เอสเอสบี
โครงสร้างผลึกของ PriB ซึ่งเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการจำลองแบบดีเอ็นเอของพรีโมโซมในแบคทีเรีย Escherichia coli
ตัวระบุ
เครื่องหมาย	เอสเอสบี
พีแฟม	PF00436
ตระกูลพีแฟม	ซีแอล0021
อินเตอร์โปร	IPR000424
โปรไซต์	PDOC00602
สโคป2	1kaw / SCOPe / SUPFAM
ทีซีดีบี	3.A.7
โครงสร้างโปรตีนที่มีอยู่: พีดีบี   IPR000424 PF00436 ( ECOD ; PDBsum )   อัลฟาโฟลด์ IPR000424 PF00436

โปรตีนที่จับกับสายเดี่ยว ( SSBs ) เป็นกลุ่มโปรตีนที่พบได้ทั้งในไวรัสและสิ่งมีชีวิตต่างๆ ตั้งแต่แบคทีเรียไปจนถึงมนุษย์

ดีเอ็นเอไวรัส_bp
โปรตีนจับกับดีเอ็นเอสายเดี่ยว (icp8) จาก ไวรัส เริมชนิดที่ 1
ตัวระบุ
เครื่องหมาย	ดีเอ็นเอไวรัส_bp
พีแฟม	PF00747
อินเตอร์โปร	IPR000635
โครงสร้างโปรตีนที่มีอยู่: พีดีบี   IPR000635 PF00747 ( ECOD ; PDBsum )   อัลฟาโฟลด์ IPR000635 PF00747

แม้ว่าภาพรวมของ การสังเคราะห์ DNA ของ ไวรัสไซโตเมกาโลของมนุษย์ (HHV-5) จะดูเป็นแบบฉบับของไวรัสกลุ่มเฮอร์พีส์ไวรัส แต่ก็มีลักษณะใหม่บางอย่างที่กำลังปรากฏขึ้น

ใน ICP8 ซึ่งเป็นโปรตีนจับกับดีเอ็นเอสายเดี่ยว (ssDNA-binding protein (SSB)) ของไวรัสเริมชนิดที่ 1 (HSV-1) ส่วนหัวประกอบด้วย เกลียวอัลฟา แปดเกลียว ด้านหน้าของบริเวณคอประกอบด้วยแผ่นเบต้า ห้าสาย และเกลียวอัลฟาสองเกลียว ในขณะที่ด้านหลังเป็นแผ่นเบต้าสามสาย ส่วนไหล่ของ โดเมน ปลาย Nประกอบด้วยบริเวณเกลียวอัลฟาและแผ่นเบต้า^{[ 1 ]} SSB ของไวรัสเริมชนิดที่ 1 (HSV-1) ICP8 เป็นโปรตีนนิวเคลียร์ซึ่งร่วมกับโปรตีนการจำลองแบบอื่นๆ จำเป็นสำหรับการจำลองดีเอ็นเอของไวรัสในระหว่างการติดเชื้อแบบไลติก^{[ 1 ]}

ยีนทั่วไปของกลุ่มไวรัสเริม 6 ยีน เข้ารหัสโปรตีนที่น่าจะประกอบเป็นกลไกการจำลองแบบของดีเอ็นเอ ซึ่งรวมถึงพอลิเมอเรสดีเอ็นเอแบบสองหน่วยย่อย คอมเพล็กซ์เฮลิเคส-ไพรเมสและโปรตีนที่จับกับดีเอ็นเอสายเดี่ยว^{[ 2 ]}โปรตีนที่จับกับดีเอ็นเอสายเดี่ยว ICP8 ของไวรัสเริมในมนุษย์ 1 (HHV-1) เป็น โปรตีน โลหะ สังกะสี ขนาด 128 kDa การติดฉลากด้วย โฟโตแอฟฟินิตีแสดงให้เห็นว่าบริเวณที่ครอบคลุมกรดอะมิโน 368-902 มีไซต์ที่จับกับดีเอ็นเอสายเดี่ยวของ ICP8 ^{[ 3 ]}ยีน HHHV-1 UL5, UL8 และ UL52 เข้ารหัสเฮลิเคส-ไพรเมส ดีเอ็นเอแบบเฮเทอโรไตร เมอริก ที่จำเป็นซึ่งรับผิดชอบต่อการคลายเกลียวดีเอ็นเอและ การสังเคราะห์ ไพรเมอร์ พร้อมกัน ที่ จุดจำลองแบบดีเอ็นเอ ของไวรัส ICP8 อาจกระตุ้นการคลายเกลียวดีเอ็นเอและช่วยให้สามารถข้ามผ่านดีเอ็นเอที่เสียหายจากซิสพลาตินได้โดยการดึงดูดเฮลิเคส-ไพรเมสไปยังดีเอ็นเอ^{[ 4 ]}

โดเมนโปรตีน SSBในแบคทีเรียมีความสำคัญในการรักษากระบวนการเผาผลาญ DNAโดยเฉพาะอย่างยิ่งการจำลองแบบ DNAการซ่อมแซม และการรวมตัวใหม่^{[ 5 ]}มีโครงสร้างเป็นเบต้าสแตรนด์ 3 เส้นต่อเบต้าชีท 6 เส้นเดียว เพื่อสร้างไดเมอร์^{[ 6 ]}

โปรตีนการจำลองแบบ A
(เฮเทอโรไตรเมอร์)
นี่คือภาพของโปรตีน A ที่เกี่ยวข้องกับการจำลองแบบ (Replication protein A) ของมนุษย์ จากPDB: 1L1OProteopedia protein A Replication protein A
การทำงาน	การจับกับ DNA ที่เสียหาย การจับกับ DNA สายเดี่ยว
ชื่อหน่วยย่อย ยีน ตำแหน่งโครโมโซม โปรตีนการจำลองแบบ A1 อาร์พีเอ1 บทที่ 17 หน้า 13.3 โปรตีนการจำลองแบบ A2 อาร์พีเอ2 บทที่ 1 หน้า35.3 โปรตีนการจำลองแบบ A3 อาร์พีเอ3 บทที่ 7 หน้า 21.3

โปรตีนการจำลองแบบ Aมีหน้าที่เทียบเท่ากับ SSB ในนิวเคลียสของเซลล์ยูคาริโอติก แม้ว่าจะไม่มีความคล้ายคลึงกันในลำดับกรดอะมิโนก็ตาม

ไมโตคอนเดรียของเซลล์ยูคาริโอตมีโปรตีนจับกับดีเอ็นเอสายเดี่ยวของตัวเอง ไมโตคอนเดรีย SSB ของมนุษย์ (mtSSB) จับกับดีเอ็นเอไมโตคอนเดรียสายเดี่ยวในรูปของเทตราเมอร์และมีลำดับคล้ายคลึงกับ SSB ของแบคทีเรีย^{[ 7 ]} mtSSB ของมนุษย์ถูกเข้ารหัสโดย ยีน SSBP1ในยีสต์ มันถูกเข้ารหัสโดยยีน RIM1 ^{[ 8 ]}

เมื่อไม่นานมานี้ พบว่า 1. ช่วยปกป้องจีโนม 2. มีความสำคัญต่อเซลล์ต้นกำเนิด และ 3. มีส่วนเกี่ยวข้องกับการรักษาระดับความยาวของเทโลเมียร์^{[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]}

• โปรตีนที่จับกับดีเอ็นเอ
• โปรตีนการจำลองแบบ A
• การเปรียบเทียบซอฟต์แวร์จำลองกรดนิวคลีอิก

• โปรตีนที่จับกับดีเอ็นเอสายเดี่ยว (Single-Stranded+DNA+Binding+Proteins ) ในฐานข้อมูล Medical Subject Headings (MeSH) ของหอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกา
• SSB ใน PFAM เก็บถาวรเมื่อ 10 กรกฎาคม 2012 ที่Wayback Machine