การขุดค้นที่เซมนาใต้ใน ช่วงปี 1966–1968 พบว่า ป้อมปราการแห่งนี้มีผู้คนอาศัยอยู่ถาวรตั้งแต่รัชสมัยของพระเจ้าเซนูสเรตที่ 1 จนถึงช่วงต้นรัชสมัยของพระเจ้าอเมเนมฮัตที่ 3แห่งราชวงศ์ที่ 12 ซึ่งขัดแย้งกับที่เวอร์คูทเตอร์กล่าวไว้ ^{[ 13 ] [ 14 ]}การขุดค้นโบสถ์ ซึ่งบางครั้งเรียกว่า “สุสานของชีค” เผยให้เห็นว่าโครงสร้างดั้งเดิมยังคงเหลืออยู่เพียงบางส่วนเท่านั้น^{[ 15 ]}ณ ปี 1982 เมื่อซาบการ์และซาบการ์ตีพิมพ์รายงาน พวกเขายังไม่สามารถระบุอายุของโบสถ์ได้เนื่องจากมีเครื่องปั้นดินเผาในโบสถ์หรือบริเวณใกล้เคียงน้อยมาก อย่างไรก็ตาม พวกเขาได้ให้การประมาณการสมมติฐานว่า “โบสถ์ในรูปแบบสุดท้าย คือแบบครึ่งวงกลม จะมีอายุย้อนไปถึงยุคคริสเตียนคลาสสิกในนูเบีย ระหว่างศตวรรษที่ 9 ถึงต้นศตวรรษที่ 11” ^{[ 15 ]}

การสำรวจครั้งนี้ได้ค้นพบกำแพงขนาดใหญ่ที่เชื่อมต่อป้อมปราการที่เซมนาใต้และเซมนาตะวันตก กำแพงนี้สนับสนุนมุมมองที่ว่าป้อมปราการทางทหารในภูมิภาคเซมนาถูกสร้างขึ้นโดยชาวอียิปต์เพื่อตอบสนองต่อ “แรงกดดันอย่างหนักและความพยายามแทรกซึมจากฝ่ายใต้ในช่วงราชวงศ์ที่ 12 ซึ่งมีการอ้างอิงถึงเรื่องนี้ในศิลาจารึกเซมนาและจดหมายเซมนาที่เป็นที่รู้จักกันดี” ^{[ 16 ]} Žabkar และ Žabkar (1982) คาดการณ์ว่าอาจมีป้อมปราการที่ซับซ้อนซึ่งครอบคลุมเซมนาใต้และตะวันตก และอาจมีป้อมปราการอื่นๆ ในภูมิภาคนี้ด้วย แต่ไม่มีหลักฐานที่แน่ชัดสำหรับป้อมปราการที่ซับซ้อนดังกล่าว

พื้นที่ซึ่งตั้งอยู่ทางด้านตะวันตกเฉียงเหนือของป้อม ซึ่งก่อนหน้านี้เรียกว่า 'สุสาน' 'แหล่งที่อยู่อาศัย' หรือ 'ค่ายพักแรม' และปกคลุมไปด้วยเศษเครื่องปั้นดินเผา ก็ได้รับการขุดค้นในช่วงฤดูกาลสำรวจภาคสนามปี 1966–1968 จากการขุดค้น พบว่าเป็นแหล่งทิ้งขยะของราชวงศ์ที่ 12 และเป็น “การค้นพบที่สำคัญที่สุดสำหรับการศึกษาประวัติศาสตร์ของป้อมเซมนาใต้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับการศึกษาการติดต่อสื่อสารกับป้อมอื่นๆ ในภูมิภาคน้ำตกแห่งแรกและแห่งที่สอง” ^{[ 17 ]}แหล่งทิ้งขยะเป็นชุดของหลุม ซึ่งเดิมเป็นเหมืองดินเหนียว และต่อมาถูกใช้เป็นที่ทิ้งขยะสำหรับวัตถุที่ถูกทิ้งจากป้อม หลุมบางหลุมลึกและบางหลุมตื้น หลุมที่ลึกที่สุดสองหลุมคือ K-1 และ K-4 ^{[ 18 ] [ 7 ]}ภายในหลุมเหล่านี้ วัตถุที่ถูกทิ้งและเศษเครื่องปั้นดินเผาผสมปนเปกันเป็นก้อนเศษซากที่หลวมๆ โดยไม่มีชั้นทางธรณีวิทยาที่มองเห็นได้ชัดเจน

สิ่งของที่พบในหลุมเหล่านี้มีความสำคัญอย่างยิ่ง ประการแรกคือขวานสมัยราชวงศ์ที่ 12 ที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้อย่างดี ซึ่งตามที่ Žabkar และ Žabkar (1982) ระบุว่าเป็นของหายากในนูเบียของซูดานและอียิปต์^{[ 19 ]} ประการที่สอง พบเศษเครื่องปั้นดินเผา ประเภท C-Group (ชาวนูเบียพื้นเมืองตั้งแต่ประมาณ 2000 – 1500 ปีก่อนคริสตกาล) ซึ่งบ่งชี้ถึงการอยู่ร่วมกันอย่างสันติระหว่างชาว C-Group กับชาวอียิปต์ ^{[ 18 ] [ 6 ] [ 20 ]}ประการที่สาม และที่สำคัญที่สุด คือ รอยประทับตราบนเครื่องปั้นดินเผาจำนวนมาก ตราประทับที่สำคัญที่สุดคือตราประทับที่มีชื่อของป้อม ซึ่งก่อนการค้นพบนี้เป็นที่รู้จักเพียงบางส่วนเท่านั้น^{[ 18 ]}

ก่อนที่จะมีการค้นพบตราประทับนี้ ชื่ออียิปต์ของป้อมปราการที่เซมนาใต้ถูกเขียนด้วยอักษรฮีราติกเป็น “ปราบปราม…” บนชิ้นส่วนของกระดาษปาปิรัสที่เจมส์ ควิเบล ล์ค้นพบในปี 1896 ใกล้กับราเมสเซียม [ ^{18 ] [ 3 ] หลังจาก}ศึกษาตราประทับเหล่านี้ ดร. ซับการ์ได้แปลอักษรฮีโรกลิฟิกเป็น “ผู้ปราบปรามชาวเซติอู-นูเบีย” หรือ “ผู้ปราบปรามดินแดนเซติ” ^{[ 18 ] [ 9 ]}การค้นพบนี้มีความสำคัญเพราะเป็นการยืนยันชื่ออียิปต์ของป้อมปราการที่เซมนาใต้อย่างเป็นทางการ และชี้แจงชื่อที่เขียนไว้บนกระดาษปาปิรัสราเมสเซียม นอกจากนี้ยังแสดงถึงบทบาทของอียิปต์ในนูเบีย: ผู้ปกครอง

คณะสำรวจสถาบันตะวันออกยังได้ขุดค้นสุสานขนาดใหญ่ทางเหนือของป้อม สุสานแห่งนี้มีหลุมฝังศพประมาณ 560 หลุม ซึ่งเป็นตัวแทนของบุคคลกว่า 800 คน โดยประมาณ 494 หลุมมาจากยุคเมโรอิติก (ศตวรรษที่ 4 ก่อนคริสต์ศักราช – ศตวรรษที่ 4 หลังคริสต์ศักราช) 50 หลุมมาจาก ยุค X-Group (ศตวรรษที่ 4 – 6 หลังคริสต์ศักราช) และ 16 หลุมมาจากยุคคริสเตียน (ค.ศ. 550 – 1500) ^{[ 21 ] [ 22 ]}ยุคเมโรอิติกจนถึงยุคคริสเตียนเป็นช่วงเวลาประมาณ 2,000 ปี ซึ่งบ่งชี้ว่าป้อมนี้ถูกใช้เป็นเวลานานในประวัติศาสตร์ของอียิปต์และนูเบีย

หลุมฝังศพของชาวเมโรอิติกวางตัวในทิศตะวันออกไปตะวันตกและมีหลายรูปแบบ ได้แก่ หลุมฝังศพรูปสี่เหลี่ยมผืนผ้าที่มีโครงสร้างคล้ายมาสตาบาหลุมฝังศพรูปสี่เหลี่ยมผืนผ้าที่ไม่มีโครงสร้าง และหลุมฝังศพรูปสี่เหลี่ยมผืนผ้าที่มีห้องเก็บศพที่ทำจากอิฐโคลน^{[ 7 ]}สำหรับซากที่พบในตำแหน่งเดิม ศีรษะจะหันไปทางทิศตะวันตกและร่างกายจะนอนหงายโดยมือวางอยู่เหนือกระดูกเชิงกราน^{[ 21 ]}พบสิ่งของโบราณจำนวนมากภายในหลุมฝังศพของชาวเมโรอิติก ได้แก่ เครื่องปั้นดินเผาสีดำและสีน้ำตาล ชามทองแดงและทองสัมฤทธิ์ ชามไม้แกะสลักอย่างประณีต ขวดน้ำมันแก้ว กระจกทองสัมฤทธิ์ เครื่องประดับทองแดง เหล็ก และทองสัมฤทธิ์ ลูกปัดและจี้ อุปกรณ์ล่าสัตว์ หนังสัตว์ และเศษผ้าห่อศพ^{[ 23 ]}

หลุมฝังศพของกลุ่ม X วางตัวในแนวเหนือจรดใต้ และส่วนใหญ่เป็นหลุมลึกที่มีห้องด้านข้าง^{[ 7 ]}ตามที่ Žabkar และ Žabkar (1982) กล่าวไว้ หลุมฝังศพส่วนใหญ่ “มีชั้นวางที่ทำจากดิน อิฐโคลน หรือหิน วางขนานไปกับห้อง ซึ่งรองรับวัสดุที่ใช้ปิดกั้น” ^{[ 24 ]}สำหรับซากที่พบในตำแหน่งเดิม ร่างกายจะอยู่ในท่างอตัวนอนตะแคง โดยศีรษะหันไปทางทิศเหนือ ทิศตะวันตกเฉียงเหนือ หรือทิศใต้ ในกรณีส่วนใหญ่มีผ้าห่อศพอยู่ แม้ว่ามักจะขาดเป็นชิ้นเล็กชิ้นน้อย^{[ 24 ]}วัตถุที่กู้คืนจากหลุมฝังศพเหล่านี้ ได้แก่ เครื่องปั้นดินเผาสีแดง เครื่องประดับ เครื่องมือสำหรับดูแลร่างกาย อุปกรณ์ล่าสัตว์ รองเท้าแตะหนัง และเสื้อผ้า^{[ 25 ]}

หลุมฝังศพในยุคคริสเตียนหันไปทางทิศตะวันออกถึงทิศตะวันตก และส่วนใหญ่เป็นหลุมฝังศพแบบปล่องแคบยาวลึก^{[ 25 ]}มีเพียงหลุมฝังศพเดียวที่มีโครงสร้างเหนือหลุมฝังศพ ในบรรดาซากศพที่อยู่ในตำแหน่งเดิม ร่างกายมักจะเหยียดตรงและนอนหงายโดยมือวางอยู่บนเชิงกรานและศีรษะหันไปทางทิศตะวันตก พบศพหนึ่งนอนตะแคงในท่างอตัวหันหน้าไปทางทิศเหนือ^{[ 25 ]}ศพส่วนใหญ่ถูกห่อด้วยผ้าลินินหรือผ้าขนสัตว์ซึ่งผูกไว้ด้วยเชือก^{[ 25 ]}