายภาพกับปัจจัยควบคุมต่างๆ เช่นSWI/SNF [ ⁸^] TFIID , GATA-2 , GATA-1และc-Junปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีนของปัจจัยเหล่านี้สามารถควบคุมการตัดสินใจชะตากรรมของเซลล์ที่ขึ้นอยู่กับ PU.1 ได้ PU.1 สามารถปรับเปลี่ยนการแสดงออกของยีน 3000 ยีนในเซลล์เม็ดเลือด รวมถึงไซโตไคน์มันถูกแสดงออกในโมโนไซต์แกรนูโลไซต์ เซลล์ B และเซลล์ NK แต่ไม่มีอยู่ในเซลล์ Tเรติคิวโลไซต์และเมกะคาริโอไซต์การถอดรหัสของมันถูกควบคุมโดยกลไกต่างๆ^[⁹^]

PU.1 เป็นตัวควบคุมที่สำคัญของระบบโปรไฟโบรซิส ในสภาวะไฟโบรซิสการแสดงออกของ PU.1 จะถูกรบกวน ส่งผลให้มีการเพิ่มการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับไฟโบรซิสใน ไฟ โบรบลา สต์ การหยุดชะงักของ PU.1 ในไฟโบรบลาสต์โปรไฟโบรซิสทำให้พวกมันกลับคืนสู่สภาวะพักตัว พบว่า PU.1 มีการแสดงออกสูงในไฟโบรบลาสต์โปรไฟโบรซิสที่สร้างเมทริกซ์นอกเซลล์ในขณะที่มีการแสดงออกลดลงในไฟโบรบลาสต์ที่อักเสบ /ย่อยสลาย ECM และไฟโบรบลาสต์ที่พักตัว เซลล์ส่วนใหญ่ที่แสดงออก PU.1 ในสภาวะไฟโบรซิสคือไฟโบรบลาสต์ที่มี ลิมโฟไซต์แทรกซึมอยู่เล็กน้อยPU.1 กระตุ้นการแบ่งขั้วของไฟโบรบลาสต์ที่พักตัวและอักเสบให้กลายเป็นไฟโบรบลาสต์โปรไฟโบรซิส^{[ 10 ]}

โครงสร้าง

โดเมน ETS คือโมดูลจับกับ DNA ของ PU.1 และปัจจัยถอดรหัสในกลุ่ม ETS อื่นๆ

ปฏิสัมพันธ์

จากการศึกษาพบว่า SPI1 มีปฏิกิริยากับสารต่างๆ ดังนี้:

FUS , ^{[ 11 ]}
GATA2 , ^{[ 12 ]}
IRF4 , ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}และ
โนโน . ^{[ 15 ]}

อ่านเพิ่มเติม

Klemsz MJ, McKercher SR, Celada A, Van Beveren C, Maki RA (เมษายน 1990). "ปัจจัยการถอดรหัสเฉพาะของแมคโครฟาจและเซลล์บี PU.1 เกี่ยวข้องกับออนโคยีน ets" Cell . 61 (1): 113– 124. doi : 10.1016/0092-8674(90)90219-5 . PMID 2180582 . S2CID 27819155 .
Nguyen VC, Ray D, Gross MS, de Tand MF, Frézal J, Moreau-Gachelin F (พฤษภาคม 1990). "การระบุตำแหน่งของยีนก่อมะเร็ง SPI1 ของมนุษย์บนโครโมโซม 11 บริเวณ p11.22" Human Genetics . 84 (6): 542– 546. doi : 10.1007/bf00210807 . PMID 2338340 . S2CID 22337200 .
Chen H, Ray-Gallet D, Zhang P, Hetherington CJ, Gonzalez DA, Zhang DE และ คณะ (ตุลาคม 2538). "PU.1 (Spi-1) ควบคุมการแสดงออกในเซลล์ไมอีลอยด์โดยอัตโนมัติ" อองโคยีน . 11 (8): 1549– 1560. PMID 7478579 .
Nagulapalli S, Pongubala JM, Atchison ML (พฤศจิกายน 1995). "โปรตีนหลายชนิดมีปฏิสัมพันธ์ทางกายภาพกับ PU.1 การทำงานร่วมกันของการถอดรหัสกับ NF-IL6 เบต้า (C/EBP เดลต้า, CRP3)"วารสารภูมิคุ้มกันวิทยา 155 ( 9): 4330– 4338. doi : 10.4049/jimmunol.155.9.4330 . PMID 7594592 .
Pongubala JM, Atchison ML (เมษายน 1995). "ปัจจัยการถอดรหัสที่กระตุ้น 1 และตัวปรับองค์ประกอบการตอบสนองของ cyclic AMP สามารถปรับเปลี่ยนกิจกรรมของตัวเร่งปฏิกิริยาอิมมูโนโกลบูลินแคปปา 3' ได้"วารสารเคมีชีวภาพ 270 ( 17): 10304– 10313. doi : 10.1074/jbc.270.17.10304 . PMID 7730336 .
Hromas R, Orazi A, Neiman RS, Maki R, Van Beveran C, Moore J และ คณะ (พฤศจิกายน 1993). "การแสดงออกของสมาชิกในกลุ่มยีนมะเร็ง ETS PU.1 ที่จำกัดเฉพาะสายเลือดและระยะของเซลล์เม็ดเลือด" . Blood . 82 (10): 2998– 3004. doi : 10.1182/blood.V82.10.2998.2998 . PMID 8219191 .
Hagemeier C, Bannister AJ, Cook A, Kouzarides T (กุมภาพันธ์ 1993). "โดเมนการกระตุ้นของปัจจัยการถอดรหัส PU.1 จับกับโปรตีนเรตินอบลาสโตมา (RB) และปัจจัยการถอดรหัส TFIID ในหลอดทดลอง: RB แสดงความคล้ายคลึงกันของลำดับกับ TFIID และ TFIIB" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 90 (4): 1580– 1584. Bibcode : 1993PNAS...90.1580H . doi : 10.1073/pnas.90.4.1580 . PMC 45918 . PMID 8434021 .
Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (พฤษภาคม 1996). "ปัจจัยการถอดรหัส Spi-1/PU.1 จับกับ RNA และรบกวนโปรตีนที่จับกับ RNA p54nrb"วารสารเคมีชีวภาพ 271 ( 19): 11177– 11181. doi : 10.1074/jbc.271.19.11177 . PMID 8626664 .
Bassuk AG, Anandappa RT, Leiden JM (พฤษภาคม 1997). "ปฏิสัมพันธ์ทางกายภาพระหว่าง Ets และโปรตีน NF-kappaB/NFAT มีบทบาทสำคัญในการกระตุ้นการทำงานร่วมกันของตัวเร่งปฏิกิริยาภูมิคุ้มกันบกพร่องของมนุษย์ในเซลล์ T"วารสารไวรัสวิทยา 71 ( 5): 3563– 3573. doi : 10.1128/JVI.71.5.3563-3573.1997 . PMC 191503 . PMID 9094628 .
Li SL, Valente AJ, Zhao SJ, Clark RA (กรกฎาคม 1997). "PU.1 เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับกิจกรรมโปรโมเตอร์ p47(phox) ในเซลล์เม็ดเลือดขาว"วารสารชีวเคมี 272 ( 28): 17802– 17809. doi : 10.1074/jbc.272.28.17802 . PMID 9211934 .
Tsukada J, Misago M, Serino Y, Ogawa R, Murakami S, Nakanishi M และ คณะ (ตุลาคม 1997). "ไวรัสลูคีเมียเซลล์ T ของมนุษย์ชนิดที่ 1 Tax กระตุ้นการทำงานของโปรโมเตอร์ของยีน prointerleukin-1beta ของมนุษย์โดยเชื่อมโยงกับปัจจัยการถอดรหัสสองตัว ได้แก่ nuclear factor-interleukin-6 และ Spi-1" . Blood . 90 (8): 3142– 3153. doi : 10.1182/blood.V90.8.3142 . PMID 9376596 .
Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (กุมภาพันธ์ 1998). "ปัจจัยการถอดรหัส Spi-1/PU.1 มีปฏิสัมพันธ์กับปัจจัยการตัดต่อ TLS ที่มีศักยภาพ"วารสารเคมีชีวภาพ 273 ( 9): 4838– 4842. doi : 10.1074/jbc.273.9.4838 . PMID 9478924 .
Suzuki S, Kumatori A, Haagen IA, Fujii Y, Sadat MA, Jun HL และคณะ (พฤษภาคม 1998). "PU.1 เป็นตัวกระตุ้นที่จำเป็นสำหรับการแสดงออกของยีน gp91(phox) ในนิวโทรฟิล โมโนไซต์ และลิมโฟไซต์บีในเลือดของมนุษย์" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (11): 6085– 6090. Bibcode : 1998PNAS ... 95.6085S . doi : 10.1073/pnas.95.11.6085 . PMC 27589. PMID 9600921 .
Carrère S, Verger A, Flourens A, Stehelin D, Duterque-Coquillaud M (มิถุนายน 1998). "โปรตีน Erg ซึ่งเป็นปัจจัยการถอดรหัสของตระกูล Ets สร้างโฮโมไดเมอร์ เฮเทอโรไดเมอร์ และคอมเพล็กซ์สามองค์ประกอบผ่านโดเมนที่แตกต่างกันสองโดเมน" Oncogene . 16 (25): 3261– 3268. doi : 10.1038/sj.onc.1201868 . PMID 9681824 . S2CID 26807714 .
Sato M, Morii E, Takebayashi-Suzuki K, Yasui N, Ochi T, Kitamura Y, และ คณะ (มกราคม 2542). "ปัจจัยการถอดรหัสที่เกี่ยวข้องกับ Microphthalmia โต้ตอบกับ PU.1 และ c-Fos: การกำหนดตำแหน่งเซลล์ย่อย" การสื่อสารการวิจัยทางชีวเคมีและชีวฟิสิกส์254 (2): 384– 387. ดอย : 10.1006/bbrc.1998.9918 . PMID9918847 .
Brass AL, Zhu AQ, Singh H (กุมภาพันธ์ 1999). "ข้อกำหนดในการประกอบของคอมเพล็กซ์ตัวกระตุ้น PU.1-Pip (IRF-4): การยับยั้งการทำงานในร่างกายโดยใช้ไดเมอร์ที่หลอมรวมกัน"วารสารEMBO . 18 (4): 977– 991. doi : 10.1093/emboj/18.4.977 . PMC 1171190 . PMID 10022840 .
Yamamoto H, Kihara-Negishi F, Yamada T, Hashimoto Y, Oikawa T (กุมภาพันธ์ 1999). "ปฏิสัมพันธ์ทางกายภาพและการทำงานระหว่างปัจจัยการถอดรหัส PU.1 และตัวกระตุ้นร่วม CBP" . Oncogene . 18 (7): 1495– 1501. doi : 10.1038/sj.onc.1202427 . PMID 10050886 .
Rao S, Matsumura A, Yoon J, Simon MC (เมษายน 1999). " SPI-B กระตุ้นการถอดรหัสผ่านโดเมนโพรลีน เซรีน และทรีโอนีนที่เป็นเอกลักษณ์ และแสดงความแตกต่างของความสัมพันธ์ในการจับกับ DNA จาก PU.1"วารสารเคมีชีวภาพ274 (16): 11115– 11124. doi : 10.1074/jbc.274.16.11115 . PMID 10196196 .
Mao S, Frank RC, Zhang J, Miyazaki Y, Nimer SD (พฤษภาคม 1999). "ปฏิสัมพันธ์เชิงฟังก์ชันและทางกายภาพระหว่างโปรตีน AML1 และโปรตีน ETS, MEF: นัยสำคัญต่อการเกิดโรคของมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิด t(8;21)-positive" . Molecular and Cellular Biology . 19 (5): 3635– 3644. doi : 10.1128/mcb.19.5.3635 . PMC 84165 . PMID 10207087 .

ลิงก์ภายนอก

แฟคเตอร์บุ๊คPU.1

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

ใน

[ 6 ]

[ 7 ]

กรรม

[

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]