ในปี พ.ศ. 2528 ผู้ที่ชื่นชอบอวกาศอย่างปีเตอร์ ไดอะแมนดิสท็อดด์ ฮอว์ลีย์และโรเบิร์ต ดี. ริชาร์ดส์ได้ก่อตั้งมูลนิธิ Space Generation Foundation โดยมีเป้าหมายเพื่อส่งเสริมความรู้สึกถึงอัตลักษณ์ให้กับผู้คนที่เกิดตั้งแต่ต้นยุคอวกาศ^{[ 5 ]}หนึ่งในแนวคิดที่พัฒนาโดยมูลนิธิคือ 'มหาวิทยาลัยอวกาศ' โดยเฉพาะ^{[ 6 ]}ซึ่งได้รับการสนับสนุนจากบุคคลที่มีชื่อเสียงหลายคนในสาขาอวกาศ รวมถึงUR Rao , Harrison Schmitt , Burton Edelson , Gerard K. O'Neill , Hermann OberthและArthur C. Clarke ^{[ 7 ]}

โครงการริเริ่มนี้ได้รับการพัฒนาเพิ่มเติมและนำเสนอต่อที่ประชุม Advances in the Astronautical Sciences (AAS) ซึ่งอุทิศให้กับAerospace Century XXIในเมืองโบลเดอร์ รัฐโคโลราโดในปี 1986 ^{[ 8 ]}ในปีต่อมา ได้มีการจัดการประชุมก่อตั้งเป็นเวลาสามวัน ณสถาบันเทคโนโลยีแมสซาชูเซตส์ (MIT) ตั้งแต่วันที่ 10 ถึง 12 เมษายน 1987 โดยเลือกวันที่ดังกล่าวเพื่อรำลึกถึงการบินอวกาศครั้งแรกของยูริ กาการิน (12 เมษายน 1961)

การประชุมก่อตั้งนำไปสู่การก่อตั้งมหาวิทยาลัยอวกาศนานาชาติอย่างเป็นทางการ ซึ่งจัดตั้งขึ้นเป็นองค์กรการศึกษาที่ไม่แสวงหาผลกำไร ตาม มาตรา 501(c)(3) ใน รัฐแมสซาชูเซตส์ โครงการภาคฤดูร้อน (SSP) ครั้งแรกของ ISU จัดขึ้นที่ MIT ตั้งแต่วันที่ 20 มิถุนายนถึง 20 สิงหาคม 1988 โดยได้รับการสนับสนุนจากหน่วยงานอวกาศหลักๆ ผู้เข้าร่วมจากต่างประเทศกลุ่มแรกในภาคฤดูร้อนได้รับการนำโดยผู้ก่อตั้งอย่างเป็นทางการ โดยเดินข้ามแม่น้ำชาร์ลส์จาก MIT ในเคมบริดจ์ไปยังบอสตัน ภาพประกอบสำหรับโบรชัวร์ฉบับแรกสร้างสรรค์โดยPat Rawlingsและยังคงใช้มาจนถึงปัจจุบัน สำนักงานดั้งเดิมของ ISU ตั้งอยู่ในบ้านสไตล์วิคตอเรียนที่มองเห็นจัตุรัสเคนมอร์ในบอสตัน

เดิมที ISU พัฒนาขึ้นเป็นสถาบันที่กระจายตัวทางภูมิศาสตร์ โดยมีการจัดภาคเรียนฤดูร้อนในประเทศต่างๆ ทุกปี หลังจากมีการแข่งขันระดับนานาชาติเพื่อหาเมืองเจ้าภาพสำหรับวิทยาเขตกลาง ISU ได้ย้ายจากแมสซาชูเซตส์ไปยังอิลเคิร์ช-กราฟเฟนสตาเดนทางใต้ของสตราสบูร์กประเทศฝรั่งเศส ในปี 1994 ในช่วงปีแรกๆ ชั้นเรียนวิทยาศาสตรมหาบัณฑิตจัดขึ้นที่ Pôle API ของÉcole Nationale Supérieure de Physique de Strasbourgปัจจุบัน ISU เป็นสมาคมไม่แสวงหาผลกำไรที่จดทะเบียนในแคว้นอัลซาสและยังคงจดทะเบียนในสหรัฐอเมริกาในฐานะองค์กรการศึกษาไม่แสวงหาผลกำไร501(c)(3)

ในปี พ.ศ. 2545 ด้วยความช่วยเหลือจากหน่วยงานท้องถิ่น ISU ได้รับอาคารของตนเองในParc d'InnovationของIllkirch- Graffenstaden ^{[ 9 ]}

กระทรวงศึกษาธิการของฝรั่งเศสรับรอง ISU ให้เป็นสถาบันอุดมศึกษาในปี 2547 ^{[ 10 ]} ISU มีสถานะผู้สังเกตการณ์ถาวรกับคณะกรรมการสหประชาชาติว่าด้วยการใช้ประโยชน์จากอวกาศอย่างสันติ (COPUOS) ของสำนักงานกิจการอวกาศแห่งสหประชาชาติมาตั้งแต่ปี 2541 นอกจากนี้ ISU ยังได้รับสมาชิกภาพเต็มรูปแบบของSpace Agency Forum (SAF) ในปี 2538 ISU เป็นสมาชิกของสหพันธ์นักบินอวกาศนานาชาติ (IAF) และมีส่วนร่วมในโครงการระหว่างประเทศต่างๆ รวมถึง Asia-Pacific Regional Space Agency Forum ^{[ 11 ]}การประชุมสัมมนา IAF เรื่อง "การนำอวกาศมาสู่การศึกษา" การประชุมเชิงปฏิบัติการด้านการศึกษาเกี่ยวกับอวกาศโลก และคณะกรรมการอำนวยการสัปดาห์วิทยาศาสตร์แห่งชาติ

ในเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2560 มหาวิทยาลัยอวกาศนานาชาติได้จัดการประชุมที่เมืองสตราสบูร์ก ซึ่งนำไปสู่การก่อตั้งสมาคมหมู่บ้านดวงจันทร์^{[ 12 ] [ 13 ]}

มหาวิทยาลัยแห่งนี้เปิดสอนหลักสูตรปริญญาโทสาขาการศึกษาอวกาศ (MSS) ในเมืองสตราสบูร์ก ซึ่งสามารถสำเร็จได้ภายในหนึ่งปีหากเข้าร่วมฝึกงาน หรือภายในสองปีหากทำวิทยานิพนธ์วิจัยเพื่อรับปริญญาโทวิทยาศาสตร์ (MSc) นอกจากนี้ยังเปิดสอนหลักสูตรปริญญาโทวิจัยออนไลน์เต็มรูปแบบ คือ ปริญญาโทสาขาการวิจัยอวกาศ (MPhil)

มหาวิทยาลัยยังเสนอโปรแกรมพัฒนาวิชาชีพระยะสั้นทั่วโลก ซึ่งรวมถึงโปรแกรมศึกษาอวกาศแบบเดินทางไปทั่วโลก (SSP) ระยะเวลาแปดสัปดาห์ โปรแกรมศึกษาอวกาศซีกโลกใต้ (SHSSP) ระยะเวลาห้าสัปดาห์ร่วมกับมหาวิทยาลัยแอดิเลด หลักสูตรอวกาศสำหรับผู้บริหารที่เปิดสอนทั่วโลก และหลักสูตรการศึกษาขั้นสูงในสตราสบูร์ก^{[ 14 ]}

โครงสร้างองค์กรของ ISU ประกอบด้วยคณะกรรมการที่ปรึกษา ซึ่งมีอธิการบดีเป็นประธาน และคณะกรรมการบริหารที่ได้รับการเลือกตั้งจากสมาชิกผู้ปกครองของ ISU คณะกรรมการบริหารเป็นผู้กำหนดวัตถุประสงค์โดยรวมของ ISU ดูแลกิจการของมหาวิทยาลัย และแต่งตั้งอธิการบดีของ ISU อธิการบดีได้รับการสนับสนุนจากคณะกรรมการบริหาร คณาจารย์ (ผู้เตรียมและดำเนินการหลักสูตรของ ISU) และเจ้าหน้าที่ฝ่ายบริหาร (ผู้รับผิดชอบการดำเนินงานประจำวันของสถาบัน) คณาจารย์นำโดยคณบดี ซึ่งได้รับการสนับสนุนจากเจ้าหน้าที่ผู้รับผิดชอบหลักสูตรทางวิชาการของ ISU (ปริญญาโทและ SSP) และบริการห้องสมุด สภาวิชาการของ ISU มีหน้าที่รับผิดชอบในการรับรองคุณภาพทางวิชาการของกิจกรรมการสอนและการวิจัยของ ISU คณาจารย์ของ ISU ประกอบด้วยคณาจารย์ประจำจำนวนหนึ่ง เสริมด้วยคณาจารย์และอาจารย์พิเศษอื่นๆ ตามความจำเป็นของหลักสูตร^{[ 15 ]}

• เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ
• หน้าสาธารณะของห้องสมุด ISUบนNetvibes
• เดฟ ฮาสลัม พูดถึง "25 ปีของ ISU" (วิดีโอ YouTube) SpaceUp Stuttgart 2012
• โครงการ Space University เปิดตัวอย่างเป็นทางการด้วยสถาบันภาคฤดูร้อนนานาชาติแห่งแรก