แม้ว่าห้องปฏิบัติการอาจใช้น้ำแข็งแห้งเป็นสารทำความเย็นเพื่อเพิ่มความเลือกสรรของปฏิกิริยา แต่กระบวนการนี้จะซับซ้อนขึ้นในระดับอุตสาหกรรม ต้นทุนในการทำความเย็นเครื่องปฏิกรณ์ทั่วไปให้ถึงอุณหภูมินี้สูงมาก และความหนืดของสารตั้งต้นมักจะเพิ่มขึ้นเมื่ออุณหภูมิลดลง ทำให้การผสมทำได้ยาก ส่งผลให้ต้นทุนเพิ่มขึ้นจากการกวนที่แรงขึ้นและการเปลี่ยนชิ้นส่วนบ่อยขึ้น หรือส่งผลให้เกิดปฏิกิริยาที่ไม่เป็นเนื้อเดียวกัน สุดท้าย อุณหภูมิที่ต่ำลงอาจทำให้เกิดการตกตะกอนของสารตั้งต้น สารตัวกลาง และผลิตภัณฑ์พลอยได้ในภาชนะปฏิกิริยาเมื่อเวลาผ่านไป ซึ่งจะส่งผลต่อความบริสุทธิ์ของผลิตภัณฑ์^{[ 1 ]}

อัตราส่วนส โตอิคิโอเมตริกที่แตกต่างกันของสารตั้งต้นอาจส่งผลให้เกิดอัตราส่วนของผลิตภัณฑ์ที่เกิดขึ้นแตกต่างกัน ในระดับอุตสาหกรรม การเติมสารตั้งต้น A จำนวนมากลงในสารตั้งต้น B อาจใช้เวลานาน ในระหว่างนี้ สารตั้งต้น A ที่ถูกเติมเข้าไปจะสัมผัสกับสารตั้งต้น B ในปริมาณสโตอิคิโอเมตริกที่สูงกว่ามาก จนกระทั่งสารตั้งต้น A ถูกเติมเข้าไปทั้งหมด และความไม่สมดุลนี้อาจทำให้สารตั้งต้น A ทำปฏิกิริยาก่อนกำหนด และผลิตภัณฑ์ที่เกิดขึ้นตามมาก็จะทำปฏิกิริยากับสารตั้งต้น B ที่มีมากเกินไปอีกด้วย^{[ 1 ]}

การเติมตัวทำละลายอินทรีย์ลงในตัวทำละลายที่เป็นน้ำ หรือในทางกลับกัน มีความสำคัญในระดับอุตสาหกรรม ขึ้นอยู่กับตัวทำละลายที่ใช้ อาจเกิดอิมัลชันขึ้นได้ และเวลาที่จำเป็นสำหรับการแยกชั้นอาจยืดออกไปได้หากการผสมตัวทำละลายไม่เหมาะสม เมื่อเติมตัวทำละลายอินทรีย์ลงในตัวทำละลายที่เป็นน้ำ ต้องพิจารณาสัดส่วนทางเคมีอีกครั้ง เนื่องจากน้ำส่วนเกินอาจ ทำให้สารประกอบอินทรีย์ เกิดการไฮโดรไลซิสได้แม้ในสภาวะที่เป็นกรดหรือเบสอ่อนๆ ในขอบเขตที่กว้างขึ้น สถานที่ตั้งของโรงงานเคมีอาจมีบทบาทต่ออุณหภูมิแวดล้อมของภาชนะปฏิกิริยา ความแตกต่างเพียงไม่กี่องศาก็อาจทำให้ระดับการสกัดแตกต่างกันอย่างมากระหว่างโรงงานที่ตั้งอยู่ในประเทศต่างๆ^{[ 1 ]}

ในการผลิตแบบต่อเนื่อง วัตถุดิบและพลังงานจะถูกป้อนเข้าสู่ระบบในอัตราคงที่ และในขณะเดียวกันก็สามารถสกัดผลิตภัณฑ์ออกมาได้ในอัตราคงที่เช่นกัน ประสิทธิภาพของกระบวนการขึ้นอยู่กับความเสถียรของอัตราการไหลของวัสดุเป็นอย่างมาก สำหรับกระบวนการต่อเนื่องที่ใช้ผง การป้อนผงอย่างสม่ำเสมอและแม่นยำไปยังหน่วยปฏิบัติการถัดไปของสายการผลิตเป็นสิ่งสำคัญ เนื่องจากโดยทั่วไปแล้วการป้อนจะเป็นหน่วยปฏิบัติการแรก^{[ 2 ]}เครื่องป้อนได้รับการออกแบบเพื่อให้ได้ความน่าเชื่อถือของประสิทธิภาพ ความแม่นยำของอัตราการป้อน และการรบกวนน้อยที่สุด การส่งมอบวัสดุที่แม่นยำและสม่ำเสมอโดยเครื่องป้อนที่ออกแบบมาอย่างดีช่วยให้มั่นใจได้ถึงความเสถียรของกระบวนการโดยรวม เครื่องป้อนแบบชั่งน้ำหนัก (LIW) ถูกเลือกใช้ในการผลิตยา เครื่องป้อนแบบชั่งน้ำหนัก (LIW) ควบคุมการจ่ายวัสดุตามน้ำหนักในอัตราที่แม่นยำ และมักถูกเลือกใช้เพื่อลดความแปรปรวนของอัตราการไหลที่เกิดจากการเปลี่ยนแปลงระดับการบรรจุและความหนาแน่น ของวัสดุ ที่สำคัญ ประสิทธิภาพการป้อนขึ้นอยู่กับคุณสมบัติการไหลของผงเป็นอย่างมาก^{[ 3 ] [ 4 ]}

ในอุตสาหกรรมยา สารช่วยในการผลิตยาหลากหลายชนิดอาจถูกผสมรวมกับสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรมเพื่อสร้างส่วนผสมสุดท้ายที่ใช้ในการผลิตยาเม็ดความหลากหลายของวัสดุที่สามารถผสมกันได้ (สารช่วยในการผลิตยา สารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม) ทำให้เกิดตัวแปรหลายประการที่ต้องคำนึงถึงเพื่อให้ได้คุณลักษณะคุณภาพของผลิตภัณฑ์ตามเป้าหมาย ตัวแปรเหล่านี้อาจรวมถึงการกระจายขนาดอนุภาค (รวมถึงการรวมตัวหรือก้อนของวัสดุ) รูปร่างของอนุภาค (ทรงกลม แท่ง ลูกบาศก์ แผ่น และรูปร่างไม่สม่ำเสมอ) การมีอยู่ของความชื้น (หรือสารประกอบระเหยอื่นๆ) คุณสมบัติพื้นผิวของอนุภาค (ความหยาบ การยึดเกาะ) และคุณสมบัติการไหลของผง^{[ 5 ] [ 6 ]}

ในระหว่างกระบวนการผลิตยา มักจำเป็นต้องมีการบดเพื่อลดขนาดอนุภาคเฉลี่ยในผงยา^{[ 7 ]}มีเหตุผลหลายประการสำหรับเรื่องนี้ รวมถึงการเพิ่มความสม่ำเสมอและความสม่ำเสมอของขนาดยา การเพิ่มการดูดซึมยาและการเพิ่มความสามารถในการละลายของสารประกอบยา^{[ 8 ]}ในบางกรณี การผสมผงซ้ำๆ ตามด้วยการบดจะดำเนินการเพื่อปรับปรุงความสามารถในการผลิตของส่วนผสม

โดยทั่วไป การทำแกรนูลมีสองประเภท ได้แก่ การทำแกรนูลแบบเปียกและการทำแกรนูลแบบแห้ง การทำแกรนูลอาจคิดได้ว่าเป็นกระบวนการตรงกันข้ามกับการบด คือกระบวนการที่อนุภาคขนาดเล็กถูกรวมเข้าด้วยกันเพื่อสร้างอนุภาคขนาดใหญ่ขึ้น เรียกว่า แกรนูล การทำแกรนูลมีประโยชน์หลายประการ การทำแกรนูลช่วยป้องกันการ "แยกตัว" ของส่วนประกอบในส่วนผสม โดยการสร้างแกรนูลที่มีส่วนประกอบทั้งหมดในสัดส่วนที่ต้องการ ช่วยปรับปรุงคุณสมบัติการไหลของผง (เนื่องจากอนุภาคขนาดเล็กไหลได้ไม่ดี) และปรับปรุงคุณสมบัติการอัดขึ้นรูปสำหรับการทำยาเม็ด^{[ 9 ] [ 10 ]}

การอัดรีดด้วยความร้อนถูกนำมาใช้ในกระบวนการผลิตยาเม็ดแข็งทางปากเพื่อช่วยในการส่งยาที่มีความสามารถในการละลายและการดูดซึมต่ำ การอัดรีดด้วยความร้อนแสดงให้เห็นว่าสามารถกระจายตัวยาที่ละลายได้น้อยในตัวพาโพลีเมอร์ในระดับโมเลกุล ทำให้เพิ่มอัตราการละลายและการดูดซึม กระบวนการนี้เกี่ยวข้องกับการใช้ความร้อน ความดัน และการกวนเพื่อผสมวัสดุเข้าด้วยกันและ "อัดรีด" ผ่านแม่พิมพ์ เครื่องอัดรีดแบบสกรูคู่ที่มีแรงเฉือนสูงจะผสมวัสดุและในขณะเดียวกันก็ทำให้อนุภาคแตกตัว อนุภาคที่ได้สามารถนำมาผสมและอัดเป็นเม็ดหรือบรรจุลงในแคปซูลได้^{[ 11 ]}

เอกสาร Site Master File เป็นเอกสารในอุตสาหกรรมยาซึ่งให้ข้อมูลเกี่ยวกับการผลิตและการควบคุมการดำเนินงานการผลิตเอกสารนี้สร้างขึ้นโดยผู้ผลิต^{[ 12 ]} เอกสาร Site Master File ประกอบด้วย ข้อมูล GMP ที่เฉพาะเจาะจงและเป็นข้อเท็จจริง เกี่ยวกับการผลิตและการควบคุมการดำเนินงานการผลิตยาที่ดำเนินการ ณ สถานที่ที่ระบุ และการดำเนินงานที่บูรณาการอย่างใกล้ชิดในอาคารที่อยู่ติดกันและใกล้เคียง หากมีการดำเนินการผลิตยาเพียงบางส่วนในสถานที่นั้น เอกสาร Site Master File จะต้องอธิบายเฉพาะการดำเนินงานเหล่านั้น เช่น การวิเคราะห์ การบรรจุ^{[ 13 ]}