อ่าน 1 นาที
ส่วนขยายฐานเดี่ยว
การขยายฐานเดี่ยว (Single-base extension หรือ SBE) เป็นวิธีการระบุเอกลักษณ์ของ ฐาน นิวคลีโอไทด์ ณ ตำแหน่งเฉพาะใน กรดนิวคลีอิก วิธีนี้ใช้ในการระบุ ความแปรผันของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว...
ส่วนขยายฐานเดี่ยว
การขยายฐานเดี่ยว (Single-base extension หรือ SBE)เป็นวิธีการระบุเอกลักษณ์ของ ฐาน นิวคลีโอไทด์ณ ตำแหน่งเฉพาะในกรดนิวคลีอิกวิธีนี้ใช้ในการระบุความแปรผันของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว (Single-nucleotide polymorphismหรือ SNP)
ในวิธีการนี้ ไพรเมอร์ โอลิโกนิวคลีโอไทด์จะจับคู่กับบริเวณที่เสริมกันตามแนวกรดนิวคลีอิกเพื่อสร้างคู่ โดยปลาย 3' ของไพรเมอร์จะอยู่ติดกับเบสนิวคลีโอไทด์ที่ต้องการระบุโดยตรง โดยใช้เอนไซม์ดีเอ็นเอพอลิเมอเรส ไพรเมอร์โอลิโกนิวคลีโอไทด์จะถูกต่อเติมด้วยเบสเดี่ยวในขณะที่มีตัวหยุดนิวคลีโอไทด์ทั้งสี่ตัวอยู่ด้วย ตัวหยุดนิวคลีโอไทด์ที่เสริมกับเบสในแม่แบบที่กำลังตรวจสอบจะถูกรวมเข้าไปและระบุ การมีตัวหยุดทั้งสี่ตัวจะช่วยยับยั้งการรวมนิวคลีโอไทด์ที่ไม่เสริมกัน มีหลายวิธีที่สามารถใช้ในการระบุตัวตนของตัวหยุดที่รวมเข้าไปแล้ว รวมถึงการติดฉลากด้วยฟลูออเรสเซนต์ การติดฉลากมวลสำหรับการวิเคราะห์ด้วยแมสสเปกโทรเมตรี การติดฉลากไอโซโทป และการติดแท็กเบสด้วยแฮปเทนและตรวจจับด้วยวิธีโครโมเจนิคโดยใช้แอนติบอดี-เอนไซม์ที่จับกับแฮปเทน (เช่น ผ่านรูปแบบ ELISA)
วิธีการนี้คิดค้นโดย Philip Goelet, Michael Knapp, Richard Douglas และ Stephen Anderson ขณะทำงานอยู่ที่บริษัท Molecular Tool แนวทางนี้ออกแบบมาสำหรับการตรวจหาจีโนไทป์ SNP ในปริมาณมาก และเดิมเรียกว่า "การวิเคราะห์บิตทางพันธุกรรม" (Genetic Bit Analysis หรือ GBA) บริษัท Illumina, Inc. นำวิธีการนี้ไปใช้ในเทคโนโลยี Infinium ของตน ( http://www.illumina.com/technology/beadarray-technology/infinium-hd-assay.html ) เพื่อวัด ระดับการเมทิลเลชั่ น ของ DNAในจีโนมมนุษย์
สรุปเนื้อหา
ข้อมูลสำคัญจากบทความ
ข้อมูลสำคัญเกี่ยวกับ ส่วนขยายฐานเดี่ยว
การขยายฐานเดี่ยว (Single-base extension หรือ SBE) เป็นวิธีการระบุเอกลักษณ์ของ ฐาน นิวคลีโอไทด์ ณ ตำแหน่งเฉพาะใน กรดนิวคลีอิก วิธีนี้ใช้ในการระบุ ความแปรผันของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว...