สโมสรรักบี้ลีกเซนต์แมรีส์พัฒนามาจากสโมสรรักบี้ยูเนียนเซนต์แมรีส์ยูไนเต็ดในปี 1908 และเป็นสโมสรรักบี้ลีกที่เก่าแก่ที่สุดในลีกรักบี้เขตเพนริธ สโมสรรักบี้ ลีกเซนต์แมรีส์ยูไนเต็ดจะเล่นรักบี้ยูเนียนในวันเสาร์ และกลับมาเล่นรักบี้ลีกอีกครั้งในวันอาทิตย์กับทีมจากการแข่งขันซิดนีย์ในทุ่งหญ้าซึ่งปัจจุบันเป็นที่ตั้งของโรงเรียนมัธยมเซนต์แมรีส์ พวกเขาคว้าแชมป์ระดับ A ครั้งแรกในการแข่งขันลีกจูเนียร์เขตตะวันตกในปี 1945 ^{[ 1 ]}

ในปี พ.ศ. 2490 พาราแมตตาเข้าร่วมการแข่งขันรักบี้ลีก NSW และเซนต์แมรีส์เข้าร่วมลีกเยาวชน โดยชนะการแข่งขันระดับ A ในปี พ.ศ. 2490, พ.ศ. 2504–2506 และ พ.ศ. 2508 พวกเขายังประสบความสำเร็จในการชนะการแข่งขันระดับ A สำรอง ในปี พ.ศ. 2492 และอีกครั้งในปี พ.ศ. 2507 ทีมที่ประสบความสำเร็จอื่นๆ ได้แก่ ทีมระดับ D ซึ่งชนะการแข่งขันชิงแชมป์ครั้งแรกในปี พ.ศ. 2490 และทีมระดับ F ซึ่งชนะการแข่งขันชิงแชมป์ในปี พ.ศ. 2491 ในขณะที่ทีมระดับ E ประสบความสำเร็จในการชนะการแข่งขันในปี พ.ศ. 2503 ^{[ 1 ]}

ในปี พ.ศ. 2510 เซนต์แมรีส์ได้เข้าร่วมลีกรักบี้เยาวชนเพนริธเมื่อเพนริธได้รับการยอมรับเข้าสู่การแข่งขันรักบี้ลีกของรัฐนิวเซาท์เวลส์ ในปี พ.ศ. 2513 เพียง 3 ปีต่อมา เซนต์แมรีส์ได้ส่งทีมเข้าร่วมการแข่งขันดิวิชั่น 2 ของซิดนีย์ ซึ่งเปลี่ยนชื่อเป็นเมโทรโพลิแทนคัพในปี พ.ศ. 2517 แต่การแข่งขันดังกล่าวได้ยุติลงในปี พ.ศ. 2519 ซึ่งเป็นปีเดียวกับที่สโมสรคว้าแชมป์เมโทรโพลิแทนคัพระดับ 2 เนื่องจากไม่มีการแข่งขันเมโทรโพลิแทนคัพในปี พ.ศ. 2520 เซนต์แมรีส์จึงเลือกที่จะส่งทีมเข้าร่วมลีกเยาวชนเพนริธ และคว้าแชมป์ระดับ A เป็นครั้งแรกในลีกเยาวชนเพนริธในปีเดียวกัน^{[ 1 ]}

ในปี 1991 สโมสรได้กลับเข้าร่วมการแข่งขัน Metropolitan Cup อีกครั้ง ซึ่งได้รับการปรับปรุงใหม่เมื่อหนึ่งปีก่อนหน้านั้น โดยคว้าแชมป์ First Grade Premierships ในปี 1993–1994 และอีกครั้งในปี 2001 สโมสรยังประสบความสำเร็จในการคว้าแชมป์ 2nd Grade Premiership ในปี 1995 ปีต่อมา สโมสรตัดสินใจว่าการแข่งขัน Metropolitan Cup ไม่มีทิศทาง การแข่งขันเหลือเพียง 7 ทีม และไม่มีทีมอื่นใดสนใจที่จะเข้าร่วมการแข่งขัน Metropolitan Cup จึงตัดสินใจถอนทีมออกและมุ่งเน้นไปที่ Junior League แทน^{[ 1 ]}

ในปี 1950 สโมสรยังคงใช้สนามรูปไข่เดิมที่วิคตอเรียพาร์คเป็นฐานที่มั่น แต่ได้รับแจ้งจากสภาเมืองเพนริธว่าจะเปลี่ยนสนามรูปไข่ดังกล่าวให้เป็นสวนสาธารณะ และจะไม่มีที่ว่างสำหรับสโมสรรักบี้ลีกเซนต์แมรีส์อีกต่อไป สโมสรจึงต้องตัดสินใจเกี่ยวกับอนาคตอันใกล้ เนื่องจากไม่มีทางเลือกอื่นนอกจากต้องมองหาสถานที่ใหม่เพื่อเล่นรักบี้ลีก และได้พบที่ดินซึ่งปัจจุบันเป็นที่ตั้งของศูนย์การค้าทาร์เก็ต

ในปี พ.ศ. 2538 น่าเสียดายที่สภาเพนริธไม่สามารถหาเงินทุนได้ ดังนั้นสโมสรรักบี้ลีกเซนต์แมรีส์จึงรับหน้าที่สร้างสนามกีฬารักบี้ลีกที่ทันสมัยที่สุดแห่งหนึ่งที่ด้านหลังของสโมสรด้วยงบประมาณ 6.25 ล้านดอลลาร์ ซึ่งสโมสรเป็นผู้รับผิดชอบค่าใช้จ่ายทั้งหมด สนามกีฬาแห่งนี้เปิดให้บริการในเดือนมกราคม พ.ศ. 2545 ^{[ 1 ]}

ในปี 2003 สโมสรได้ก้าวไปในทิศทางใหม่และเข้าร่วมกับเพนริธ แพนเธอร์ส ในการร่วมทุนเพื่อควบรวมกิจการเป็นสโมสรเดียวที่รู้จักกันในชื่อ เซนต์แมรีส์/เพนริธ คูการ์ส พวกเขาร่วมกันส่งทีมเข้าร่วมการแข่งขันจิม บีม คัพ และพรีเมียร์ลีก การร่วมทุนในจิม บีม คัพ ดำเนินไปจนถึงสิ้นสุดฤดูกาล 2005 เท่านั้น ส่วนการร่วมทุนในพรีเมียร์ลีกก็ยุติลงในอีกหนึ่งปีต่อมา เมื่อสโมสรถูกบังคับให้ถอนตัวออกจากการสนับสนุนเนื่องจากการเพิ่มขึ้นอย่างมากของภาษีเครื่องเล่นพนันและข้อจำกัดเกี่ยวกับการสูบบุหรี่ ถึงกระนั้น ลีกเยาวชนก็ยังคงแข็งแกร่งขึ้นเรื่อยๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในช่วง 10 ปีที่ผ่านมา โดยคว้าแชมป์พรีเมียร์ลีกได้ถึง 11 ครั้ง ซึ่งเป็นสถิติสูงสุดในปี 2004 และอีกครั้งในปี 2007 ^{[ 1 ]}เมื่อวันที่ 26 กันยายน 2016 เซนต์แมรีส์ได้เข้า สู่รอบชิงชนะ เลิศรอน แมสซีย์คัพ กับเมาท์ พริตชาร์ด เมาน์ตีส์ แต่แพ้ไปด้วยคะแนน 36–16 ^{[ 3 ]}เมื่อวันที่ 24 กันยายน 2017 เซนต์แมรีส์เอาชนะเมาน์ตีส์เพื่อคว้า แชมป์ ซิดนีย์ ชีลด์ในรอบชิงชนะเลิศ^{[ 4 ]}ในปี 2018 เซนต์แมรีส์เข้าถึงรอบชิงชนะเลิศของถ้วยรอนแมสซีย์ โดยพบกับเวนท์เวิ ร์ธวิลล์ แม็กไพส์ แชมป์เก่า แต่พ่ายแพ้ไปด้วยคะแนน 38–4 ^{[ 5 ]}ในฤดูกาลถ้วยรอนแมสซีย์ ปี 2019 เซนต์แมรีส์เข้าถึงรอบชิงชนะเลิศ โดยพบกับเวนท์เวิร์ธวิลล์อีกครั้ง ซึ่งเป็นการรีแมตช์จากรอบชิงชนะเลิศของฤดูกาลก่อน เซนต์แมรีส์ก็พ่ายแพ้ในรอบชิงชนะเลิศอีกครั้งด้วยคะแนน 32-14 ที่สนามไลช์ฮาร์ด โอวัล [ ^{6 ] เมื่อ}วันที่ 4 กันยายน 2022 เซนต์แมรีส์คว้าแชมป์ซิดนีย์ชีลด์ปี 2022 โดยเอาชนะบราเธอร์ส เพนริธ 36-12 ในรอบชิงชนะเลิศ เมื่อวันที่ 3 กันยายน 2023 เซนต์แมรีส์เอาชนะเวนท์เวิร์ธวิลล์ 40-12 เพื่อคว้าแชมป์ถ้วยรอนแมสซีย์รอบชิงชนะเลิศ^{[ 7 ]}เมื่อวันที่ 13 กันยายน 2025 เซนต์แมรีส์ เอาชนะเวนท์ เวิร์ธวิลล์ในรอบชิงชนะเลิศถ้วยรอนแมสซีย์ปี 2025 ^{[ 8 ]}

สโมสรเซนต์แมรีส์เข้าร่วมการแข่งขันรอน แมสซีย์ คัพในปี 2016 ก่อนหน้านี้ สโมสรเคยเข้าร่วมการแข่งขันระดับดิวิชั่นสามที่เทียบเท่ากันในช่วงทศวรรษ 1970 และ 1990 จนถึงปี 2001 และ 2003

ในช่วงกลางทศวรรษ 2000 สโมสรได้ร่วมมือกับทีมเพนริธ แพนเธอร์ส ส่งทีมเข้าร่วมแข่งขัน ในลีกระดับสองอย่างพรีเมียร์ลีกโดยใช้ชื่อว่า เซนต์แมรีส์ เพนริธ คูการ์ส