ไวรัสเซโควิริเด
| ไวรัสเซโควิริเด | |
|---|---|
| โครงสร้างของไวรัส Cowpea mosaic virus อ้างอิงจาก PDB 2BFU | |
| การจำแนกประเภทไวรัส | |
| (ไม่จัดอันดับ): | ไวรัส |
| อาณาจักร: | ไรโบวิเรีย |
| อาณาจักร: | ออร์ธอร์นาไวเร |
| ไฟลัม: | พิสุวิริโคตา |
| ระดับ: | พิโซนิวิริเซเตส |
| คำสั่ง: | พิคอร์นาไวรัลส์ |
| ตระกูล: | ไวรัสเซโควิริเด |
| ยีน | |
ดูข้อความ | |
Secoviridaeเป็นวงศ์ของไวรัสในอันดับ Picornaviralesพืชเป็นโฮสต์ตามธรรมชาติ มี 10 สกุลในวงศ์นี้ โดย 4 สกุลถูกจัดอยู่ในวงศ์ย่อย [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]วงศ์นี้ถูกสร้างขึ้นในปี 2009 โดยการรวมกลุ่มของวงศ์ Sequiviridaeซึ่งปัจจุบันถูกยุบไปแล้ว และ วงศ์ Comoviridaeซึ่งปัจจุบันอยู่ในวงศ์ย่อย Comovirinaeพร้อมกับสกุล Cheravirus , Sadwavirusและ Torradovirusที่ ยังไม่ได้จัดกลุ่มในขณะนั้น [ 4 ]
อนุกรมวิธาน
ครอบครัวนี้ประกอบด้วยสกุลต่อไปนี้ (- virinaeหมายถึงวงศ์ย่อย และ - virusหมายถึงสกุล): [ 4 ]
โครงสร้าง
ไวรัสในวงศ์ Secoviridaeไม่มีเปลือกหุ้ม มีรูปทรงเรขาคณิตแบบไอโคซาเฮดรอล และมีสมมาตร T=pseudo3 เส้นผ่านศูนย์กลางประมาณ 25-30 นาโนเมตร จีโนมเป็นแบบเส้นตรงและแบ่งเป็นส่วนๆ มีสองส่วน มีความยาวประมาณ 24-7 กิโลเบส[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
| ประเภท | โครงสร้าง | สมมาตร | แคปซิด | การจัดเรียงจีโนม | การแบ่งส่วนจีโนม |
|---|---|---|---|---|---|
| เซควิไวรัส | ทรงยี่สิบหน้า | เทียม T=3 | ไม่มีซอง | เชิงเส้น | โมโนพาร์ไทต์ |
| ไวรัสซาดวา | ทรงยี่สิบหน้า | เทียม T=3 | ไม่มีซอง | เชิงเส้น | แบ่งส่วน |
| เนโปไวรัส | ทรงยี่สิบหน้า | เทียม T=3 | ไม่มีซอง | เชิงเส้น | แบ่งส่วน |
| ไวรัสฟาบา | ทรงยี่สิบหน้า | เทียม T=3 | ไม่มีซอง | เชิงเส้น | แบ่งส่วน |
| โคโมไวรัส | ทรงยี่สิบหน้า | เทียม T=3 | ไม่มีซอง | เชิงเส้น | แบ่งส่วน |
| เชอราไวรัส | ทรงยี่สิบหน้า | เทียม T=3 | ไม่มีซอง | เชิงเส้น | แบ่งส่วน |
| ทอร์ราโดไวรัส | ทรงยี่สิบหน้า | เทียม T=3 | ไม่มีซอง | เชิงเส้น | แบ่งส่วน |
| ไวรัสไวกา | ทรงยี่สิบหน้า | เทียม T=3 | ไม่มีซอง | เชิงเส้น | โมโนพาร์ไทต์ |
วงจรชีวิต
การจำลองแบบของไวรัสเกิดขึ้นในไซโตพลาสซึม การเข้าสู่เซลล์เจ้าบ้านเกิดขึ้นโดยการเจาะเข้าไปในเซลล์เจ้าบ้าน การจำลองแบบเป็นไปตามแบบจำลองการจำลองแบบของไวรัส RNA สายบวก การถอดรหัสของไวรัส RNA สายบวกเป็นวิธีการถอดรหัส ไวรัสออกจากเซลล์เจ้าบ้านโดยการเคลื่อนที่ของไวรัสที่นำทางด้วยท่อ พืชทำหน้าที่เป็นเจ้าบ้านตามธรรมชาติ เส้นทางการแพร่กระจายเป็นแบบกลไก[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
| ประเภท | รายละเอียดโฮสต์ | การมุ่งเป้าไปยังเนื้อเยื่อ | รายละเอียดการลงทะเบียน | รายละเอียดการเผยแพร่ | ไซต์จำลอง | สถานที่ประกอบการ | การแพร่เชื้อ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| เซควิไวรัส | พืช | ไม่มี | การเคลื่อนที่ของไวรัส; การฉีดวัคซีนทางกล | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | ไซโตพลาสซึม | ไซโตพลาสซึม | การปลูกเชื้อด้วยวิธีทางกล: เพลี้ยอ่อน; การปลูกเชื้อด้วยวิธีทางกล: Cavariella aegopodii; การปลูกเชื้อด้วยวิธีทางกล: Cavariella pastinacae |
| ไวรัสซาดวา | พืช | ไม่มี | การเคลื่อนที่ของไวรัส; การฉีดวัคซีนทางกล | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | ไซโตพลาสซึม | ไซโตพลาสซึม | ไส้เดือนฝอย; ไร; เพลี้ยไฟ |
| เนโปไวรัส | พืช | ไม่มี | การเคลื่อนที่ของไวรัส; การฉีดวัคซีนทางกล | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | ไซโตพลาสซึม | ไซโตพลาสซึม | ไส้เดือนฝอย; ไร; เพลี้ยไฟ |
| ไวรัสฟาบา | พืช | ไม่มี | การเคลื่อนที่ของไวรัส; การฉีดวัคซีนทางกล | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | ไซโตพลาสซึม | ไซโตพลาสซึม | การฉีดวัคซีนทางกล: เพลี้ยอ่อน |
| โคโมไวรัส | พืช | ไม่มี | การเคลื่อนที่ของไวรัส; การฉีดวัคซีนทางกล | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | ไซโตพลาสซึม | ไซโตพลาสซึม | การฉีดวัคซีนทางกล: ด้วง |
| เชอราไวรัส | พืช | ไม่มี | การเคลื่อนที่ของไวรัส; การฉีดวัคซีนทางกล | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | ไซโตพลาสซึม | ไซโตพลาสซึม | ไส้เดือนฝอย; ไร; เพลี้ยไฟ |
| ทอร์ราโดไวรัส | พืช | ไม่มี | การเคลื่อนที่ของไวรัส; การฉีดวัคซีนทางกล | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | ไซโตพลาสซึม | ไซโตพลาสซึม | ไม่ทราบ |
| ไวรัสไวกา | วงศ์หญ้า (Gramineae) | โฟลเอ็ม; พาเรนไคมาของโฟลเอ็ม; ปลอกมัดท่อลำเลียง | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | การเคลื่อนไหวแบบไวรัล | ไซโตพลาสซึม | ไซโตพลาสซึม | การปลูกเชื้อด้วยวิธีทางกล: เพลี้ยอ่อน; การปลูกเชื้อด้วยวิธีทางกล: เพลี้ยจักจั่น |
วิวัฒนาการ
วงศ์ย่อยComovirinaeวิวัฒนาการเมื่อประมาณ 1,000 ปีที่แล้ว โดยสายพันธุ์ที่มีอยู่ในปัจจุบันมีการแตกแขนงออกไปเมื่อประมาณ 50 ถึง 250 ปีที่แล้ว ช่วงเวลานี้ตรงกับการเพิ่มความเข้มข้นของการทำการเกษตรในสังคมอุตสาหกรรม[ 5 ]
อัตราการกลายพันธุ์ได้รับการประมาณไว้ที่ 9.29×10 −3ถึง 2.74×10 −3ซับไซต์/ปี[ 5 ]
ลิงก์ภายนอก
- ไวรัลโซน: เซโคไวริเด
- ระบบจำแนกประเภท UniProt